MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 chromosome

Total Repeats: 149709

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_018000	CGATG	2	10	220665	220674	20 %	20 %	40 %	20 %	398350089
5502	NC_018000	ACC	2	6	220843	220848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398350089
5503	NC_018000	GTC	2	6	220882	220887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350089
5504	NC_018000	GGC	2	6	220909	220914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350089
5505	NC_018000	GGCG	2	8	220917	220924	0 %	0 %	75 %	25 %	398350089
5506	NC_018000	GCC	2	6	220933	220938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350089
5507	NC_018000	TGG	2	6	220940	220945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398350089
5508	NC_018000	CGT	2	6	220965	220970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350089
5509	NC_018000	CGG	2	6	220980	220985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350089
5510	NC_018000	TAT	2	6	221065	221070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	398350089
5511	NC_018000	GCC	2	6	221071	221076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350089
5512	NC_018000	CGG	3	9	221154	221162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350089
5513	NC_018000	CG	3	6	221196	221201	0 %	0 %	50 %	50 %	398350089
5514	NC_018000	CGA	2	6	221247	221252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350089
5515	NC_018000	CGC	2	6	221259	221264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350089
5516	NC_018000	GC	3	6	221266	221271	0 %	0 %	50 %	50 %	398350089
5517	NC_018000	GCGG	2	8	221370	221377	0 %	0 %	75 %	25 %	398350089
5518	NC_018000	AGG	2	6	221459	221464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398350089
5519	NC_018000	TCG	3	9	221516	221524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350089
5520	NC_018000	CGC	2	6	221562	221567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350089
5521	NC_018000	CCAG	2	8	221582	221589	25 %	0 %	25 %	50 %	398350089
5522	NC_018000	ACC	2	6	221591	221596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398350089
5523	NC_018000	TCG	2	6	221609	221614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350089
5524	NC_018000	TCG	2	6	221633	221638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350089
5525	NC_018000	GAC	2	6	221656	221661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350089
5526	NC_018000	CGG	2	6	221685	221690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350089
5527	NC_018000	CCG	2	6	221726	221731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350089
5528	NC_018000	CGG	2	6	221750	221755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350089
5529	NC_018000	GCG	2	6	221759	221764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350089
5530	NC_018000	GAT	2	6	221836	221841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398350089
5531	NC_018000	GGC	2	6	221870	221875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350089
5532	NC_018000	GCG	2	6	221903	221908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5533	NC_018000	AGA	2	6	221944	221949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398350090
5534	NC_018000	TGT	2	6	222169	222174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_018000	CGA	2	6	222199	222204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5536	NC_018000	CGT	2	6	222218	222223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5537	NC_018000	TCA	2	6	222233	222238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5538	NC_018000	GAC	2	6	222252	222257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5539	NC_018000	A	6	6	222311	222316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_018000	A	6	6	222395	222400	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_018000	TGC	2	6	222405	222410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5542	NC_018000	AG	3	6	222412	222417	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_018000	AGT	2	6	222460	222465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_018000	GGTG	2	8	222484	222491	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_018000	CG	3	6	222572	222577	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5546	NC_018000	AGG	2	6	222579	222584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_018000	GCA	2	6	222585	222590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5548	NC_018000	TCC	2	6	222749	222754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5549	NC_018000	TCC	2	6	222893	222898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5550	NC_018000	AGT	2	6	222925	222930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_018000	AATC	2	8	222968	222975	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5552	NC_018000	TC	3	6	223022	223027	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5553	NC_018000	GCC	2	6	223047	223052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5554	NC_018000	GCG	2	6	223164	223169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350091
5555	NC_018000	TCG	2	6	223190	223195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350091
5556	NC_018000	TTC	2	6	223196	223201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398350091
5557	NC_018000	GAC	2	6	223303	223308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350091
5558	NC_018000	CCT	2	6	223314	223319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398350091
5559	NC_018000	CTG	2	6	223356	223361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350091
5560	NC_018000	CGCCC	2	10	223392	223401	0 %	0 %	20 %	80 %	398350091
5561	NC_018000	CG	3	6	223437	223442	0 %	0 %	50 %	50 %	398350091
5562	NC_018000	GCA	2	6	223502	223507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350091
5563	NC_018000	CAA	2	6	223527	223532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	398350091
5564	NC_018000	TCGG	2	8	223616	223623	0 %	25 %	50 %	25 %	398350091
5565	NC_018000	CCA	2	6	223759	223764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5566	NC_018000	GAG	2	6	223777	223782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_018000	TGC	2	6	223818	223823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5568	NC_018000	AGG	2	6	223833	223838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_018000	GA	3	6	223872	223877	50 %	0 %	50 %	0 %	398350092
5570	NC_018000	ACCG	2	8	223938	223945	25 %	0 %	25 %	50 %	398350092
5571	NC_018000	TGG	2	6	224116	224121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398350092
5572	NC_018000	TGC	2	6	224122	224127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350092
5573	NC_018000	CGA	2	6	224179	224184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350092
5574	NC_018000	TGG	2	6	224256	224261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5575	NC_018000	TGAAGG	2	12	224268	224279	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_018000	CAG	2	6	224375	224380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5577	NC_018000	GAA	2	6	224430	224435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_018000	GGA	2	6	224437	224442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_018000	CTGG	2	8	224509	224516	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5580	NC_018000	TCC	2	6	224531	224536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5581	NC_018000	CG	3	6	224579	224584	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5582	NC_018000	GGT	2	6	224680	224685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_018000	GAG	2	6	224701	224706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_018000	TGA	2	6	224710	224715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_018000	C	6	6	224723	224728	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5586	NC_018000	ACCA	2	8	224765	224772	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5587	NC_018000	G	6	6	224865	224870	0 %	0 %	100 %	0 %	398350093
5588	NC_018000	GTC	2	6	224990	224995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350093
5589	NC_018000	CCG	2	6	225019	225024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350093
5590	NC_018000	GGT	2	6	225038	225043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398350093
5591	NC_018000	CGA	2	6	225049	225054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350093
5592	NC_018000	CAA	2	6	225074	225079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	398350093
5593	NC_018000	AGCGGG	2	12	225112	225123	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	398350093
5594	NC_018000	AGC	3	9	225143	225151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350093
5595	NC_018000	GCA	2	6	225320	225325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5596	NC_018000	CT	3	6	225357	225362	0 %	50 %	0 %	50 %	398350094
5597	NC_018000	GCC	2	6	225397	225402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350094
5598	NC_018000	TAG	2	6	225498	225503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398350094
5599	NC_018000	TTG	2	6	225533	225538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	398350094
5600	NC_018000	GACG	2	8	225570	225577	25 %	0 %	50 %	25 %	398350094
5601	NC_018000	GCC	2	6	225602	225607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350094
5602	NC_018000	CATC	2	8	225720	225727	25 %	25 %	0 %	50 %	398350094
5603	NC_018000	GAT	2	6	225874	225879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398350094
5604	NC_018000	CTG	2	6	225997	226002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350094
5605	NC_018000	CTC	2	6	226013	226018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398350094
5606	NC_018000	ACA	2	6	226027	226032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	398350094
5607	NC_018000	AACG	2	8	226055	226062	50 %	0 %	25 %	25 %	398350094
5608	NC_018000	GCCA	2	8	226176	226183	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5609	NC_018000	AAT	2	6	226295	226300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_018000	TCT	2	6	226305	226310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5611	NC_018000	TGC	2	6	226458	226463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5612	NC_018000	TCAG	2	8	226471	226478	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5613	NC_018000	TGG	2	6	226532	226537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_018000	CAA	3	9	226566	226574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5615	NC_018000	TC	3	6	226625	226630	0 %	50 %	0 %	50 %	398350095
5616	NC_018000	TCA	2	6	226644	226649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398350095
5617	NC_018000	CGA	2	6	226695	226700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350095
5618	NC_018000	CTG	2	6	226730	226735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350095
5619	NC_018000	GAG	2	6	226908	226913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_018000	TCC	2	6	226943	226948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5621	NC_018000	AGC	2	6	226962	226967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5622	NC_018000	CCA	2	6	227025	227030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5623	NC_018000	CA	3	6	227029	227034	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5624	NC_018000	GT	3	6	227084	227089	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5625	NC_018000	AGG	2	6	227098	227103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5626	NC_018000	G	6	6	227113	227118	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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5872	NC_018000	T	6	6	239776	239781	0 %	100 %	0 %	0 %	398350104
5873	NC_018000	CG	3	6	239898	239903	0 %	0 %	50 %	50 %	398350104
5874	NC_018000	TCG	2	6	239910	239915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350104
5875	NC_018000	GGCC	2	8	239968	239975	0 %	0 %	50 %	50 %	398350104
5876	NC_018000	CGCT	2	8	240003	240010	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5877	NC_018000	A	6	6	240057	240062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5885	NC_018000	CTG	2	6	240523	240528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350106
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5911	NC_018000	CTG	2	6	241355	241360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5998	NC_018000	GCT	2	6	245398	245403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350109
5999	NC_018000	CTT	2	6	245473	245478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398350109
6000	NC_018000	AGC	3	9	245480	245488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350109

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