MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 chromosome

Total Repeats: 149709

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_018000	CTT	2	6	555125	555130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398350397
13002	NC_018000	CGA	2	6	555163	555168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350397
13003	NC_018000	GC	3	6	555221	555226	0 %	0 %	50 %	50 %	398350397
13004	NC_018000	CGG	2	6	555262	555267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350397
13005	NC_018000	GAA	2	6	555285	555290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398350397
13006	NC_018000	CGG	2	6	555298	555303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13007	NC_018000	CGCC	2	8	555310	555317	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13008	NC_018000	CCA	2	6	555337	555342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13009	NC_018000	CGG	2	6	555374	555379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350398
13010	NC_018000	GCCG	2	8	555380	555387	0 %	0 %	50 %	50 %	398350398
13011	NC_018000	TCG	2	6	555415	555420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350398
13012	NC_018000	GCC	2	6	555445	555450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350398
13013	NC_018000	TGC	3	9	555475	555483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350398
13014	NC_018000	GCA	2	6	555497	555502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350398
13015	NC_018000	GGCT	2	8	555519	555526	0 %	25 %	50 %	25 %	398350398
13016	NC_018000	GCACG	2	10	555530	555539	20 %	0 %	40 %	40 %	398350398
13017	NC_018000	GTG	2	6	555549	555554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398350398
13018	NC_018000	GTC	2	6	555585	555590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350398
13019	NC_018000	CTT	2	6	555650	555655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398350398
13020	NC_018000	GGC	2	6	555665	555670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350398
13021	NC_018000	TCGA	2	8	555733	555740	25 %	25 %	25 %	25 %	398350398
13022	NC_018000	CCTT	2	8	555757	555764	0 %	50 %	0 %	50 %	398350398
13023	NC_018000	GCCT	2	8	555781	555788	0 %	25 %	25 %	50 %	398350398
13024	NC_018000	TGG	2	6	555796	555801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398350398
13025	NC_018000	CGGC	2	8	555808	555815	0 %	0 %	50 %	50 %	398350398
13026	NC_018000	CGC	2	6	555830	555835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350398
13027	NC_018000	GCG	2	6	555851	555856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350398
13028	NC_018000	GCC	2	6	555861	555866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350398
13029	NC_018000	TGC	2	6	555869	555874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350398
13030	NC_018000	CTTC	2	8	555888	555895	0 %	50 %	0 %	50 %	398350398
13031	NC_018000	CGG	2	6	555946	555951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350398
13032	NC_018000	TGGC	2	8	555975	555982	0 %	25 %	50 %	25 %	398350398
13033	NC_018000	TCC	2	6	555988	555993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398350398
13034	NC_018000	TCT	2	6	556042	556047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398350398
13035	NC_018000	GGT	2	6	556061	556066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398350398
13036	NC_018000	CAG	2	6	556107	556112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350398
13037	NC_018000	CTGGCG	2	12	556161	556172	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	398350398
13038	NC_018000	GAC	2	6	556175	556180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350398
13039	NC_018000	GTGCTC	2	12	556194	556205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350398
13040	NC_018000	TCG	2	6	556210	556215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350398
13041	NC_018000	GC	3	6	556333	556338	0 %	0 %	50 %	50 %	398350398
13042	NC_018000	GC	3	6	556355	556360	0 %	0 %	50 %	50 %	398350398
13043	NC_018000	CGC	2	6	556364	556369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350398
13044	NC_018000	CGG	3	9	556396	556404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350398
13045	NC_018000	CGA	2	6	556510	556515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350398
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13047	NC_018000	CGCTT	2	10	556556	556565	0 %	40 %	20 %	40 %	398350398
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13049	NC_018000	GGCT	2	8	556613	556620	0 %	25 %	50 %	25 %	398350398
13050	NC_018000	CGC	2	6	556653	556658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13051	NC_018000	GCG	2	6	556674	556679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13052	NC_018000	CCTT	2	8	556711	556718	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13053	NC_018000	ACG	2	6	556801	556806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350399
13054	NC_018000	GC	4	8	556884	556891	0 %	0 %	50 %	50 %	398350399
13055	NC_018000	CGC	2	6	556924	556929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350399
13056	NC_018000	CGA	2	6	556976	556981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350399
13057	NC_018000	GATCG	2	10	556989	556998	20 %	20 %	40 %	20 %	398350399
13058	NC_018000	TTC	2	6	557052	557057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398350399
13059	NC_018000	CGG	2	6	557113	557118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350399
13060	NC_018000	ACG	3	9	557152	557160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350399
13061	NC_018000	CGG	2	6	557312	557317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350399
13062	NC_018000	GC	3	6	557322	557327	0 %	0 %	50 %	50 %	398350399
13063	NC_018000	GCT	2	6	557361	557366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350399
13064	NC_018000	CT	3	6	557365	557370	0 %	50 %	0 %	50 %	398350399
13065	NC_018000	CG	4	8	557405	557412	0 %	0 %	50 %	50 %	398350399
13066	NC_018000	CCGA	2	8	557436	557443	25 %	0 %	25 %	50 %	398350399
13067	NC_018000	CATG	2	8	557513	557520	25 %	25 %	25 %	25 %	398350399
13068	NC_018000	CGA	2	6	557531	557536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350399
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13070	NC_018000	GTG	2	6	557582	557587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398350399
13071	NC_018000	GAC	2	6	557610	557615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13072	NC_018000	CGG	2	6	557673	557678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350400
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13074	NC_018000	CGT	2	6	557985	557990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350400
13075	NC_018000	CGGCC	2	10	558030	558039	0 %	0 %	40 %	60 %	398350400
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13080	NC_018000	CTTG	2	8	558141	558148	0 %	50 %	25 %	25 %	398350400
13081	NC_018000	CGGC	2	8	558170	558177	0 %	0 %	50 %	50 %	398350400
13082	NC_018000	CGG	2	6	558216	558221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350400
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13087	NC_018000	GCT	2	6	558393	558398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350400
13088	NC_018000	CTT	2	6	558456	558461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398350400
13089	NC_018000	CGA	2	6	558474	558479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350400
13090	NC_018000	GA	3	6	558519	558524	50 %	0 %	50 %	0 %	398350400
13091	NC_018000	GC	4	8	558538	558545	0 %	0 %	50 %	50 %	398350400
13092	NC_018000	TGAG	2	8	558569	558576	25 %	25 %	50 %	0 %	398350400
13093	NC_018000	AAC	2	6	558688	558693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13094	NC_018000	TCG	2	6	558713	558718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13095	NC_018000	CG	4	8	558756	558763	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13096	NC_018000	GC	3	6	558769	558774	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13097	NC_018000	CG	3	6	558855	558860	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13098	NC_018000	TCC	2	6	558913	558918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398350401
13099	NC_018000	GC	3	6	558951	558956	0 %	0 %	50 %	50 %	398350401
13100	NC_018000	AGA	2	6	558998	559003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398350401
13101	NC_018000	AAG	2	6	559015	559020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398350401
13102	NC_018000	TCC	2	6	559030	559035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398350401
13103	NC_018000	GCCG	2	8	559036	559043	0 %	0 %	50 %	50 %	398350401
13104	NC_018000	TGC	2	6	559055	559060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350401
13105	NC_018000	GCCC	2	8	559067	559074	0 %	0 %	25 %	75 %	398350401
13106	NC_018000	TCA	2	6	559130	559135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398350401
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13109	NC_018000	GAG	2	6	559324	559329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398350401
13110	NC_018000	ACG	2	6	559372	559377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350401
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13112	NC_018000	GGTC	2	8	559469	559476	0 %	25 %	50 %	25 %	398350401
13113	NC_018000	GTC	2	6	559555	559560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350401
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13119	NC_018000	GCC	2	6	559756	559761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350401
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13121	NC_018000	GCT	2	6	559875	559880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350401
13122	NC_018000	CGA	2	6	559899	559904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350401
13123	NC_018000	TGGA	2	8	559963	559970	25 %	25 %	50 %	0 %	398350401
13124	NC_018000	GC	3	6	559990	559995	0 %	0 %	50 %	50 %	398350401
13125	NC_018000	CGA	2	6	560025	560030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350401
13126	NC_018000	GGC	2	6	560080	560085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350401
13127	NC_018000	TGA	2	6	560100	560105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398350401
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13131	NC_018000	GAA	2	6	560217	560222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398350401
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13135	NC_018000	CGA	2	6	560319	560324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350401
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13195	NC_018000	TGC	2	6	562851	562856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350403
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13199	NC_018000	TGG	2	6	563122	563127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13200	NC_018000	GCC	2	6	563169	563174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13201	NC_018000	GTA	2	6	563193	563198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13203	NC_018000	GC	3	6	563211	563216	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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13212	NC_018000	TCG	2	6	563452	563457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13213	NC_018000	CGT	2	6	563478	563483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13221	NC_018000	GTC	2	6	563817	563822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350404
13222	NC_018000	ATCCG	2	10	563860	563869	20 %	20 %	20 %	40 %	398350404
13223	NC_018000	GGCT	2	8	563909	563916	0 %	25 %	50 %	25 %	398350404
13224	NC_018000	GAC	2	6	563921	563926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350404
13225	NC_018000	GCCG	2	8	563944	563951	0 %	0 %	50 %	50 %	398350404
13226	NC_018000	CG	3	6	563983	563988	0 %	0 %	50 %	50 %	398350404
13227	NC_018000	GCC	2	6	564001	564006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350404
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13229	NC_018000	ACGA	2	8	564039	564046	50 %	0 %	25 %	25 %	398350404
13230	NC_018000	G	6	6	564048	564053	0 %	0 %	100 %	0 %	398350404
13231	NC_018000	GGTT	2	8	564084	564091	0 %	50 %	50 %	0 %	398350404
13232	NC_018000	GCG	2	6	564092	564097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350404
13233	NC_018000	CG	3	6	564108	564113	0 %	0 %	50 %	50 %	398350404
13234	NC_018000	GATC	2	8	564122	564129	25 %	25 %	25 %	25 %	398350404
13235	NC_018000	GAGC	2	8	564341	564348	25 %	0 %	50 %	25 %	398350404
13236	NC_018000	GCCG	2	8	564461	564468	0 %	0 %	50 %	50 %	398350404
13237	NC_018000	TGC	2	6	564497	564502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350404
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13240	NC_018000	TGA	2	6	564590	564595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398350404
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13242	NC_018000	GA	3	6	564630	564635	50 %	0 %	50 %	0 %	398350404
13243	NC_018000	AAG	2	6	564723	564728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398350404
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13274	NC_018000	CG	3	6	565806	565811	0 %	0 %	50 %	50 %	398350405
13275	NC_018000	GGC	3	9	565820	565828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350405
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13362	NC_018000	GCG	2	6	568721	568726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350407
13363	NC_018000	GCG	2	6	568767	568772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350407
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13369	NC_018000	GAGGC	2	10	568883	568892	20 %	0 %	60 %	20 %	398350407
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13373	NC_018000	CGAT	2	8	568997	569004	25 %	25 %	25 %	25 %	398350408
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13480	NC_018000	GCG	2	6	573393	573398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350412
13481	NC_018000	GGT	2	6	573425	573430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398350412
13482	NC_018000	ACA	2	6	573436	573441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	398350412
13483	NC_018000	T	7	7	573601	573607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13484	NC_018000	GCCG	2	8	573633	573640	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13485	NC_018000	CGGC	2	8	573642	573649	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13486	NC_018000	TGG	2	6	573742	573747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398350413
13487	NC_018000	CGC	2	6	573807	573812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350413
13488	NC_018000	GGAT	2	8	573818	573825	25 %	25 %	50 %	0 %	398350413
13489	NC_018000	GC	3	6	573829	573834	0 %	0 %	50 %	50 %	398350413
13490	NC_018000	GCCG	2	8	573843	573850	0 %	0 %	50 %	50 %	398350413
13491	NC_018000	CGG	2	6	573882	573887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350413
13492	NC_018000	GGCA	2	8	573888	573895	25 %	0 %	50 %	25 %	398350413
13493	NC_018000	GGC	2	6	573924	573929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350413
13494	NC_018000	GGC	2	6	573973	573978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350413
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13497	NC_018000	CGA	2	6	574035	574040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350413
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