MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257

Total Repeats: 3098

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_018179	GCG	2	6	48907	48912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752710
1002	NC_018179	GAG	2	6	48995	49000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_018179	GGAT	2	8	49007	49014	25 %	25 %	50 %	0 %	400752711
1004	NC_018179	GCGCGA	2	12	49074	49085	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	400752711
1005	NC_018179	GAA	2	6	49104	49109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400752711
1006	NC_018179	CAC	2	6	49120	49125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400752711
1007	NC_018179	CAC	2	6	49258	49263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400752711
1008	NC_018179	GAC	2	6	49315	49320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752711
1009	NC_018179	GC	3	6	49321	49326	0 %	0 %	50 %	50 %	400752711
1010	NC_018179	GCG	2	6	49351	49356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752711
1011	NC_018179	GC	3	6	49431	49436	0 %	0 %	50 %	50 %	400752711
1012	NC_018179	TTCT	2	8	49445	49452	0 %	75 %	0 %	25 %	400752711
1013	NC_018179	CGA	3	9	49476	49484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752711
1014	NC_018179	TCGC	2	8	49510	49517	0 %	25 %	25 %	50 %	400752711
1015	NC_018179	TGA	2	6	49590	49595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400752712
1016	NC_018179	GTC	2	6	49649	49654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752712
1017	NC_018179	TCT	2	6	49757	49762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400752712
1018	NC_018179	GTC	2	6	49808	49813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752712
1019	NC_018179	CT	3	6	49820	49825	0 %	50 %	0 %	50 %	400752712
1020	NC_018179	GCTT	2	8	49867	49874	0 %	50 %	25 %	25 %	400752712
1021	NC_018179	GGA	2	6	49939	49944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400752712
1022	NC_018179	CG	3	6	50096	50101	0 %	0 %	50 %	50 %	400752712
1023	NC_018179	CG	3	6	50136	50141	0 %	0 %	50 %	50 %	400752712
1024	NC_018179	CGG	2	6	50199	50204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752712
1025	NC_018179	CTGT	2	8	50279	50286	0 %	50 %	25 %	25 %	400752712
1026	NC_018179	ACC	2	6	50322	50327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400752712
1027	NC_018179	CCGC	2	8	50347	50354	0 %	0 %	25 %	75 %	400752712
1028	NC_018179	GAG	2	6	50488	50493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400752712
1029	NC_018179	GGC	2	6	50523	50528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752712
1030	NC_018179	CTT	2	6	50670	50675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400752713
1031	NC_018179	GTC	2	6	50712	50717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752713
1032	NC_018179	GTT	2	6	50745	50750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400752713
1033	NC_018179	ACC	2	6	50789	50794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400752713
1034	NC_018179	CGA	2	6	50906	50911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752713
1035	NC_018179	GCC	2	6	50922	50927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752713
1036	NC_018179	CTTG	2	8	50945	50952	0 %	50 %	25 %	25 %	400752713
1037	NC_018179	AAG	2	6	50961	50966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400752713
1038	NC_018179	AGC	2	6	50980	50985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752713
1039	NC_018179	TCCTC	2	10	50995	51004	0 %	40 %	0 %	60 %	400752713
1040	NC_018179	GC	3	6	51032	51037	0 %	0 %	50 %	50 %	400752713
1041	NC_018179	CAG	2	6	51046	51051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752713
1042	NC_018179	GC	3	6	51098	51103	0 %	0 %	50 %	50 %	400752713
1043	NC_018179	TCC	2	6	51118	51123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	400752713
1044	NC_018179	ACG	2	6	51159	51164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752713
1045	NC_018179	CGA	2	6	51199	51204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752713
1046	NC_018179	TCG	2	6	51235	51240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752713
1047	NC_018179	TGG	2	6	51348	51353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	400752714
1048	NC_018179	TTG	2	6	51396	51401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400752714
1049	NC_018179	CAT	2	6	51415	51420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400752714
1050	NC_018179	GCA	2	6	51425	51430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752714
1051	NC_018179	CACT	2	8	51456	51463	25 %	25 %	0 %	50 %	400752714
1052	NC_018179	CG	3	6	51673	51678	0 %	0 %	50 %	50 %	400752715
1053	NC_018179	TCCT	2	8	51695	51702	0 %	50 %	0 %	50 %	400752715
1054	NC_018179	AGG	2	6	51848	51853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400752715
1055	NC_018179	TCG	2	6	52034	52039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752715
1056	NC_018179	G	6	6	52044	52049	0 %	0 %	100 %	0 %	400752715
1057	NC_018179	CAT	2	6	52115	52120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400752715
1058	NC_018179	CTC	2	6	52153	52158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	400752715
1059	NC_018179	CAT	2	6	52164	52169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400752715
1060	NC_018179	ATT	2	6	52179	52184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400752715
1061	NC_018179	TCT	2	6	52202	52207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400752715
1062	NC_018179	TGAT	2	8	52217	52224	25 %	50 %	25 %	0 %	400752715
1063	NC_018179	AT	3	6	52223	52228	50 %	50 %	0 %	0 %	400752715
1064	NC_018179	ATG	3	9	52231	52239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400752715
1065	NC_018179	CCG	2	6	52282	52287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752715
1066	NC_018179	ATC	2	6	52309	52314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400752715
1067	NC_018179	AAG	2	6	52449	52454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400752716
1068	NC_018179	CG	3	6	52463	52468	0 %	0 %	50 %	50 %	400752716
1069	NC_018179	CG	3	6	52506	52511	0 %	0 %	50 %	50 %	400752716
1070	NC_018179	GCC	2	6	52512	52517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752716
1071	NC_018179	CTA	2	6	52584	52589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400752716
1072	NC_018179	GCT	2	6	52682	52687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752716
1073	NC_018179	TC	4	8	52747	52754	0 %	50 %	0 %	50 %	400752716
1074	NC_018179	A	6	6	52777	52782	100 %	0 %	0 %	0 %	400752716
1075	NC_018179	CGG	2	6	52868	52873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752716
1076	NC_018179	CTT	2	6	52886	52891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400752716
1077	NC_018179	CGT	2	6	52949	52954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752716
1078	NC_018179	CGG	2	6	53006	53011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752716
1079	NC_018179	GATC	2	8	53015	53022	25 %	25 %	25 %	25 %	400752716
1080	NC_018179	GTG	2	6	53233	53238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	400752716
1081	NC_018179	GAT	2	6	53331	53336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400752716
1082	NC_018179	ATGG	2	8	53522	53529	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_018179	GAA	2	6	53535	53540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_018179	TGC	2	6	53545	53550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_018179	CGG	2	6	53566	53571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_018179	ATC	2	6	53573	53578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_018179	GGC	2	6	53599	53604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_018179	GTT	2	6	53658	53663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_018179	CGG	2	6	53725	53730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_018179	CGTG	2	8	53766	53773	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1091	NC_018179	TCG	2	6	53860	53865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_018179	GATC	2	8	53872	53879	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1093	NC_018179	T	7	7	53885	53891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_018179	TGC	2	6	53909	53914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752717
1095	NC_018179	CGG	2	6	53957	53962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752717
1096	NC_018179	CCAG	2	8	54007	54014	25 %	0 %	25 %	50 %	400752717
1097	NC_018179	AGC	2	6	54071	54076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752717
1098	NC_018179	AGCC	2	8	54196	54203	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1099	NC_018179	A	6	6	54216	54221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_018179	AGCA	2	8	54291	54298	50 %	0 %	25 %	25 %	400752718
1101	NC_018179	CGG	2	6	54368	54373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752718
1102	NC_018179	AGG	2	6	54435	54440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400752718
1103	NC_018179	TCG	2	6	54560	54565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752718
1104	NC_018179	GT	3	6	54611	54616	0 %	50 %	50 %	0 %	400752718
1105	NC_018179	TGA	2	6	54622	54627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400752718
1106	NC_018179	GAA	2	6	54651	54656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400752718
1107	NC_018179	GA	3	6	54677	54682	50 %	0 %	50 %	0 %	400752718
1108	NC_018179	GC	3	6	54815	54820	0 %	0 %	50 %	50 %	400752718
1109	NC_018179	GAT	2	6	54851	54856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400752718
1110	NC_018179	TTG	2	6	54862	54867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400752718
1111	NC_018179	GAT	2	6	54873	54878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400752718
1112	NC_018179	GGC	2	6	54943	54948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752718
1113	NC_018179	CCG	2	6	54960	54965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752718
1114	NC_018179	GCT	2	6	55015	55020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752718
1115	NC_018179	TCATG	2	10	55110	55119	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1116	NC_018179	GTA	2	6	55225	55230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_018179	GTTC	2	8	55231	55238	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1118	NC_018179	AAGC	2	8	55397	55404	50 %	0 %	25 %	25 %	400752719
1119	NC_018179	GA	3	6	55434	55439	50 %	0 %	50 %	0 %	400752719
1120	NC_018179	CTG	2	6	55475	55480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752719
1121	NC_018179	T	7	7	55502	55508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_018179	GCC	2	6	55601	55606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752720
1123	NC_018179	GCA	2	6	55641	55646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752720
1124	NC_018179	CTT	2	6	55665	55670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_018179	T	6	6	55669	55674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_018179	CGC	2	6	55730	55735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1127	NC_018179	G	6	6	55810	55815	0 %	0 %	100 %	0 %	400752721
1128	NC_018179	GCC	2	6	55836	55841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752721
1129	NC_018179	GCG	2	6	55889	55894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752721
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1251	NC_018179	GCA	3	9	62186	62194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1379	NC_018179	CG	3	6	68938	68943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1380	NC_018179	ACG	2	6	69006	69011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1381	NC_018179	CGA	2	6	69079	69084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1384	NC_018179	CCT	2	6	69374	69379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	400752738
1385	NC_018179	CGG	2	6	69502	69507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1386	NC_018179	ATC	2	6	69512	69517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1388	NC_018179	CTT	2	6	69540	69545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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