MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus intermedius JTH08

Total Repeats: 42052

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
42001	NC_018073	TACT	2	8	1931819	1931826	25 %	50 %	0 %	25 %	392429592
42002	NC_018073	GTC	2	6	1931838	1931843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392429592
42003	NC_018073	AGTCA	2	10	1931861	1931870	40 %	20 %	20 %	20 %	392429592
42004	NC_018073	TGCTAT	2	12	1931915	1931926	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	392429592
42005	NC_018073	ATT	2	6	1931973	1931978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392429592
42006	NC_018073	TGG	2	6	1932077	1932082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392429592
42007	NC_018073	ATG	2	6	1932187	1932192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392429592
42008	NC_018073	CAT	2	6	1932200	1932205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392429592
42009	NC_018073	TGAT	2	8	1932259	1932266	25 %	50 %	25 %	0 %	392429592
42010	NC_018073	ATCT	2	8	1932274	1932281	25 %	50 %	0 %	25 %	392429592
42011	NC_018073	GTT	3	9	1932330	1932338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392429592
42012	NC_018073	GCA	2	6	1932363	1932368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392429592
42013	NC_018073	ATG	2	6	1932385	1932390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392429592
42014	NC_018073	TTA	2	6	1932391	1932396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392429592
42015	NC_018073	AGAT	2	8	1932400	1932407	50 %	25 %	25 %	0 %	392429592
42016	NC_018073	TGA	2	6	1932467	1932472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392429592
42017	NC_018073	ACC	3	9	1932510	1932518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392429592
42018	NC_018073	AAT	2	6	1932555	1932560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392429592
42019	NC_018073	TAA	2	6	1932569	1932574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42020	NC_018073	GT	3	6	1932598	1932603	0 %	50 %	50 %	0 %	392429593
42021	NC_018073	AAGAA	2	10	1932674	1932683	80 %	0 %	20 %	0 %	392429593
42022	NC_018073	AGA	2	6	1932689	1932694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392429593
42023	NC_018073	A	6	6	1932694	1932699	100 %	0 %	0 %	0 %	392429593
42024	NC_018073	ATT	2	6	1932735	1932740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392429593
42025	NC_018073	CAT	2	6	1932746	1932751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392429593
42026	NC_018073	AAT	2	6	1932767	1932772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392429593
42027	NC_018073	GCT	2	6	1932810	1932815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392429593
42028	NC_018073	TAT	2	6	1932845	1932850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392429593
42029	NC_018073	GAT	2	6	1932864	1932869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392429593
42030	NC_018073	AAGC	2	8	1932879	1932886	50 %	0 %	25 %	25 %	392429593
42031	NC_018073	AGA	2	6	1932908	1932913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392429593
42032	NC_018073	AGA	2	6	1932926	1932931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392429593
42033	NC_018073	AC	3	6	1932969	1932974	50 %	0 %	0 %	50 %	392429593
42034	NC_018073	TTACA	2	10	1933010	1933019	40 %	40 %	0 %	20 %	392429593
42035	NC_018073	TTA	2	6	1933032	1933037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392429593
42036	NC_018073	AAG	2	6	1933069	1933074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392429593
42037	NC_018073	TC	3	6	1933081	1933086	0 %	50 %	0 %	50 %	392429593
42038	NC_018073	TC	3	6	1933112	1933117	0 %	50 %	0 %	50 %	392429593
42039	NC_018073	A	7	7	1933143	1933149	100 %	0 %	0 %	0 %	392429593
42040	NC_018073	A	6	6	1933220	1933225	100 %	0 %	0 %	0 %	392429593
42041	NC_018073	AGA	4	12	1933247	1933258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392429593
42042	NC_018073	A	6	6	1933265	1933270	100 %	0 %	0 %	0 %	392429593
42043	NC_018073	AAG	2	6	1933348	1933353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392429593
42044	NC_018073	ATT	2	6	1933365	1933370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392429593
42045	NC_018073	TTATTT	2	12	1933391	1933402	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42046	NC_018073	A	7	7	1933458	1933464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42047	NC_018073	CAA	2	6	1933474	1933479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42048	NC_018073	ATTT	2	8	1933509	1933516	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42049	NC_018073	ACT	2	6	1933567	1933572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42050	NC_018073	AAT	2	6	1933587	1933592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42051	NC_018073	AGG	2	6	1933599	1933604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42052	NC_018073	T	6	6	1933605	1933610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.