MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 chromosome

Total Repeats: 149709

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018000	TCC	2	6	21029	21034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
502	NC_018000	CGC	2	6	21045	21050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
503	NC_018000	GCAC	2	8	21102	21109	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
504	NC_018000	CATC	2	8	21123	21130	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
505	NC_018000	GC	3	6	21134	21139	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
506	NC_018000	GCG	2	6	21144	21149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_018000	GGT	2	6	21185	21190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
508	NC_018000	GAA	2	6	21239	21244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398349923
509	NC_018000	CGG	2	6	21256	21261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349923
510	NC_018000	GTC	2	6	21292	21297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349923
511	NC_018000	AAGGGC	2	12	21336	21347	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	398349923
512	NC_018000	GCC	3	9	21350	21358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349923
513	NC_018000	GC	3	6	21391	21396	0 %	0 %	50 %	50 %	398349923
514	NC_018000	GC	4	8	21399	21406	0 %	0 %	50 %	50 %	398349923
515	NC_018000	GCCG	2	8	21431	21438	0 %	0 %	50 %	50 %	398349923
516	NC_018000	ATC	2	6	21481	21486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398349923
517	NC_018000	GCG	2	6	21496	21501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349923
518	NC_018000	AGGCCC	2	12	21550	21561	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	398349923
519	NC_018000	CCG	2	6	21583	21588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349923
520	NC_018000	CGA	2	6	21626	21631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349923
521	NC_018000	CGGC	3	12	21796	21807	0 %	0 %	50 %	50 %	398349923
522	NC_018000	CGC	2	6	21857	21862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349923
523	NC_018000	GGCG	2	8	21866	21873	0 %	0 %	75 %	25 %	398349923
524	NC_018000	GAA	2	6	21899	21904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398349923
525	NC_018000	GC	3	6	21918	21923	0 %	0 %	50 %	50 %	398349923
526	NC_018000	GC	4	8	21939	21946	0 %	0 %	50 %	50 %	398349923
527	NC_018000	ACG	2	6	22007	22012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349923
528	NC_018000	GACC	2	8	22037	22044	25 %	0 %	25 %	50 %	398349923
529	NC_018000	ATC	2	6	22093	22098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398349923
530	NC_018000	CG	3	6	22176	22181	0 %	0 %	50 %	50 %	398349923
531	NC_018000	GCG	2	6	22228	22233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349923
532	NC_018000	TCA	2	6	22255	22260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398349923
533	NC_018000	GGGC	2	8	22293	22300	0 %	0 %	75 %	25 %	398349923
534	NC_018000	CGC	2	6	22365	22370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349924
535	NC_018000	AGG	2	6	22386	22391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398349924
536	NC_018000	CCAAT	2	10	22404	22413	40 %	20 %	0 %	40 %	398349924
537	NC_018000	CG	3	6	22427	22432	0 %	0 %	50 %	50 %	398349924
538	NC_018000	AGA	2	6	22440	22445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398349924
539	NC_018000	CGA	2	6	22453	22458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349924
540	NC_018000	GGGC	2	8	22600	22607	0 %	0 %	75 %	25 %	398349924
541	NC_018000	CGA	2	6	22638	22643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349924
542	NC_018000	CGC	2	6	22649	22654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349924
543	NC_018000	TGG	2	6	22668	22673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398349924
544	NC_018000	AGC	2	6	22686	22691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349924
545	NC_018000	GGA	2	6	22723	22728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398349924
546	NC_018000	ATC	2	6	22781	22786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398349924
547	NC_018000	CGC	2	6	22798	22803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349924
548	NC_018000	CAT	2	6	22816	22821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398349924
549	NC_018000	ACC	2	6	22835	22840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398349924
550	NC_018000	CGA	2	6	22869	22874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349924
551	NC_018000	CGG	2	6	22941	22946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349924
552	NC_018000	GGT	2	6	22954	22959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398349924
553	NC_018000	GTC	2	6	23018	23023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349924
554	NC_018000	CTG	2	6	23024	23029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349924
555	NC_018000	GGCC	2	8	23044	23051	0 %	0 %	50 %	50 %	398349924
556	NC_018000	GCC	2	6	23075	23080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349924
557	NC_018000	CAT	2	6	23143	23148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398349924
558	NC_018000	GC	3	6	23159	23164	0 %	0 %	50 %	50 %	398349924
559	NC_018000	TGA	2	6	23192	23197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398349924
560	NC_018000	TCG	2	6	23249	23254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349925
561	NC_018000	TGG	2	6	23285	23290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398349925
562	NC_018000	AGG	2	6	23309	23314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398349925
563	NC_018000	GTC	2	6	23323	23328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349925
564	NC_018000	TCG	2	6	23405	23410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349925
565	NC_018000	GAT	2	6	23496	23501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398349925
566	NC_018000	GC	3	6	23510	23515	0 %	0 %	50 %	50 %	398349925
567	NC_018000	TCG	2	6	23525	23530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349925
568	NC_018000	GCT	2	6	23535	23540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349925
569	NC_018000	CAC	2	6	23574	23579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398349925
570	NC_018000	TCA	2	6	23618	23623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398349925
571	NC_018000	CGA	2	6	23649	23654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349925
572	NC_018000	GAGC	2	8	23744	23751	25 %	0 %	50 %	25 %	398349926
573	NC_018000	TCA	2	6	23754	23759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398349926
574	NC_018000	CGG	2	6	23821	23826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349926
575	NC_018000	GCG	2	6	23832	23837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349926
576	NC_018000	GCG	3	9	23910	23918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349926
577	NC_018000	TCG	2	6	23926	23931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349926
578	NC_018000	GC	5	10	23935	23944	0 %	0 %	50 %	50 %	398349926
579	NC_018000	CTG	2	6	23955	23960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349926
580	NC_018000	TGC	2	6	23969	23974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349926
581	NC_018000	GAT	2	6	24012	24017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398349926
582	NC_018000	GCG	2	6	24021	24026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349926
583	NC_018000	TCCG	2	8	24027	24034	0 %	25 %	25 %	50 %	398349926
584	NC_018000	AGCGG	2	10	24065	24074	20 %	0 %	60 %	20 %	398349926
585	NC_018000	GCT	2	6	24095	24100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349926
586	NC_018000	CGA	2	6	24103	24108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349926
587	NC_018000	GCCG	2	8	24290	24297	0 %	0 %	50 %	50 %	398349926
588	NC_018000	GTC	2	6	24324	24329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349926
589	NC_018000	GC	3	6	24402	24407	0 %	0 %	50 %	50 %	398349926
590	NC_018000	G	6	6	24409	24414	0 %	0 %	100 %	0 %	398349926
591	NC_018000	AGG	2	6	24415	24420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398349926
592	NC_018000	GC	3	6	24428	24433	0 %	0 %	50 %	50 %	398349926
593	NC_018000	GCT	2	6	24461	24466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349926
594	NC_018000	CACG	2	8	24476	24483	25 %	0 %	25 %	50 %	398349926
595	NC_018000	CGC	2	6	24493	24498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349926
596	NC_018000	AGC	2	6	24553	24558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349926
597	NC_018000	GCA	2	6	24578	24583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349926
598	NC_018000	CGGC	2	8	24640	24647	0 %	0 %	50 %	50 %	398349926
599	NC_018000	GTG	2	6	24699	24704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398349926
600	NC_018000	CGAT	2	8	24754	24761	25 %	25 %	25 %	25 %	398349926
601	NC_018000	CG	3	6	24794	24799	0 %	0 %	50 %	50 %	398349926
602	NC_018000	CGG	2	6	24854	24859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349926
603	NC_018000	GGC	2	6	24929	24934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349926
604	NC_018000	CGA	2	6	24935	24940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349926
605	NC_018000	GC	3	6	24945	24950	0 %	0 %	50 %	50 %	398349926
606	NC_018000	GAG	2	6	24957	24962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398349926
607	NC_018000	GAC	2	6	24978	24983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349926
608	NC_018000	CGG	2	6	25046	25051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349926
609	NC_018000	CCG	2	6	25139	25144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349926
610	NC_018000	GCTC	2	8	25175	25182	0 %	25 %	25 %	50 %	398349926
611	NC_018000	CGG	2	6	25198	25203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349926
612	NC_018000	TGC	2	6	25208	25213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349926
613	NC_018000	CGG	2	6	25229	25234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349926
614	NC_018000	CG	3	6	25245	25250	0 %	0 %	50 %	50 %	398349926
615	NC_018000	GGC	3	9	25259	25267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349926
616	NC_018000	GC	3	6	25266	25271	0 %	0 %	50 %	50 %	398349926
617	NC_018000	CGT	2	6	25274	25279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349926
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620	NC_018000	TGG	2	6	25498	25503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398349926
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622	NC_018000	CGGC	2	8	25514	25521	0 %	0 %	50 %	50 %	398349926
623	NC_018000	ACA	2	6	25555	25560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	398349926
624	NC_018000	CGG	2	6	25594	25599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349926
625	NC_018000	GCC	2	6	25612	25617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349926
626	NC_018000	TGC	2	6	25621	25626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349926
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628	NC_018000	GA	3	6	25674	25679	50 %	0 %	50 %	0 %	398349926
629	NC_018000	CGC	2	6	25712	25717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349926
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757	NC_018000	CCG	2	6	30740	30745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349929
758	NC_018000	GCC	2	6	30770	30775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349929
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770	NC_018000	CGG	2	6	31069	31074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349929
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866	NC_018000	CGA	2	6	35316	35321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349930
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869	NC_018000	GCA	2	6	35429	35434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349930
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872	NC_018000	GCTT	2	8	35525	35532	0 %	50 %	25 %	25 %	398349930
873	NC_018000	CGG	2	6	35543	35548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349930
874	NC_018000	CAC	2	6	35589	35594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398349930
875	NC_018000	GACC	2	8	35628	35635	25 %	0 %	25 %	50 %	398349930
876	NC_018000	TGG	2	6	35636	35641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398349930
877	NC_018000	CG	3	6	35682	35687	0 %	0 %	50 %	50 %	398349930
878	NC_018000	CGA	2	6	35715	35720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349930
879	NC_018000	GC	3	6	35722	35727	0 %	0 %	50 %	50 %	398349930
880	NC_018000	CAT	2	6	35745	35750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398349930
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883	NC_018000	ACCGG	2	10	35907	35916	20 %	0 %	40 %	40 %	398349931
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997	NC_018000	GCA	2	6	40432	40437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349935
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1000	NC_018000	CGG	2	6	40625	40630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349935

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