MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257

Total Repeats: 3098

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_018179	GA	3	6	74008	74013	50 %	0 %	50 %	0 %	400752742
1502	NC_018179	GCG	2	6	74048	74053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752742
1503	NC_018179	CG	3	6	74094	74099	0 %	0 %	50 %	50 %	400752742
1504	NC_018179	GGT	2	6	74148	74153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	400752742
1505	NC_018179	GCT	2	6	74295	74300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752742
1506	NC_018179	CGG	2	6	74347	74352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752742
1507	NC_018179	AGC	2	6	74417	74422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752742
1508	NC_018179	GCGTG	2	10	74469	74478	0 %	20 %	60 %	20 %	400752742
1509	NC_018179	GGAT	2	8	74543	74550	25 %	25 %	50 %	0 %	400752742
1510	NC_018179	ACG	2	6	74556	74561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752742
1511	NC_018179	GCCGCT	2	12	74605	74616	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1512	NC_018179	TCG	2	6	74632	74637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_018179	TGC	2	6	74655	74660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_018179	CGG	3	9	74708	74716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_018179	GC	3	6	74736	74741	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1516	NC_018179	CAC	2	6	74911	74916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1517	NC_018179	ATT	2	6	74920	74925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_018179	TCT	2	6	74935	74940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_018179	CG	3	6	75012	75017	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1520	NC_018179	TCG	2	6	75105	75110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752743
1521	NC_018179	GC	4	8	75132	75139	0 %	0 %	50 %	50 %	400752743
1522	NC_018179	GGC	2	6	75272	75277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_018179	TCGT	2	8	75314	75321	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1524	NC_018179	T	6	6	75461	75466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_018179	GC	4	8	75514	75521	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1526	NC_018179	TGC	2	6	75561	75566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_018179	ATACAA	2	12	75570	75581	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1528	NC_018179	T	6	6	75674	75679	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_018179	GAG	2	6	75769	75774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_018179	T	6	6	75831	75836	0 %	100 %	0 %	0 %	400752744
1531	NC_018179	CG	3	6	75849	75854	0 %	0 %	50 %	50 %	400752744
1532	NC_018179	GCT	2	6	75891	75896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752744
1533	NC_018179	CGG	2	6	75938	75943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752744
1534	NC_018179	CGG	2	6	75964	75969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752744
1535	NC_018179	CAGG	2	8	76059	76066	25 %	0 %	50 %	25 %	400752744
1536	NC_018179	GCC	2	6	76082	76087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752744
1537	NC_018179	CCG	2	6	76091	76096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752744
1538	NC_018179	TGC	2	6	76107	76112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752744
1539	NC_018179	GGC	2	6	76120	76125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752744
1540	NC_018179	CGA	2	6	76139	76144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752744
1541	NC_018179	TCG	2	6	76154	76159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752744
1542	NC_018179	TGA	2	6	76167	76172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400752744
1543	NC_018179	GGC	2	6	76202	76207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_018179	GGT	2	6	76255	76260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_018179	GGGA	2	8	76263	76270	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_018179	GCG	2	6	76271	76276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_018179	CGAG	2	8	76383	76390	25 %	0 %	50 %	25 %	400752745
1548	NC_018179	TCCG	2	8	76450	76457	0 %	25 %	25 %	50 %	400752745
1549	NC_018179	CAA	2	6	76494	76499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400752745
1550	NC_018179	C	7	7	76539	76545	0 %	0 %	0 %	100 %	400752745
1551	NC_018179	AAT	2	6	76575	76580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400752745
1552	NC_018179	GAC	2	6	76717	76722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752745
1553	NC_018179	AT	3	6	76927	76932	50 %	50 %	0 %	0 %	400752745
1554	NC_018179	AAG	2	6	76951	76956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400752745
1555	NC_018179	AGG	2	6	76977	76982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400752745
1556	NC_018179	CCCA	2	8	77056	77063	25 %	0 %	0 %	75 %	400752745
1557	NC_018179	GCC	2	6	77072	77077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752745
1558	NC_018179	AG	3	6	77304	77309	50 %	0 %	50 %	0 %	400752746
1559	NC_018179	GCAA	2	8	77328	77335	50 %	0 %	25 %	25 %	400752746
1560	NC_018179	TC	3	6	77338	77343	0 %	50 %	0 %	50 %	400752746
1561	NC_018179	TGG	2	6	77384	77389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	400752746
1562	NC_018179	ACG	2	6	77446	77451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752746
1563	NC_018179	TTC	2	6	77481	77486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400752746
1564	NC_018179	CCCA	2	8	77497	77504	25 %	0 %	0 %	75 %	400752746
1565	NC_018179	CGA	2	6	77540	77545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752746
1566	NC_018179	TGT	2	6	77559	77564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400752746
1567	NC_018179	CTG	2	6	77601	77606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752746
1568	NC_018179	CAT	2	6	77610	77615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400752746
1569	NC_018179	GCC	2	6	77710	77715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752746
1570	NC_018179	GCAT	2	8	77794	77801	25 %	25 %	25 %	25 %	400752746
1571	NC_018179	CT	3	6	77811	77816	0 %	50 %	0 %	50 %	400752746
1572	NC_018179	AGCC	2	8	77910	77917	25 %	0 %	25 %	50 %	400752746
1573	NC_018179	GCA	2	6	78113	78118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752746
1574	NC_018179	A	6	6	78153	78158	100 %	0 %	0 %	0 %	400752746
1575	NC_018179	ATG	2	6	78215	78220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400752746
1576	NC_018179	ACGA	2	8	78221	78228	50 %	0 %	25 %	25 %	400752746
1577	NC_018179	CAG	2	6	78264	78269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752746
1578	NC_018179	GGC	2	6	78383	78388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1579	NC_018179	TCG	2	6	78403	78408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_018179	GC	3	6	78517	78522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1581	NC_018179	TTCA	2	8	78575	78582	25 %	50 %	0 %	25 %	400752747
1582	NC_018179	TTG	2	6	78594	78599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400752747
1583	NC_018179	GCGT	2	8	78670	78677	0 %	25 %	50 %	25 %	400752747
1584	NC_018179	GGA	2	6	78698	78703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400752747
1585	NC_018179	AAG	2	6	78730	78735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400752747
1586	NC_018179	CGA	2	6	78744	78749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752747
1587	NC_018179	CG	3	6	78872	78877	0 %	0 %	50 %	50 %	400752747
1588	NC_018179	GCA	2	6	78929	78934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752747
1589	NC_018179	GATA	2	8	79065	79072	50 %	25 %	25 %	0 %	400752747
1590	NC_018179	CCT	2	6	79134	79139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	400752747
1591	NC_018179	CA	3	6	79167	79172	50 %	0 %	0 %	50 %	400752747
1592	NC_018179	CAT	2	6	79191	79196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400752747
1593	NC_018179	CCA	2	6	79285	79290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400752747
1594	NC_018179	GAA	2	6	79297	79302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400752747
1595	NC_018179	GGAA	2	8	79311	79318	50 %	0 %	50 %	0 %	400752747
1596	NC_018179	A	6	6	79378	79383	100 %	0 %	0 %	0 %	400752747
1597	NC_018179	CCGT	2	8	79455	79462	0 %	25 %	25 %	50 %	400752747
1598	NC_018179	GCC	2	6	79481	79486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752747
1599	NC_018179	GA	3	6	79524	79529	50 %	0 %	50 %	0 %	400752747
1600	NC_018179	TGC	2	6	79549	79554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NC_018179	GCC	2	6	79566	79571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1602	NC_018179	TCT	2	6	79586	79591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_018179	GAAGA	2	10	79748	79757	60 %	0 %	40 %	0 %	400752748
1604	NC_018179	GCTC	2	8	79798	79805	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1605	NC_018179	GCA	2	6	79906	79911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752749
1606	NC_018179	GTC	2	6	79917	79922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752749
1607	NC_018179	GCC	2	6	79983	79988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752749
1608	NC_018179	CGT	2	6	80015	80020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752749
1609	NC_018179	CCGG	2	8	80130	80137	0 %	0 %	50 %	50 %	400752749
1610	NC_018179	CGA	2	6	80165	80170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752749
1611	NC_018179	ATG	2	6	80218	80223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400752749
1612	NC_018179	GCT	2	6	80327	80332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752749
1613	NC_018179	CAC	2	6	80394	80399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400752749
1614	NC_018179	CGC	2	6	80412	80417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752749
1615	NC_018179	CAG	2	6	80466	80471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752749
1616	NC_018179	CGA	2	6	80556	80561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752749
1617	NC_018179	CGC	2	6	80616	80621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752749
1618	NC_018179	TGG	2	6	80702	80707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	400752749
1619	NC_018179	GCT	2	6	80727	80732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752749
1620	NC_018179	AGC	2	6	80779	80784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752749
1621	NC_018179	TGCATC	2	12	80859	80870	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	400752749
1622	NC_018179	GCT	2	6	80879	80884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752749
1623	NC_018179	TCG	2	6	80908	80913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752749
1624	NC_018179	TTG	2	6	80917	80922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400752749
1625	NC_018179	TCGG	2	8	80958	80965	0 %	25 %	50 %	25 %	400752749
1626	NC_018179	TGC	2	6	80997	81002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752749
1627	NC_018179	CCCG	2	8	81070	81077	0 %	0 %	25 %	75 %	400752749
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1629	NC_018179	CGAC	2	8	81133	81140	25 %	0 %	25 %	50 %	400752749
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