MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 chromosome

Total Repeats: 149709

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_018000	GGC	2	6	139681	139686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350021
3502	NC_018000	TCG	2	6	139728	139733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350021
3503	NC_018000	CAT	2	6	139792	139797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398350021
3504	NC_018000	CGA	2	6	139862	139867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3505	NC_018000	ATG	2	6	139895	139900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398350022
3506	NC_018000	TGG	2	6	139958	139963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398350022
3507	NC_018000	TCCG	2	8	139969	139976	0 %	25 %	25 %	50 %	398350022
3508	NC_018000	GAC	2	6	140038	140043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350022
3509	NC_018000	GATC	2	8	140126	140133	25 %	25 %	25 %	25 %	398350022
3510	NC_018000	GC	3	6	140230	140235	0 %	0 %	50 %	50 %	398350022
3511	NC_018000	CGA	2	6	140337	140342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350022
3512	NC_018000	ATG	2	6	140392	140397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398350022
3513	NC_018000	TCT	2	6	140430	140435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398350022
3514	NC_018000	CTA	2	6	140496	140501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398350022
3515	NC_018000	GAC	2	6	140542	140547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350022
3516	NC_018000	TCG	2	6	140554	140559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350022
3517	NC_018000	CGAGGA	2	12	140651	140662	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	398350023
3518	NC_018000	CGA	2	6	140732	140737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350023
3519	NC_018000	GCC	2	6	140821	140826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350023
3520	NC_018000	ATC	2	6	140862	140867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398350023
3521	NC_018000	GC	3	6	140877	140882	0 %	0 %	50 %	50 %	398350023
3522	NC_018000	AGCG	2	8	140892	140899	25 %	0 %	50 %	25 %	398350023
3523	NC_018000	CGA	2	6	140924	140929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350023
3524	NC_018000	CGT	2	6	140933	140938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350023
3525	NC_018000	GGCG	2	8	140989	140996	0 %	0 %	75 %	25 %	398350023
3526	NC_018000	GCG	2	6	141028	141033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350023
3527	NC_018000	CCG	2	6	141068	141073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350023
3528	NC_018000	CTC	2	6	141111	141116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398350023
3529	NC_018000	TCT	2	6	141145	141150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398350023
3530	NC_018000	CGA	2	6	141197	141202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350023
3531	NC_018000	GCG	2	6	141283	141288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350023
3532	NC_018000	GTC	2	6	141322	141327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_018000	CGT	2	6	141336	141341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3534	NC_018000	AG	3	6	141368	141373	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_018000	TTC	2	6	141401	141406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3536	NC_018000	GCG	2	6	141439	141444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350024
3537	NC_018000	CG	3	6	141473	141478	0 %	0 %	50 %	50 %	398350024
3538	NC_018000	GAT	2	6	141616	141621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398350024
3539	NC_018000	CCA	2	6	141651	141656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398350024
3540	NC_018000	GC	4	8	141722	141729	0 %	0 %	50 %	50 %	398350024
3541	NC_018000	GC	3	6	141743	141748	0 %	0 %	50 %	50 %	398350024
3542	NC_018000	GTC	2	6	141758	141763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350024
3543	NC_018000	CCG	2	6	141791	141796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350024
3544	NC_018000	GCTGC	2	10	141867	141876	0 %	20 %	40 %	40 %	398350024
3545	NC_018000	CTT	2	6	141910	141915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398350024
3546	NC_018000	CTCG	2	8	141927	141934	0 %	25 %	25 %	50 %	398350024
3547	NC_018000	CCG	2	6	142049	142054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3548	NC_018000	CTG	2	6	142183	142188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3549	NC_018000	T	6	6	142194	142199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_018000	TC	4	8	142212	142219	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3551	NC_018000	TTG	2	6	142245	142250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_018000	GCC	2	6	142283	142288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3553	NC_018000	GGC	2	6	142293	142298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_018000	GACG	2	8	142337	142344	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3555	NC_018000	CAA	2	6	142367	142372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	398350025
3556	NC_018000	CGC	2	6	142373	142378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350025
3557	NC_018000	TGCG	2	8	142394	142401	0 %	25 %	50 %	25 %	398350025
3558	NC_018000	CGAG	2	8	142413	142420	25 %	0 %	50 %	25 %	398350025
3559	NC_018000	CCCATC	2	12	142505	142516	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	398350025
3560	NC_018000	TCG	2	6	142517	142522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350025
3561	NC_018000	GCG	2	6	142599	142604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350025
3562	NC_018000	TTC	2	6	142636	142641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398350025
3563	NC_018000	GC	3	6	142684	142689	0 %	0 %	50 %	50 %	398350025
3564	NC_018000	CCA	2	6	142692	142697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398350025
3565	NC_018000	TCA	2	6	142730	142735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398350025
3566	NC_018000	CGA	2	6	142769	142774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350025
3567	NC_018000	CGGC	2	8	142778	142785	0 %	0 %	50 %	50 %	398350025
3568	NC_018000	CAG	2	6	142789	142794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350025
3569	NC_018000	GCC	2	6	142858	142863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350025
3570	NC_018000	ACG	2	6	142880	142885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350025
3571	NC_018000	CGG	2	6	142889	142894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350025
3572	NC_018000	AGGGCG	2	12	142916	142927	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	398350025
3573	NC_018000	TGCG	2	8	142964	142971	0 %	25 %	50 %	25 %	398350025
3574	NC_018000	CGA	2	6	142977	142982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350025
3575	NC_018000	GCG	2	6	143018	143023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350025
3576	NC_018000	CAT	2	6	143076	143081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398350025
3577	NC_018000	CGG	3	9	143100	143108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350025
3578	NC_018000	GCCT	2	8	143122	143129	0 %	25 %	25 %	50 %	398350025
3579	NC_018000	GCG	2	6	143140	143145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350025
3580	NC_018000	TGG	2	6	143156	143161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398350025
3581	NC_018000	GGC	2	6	143185	143190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350025
3582	NC_018000	CGT	2	6	143229	143234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350025
3583	NC_018000	GAG	2	6	143329	143334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398350025
3584	NC_018000	CCG	2	6	143381	143386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350025
3585	NC_018000	GCT	2	6	143415	143420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350025
3586	NC_018000	TGC	2	6	143444	143449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350025
3587	NC_018000	GCC	2	6	143457	143462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350025
3588	NC_018000	CAC	2	6	143469	143474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398350025
3589	NC_018000	GCC	2	6	143476	143481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350025
3590	NC_018000	GCG	2	6	143578	143583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3591	NC_018000	TC	3	6	143656	143661	0 %	50 %	0 %	50 %	398350026
3592	NC_018000	ATC	2	6	143690	143695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398350026
3593	NC_018000	GAT	2	6	143770	143775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398350026
3594	NC_018000	CACCCG	2	12	143791	143802	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	398350026
3595	NC_018000	GCG	2	6	143835	143840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350026
3596	NC_018000	ATC	2	6	143952	143957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398350026
3597	NC_018000	GCT	2	6	143962	143967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350026
3598	NC_018000	TCA	2	6	143997	144002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398350026
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3600	NC_018000	GAG	2	6	144059	144064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398350026
3601	NC_018000	CAA	2	6	144112	144117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	398350026
3602	NC_018000	GC	3	6	144218	144223	0 %	0 %	50 %	50 %	398350026
3603	NC_018000	TGG	2	6	144229	144234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398350026
3604	NC_018000	TCC	2	6	144240	144245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398350026
3605	NC_018000	CGT	2	6	144286	144291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350026
3606	NC_018000	TGA	2	6	144375	144380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398350026
3607	NC_018000	TGCC	2	8	144413	144420	0 %	25 %	25 %	50 %	398350026
3608	NC_018000	CGA	2	6	144445	144450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350026
3609	NC_018000	CGT	2	6	144472	144477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350026
3610	NC_018000	CGA	2	6	144481	144486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350026
3611	NC_018000	CGT	2	6	144538	144543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350026
3612	NC_018000	GGC	2	6	144613	144618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_018000	GC	3	6	144655	144660	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3614	NC_018000	CTG	2	6	144708	144713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3615	NC_018000	CA	3	6	144893	144898	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3616	NC_018000	ACG	2	6	144914	144919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3617	NC_018000	CGT	2	6	144938	144943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3618	NC_018000	GAC	2	6	145010	145015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350027
3619	NC_018000	CGT	2	6	145018	145023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350027
3620	NC_018000	TCG	3	9	145230	145238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350027
3621	NC_018000	GC	3	6	145274	145279	0 %	0 %	50 %	50 %	398350027
3622	NC_018000	GCC	3	9	145298	145306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350027
3623	NC_018000	GGCG	2	8	145313	145320	0 %	0 %	75 %	25 %	398350027
3624	NC_018000	GGA	2	6	145429	145434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398350027
3625	NC_018000	GC	3	6	145543	145548	0 %	0 %	50 %	50 %	398350027
3626	NC_018000	CGG	2	6	145549	145554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350027
3627	NC_018000	TGG	2	6	145557	145562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398350027
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3635	NC_018000	CGA	2	6	145855	145860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350027
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3645	NC_018000	AGGC	2	8	146464	146471	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3646	NC_018000	CGGTG	2	10	146484	146493	0 %	20 %	60 %	20 %	398350029
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3654	NC_018000	GC	3	6	147061	147066	0 %	0 %	50 %	50 %	398350029
3655	NC_018000	GACG	2	8	147079	147086	25 %	0 %	50 %	25 %	398350029
3656	NC_018000	CCGC	2	8	147095	147102	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3657	NC_018000	TGC	2	6	147126	147131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3660	NC_018000	GCCG	2	8	147224	147231	0 %	0 %	50 %	50 %	398350030
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3729	NC_018000	CG	3	6	149960	149965	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3730	NC_018000	TGCT	2	8	149990	149997	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3731	NC_018000	AGCG	2	8	150024	150031	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3732	NC_018000	GC	3	6	150064	150069	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3733	NC_018000	CAC	2	6	150120	150125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3734	NC_018000	GCCC	2	8	150267	150274	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3735	NC_018000	GCAGGG	2	12	150279	150290	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
3736	NC_018000	TCG	2	6	150299	150304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3737	NC_018000	GCCG	2	8	150417	150424	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3738	NC_018000	GAC	2	6	150459	150464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3739	NC_018000	T	6	6	150487	150492	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3740	NC_018000	TCT	2	6	150569	150574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3741	NC_018000	CGC	2	6	150615	150620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3742	NC_018000	TGC	2	6	150625	150630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3743	NC_018000	GATG	2	8	150636	150643	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3744	NC_018000	GCCC	2	8	150705	150712	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3745	NC_018000	CTG	2	6	150736	150741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3746	NC_018000	GAA	2	6	150766	150771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3747	NC_018000	CGG	2	6	150847	150852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350032
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3867	NC_018000	GCC	2	6	156198	156203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350040
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3987	NC_018000	TCA	2	6	160492	160497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398350042
3988	NC_018000	GCG	2	6	160502	160507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350042
3989	NC_018000	GAT	2	6	160523	160528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398350042
3990	NC_018000	AGCG	2	8	160566	160573	25 %	0 %	50 %	25 %	398350042
3991	NC_018000	CG	3	6	160588	160593	0 %	0 %	50 %	50 %	398350042
3992	NC_018000	TCA	3	9	160669	160677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398350042
3993	NC_018000	CGC	2	6	160789	160794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350042
3994	NC_018000	GC	3	6	160810	160815	0 %	0 %	50 %	50 %	398350042
3995	NC_018000	GGCC	2	8	160818	160825	0 %	0 %	50 %	50 %	398350042
3996	NC_018000	GTC	2	6	160826	160831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350042
3997	NC_018000	GC	3	6	160885	160890	0 %	0 %	50 %	50 %	398350042
3998	NC_018000	GAT	2	6	160916	160921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398350042
3999	NC_018000	CGG	2	6	160945	160950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350042
4000	NC_018000	TCT	2	6	160960	160965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398350042

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