MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Sulfurospirillum barnesii SES-3 chromosome

Total Repeats: 1883

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018002	CAAAG	2	10	539	548	60 %	0 %	20 %	20 %	390939175
2	NC_018002	AAACA	2	10	1829	1838	80 %	0 %	0 %	20 %	390939176
3	NC_018002	TATTT	2	10	5648	5657	20 %	80 %	0 %	0 %	390939178
4	NC_018002	TTGAT	2	10	6112	6121	20 %	60 %	20 %	0 %	390939178
5	NC_018002	CGAAA	2	10	6709	6718	60 %	0 %	20 %	20 %	390939179
6	NC_018002	TTATT	2	10	6845	6854	20 %	80 %	0 %	0 %	390939180
7	NC_018002	TTTGG	2	10	10404	10413	0 %	60 %	40 %	0 %	390939183
8	NC_018002	TTTTG	2	10	13633	13642	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018002	TGTGG	2	10	15896	15905	0 %	40 %	60 %	0 %	390939187
10	NC_018002	ACCAA	2	10	21181	21190	60 %	0 %	0 %	40 %	390939193
11	NC_018002	GCCAA	2	10	21442	21451	40 %	0 %	20 %	40 %	390939193
12	NC_018002	ACCAT	2	10	21475	21484	40 %	20 %	0 %	40 %	390939193
13	NC_018002	TTTGG	2	10	22526	22535	0 %	60 %	40 %	0 %	390939195
14	NC_018002	GTGAT	2	10	24349	24358	20 %	40 %	40 %	0 %	390939197
15	NC_018002	ATTTT	2	10	24718	24727	20 %	80 %	0 %	0 %	390939198
16	NC_018002	TTGCT	2	10	25005	25014	0 %	60 %	20 %	20 %	390939198
17	NC_018002	TATAA	2	10	27113	27122	60 %	40 %	0 %	0 %	390939198
18	NC_018002	AAAAT	2	10	29441	29450	80 %	20 %	0 %	0 %	390939201
19	NC_018002	ACAAA	2	10	29838	29847	80 %	0 %	0 %	20 %	390939202
20	NC_018002	TATTT	2	10	32763	32772	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018002	TTATG	2	10	32815	32824	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018002	CGTTT	2	10	33410	33419	0 %	60 %	20 %	20 %	390939205
23	NC_018002	GTTTT	2	10	34349	34358	0 %	80 %	20 %	0 %	390939205
24	NC_018002	TGCGA	2	10	34715	34724	20 %	20 %	40 %	20 %	390939206
25	NC_018002	GTTTA	2	10	35585	35594	20 %	60 %	20 %	0 %	390939207
26	NC_018002	GATGA	2	10	35805	35814	40 %	20 %	40 %	0 %	390939207
27	NC_018002	TCAGC	2	10	36769	36778	20 %	20 %	20 %	40 %	390939208
28	NC_018002	TGGTG	2	10	39897	39906	0 %	40 %	60 %	0 %	390939211
29	NC_018002	TGGCA	2	10	41947	41956	20 %	20 %	40 %	20 %	390939214
30	NC_018002	ACGAC	2	10	42820	42829	40 %	0 %	20 %	40 %	390939216
31	NC_018002	GTATG	2	10	43288	43297	20 %	40 %	40 %	0 %	390939216
32	NC_018002	CCAGC	2	10	44627	44636	20 %	0 %	20 %	60 %	390939218
33	NC_018002	TTCTT	2	10	45989	45998	0 %	80 %	0 %	20 %	390939220
34	NC_018002	GCTTT	2	10	48013	48022	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_018002	ATAAA	2	10	50329	50338	80 %	20 %	0 %	0 %	390939224
36	NC_018002	CTTTT	2	10	50832	50841	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_018002	CAATT	2	10	51349	51358	40 %	40 %	0 %	20 %	390939225
38	NC_018002	TATTT	2	10	52192	52201	20 %	80 %	0 %	0 %	390939225
39	NC_018002	GTGTA	2	10	53958	53967	20 %	40 %	40 %	0 %	390939228
40	NC_018002	AAATA	2	10	55200	55209	80 %	20 %	0 %	0 %	390939228
41	NC_018002	ACAAG	2	10	55804	55813	60 %	0 %	20 %	20 %	390939229
42	NC_018002	ACCAA	2	10	56976	56985	60 %	0 %	0 %	40 %	390939230
43	NC_018002	GTGTG	2	10	57095	57104	0 %	40 %	60 %	0 %	390939230
44	NC_018002	GCAAG	2	10	59515	59524	40 %	0 %	40 %	20 %	390939231
45	NC_018002	TTTTG	2	10	60695	60704	0 %	80 %	20 %	0 %	390939233
46	NC_018002	TAAAT	2	10	61612	61621	60 %	40 %	0 %	0 %	390939234
47	NC_018002	ATTCC	2	10	63460	63469	20 %	40 %	0 %	40 %	390939237
48	NC_018002	CATCA	2	10	64850	64859	40 %	20 %	0 %	40 %	390939237
49	NC_018002	ATGTT	2	10	65557	65566	20 %	60 %	20 %	0 %	390939238
50	NC_018002	AAGAC	2	10	68688	68697	60 %	0 %	20 %	20 %	390939240
51	NC_018002	TCTCT	2	10	69718	69727	0 %	60 %	0 %	40 %	390939240
52	NC_018002	AGCGA	2	10	70143	70152	40 %	0 %	40 %	20 %	390939241
53	NC_018002	TTTGC	2	10	73088	73097	0 %	60 %	20 %	20 %	390939245
54	NC_018002	TGTGA	2	10	73320	73329	20 %	40 %	40 %	0 %	390939246
55	NC_018002	ATCAC	2	10	76357	76366	40 %	20 %	0 %	40 %	390939248
56	NC_018002	TGCAA	2	10	76382	76391	40 %	20 %	20 %	20 %	390939248
57	NC_018002	AATCA	2	10	76506	76515	60 %	20 %	0 %	20 %	390939248
58	NC_018002	GAGAT	2	10	76935	76944	40 %	20 %	40 %	0 %	390939249
59	NC_018002	CCCCT	2	10	79634	79643	0 %	20 %	0 %	80 %	390939251
60	NC_018002	GGTTG	2	10	79674	79683	0 %	40 %	60 %	0 %	390939251
61	NC_018002	AGGTG	2	10	79974	79983	20 %	20 %	60 %	0 %	390939252
62	NC_018002	ATAAA	2	10	82495	82504	80 %	20 %	0 %	0 %	390939254
63	NC_018002	AAAAG	2	10	82518	82527	80 %	0 %	20 %	0 %	390939254
64	NC_018002	GCGCT	2	10	82648	82657	0 %	20 %	40 %	40 %	390939255
65	NC_018002	TTCAT	2	10	83131	83140	20 %	60 %	0 %	20 %	390939255
66	NC_018002	AAAAG	2	10	83324	83333	80 %	0 %	20 %	0 %	390939255
67	NC_018002	CAAAT	2	10	83350	83359	60 %	20 %	0 %	20 %	390939255
68	NC_018002	GAAGA	2	10	84203	84212	60 %	0 %	40 %	0 %	390939256
69	NC_018002	ACCCT	2	10	85885	85894	20 %	20 %	0 %	60 %	390939259
70	NC_018002	CTTTT	2	10	87266	87275	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_018002	AAAAT	2	10	87320	87329	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018002	GGTTT	2	10	88253	88262	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018002	TAAAA	2	10	88793	88802	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018002	ATGCG	3	15	89724	89738	20 %	20 %	40 %	20 %	390939262
75	NC_018002	GTATT	2	10	89992	90001	20 %	60 %	20 %	0 %	390939262
76	NC_018002	AGAAA	2	10	90530	90539	80 %	0 %	20 %	0 %	390939262
77	NC_018002	TAAAA	2	10	95590	95599	80 %	20 %	0 %	0 %	390939266
78	NC_018002	GTTTA	2	10	96358	96367	20 %	60 %	20 %	0 %	390939268
79	NC_018002	AAAAG	2	10	96388	96397	80 %	0 %	20 %	0 %	390939268
80	NC_018002	GTAGC	2	10	97112	97121	20 %	20 %	40 %	20 %	390939269
81	NC_018002	ACTCT	2	10	97896	97905	20 %	40 %	0 %	40 %	390939270
82	NC_018002	GTTGC	2	10	98161	98170	0 %	40 %	40 %	20 %	390939271
83	NC_018002	AAAAG	2	10	99346	99355	80 %	0 %	20 %	0 %	390939272
84	NC_018002	ATTTG	2	10	103821	103830	20 %	60 %	20 %	0 %	390939277
85	NC_018002	TTTTA	2	10	104619	104628	20 %	80 %	0 %	0 %	390939279
86	NC_018002	CCACA	2	10	106999	107008	40 %	0 %	0 %	60 %	390939283
87	NC_018002	ACTGC	2	10	107036	107045	20 %	20 %	20 %	40 %	390939283
88	NC_018002	AAACG	2	10	107237	107246	60 %	0 %	20 %	20 %	390939283
89	NC_018002	CTTCC	2	10	109322	109331	0 %	40 %	0 %	60 %	390939287
90	NC_018002	GCTTT	2	10	109435	109444	0 %	60 %	20 %	20 %	390939287
91	NC_018002	TAATT	2	10	111927	111936	40 %	60 %	0 %	0 %	390939290
92	NC_018002	AGTTT	2	10	112243	112252	20 %	60 %	20 %	0 %	390939291
93	NC_018002	GAGAA	2	10	112265	112274	60 %	0 %	40 %	0 %	390939291
94	NC_018002	GTCCT	2	10	113061	113070	0 %	40 %	20 %	40 %	390939292
95	NC_018002	ATTTT	2	10	114436	114445	20 %	80 %	0 %	0 %	390939293
96	NC_018002	ATGAA	2	10	115752	115761	60 %	20 %	20 %	0 %	390939293
97	NC_018002	ATTTT	2	10	116324	116333	20 %	80 %	0 %	0 %	390939294
98	NC_018002	TTATT	2	10	118566	118575	20 %	80 %	0 %	0 %	390939295
99	NC_018002	GTTAA	2	10	122584	122593	40 %	40 %	20 %	0 %	390939299
100	NC_018002	CGATT	2	10	122646	122655	20 %	40 %	20 %	20 %	390939299
101	NC_018002	TTGCA	2	10	123188	123197	20 %	40 %	20 %	20 %	390939300
102	NC_018002	TGAAA	2	10	124945	124954	60 %	20 %	20 %	0 %	390939303
103	NC_018002	ACCAC	2	10	125422	125431	40 %	0 %	0 %	60 %	390939303
104	NC_018002	TTTGA	2	10	125483	125492	20 %	60 %	20 %	0 %	390939303
105	NC_018002	ATTCT	2	10	128917	128926	20 %	60 %	0 %	20 %	390939307
106	NC_018002	TGAAT	2	10	129386	129395	40 %	40 %	20 %	0 %	390939307
107	NC_018002	ATCGT	2	10	129461	129470	20 %	40 %	20 %	20 %	390939307
108	NC_018002	AAACG	2	10	130507	130516	60 %	0 %	20 %	20 %	390939308
109	NC_018002	AATAA	2	10	131650	131659	80 %	20 %	0 %	0 %	390939310
110	NC_018002	AACAA	2	10	133702	133711	80 %	0 %	0 %	20 %	390939312
111	NC_018002	AAAAC	2	10	136700	136709	80 %	0 %	0 %	20 %	390939316
112	NC_018002	AGAGA	2	10	138740	138749	60 %	0 %	40 %	0 %	390939318
113	NC_018002	TTATT	2	10	140425	140434	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018002	CAAAC	2	10	140946	140955	60 %	0 %	0 %	40 %	390939320
115	NC_018002	CGAAT	2	10	141993	142002	40 %	20 %	20 %	20 %	390939320
116	NC_018002	CCAAG	2	10	143901	143910	40 %	0 %	20 %	40 %	390939323
117	NC_018002	GGGTG	2	10	143939	143948	0 %	20 %	80 %	0 %	390939323
118	NC_018002	AGTGA	2	10	146307	146316	40 %	20 %	40 %	0 %	390939326
119	NC_018002	AGTAT	2	10	150163	150172	40 %	40 %	20 %	0 %	390939329
120	NC_018002	TGCTT	2	10	152636	152645	0 %	60 %	20 %	20 %	390939332
121	NC_018002	TGGTT	2	10	159729	159738	0 %	60 %	40 %	0 %	390939337
122	NC_018002	TACTC	2	10	160156	160165	20 %	40 %	0 %	40 %	390939337
123	NC_018002	CATTG	2	10	164686	164695	20 %	40 %	20 %	20 %	390939343
124	NC_018002	ATCGT	2	10	165417	165426	20 %	40 %	20 %	20 %	390939343
125	NC_018002	ATACC	2	10	165582	165591	40 %	20 %	0 %	40 %	390939343
126	NC_018002	TTGCT	2	10	166193	166202	0 %	60 %	20 %	20 %	390939344
127	NC_018002	ATTTT	2	10	166977	166986	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018002	TTTAG	2	10	170985	170994	20 %	60 %	20 %	0 %	390939351
129	NC_018002	AATAA	2	10	173424	173433	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018002	TTCTT	2	10	173677	173686	0 %	80 %	0 %	20 %	390939354
131	NC_018002	TAATT	2	10	175935	175944	40 %	60 %	0 %	0 %	390939357
132	NC_018002	AAAAG	2	10	177424	177433	80 %	0 %	20 %	0 %	390939358
133	NC_018002	TTGAA	2	10	177856	177865	40 %	40 %	20 %	0 %	390939359
134	NC_018002	CAAAA	2	10	178279	178288	80 %	0 %	0 %	20 %	390939360
135	NC_018002	TGGTT	2	10	182535	182544	0 %	60 %	40 %	0 %	390939364
136	NC_018002	GGGCT	2	10	183018	183027	0 %	20 %	60 %	20 %	390939364
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264	NC_018002	AAAAT	2	10	348786	348795	80 %	20 %	0 %	0 %	390939536
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