MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 chromosome

Total Repeats: 149709

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_018000	ACCG	2	8	80557	80564	25 %	0 %	25 %	50 %	398349972
2002	NC_018000	CGAC	2	8	80620	80627	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2003	NC_018000	GCG	2	6	80698	80703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349973
2004	NC_018000	GGC	2	6	80726	80731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349973
2005	NC_018000	CTGTTC	2	12	80741	80752	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	398349973
2006	NC_018000	GAG	2	6	80850	80855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398349973
2007	NC_018000	TGA	2	6	80884	80889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398349973
2008	NC_018000	TCG	3	9	80892	80900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349973
2009	NC_018000	GC	3	6	80950	80955	0 %	0 %	50 %	50 %	398349973
2010	NC_018000	GCC	2	6	81005	81010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349973
2011	NC_018000	AGG	2	6	81027	81032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398349973
2012	NC_018000	GCCTT	2	10	81081	81090	0 %	40 %	20 %	40 %	398349973
2013	NC_018000	ACG	2	6	81105	81110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349973
2014	NC_018000	GATC	2	8	81124	81131	25 %	25 %	25 %	25 %	398349973
2015	NC_018000	CTT	2	6	81140	81145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398349973
2016	NC_018000	AGG	2	6	81162	81167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398349973
2017	NC_018000	CCT	2	6	81178	81183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398349973
2018	NC_018000	TC	5	10	81220	81229	0 %	50 %	0 %	50 %	398349973
2019	NC_018000	CCG	2	6	81255	81260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2020	NC_018000	CCAG	2	8	81265	81272	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2021	NC_018000	GCG	2	6	81280	81285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2022	NC_018000	GC	3	6	81393	81398	0 %	0 %	50 %	50 %	398349974
2023	NC_018000	TTC	2	6	81401	81406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398349974
2024	NC_018000	ACA	2	6	81436	81441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	398349974
2025	NC_018000	GCCG	2	8	81456	81463	0 %	0 %	50 %	50 %	398349974
2026	NC_018000	CTT	2	6	81464	81469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398349974
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2029	NC_018000	GAG	2	6	81569	81574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398349974
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2031	NC_018000	CGT	2	6	81589	81594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349974
2032	NC_018000	TCT	2	6	81595	81600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398349974
2033	NC_018000	GGCG	2	8	81610	81617	0 %	0 %	75 %	25 %	398349974
2034	NC_018000	CGTAGC	2	12	81715	81726	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	398349974
2035	NC_018000	CGA	2	6	81736	81741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349974
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2038	NC_018000	CGA	2	6	81853	81858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349974
2039	NC_018000	CGA	2	6	81872	81877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349974
2040	NC_018000	CGG	2	6	81926	81931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349974
2041	NC_018000	CGC	2	6	81952	81957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349974
2042	NC_018000	CGGC	2	8	81971	81978	0 %	0 %	50 %	50 %	398349974
2043	NC_018000	TTG	2	6	82002	82007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	398349974
2044	NC_018000	GCCGG	2	10	82037	82046	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2045	NC_018000	TGG	2	6	82087	82092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2046	NC_018000	AAAGG	2	10	82119	82128	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
2047	NC_018000	CCG	2	6	82191	82196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349975
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2061	NC_018000	CTG	2	6	82696	82701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349975
2062	NC_018000	GTC	2	6	82714	82719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349975
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2111	NC_018000	T	6	6	84749	84754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2112	NC_018000	AGGG	2	8	84824	84831	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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2238	NC_018000	TCGTT	2	10	89231	89240	0 %	60 %	20 %	20 %	398349980
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2248	NC_018000	CAT	2	6	89727	89732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398349981
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2250	NC_018000	TGA	2	6	89780	89785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398349981
2251	NC_018000	CTG	2	6	89836	89841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349981
2252	NC_018000	CGA	2	6	89946	89951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349981
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2284	NC_018000	GGC	2	6	91222	91227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2287	NC_018000	CCT	2	6	91478	91483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2288	NC_018000	TGC	2	6	91523	91528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2322	NC_018000	CG	3	6	92824	92829	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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2378	NC_018000	GGT	2	6	95602	95607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398349984
2379	NC_018000	CGCT	2	8	95624	95631	0 %	25 %	25 %	50 %	398349984
2380	NC_018000	CAC	2	6	95641	95646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398349984
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