MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 chromosome

Total Repeats: 149709

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_018000	CG	3	6	61546	61551	0 %	0 %	50 %	50 %	398349956
1502	NC_018000	CGC	2	6	61562	61567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349956
1503	NC_018000	CAT	2	6	61585	61590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398349956
1504	NC_018000	CGC	2	6	61595	61600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349956
1505	NC_018000	CGC	2	6	61602	61607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349956
1506	NC_018000	GGCGC	2	10	61618	61627	0 %	0 %	60 %	40 %	398349956
1507	NC_018000	TGG	2	6	61631	61636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398349956
1508	NC_018000	CGG	2	6	61671	61676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349956
1509	NC_018000	TCG	2	6	61686	61691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349956
1510	NC_018000	CAC	2	6	61705	61710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398349956
1511	NC_018000	TCGG	2	8	61714	61721	0 %	25 %	50 %	25 %	398349956
1512	NC_018000	ATCG	2	8	61754	61761	25 %	25 %	25 %	25 %	398349956
1513	NC_018000	GCG	2	6	61779	61784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349956
1514	NC_018000	CGA	2	6	61885	61890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349956
1515	NC_018000	GGC	2	6	61897	61902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349956
1516	NC_018000	GC	3	6	61910	61915	0 %	0 %	50 %	50 %	398349956
1517	NC_018000	CCG	2	6	61943	61948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349956
1518	NC_018000	GAA	2	6	62020	62025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398349957
1519	NC_018000	CAT	2	6	62047	62052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398349957
1520	NC_018000	GCA	2	6	62058	62063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349957
1521	NC_018000	GCA	2	6	62118	62123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349957
1522	NC_018000	GAC	2	6	62137	62142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349957
1523	NC_018000	A	6	6	62166	62171	100 %	0 %	0 %	0 %	398349957
1524	NC_018000	CCT	2	6	62189	62194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398349957
1525	NC_018000	CGAG	2	8	62195	62202	25 %	0 %	50 %	25 %	398349957
1526	NC_018000	AGG	2	6	62204	62209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398349957
1527	NC_018000	GTG	2	6	62261	62266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398349957
1528	NC_018000	GCG	2	6	62315	62320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349957
1529	NC_018000	GCA	2	6	62334	62339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349957
1530	NC_018000	CGA	3	9	62355	62363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349957
1531	NC_018000	TAG	2	6	62420	62425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398349957
1532	NC_018000	GCC	2	6	62427	62432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349957
1533	NC_018000	GCC	2	6	62497	62502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349957
1534	NC_018000	CAG	2	6	62548	62553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349957
1535	NC_018000	CGA	2	6	62614	62619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349958
1536	NC_018000	CGG	2	6	62653	62658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349958
1537	NC_018000	TCG	2	6	62670	62675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349958
1538	NC_018000	CGA	2	6	62695	62700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349958
1539	NC_018000	ACC	2	6	62712	62717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398349958
1540	NC_018000	TGA	2	6	62731	62736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398349958
1541	NC_018000	CCG	2	6	62754	62759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349958
1542	NC_018000	GTG	2	6	62760	62765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398349958
1543	NC_018000	GCC	3	9	62776	62784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349958
1544	NC_018000	TGC	2	6	62830	62835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349958
1545	NC_018000	AAG	2	6	62841	62846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398349958
1546	NC_018000	GC	3	6	62908	62913	0 %	0 %	50 %	50 %	398349958
1547	NC_018000	CG	4	8	62917	62924	0 %	0 %	50 %	50 %	398349958
1548	NC_018000	CGA	2	6	62941	62946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349958
1549	NC_018000	GGC	2	6	62999	63004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349958
1550	NC_018000	CGG	2	6	63031	63036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349958
1551	NC_018000	TCG	2	6	63052	63057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349958
1552	NC_018000	TG	3	6	63123	63128	0 %	50 %	50 %	0 %	398349958
1553	NC_018000	CGC	2	6	63139	63144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349958
1554	NC_018000	CGC	2	6	63190	63195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349958
1555	NC_018000	CCGG	2	8	63206	63213	0 %	0 %	50 %	50 %	398349958
1556	NC_018000	GCCG	2	8	63226	63233	0 %	0 %	50 %	50 %	398349958
1557	NC_018000	CGA	2	6	63277	63282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349958
1558	NC_018000	CAG	2	6	63310	63315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349958
1559	NC_018000	GAG	2	6	63323	63328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398349958
1560	NC_018000	TCG	2	6	63360	63365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349958
1561	NC_018000	TGA	2	6	63370	63375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398349958
1562	NC_018000	GGCG	2	8	63418	63425	0 %	0 %	75 %	25 %	398349958
1563	NC_018000	CCG	2	6	63427	63432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349958
1564	NC_018000	CGA	2	6	63433	63438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349958
1565	NC_018000	GCC	2	6	63449	63454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349958
1566	NC_018000	CCCG	2	8	63472	63479	0 %	0 %	25 %	75 %	398349958
1567	NC_018000	GCC	2	6	63488	63493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349958
1568	NC_018000	GGC	2	6	63527	63532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349958
1569	NC_018000	TCG	2	6	63534	63539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349958
1570	NC_018000	ACG	2	6	63549	63554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349958
1571	NC_018000	CGC	2	6	63632	63637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349958
1572	NC_018000	CGA	2	6	63643	63648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349958
1573	NC_018000	GCG	2	6	63670	63675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349958
1574	NC_018000	CGC	2	6	63703	63708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349958
1575	NC_018000	GCG	2	6	63744	63749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349958
1576	NC_018000	ATCGG	2	10	63759	63768	20 %	20 %	40 %	20 %	398349958
1577	NC_018000	GATGCC	2	12	63918	63929	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1578	NC_018000	AGA	2	6	64027	64032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398349959
1579	NC_018000	ATC	2	6	64068	64073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398349959
1580	NC_018000	CAC	2	6	64142	64147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398349959
1581	NC_018000	ATG	2	6	64152	64157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398349959
1582	NC_018000	TCA	2	6	64171	64176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398349959
1583	NC_018000	GAGCTC	2	12	64238	64249	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	398349959
1584	NC_018000	CGA	2	6	64261	64266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349959
1585	NC_018000	TTC	2	6	64278	64283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398349959
1586	NC_018000	CGA	2	6	64294	64299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349959
1587	NC_018000	GTT	2	6	64328	64333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	398349959
1588	NC_018000	CGC	2	6	64336	64341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349959
1589	NC_018000	GCC	2	6	64365	64370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349959
1590	NC_018000	ATG	2	6	64371	64376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398349959
1591	NC_018000	GAT	2	6	64394	64399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398349959
1592	NC_018000	GCA	3	9	64408	64416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349959
1593	NC_018000	AGC	3	9	64452	64460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349959
1594	NC_018000	CTG	2	6	64502	64507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349959
1595	NC_018000	GTCC	2	8	64517	64524	0 %	25 %	25 %	50 %	398349959
1596	NC_018000	GGC	2	6	64542	64547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349959
1597	NC_018000	CGG	2	6	64555	64560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349959
1598	NC_018000	GGC	2	6	64574	64579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349959
1599	NC_018000	GGA	2	6	64592	64597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398349959
1600	NC_018000	CGG	2	6	64627	64632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349959
1601	NC_018000	CAA	2	6	64688	64693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	398349959
1602	NC_018000	TCG	2	6	64749	64754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349959
1603	NC_018000	GC	3	6	64892	64897	0 %	0 %	50 %	50 %	398349959
1604	NC_018000	GCC	2	6	64980	64985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349959
1605	NC_018000	TCG	2	6	65010	65015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349959
1606	NC_018000	GCC	2	6	65063	65068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349959
1607	NC_018000	GCG	3	9	65092	65100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349959
1608	NC_018000	CGC	2	6	65164	65169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349959
1609	NC_018000	CGT	2	6	65183	65188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349959
1610	NC_018000	CTC	2	6	65192	65197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398349959
1611	NC_018000	TCC	2	6	65334	65339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398349959
1612	NC_018000	GCC	2	6	65414	65419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349959
1613	NC_018000	CCG	2	6	65502	65507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349959
1614	NC_018000	GCTC	2	8	65531	65538	0 %	25 %	25 %	50 %	398349959
1615	NC_018000	GAA	2	6	65540	65545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398349959
1616	NC_018000	GAA	2	6	65561	65566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398349959
1617	NC_018000	ATG	2	6	65586	65591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398349959
1618	NC_018000	GCG	2	6	65637	65642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349959
1619	NC_018000	TGA	2	6	65740	65745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398349959
1620	NC_018000	ACCAGC	2	12	65769	65780	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	398349959
1621	NC_018000	GAT	2	6	65789	65794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398349959
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1623	NC_018000	ACG	2	6	65880	65885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349959
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