MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 chromosome

Total Repeats: 149709

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_018000	GCG	2	6	100157	100162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349988
2502	NC_018000	AGG	2	6	100223	100228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398349988
2503	NC_018000	CGG	2	6	100239	100244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349988
2504	NC_018000	GCG	2	6	100251	100256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349988
2505	NC_018000	CGGC	2	8	100263	100270	0 %	0 %	50 %	50 %	398349988
2506	NC_018000	GCG	3	9	100301	100309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349988
2507	NC_018000	GAC	2	6	100357	100362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349988
2508	NC_018000	GCG	2	6	100396	100401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349988
2509	NC_018000	GTA	2	6	100414	100419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398349988
2510	NC_018000	ATCG	2	8	100429	100436	25 %	25 %	25 %	25 %	398349988
2511	NC_018000	GC	3	6	100513	100518	0 %	0 %	50 %	50 %	398349988
2512	NC_018000	CGG	2	6	100530	100535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349988
2513	NC_018000	AGGC	2	8	100544	100551	25 %	0 %	50 %	25 %	398349988
2514	NC_018000	CGG	2	6	100596	100601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349988
2515	NC_018000	CGA	2	6	100653	100658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349988
2516	NC_018000	AGCCG	2	10	100705	100714	20 %	0 %	40 %	40 %	398349988
2517	NC_018000	GCG	2	6	100715	100720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349988
2518	NC_018000	TGC	2	6	100729	100734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349988
2519	NC_018000	TGG	2	6	100746	100751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398349988
2520	NC_018000	GCC	2	6	100787	100792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349988
2521	NC_018000	CGG	2	6	100812	100817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349988
2522	NC_018000	GC	3	6	100825	100830	0 %	0 %	50 %	50 %	398349988
2523	NC_018000	CGGC	2	8	100845	100852	0 %	0 %	50 %	50 %	398349988
2524	NC_018000	CGA	2	6	100878	100883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349988
2525	NC_018000	TCG	2	6	100925	100930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349988
2526	NC_018000	GCGAT	2	10	100949	100958	20 %	20 %	40 %	20 %	398349988
2527	NC_018000	AGG	2	6	100965	100970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398349988
2528	NC_018000	GGC	2	6	100992	100997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349988
2529	NC_018000	AAGC	2	8	101007	101014	50 %	0 %	25 %	25 %	398349988
2530	NC_018000	CGTG	2	8	101022	101029	0 %	25 %	50 %	25 %	398349988
2531	NC_018000	GGC	2	6	101055	101060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349988
2532	NC_018000	CGAC	2	8	101072	101079	25 %	0 %	25 %	50 %	398349988
2533	NC_018000	CTT	2	6	101082	101087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398349988
2534	NC_018000	TGG	2	6	101169	101174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398349988
2535	NC_018000	GTCG	2	8	101218	101225	0 %	25 %	50 %	25 %	398349988
2536	NC_018000	AGC	2	6	101231	101236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349988
2537	NC_018000	TCC	2	6	101297	101302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398349988
2538	NC_018000	GC	3	6	101316	101321	0 %	0 %	50 %	50 %	398349988
2539	NC_018000	ATG	2	6	101366	101371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398349988
2540	NC_018000	GCCG	2	8	101373	101380	0 %	0 %	50 %	50 %	398349988
2541	NC_018000	CCG	2	6	101383	101388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349988
2542	NC_018000	ACG	2	6	101444	101449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349988
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2544	NC_018000	AGA	2	6	101501	101506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398349988
2545	NC_018000	GCA	2	6	101601	101606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349988
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2548	NC_018000	GTA	2	6	101749	101754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398349988
2549	NC_018000	CGG	3	9	101766	101774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349988
2550	NC_018000	CGC	2	6	101779	101784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349988
2551	NC_018000	GC	3	6	101831	101836	0 %	0 %	50 %	50 %	398349988
2552	NC_018000	TCG	2	6	101852	101857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349988
2553	NC_018000	CAT	2	6	101887	101892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398349988
2554	NC_018000	CGC	2	6	101910	101915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349988
2555	NC_018000	CGC	2	6	101931	101936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349988
2556	NC_018000	ACC	2	6	102008	102013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398349988
2557	NC_018000	GGC	2	6	102025	102030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349988
2558	NC_018000	AGCG	2	8	102041	102048	25 %	0 %	50 %	25 %	398349988
2559	NC_018000	GCC	3	9	102049	102057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349988
2560	NC_018000	CCTGAA	2	12	102212	102223	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	398349988
2561	NC_018000	GCGG	2	8	102253	102260	0 %	0 %	75 %	25 %	398349988
2562	NC_018000	GCG	3	9	102266	102274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349988
2563	NC_018000	CGA	2	6	102306	102311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349988
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2569	NC_018000	TCC	2	6	102475	102480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398349988
2570	NC_018000	CATC	2	8	102546	102553	25 %	25 %	0 %	50 %	398349988
2571	NC_018000	CTG	2	6	102567	102572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349988
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2577	NC_018000	GCCTA	2	10	102962	102971	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2578	NC_018000	CGG	2	6	103072	103077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349990
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2581	NC_018000	GCT	2	6	103150	103155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349990
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2587	NC_018000	CCGG	2	8	103357	103364	0 %	0 %	50 %	50 %	398349990
2588	NC_018000	CTGT	2	8	103382	103389	0 %	50 %	25 %	25 %	398349990
2589	NC_018000	ACGGC	2	10	103476	103485	20 %	0 %	40 %	40 %	398349990
2590	NC_018000	CTG	2	6	103505	103510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349990
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2593	NC_018000	CG	3	6	103643	103648	0 %	0 %	50 %	50 %	398349990
2594	NC_018000	ACC	2	6	103680	103685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398349990
2595	NC_018000	ATCCGC	2	12	103688	103699	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	398349990
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2598	NC_018000	CGT	2	6	103763	103768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349990
2599	NC_018000	GGGC	2	8	103817	103824	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2600	NC_018000	AAT	2	6	103830	103835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_018000	CTC	2	6	103848	103853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2602	NC_018000	AT	3	6	103978	103983	50 %	50 %	0 %	0 %	398349991
2603	NC_018000	TGA	2	6	104020	104025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398349991
2604	NC_018000	CGG	2	6	104090	104095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349992
2605	NC_018000	AGC	2	6	104128	104133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349992
2606	NC_018000	GATC	2	8	104197	104204	25 %	25 %	25 %	25 %	398349992
2607	NC_018000	CTG	2	6	104217	104222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349992
2608	NC_018000	GCC	2	6	104225	104230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349992
2609	NC_018000	TCA	2	6	104257	104262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398349992
2610	NC_018000	CCATG	2	10	104282	104291	20 %	20 %	20 %	40 %	398349992
2611	NC_018000	GAC	2	6	104315	104320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349992
2612	NC_018000	GCT	2	6	104324	104329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349992
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2614	NC_018000	CGG	3	9	104383	104391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349992
2615	NC_018000	GACG	2	8	104421	104428	25 %	0 %	50 %	25 %	398349992
2616	NC_018000	CGG	2	6	104531	104536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349992
2617	NC_018000	CAC	2	6	104573	104578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398349992
2618	NC_018000	TCG	2	6	104605	104610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349992
2619	NC_018000	CG	3	6	104643	104648	0 %	0 %	50 %	50 %	398349992
2620	NC_018000	GGT	2	6	104654	104659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398349992
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2622	NC_018000	GC	3	6	104817	104822	0 %	0 %	50 %	50 %	398349992
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2746	NC_018000	CG	3	6	109961	109966	0 %	0 %	50 %	50 %	398349998
2747	NC_018000	TCG	2	6	109989	109994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349998
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2862	NC_018000	GAT	2	6	113960	113965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398350001
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2866	NC_018000	CCGC	2	8	114114	114121	0 %	0 %	25 %	75 %	398350002
2867	NC_018000	GAT	2	6	114232	114237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398350002
2868	NC_018000	GC	4	8	114323	114330	0 %	0 %	50 %	50 %	398350002
2869	NC_018000	GGC	2	6	114551	114556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350002
2870	NC_018000	CGC	3	9	114583	114591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350002
2871	NC_018000	GTC	2	6	114605	114610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350002
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2873	NC_018000	CGTC	2	8	114679	114686	0 %	25 %	25 %	50 %	398350002
2874	NC_018000	ATCCAT	2	12	114752	114763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398350002
2875	NC_018000	TCA	2	6	114786	114791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398350002
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2894	NC_018000	CGG	2	6	115565	115570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2895	NC_018000	ATG	2	6	115575	115580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2986	NC_018000	GGT	2	6	119155	119160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398350007
2987	NC_018000	AGC	2	6	119178	119183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350007
2988	NC_018000	TCG	2	6	119223	119228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350007
2989	NC_018000	ATC	2	6	119280	119285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398350007
2990	NC_018000	CCG	2	6	119322	119327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350007
2991	NC_018000	GCG	2	6	119355	119360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350007
2992	NC_018000	GGC	2	6	119372	119377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350007
2993	NC_018000	GTG	2	6	119411	119416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398350007
2994	NC_018000	GCC	2	6	119424	119429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350007
2995	NC_018000	CG	3	6	119453	119458	0 %	0 %	50 %	50 %	398350007
2996	NC_018000	GGC	2	6	119465	119470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350007
2997	NC_018000	TCG	2	6	119488	119493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350007
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