MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Streptococcus intermedius JTH08

Total Repeats: 5588

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018073	TTAA	2	8	97	104	50 %	50 %	0 %	0 %	392427892
2	NC_018073	ATTG	2	8	627	634	25 %	50 %	25 %	0 %	392427892
3	NC_018073	GAAA	2	8	656	663	75 %	0 %	25 %	0 %	392427892
4	NC_018073	ATTT	2	8	1525	1532	25 %	75 %	0 %	0 %	392427893
5	NC_018073	ATTG	2	8	1631	1638	25 %	50 %	25 %	0 %	392427893
6	NC_018073	AGTA	2	8	1889	1896	50 %	25 %	25 %	0 %	392427893
7	NC_018073	TTAG	2	8	2391	2398	25 %	50 %	25 %	0 %	392427893
8	NC_018073	TTTA	2	8	3552	3559	25 %	75 %	0 %	0 %	392427895
9	NC_018073	TGAA	2	8	4307	4314	50 %	25 %	25 %	0 %	392427895
10	NC_018073	ACTT	2	8	4366	4373	25 %	50 %	0 %	25 %	392427895
11	NC_018073	TTAT	2	8	4957	4964	25 %	75 %	0 %	0 %	392427896
12	NC_018073	AACA	2	8	5230	5237	75 %	0 %	0 %	25 %	392427896
13	NC_018073	AAAT	2	8	6108	6115	75 %	25 %	0 %	0 %	392427897
14	NC_018073	TAAA	2	8	6179	6186	75 %	25 %	0 %	0 %	392427897
15	NC_018073	AATT	2	8	8292	8299	50 %	50 %	0 %	0 %	392427897
16	NC_018073	TTGA	2	8	8419	8426	25 %	50 %	25 %	0 %	392427897
17	NC_018073	TTTA	2	8	8486	8493	25 %	75 %	0 %	0 %	392427897
18	NC_018073	TTGA	2	8	8644	8651	25 %	50 %	25 %	0 %	392427897
19	NC_018073	ACAA	2	8	9481	9488	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_018073	TCAA	2	8	9929	9936	50 %	25 %	0 %	25 %	392427899
21	NC_018073	AAGT	2	8	10175	10182	50 %	25 %	25 %	0 %	392427899
22	NC_018073	TCTA	2	8	10200	10207	25 %	50 %	0 %	25 %	392427899
23	NC_018073	CAAT	2	8	10517	10524	50 %	25 %	0 %	25 %	392427899
24	NC_018073	CTAT	2	8	10627	10634	25 %	50 %	0 %	25 %	392427899
25	NC_018073	CAAA	2	8	10668	10675	75 %	0 %	0 %	25 %	392427899
26	NC_018073	AAAC	2	8	11680	11687	75 %	0 %	0 %	25 %	392427900
27	NC_018073	GATA	2	8	12702	12709	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018073	TGTT	2	8	13489	13496	0 %	75 %	25 %	0 %	392427902
29	NC_018073	GTCG	2	8	13584	13591	0 %	25 %	50 %	25 %	392427902
30	NC_018073	TTGA	2	8	13653	13660	25 %	50 %	25 %	0 %	392427902
31	NC_018073	GATG	2	8	13661	13668	25 %	25 %	50 %	0 %	392427902
32	NC_018073	TAGT	2	8	14756	14763	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018073	CTTT	2	8	15350	15357	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_018073	TTTG	2	8	15575	15582	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018073	ATAA	2	8	15816	15823	75 %	25 %	0 %	0 %	392427903
36	NC_018073	GAAT	2	8	16079	16086	50 %	25 %	25 %	0 %	392427903
37	NC_018073	TTGG	2	8	17082	17089	0 %	50 %	50 %	0 %	392427903
38	NC_018073	ATTT	2	8	17094	17101	25 %	75 %	0 %	0 %	392427903
39	NC_018073	CATG	2	8	17651	17658	25 %	25 %	25 %	25 %	392427903
40	NC_018073	ATAA	2	8	18399	18406	75 %	25 %	0 %	0 %	392427903
41	NC_018073	AATA	2	8	18514	18521	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018073	GTTC	2	8	18578	18585	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_018073	AAGG	2	8	18722	18729	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018073	CAAG	2	8	19111	19118	50 %	0 %	25 %	25 %	392427904
45	NC_018073	CAGT	2	8	19374	19381	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_018073	AAAT	2	8	19393	19400	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018073	CCTG	2	8	19572	19579	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_018073	GTGA	2	8	19852	19859	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018073	AGCG	2	8	20023	20030	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_018073	AGCC	2	8	20904	20911	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_018073	GTAA	2	8	21348	21355	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018073	ATTC	2	8	22370	22377	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_018073	AGTG	2	8	22835	22842	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018073	TAGG	2	8	23379	23386	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018073	TTGG	2	8	23562	23569	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018073	AATC	2	8	23571	23578	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_018073	CTTT	2	8	24428	24435	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_018073	GCGT	2	8	25602	25609	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_018073	TTTG	2	8	25798	25805	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018073	TGAA	2	8	26262	26269	50 %	25 %	25 %	0 %	392427905
61	NC_018073	AAAG	2	8	26497	26504	75 %	0 %	25 %	0 %	392427905
62	NC_018073	TTGG	2	8	26539	26546	0 %	50 %	50 %	0 %	392427905
63	NC_018073	CATT	2	8	26769	26776	25 %	50 %	0 %	25 %	392427905
64	NC_018073	TTAC	2	8	27604	27611	25 %	50 %	0 %	25 %	392427907
65	NC_018073	ATGA	2	8	28009	28016	50 %	25 %	25 %	0 %	392427907
66	NC_018073	CAAT	2	8	28103	28110	50 %	25 %	0 %	25 %	392427907
67	NC_018073	TGGT	2	8	28713	28720	0 %	50 %	50 %	0 %	392427907
68	NC_018073	TATC	2	8	28758	28765	25 %	50 %	0 %	25 %	392427907
69	NC_018073	TTGA	2	8	28814	28821	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018073	TGAT	2	8	29583	29590	25 %	50 %	25 %	0 %	392427908
71	NC_018073	TAAT	2	8	29873	29880	50 %	50 %	0 %	0 %	392427908
72	NC_018073	AGAA	2	8	29886	29893	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018073	TAGG	2	8	29897	29904	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018073	TCAA	2	8	29938	29945	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_018073	ATCA	2	8	31447	31454	50 %	25 %	0 %	25 %	392427910
76	NC_018073	TTTA	2	8	31778	31785	25 %	75 %	0 %	0 %	392427910
77	NC_018073	TTCT	2	8	32257	32264	0 %	75 %	0 %	25 %	392427911
78	NC_018073	ATTT	2	8	33396	33403	25 %	75 %	0 %	0 %	392427912
79	NC_018073	AAGG	2	8	33677	33684	50 %	0 %	50 %	0 %	392427912
80	NC_018073	AAAC	2	8	33829	33836	75 %	0 %	0 %	25 %	392427912
81	NC_018073	AATT	2	8	33870	33877	50 %	50 %	0 %	0 %	392427912
82	NC_018073	TAAG	2	8	34060	34067	50 %	25 %	25 %	0 %	392427912
83	NC_018073	TCCA	2	8	35304	35311	25 %	25 %	0 %	50 %	392427913
84	NC_018073	CGTG	2	8	35374	35381	0 %	25 %	50 %	25 %	392427913
85	NC_018073	TCTG	2	8	36001	36008	0 %	50 %	25 %	25 %	392427913
86	NC_018073	TCGA	2	8	36371	36378	25 %	25 %	25 %	25 %	392427913
87	NC_018073	AAAG	2	8	36986	36993	75 %	0 %	25 %	0 %	392427913
88	NC_018073	CTTA	2	8	37243	37250	25 %	50 %	0 %	25 %	392427913
89	NC_018073	CTCA	2	8	39353	39360	25 %	25 %	0 %	50 %	392427915
90	NC_018073	TGAT	2	8	39532	39539	25 %	50 %	25 %	0 %	392427915
91	NC_018073	CGTG	2	8	39548	39555	0 %	25 %	50 %	25 %	392427915
92	NC_018073	ATTG	2	8	39683	39690	25 %	50 %	25 %	0 %	392427915
93	NC_018073	ACTT	2	8	39744	39751	25 %	50 %	0 %	25 %	392427915
94	NC_018073	TTGA	2	8	39765	39772	25 %	50 %	25 %	0 %	392427915
95	NC_018073	ACGG	2	8	40151	40158	25 %	0 %	50 %	25 %	392427916
96	NC_018073	GTAT	2	8	40401	40408	25 %	50 %	25 %	0 %	392427916
97	NC_018073	CGGT	2	8	40440	40447	0 %	25 %	50 %	25 %	392427916
98	NC_018073	ATTC	2	8	40526	40533	25 %	50 %	0 %	25 %	392427916
99	NC_018073	GCTG	2	8	40876	40883	0 %	25 %	50 %	25 %	392427916
100	NC_018073	GCTG	2	8	41259	41266	0 %	25 %	50 %	25 %	392427917
101	NC_018073	ATCC	2	8	41290	41297	25 %	25 %	0 %	50 %	392427917
102	NC_018073	TAAT	2	8	41595	41602	50 %	50 %	0 %	0 %	392427918
103	NC_018073	ATTT	2	8	41801	41808	25 %	75 %	0 %	0 %	392427918
104	NC_018073	TTTA	2	8	41824	41831	25 %	75 %	0 %	0 %	392427918
105	NC_018073	GCTA	2	8	43169	43176	25 %	25 %	25 %	25 %	392427919
106	NC_018073	TGGT	2	8	43267	43274	0 %	50 %	50 %	0 %	392427919
107	NC_018073	GCCA	2	8	43342	43349	25 %	0 %	25 %	50 %	392427919
108	NC_018073	TCCG	2	8	43617	43624	0 %	25 %	25 %	50 %	392427919
109	NC_018073	GATT	2	8	43721	43728	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018073	GTGA	2	8	43888	43895	25 %	25 %	50 %	0 %	392427920
111	NC_018073	GAAA	2	8	44104	44111	75 %	0 %	25 %	0 %	392427920
112	NC_018073	TGAT	2	8	44474	44481	25 %	50 %	25 %	0 %	392427920
113	NC_018073	TTGA	2	8	44671	44678	25 %	50 %	25 %	0 %	392427920
114	NC_018073	GAAC	2	8	44732	44739	50 %	0 %	25 %	25 %	392427920
115	NC_018073	CTGA	2	8	45048	45055	25 %	25 %	25 %	25 %	392427920
116	NC_018073	AATA	2	8	45697	45704	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018073	GAAA	2	8	45734	45741	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018073	GAAA	2	8	45823	45830	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018073	TATT	2	8	45946	45953	25 %	75 %	0 %	0 %	392427921
120	NC_018073	AACT	2	8	46574	46581	50 %	25 %	0 %	25 %	392427921
121	NC_018073	CAAT	2	8	46643	46650	50 %	25 %	0 %	25 %	392427921
122	NC_018073	AGTA	2	8	46893	46900	50 %	25 %	25 %	0 %	392427922
123	NC_018073	TTGA	2	8	47023	47030	25 %	50 %	25 %	0 %	392427922
124	NC_018073	AATT	2	8	47537	47544	50 %	50 %	0 %	0 %	392427922
125	NC_018073	CAAT	2	8	47582	47589	50 %	25 %	0 %	25 %	392427922
126	NC_018073	TTGG	2	8	47671	47678	0 %	50 %	50 %	0 %	392427922
127	NC_018073	TCAT	2	8	48095	48102	25 %	50 %	0 %	25 %	392427923
128	NC_018073	TTCA	2	8	48157	48164	25 %	50 %	0 %	25 %	392427923
129	NC_018073	TTTG	2	8	48830	48837	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018073	ACGA	2	8	48973	48980	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_018073	ATAA	2	8	48997	49004	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018073	TGGC	2	8	50026	50033	0 %	25 %	50 %	25 %	392427924
133	NC_018073	ACTC	2	8	50539	50546	25 %	25 %	0 %	50 %	392427925
134	NC_018073	GCTG	2	8	50737	50744	0 %	25 %	50 %	25 %	392427925
135	NC_018073	ATGG	2	8	50950	50957	25 %	25 %	50 %	0 %	392427925
136	NC_018073	CGAA	2	8	51368	51375	50 %	0 %	25 %	25 %	392427925
137	NC_018073	AGAA	2	8	51380	51387	75 %	0 %	25 %	0 %	392427925
138	NC_018073	GTTG	2	8	51529	51536	0 %	50 %	50 %	0 %	392427925
139	NC_018073	AGCT	2	8	53053	53060	25 %	25 %	25 %	25 %	392427927
140	NC_018073	GATT	2	8	53465	53472	25 %	50 %	25 %	0 %	392427927
141	NC_018073	CTTA	2	8	53825	53832	25 %	50 %	0 %	25 %	392427928
142	NC_018073	AAGA	2	8	53924	53931	75 %	0 %	25 %	0 %	392427928
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144	NC_018073	TTAG	2	8	54266	54273	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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