MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 chromosome

Total Repeats: 149709

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_018000	CG	3	6	40631	40636	0 %	0 %	50 %	50 %	398349935
1002	NC_018000	GCCG	2	8	40659	40666	0 %	0 %	50 %	50 %	398349935
1003	NC_018000	GTT	2	6	40687	40692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	398349935
1004	NC_018000	AGC	2	6	40712	40717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349935
1005	NC_018000	GGC	2	6	40721	40726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349935
1006	NC_018000	GC	3	6	40831	40836	0 %	0 %	50 %	50 %	398349935
1007	NC_018000	CGG	2	6	40908	40913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349935
1008	NC_018000	TCG	2	6	40937	40942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349935
1009	NC_018000	TGC	2	6	40953	40958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349935
1010	NC_018000	GAG	2	6	41100	41105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_018000	GAG	2	6	41195	41200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398349936
1012	NC_018000	GGC	3	9	41212	41220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349936
1013	NC_018000	CTG	2	6	41279	41284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349936
1014	NC_018000	CGC	2	6	41305	41310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349936
1015	NC_018000	GGC	2	6	41436	41441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349936
1016	NC_018000	CGA	2	6	41503	41508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349936
1017	NC_018000	CTA	2	6	41575	41580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398349936
1018	NC_018000	GC	3	6	41597	41602	0 %	0 %	50 %	50 %	398349936
1019	NC_018000	CCG	2	6	41604	41609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349936
1020	NC_018000	GTG	2	6	41649	41654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_018000	GAT	2	6	41674	41679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398349937
1022	NC_018000	TC	3	6	41726	41731	0 %	50 %	0 %	50 %	398349937
1023	NC_018000	GCCT	2	8	41753	41760	0 %	25 %	25 %	50 %	398349937
1024	NC_018000	TTGG	2	8	41761	41768	0 %	50 %	50 %	0 %	398349937
1025	NC_018000	GCC	2	6	41817	41822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349937
1026	NC_018000	CGG	3	9	41861	41869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349937
1027	NC_018000	GCT	2	6	41872	41877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349937
1028	NC_018000	GTC	2	6	41920	41925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349937
1029	NC_018000	TCG	2	6	41943	41948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349937
1030	NC_018000	CGGC	2	8	42061	42068	0 %	0 %	50 %	50 %	398349937
1031	NC_018000	GTC	2	6	42086	42091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349937
1032	NC_018000	GCC	3	9	42161	42169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349937
1033	NC_018000	CTA	2	6	42259	42264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398349937
1034	NC_018000	GCT	2	6	42298	42303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349937
1035	NC_018000	TCG	2	6	42312	42317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349937
1036	NC_018000	ACC	2	6	42378	42383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398349937
1037	NC_018000	AGTC	2	8	42400	42407	25 %	25 %	25 %	25 %	398349937
1038	NC_018000	GCA	2	6	42429	42434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349937
1039	NC_018000	TGT	2	6	42435	42440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	398349937
1040	NC_018000	GCGG	2	8	42453	42460	0 %	0 %	75 %	25 %	398349937
1041	NC_018000	GC	3	6	42467	42472	0 %	0 %	50 %	50 %	398349937
1042	NC_018000	GCC	2	6	42509	42514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1043	NC_018000	CGA	2	6	42617	42622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349938
1044	NC_018000	GC	3	6	42633	42638	0 %	0 %	50 %	50 %	398349938
1045	NC_018000	GACG	2	8	42728	42735	25 %	0 %	50 %	25 %	398349938
1046	NC_018000	GCC	2	6	42817	42822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349938
1047	NC_018000	GAA	2	6	42833	42838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398349938
1048	NC_018000	GCGA	2	8	42846	42853	25 %	0 %	50 %	25 %	398349938
1049	NC_018000	CG	3	6	42921	42926	0 %	0 %	50 %	50 %	398349938
1050	NC_018000	CGG	2	6	42928	42933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349938
1051	NC_018000	GCG	2	6	42997	43002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349938
1052	NC_018000	CGT	2	6	43007	43012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349938
1053	NC_018000	CCCGTG	2	12	43075	43086	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	398349938
1054	NC_018000	AGG	2	6	43111	43116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398349938
1055	NC_018000	GTG	2	6	43143	43148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398349938
1056	NC_018000	ATC	2	6	43191	43196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398349938
1057	NC_018000	CGG	2	6	43220	43225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349938
1058	NC_018000	GCT	2	6	43241	43246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349938
1059	NC_018000	TGT	2	6	43312	43317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	398349938
1060	NC_018000	GCTAC	2	10	43349	43358	20 %	20 %	20 %	40 %	398349938
1061	NC_018000	ACC	2	6	43359	43364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398349938
1062	NC_018000	CG	3	6	43372	43377	0 %	0 %	50 %	50 %	398349938
1063	NC_018000	CGAT	2	8	43407	43414	25 %	25 %	25 %	25 %	398349938
1064	NC_018000	ATCTGC	2	12	43432	43443	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	398349938
1065	NC_018000	CGG	2	6	43495	43500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349938
1066	NC_018000	TCG	2	6	43570	43575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349938
1067	NC_018000	GAG	2	6	43593	43598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398349938
1068	NC_018000	TCG	2	6	43621	43626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349938
1069	NC_018000	CAG	2	6	43764	43769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349938
1070	NC_018000	CGC	3	9	43778	43786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349938
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1072	NC_018000	GGCC	2	8	43934	43941	0 %	0 %	50 %	50 %	398349938
1073	NC_018000	CG	3	6	44048	44053	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1074	NC_018000	GAG	2	6	44072	44077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_018000	AAC	2	6	44175	44180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	398349939
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1078	NC_018000	ACCA	2	8	44301	44308	50 %	0 %	0 %	50 %	398349939
1079	NC_018000	GGCGC	2	10	44309	44318	0 %	0 %	60 %	40 %	398349939
1080	NC_018000	GC	4	8	44315	44322	0 %	0 %	50 %	50 %	398349939
1081	NC_018000	TCGA	2	8	44358	44365	25 %	25 %	25 %	25 %	398349939
1082	NC_018000	CGA	2	6	44408	44413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349939
1083	NC_018000	AAG	2	6	44478	44483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398349939
1084	NC_018000	GC	3	6	44493	44498	0 %	0 %	50 %	50 %	398349939
1085	NC_018000	CGGCC	2	10	44558	44567	0 %	0 %	40 %	60 %	398349939
1086	NC_018000	GCGCG	2	10	44618	44627	0 %	0 %	60 %	40 %	398349939
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1089	NC_018000	GGCG	2	8	44663	44670	0 %	0 %	75 %	25 %	398349939
1090	NC_018000	CGGCT	2	10	44673	44682	0 %	20 %	40 %	40 %	398349939
1091	NC_018000	ACG	2	6	44734	44739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349939
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1095	NC_018000	CGA	2	6	44858	44863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349939
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1097	NC_018000	CG	3	6	44965	44970	0 %	0 %	50 %	50 %	398349939
1098	NC_018000	TCG	2	6	44986	44991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349939
1099	NC_018000	GT	3	6	45022	45027	0 %	50 %	50 %	0 %	398349939
1100	NC_018000	TGG	2	6	45070	45075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398349939
1101	NC_018000	ATG	2	6	45161	45166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398349940
1102	NC_018000	GGA	2	6	45211	45216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398349940
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1104	NC_018000	AGC	2	6	45282	45287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349940
1105	NC_018000	GCC	2	6	45301	45306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349940
1106	NC_018000	CGA	2	6	45328	45333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349940
1107	NC_018000	CAT	2	6	45451	45456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398349940
1108	NC_018000	GAG	2	6	45509	45514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398349940
1109	NC_018000	TCT	2	6	45526	45531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398349940
1110	NC_018000	TCC	2	6	45543	45548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398349940
1111	NC_018000	GAC	2	6	45575	45580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349940
1112	NC_018000	GAG	2	6	45719	45724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398349941
1113	NC_018000	AGT	3	9	45755	45763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398349941
1114	NC_018000	ACC	2	6	45764	45769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398349941
1115	NC_018000	CAA	2	6	45784	45789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	398349941
1116	NC_018000	GGTGCG	2	12	45833	45844	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	398349941
1117	NC_018000	TGA	2	6	45876	45881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398349941
1118	NC_018000	GAG	2	6	45914	45919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398349941
1119	NC_018000	CAA	2	6	45931	45936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	398349941
1120	NC_018000	TCC	2	6	45939	45944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398349941
1121	NC_018000	GAA	2	6	46043	46048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398349941
1122	NC_018000	GAC	2	6	46088	46093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349941
1123	NC_018000	CG	3	6	46095	46100	0 %	0 %	50 %	50 %	398349941
1124	NC_018000	CCG	3	9	46153	46161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349941
1125	NC_018000	GCC	2	6	46184	46189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349941
1126	NC_018000	CGC	2	6	46203	46208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349941
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1167	NC_018000	GTG	2	6	47508	47513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1231	NC_018000	T	6	6	50024	50029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1232	NC_018000	CTC	2	6	50063	50068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1233	NC_018000	GCG	2	6	50102	50107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1234	NC_018000	AT	3	6	50122	50127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1236	NC_018000	GC	3	6	50209	50214	0 %	0 %	50 %	50 %	398349946
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1249	NC_018000	CCG	2	6	50664	50669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349946
1250	NC_018000	CTA	2	6	50689	50694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398349946
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1252	NC_018000	AAG	2	6	50732	50737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398349946
1253	NC_018000	CGAG	2	8	50811	50818	25 %	0 %	50 %	25 %	398349946
1254	NC_018000	GTC	2	6	50819	50824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349946
1255	NC_018000	CGA	2	6	50851	50856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349946
1256	NC_018000	CGA	2	6	50932	50937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349946
1257	NC_018000	CGG	2	6	50977	50982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349946
1258	NC_018000	ATC	2	6	51017	51022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398349946
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1260	NC_018000	CCGCA	2	10	51042	51051	20 %	0 %	20 %	60 %	398349946
1261	NC_018000	CGG	3	9	51052	51060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349946
1262	NC_018000	ACC	2	6	51080	51085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398349946
1263	NC_018000	GCC	2	6	51101	51106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349946
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1265	NC_018000	GAA	2	6	51127	51132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398349946
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1269	NC_018000	CGC	2	6	51302	51307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349946
1270	NC_018000	CAA	2	6	51319	51324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	398349946
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1273	NC_018000	GCCGC	2	10	51462	51471	0 %	0 %	40 %	60 %	398349946
1274	NC_018000	ACA	2	6	51511	51516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1275	NC_018000	AC	4	8	51544	51551	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1276	NC_018000	TCGA	2	8	51667	51674	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1277	NC_018000	GAA	2	6	51696	51701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1278	NC_018000	CCGCG	2	10	51715	51724	0 %	0 %	40 %	60 %	398349947
1279	NC_018000	GCC	2	6	51749	51754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349947
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1281	NC_018000	CTG	2	6	51866	51871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349947
1282	NC_018000	CGG	2	6	51903	51908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349947
1283	NC_018000	TCAT	2	8	51920	51927	25 %	50 %	0 %	25 %	398349947
1284	NC_018000	GCG	2	6	51931	51936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349947
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1290	NC_018000	CGG	2	6	52197	52202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349947
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1293	NC_018000	GCA	2	6	52446	52451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1294	NC_018000	CTC	2	6	52517	52522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1379	NC_018000	GAC	2	6	56011	56016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349951
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1382	NC_018000	GAC	2	6	56134	56139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349951
1383	NC_018000	GAC	2	6	56198	56203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349951
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1401	NC_018000	ACGA	2	8	57091	57098	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1402	NC_018000	TCGC	2	8	57119	57126	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1403	NC_018000	ATC	2	6	57138	57143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1466	NC_018000	ACT	2	6	60176	60181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1469	NC_018000	GC	3	6	60268	60273	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1470	NC_018000	AG	3	6	60282	60287	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1471	NC_018000	CAT	2	6	60314	60319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398349955
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1494	NC_018000	GCGG	3	12	61160	61171	0 %	0 %	75 %	25 %	398349955
1495	NC_018000	GTCCT	2	10	61340	61349	0 %	40 %	20 %	40 %	398349956
1496	NC_018000	GCCG	2	8	61379	61386	0 %	0 %	50 %	50 %	398349956
1497	NC_018000	CG	3	6	61437	61442	0 %	0 %	50 %	50 %	398349956
1498	NC_018000	GCC	2	6	61493	61498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349956
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1500	NC_018000	GCC	2	6	61531	61536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349956

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