MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 chromosome

Total Repeats: 149709

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_018000	CCG	2	6	200922	200927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350077
5002	NC_018000	ACG	2	6	200935	200940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350077
5003	NC_018000	AAC	2	6	200969	200974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	398350077
5004	NC_018000	CGT	2	6	201045	201050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350077
5005	NC_018000	CGC	2	6	201093	201098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350077
5006	NC_018000	CCGA	2	8	201139	201146	25 %	0 %	25 %	50 %	398350077
5007	NC_018000	CGG	2	6	201218	201223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350077
5008	NC_018000	GC	3	6	201304	201309	0 %	0 %	50 %	50 %	398350077
5009	NC_018000	CGA	2	6	201371	201376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350077
5010	NC_018000	TGC	2	6	201386	201391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350077
5011	NC_018000	GCG	2	6	201432	201437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350077
5012	NC_018000	CCG	2	6	201446	201451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350077
5013	NC_018000	CGG	2	6	201474	201479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350077
5014	NC_018000	GC	3	6	201488	201493	0 %	0 %	50 %	50 %	398350077
5015	NC_018000	GCT	2	6	201540	201545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350077
5016	NC_018000	CGGC	2	8	201552	201559	0 %	0 %	50 %	50 %	398350077
5017	NC_018000	ATC	2	6	201613	201618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398350077
5018	NC_018000	TCG	2	6	201635	201640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350077
5019	NC_018000	TCA	2	6	201644	201649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398350077
5020	NC_018000	CAGC	2	8	201690	201697	25 %	0 %	25 %	50 %	398350077
5021	NC_018000	CAT	2	6	201718	201723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398350077
5022	NC_018000	GGT	2	6	201729	201734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398350077
5023	NC_018000	GCAG	2	8	201735	201742	25 %	0 %	50 %	25 %	398350077
5024	NC_018000	GCC	2	6	201757	201762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350077
5025	NC_018000	CGA	2	6	201807	201812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350077
5026	NC_018000	GC	3	6	201855	201860	0 %	0 %	50 %	50 %	398350077
5027	NC_018000	GCC	2	6	201883	201888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350078
5028	NC_018000	GCG	2	6	201911	201916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350078
5029	NC_018000	GCC	2	6	202033	202038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350078
5030	NC_018000	ATCCGG	2	12	202065	202076	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	398350078
5031	NC_018000	GCG	2	6	202082	202087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350078
5032	NC_018000	GCT	2	6	202109	202114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350078
5033	NC_018000	GGTC	2	8	202115	202122	0 %	25 %	50 %	25 %	398350078
5034	NC_018000	CGG	2	6	202193	202198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350078
5035	NC_018000	TCT	2	6	202226	202231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398350078
5036	NC_018000	CAG	2	6	202236	202241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350078
5037	NC_018000	GAC	2	6	202266	202271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350078
5038	NC_018000	GC	4	8	202272	202279	0 %	0 %	50 %	50 %	398350078
5039	NC_018000	TGG	2	6	202300	202305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398350078
5040	NC_018000	TGA	2	6	202307	202312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398350078
5041	NC_018000	TGT	2	6	202334	202339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	398350078
5042	NC_018000	GCC	2	6	202372	202377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350078
5043	NC_018000	GCGTG	2	10	202381	202390	0 %	20 %	60 %	20 %	398350078
5044	NC_018000	CCT	2	6	202418	202423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398350078
5045	NC_018000	CCG	2	6	202532	202537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350078
5046	NC_018000	GCTT	2	8	202550	202557	0 %	50 %	25 %	25 %	398350078
5047	NC_018000	GTC	2	6	202558	202563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350078
5048	NC_018000	CAGC	2	8	202576	202583	25 %	0 %	25 %	50 %	398350078
5049	NC_018000	AGG	2	6	202666	202671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398350078
5050	NC_018000	AAGG	2	8	202689	202696	50 %	0 %	50 %	0 %	398350078
5051	NC_018000	GCC	4	12	202706	202717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350078
5052	NC_018000	TCCGGC	2	12	202720	202731	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	398350078
5053	NC_018000	CGC	3	9	202737	202745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350078
5054	NC_018000	CTG	2	6	202755	202760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350078
5055	NC_018000	GAC	2	6	202786	202791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350078
5056	NC_018000	GCC	2	6	202794	202799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350078
5057	NC_018000	CGA	3	9	202841	202849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350078
5058	NC_018000	GC	3	6	202869	202874	0 %	0 %	50 %	50 %	398350078
5059	NC_018000	TGG	2	6	202891	202896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398350078
5060	NC_018000	GAG	2	6	202914	202919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398350078
5061	NC_018000	GGC	2	6	202940	202945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350078
5062	NC_018000	CGA	2	6	202958	202963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350078
5063	NC_018000	GC	3	6	203000	203005	0 %	0 %	50 %	50 %	398350078
5064	NC_018000	AGA	2	6	203018	203023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398350078
5065	NC_018000	GCAG	2	8	203051	203058	25 %	0 %	50 %	25 %	398350078
5066	NC_018000	CGA	2	6	203106	203111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350078
5067	NC_018000	CAGGAA	2	12	203121	203132	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	398350078
5068	NC_018000	CGT	2	6	203137	203142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350078
5069	NC_018000	GCT	2	6	203147	203152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350078
5070	NC_018000	GTG	2	6	203158	203163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398350078
5071	NC_018000	TGC	2	6	203175	203180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_018000	GCT	2	6	203197	203202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350079
5073	NC_018000	AGC	2	6	203238	203243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350079
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5075	NC_018000	CGGG	2	8	203300	203307	0 %	0 %	75 %	25 %	398350079
5076	NC_018000	TAA	2	6	203328	203333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	398350079
5077	NC_018000	AGG	2	6	203373	203378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398350079
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5079	NC_018000	CTT	2	6	203444	203449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398350079
5080	NC_018000	CGA	2	6	203554	203559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350079
5081	NC_018000	AGA	2	6	203560	203565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398350079
5082	NC_018000	TCG	3	9	203574	203582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350079
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5085	NC_018000	ATGA	2	8	203747	203754	50 %	25 %	25 %	0 %	398350079
5086	NC_018000	TGCG	2	8	203757	203764	0 %	25 %	50 %	25 %	398350079
5087	NC_018000	CGGCAT	2	12	203797	203808	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	398350079
5088	NC_018000	GCG	2	6	203814	203819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350079
5089	NC_018000	GCC	2	6	203903	203908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350079
5090	NC_018000	GAC	2	6	204029	204034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350079
5091	NC_018000	GCG	2	6	204040	204045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350079
5092	NC_018000	CCT	2	6	204046	204051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398350079
5093	NC_018000	GATCA	2	10	204059	204068	40 %	20 %	20 %	20 %	398350079
5094	NC_018000	GC	3	6	204078	204083	0 %	0 %	50 %	50 %	398350079
5095	NC_018000	CGA	2	6	204103	204108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350079
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5098	NC_018000	ACC	2	6	204150	204155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398350079
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5101	NC_018000	GCC	2	6	204228	204233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350079
5102	NC_018000	CGG	2	6	204277	204282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350079
5103	NC_018000	CGATCA	2	12	204283	204294	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	398350079
5104	NC_018000	CGA	2	6	204388	204393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350079
5105	NC_018000	ACG	2	6	204402	204407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350079
5106	NC_018000	AGA	2	6	204424	204429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398350079
5107	NC_018000	CGA	2	6	204454	204459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350079
5108	NC_018000	GAT	2	6	204527	204532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398350079
5109	NC_018000	GAA	2	6	204533	204538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398350079
5110	NC_018000	GCC	2	6	204568	204573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350079
5111	NC_018000	GAA	2	6	204584	204589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398350079
5112	NC_018000	CGA	2	6	204634	204639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350079
5113	NC_018000	CGC	2	6	204675	204680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350079
5114	NC_018000	CGGT	2	8	204702	204709	0 %	25 %	50 %	25 %	398350079
5115	NC_018000	GAA	2	6	204710	204715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398350079
5116	NC_018000	CAG	2	6	204731	204736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350079
5117	NC_018000	AGC	2	6	204739	204744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350079
5118	NC_018000	GCT	2	6	204756	204761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350079
5119	NC_018000	CCGCG	2	10	204818	204827	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5120	NC_018000	ACG	2	6	204860	204865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5121	NC_018000	GC	3	6	204912	204917	0 %	0 %	50 %	50 %	398350080
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5244	NC_018000	GAC	2	6	209347	209352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350082
5245	NC_018000	TTC	2	6	209386	209391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398350082
5246	NC_018000	TGC	2	6	209400	209405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350082
5247	NC_018000	GGC	2	6	209473	209478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350082
5248	NC_018000	AGC	2	6	209528	209533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350082
5249	NC_018000	AGC	2	6	209561	209566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350082
5250	NC_018000	GCAA	2	8	209579	209586	50 %	0 %	25 %	25 %	398350082
5251	NC_018000	ACTCGT	2	12	209643	209654	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	398350082
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5255	NC_018000	TCG	2	6	209855	209860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350082
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5264	NC_018000	GCGGA	2	10	210332	210341	20 %	0 %	60 %	20 %	398350082
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5267	NC_018000	CGA	2	6	210501	210506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350082
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5272	NC_018000	GCC	2	6	210728	210733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350082
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5364	NC_018000	CAT	2	6	215273	215278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398350083
5365	NC_018000	CGA	2	6	215323	215328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350083
5366	NC_018000	GCC	2	6	215335	215340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350083
5367	NC_018000	GGC	2	6	215352	215357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350083
5368	NC_018000	TCGGCG	2	12	215377	215388	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	398350083
5369	NC_018000	AAAC	2	8	215451	215458	75 %	0 %	0 %	25 %	398350083
5370	NC_018000	TCG	2	6	215470	215475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350083
5371	NC_018000	GGC	2	6	215492	215497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350083
5372	NC_018000	TTCGC	2	10	215518	215527	0 %	40 %	20 %	40 %	398350083
5373	NC_018000	GC	3	6	215547	215552	0 %	0 %	50 %	50 %	398350083
5374	NC_018000	GCC	2	6	215656	215661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350083
5375	NC_018000	GGT	2	6	215666	215671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398350083
5376	NC_018000	GGT	2	6	215721	215726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398350083
5377	NC_018000	AAG	2	6	215772	215777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398350083
5378	NC_018000	CTG	2	6	215790	215795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350083
5379	NC_018000	ATC	2	6	215802	215807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398350083
5380	NC_018000	CGG	3	9	215963	215971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350083
5381	NC_018000	GAG	2	6	216018	216023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398350083
5382	NC_018000	TCG	2	6	216154	216159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350083
5383	NC_018000	CG	3	6	216245	216250	0 %	0 %	50 %	50 %	398350083
5384	NC_018000	CAA	2	6	216305	216310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	398350083
5385	NC_018000	CGCC	2	8	216368	216375	0 %	0 %	25 %	75 %	398350084
5386	NC_018000	CGCGC	2	10	216376	216385	0 %	0 %	40 %	60 %	398350084
5387	NC_018000	ATCG	2	8	216400	216407	25 %	25 %	25 %	25 %	398350084
5388	NC_018000	CAT	2	6	216423	216428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398350084
5389	NC_018000	GCC	3	9	216441	216449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350084
5390	NC_018000	GCC	2	6	216463	216468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5391	NC_018000	CG	3	6	216470	216475	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5392	NC_018000	TGAT	2	8	216481	216488	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5393	NC_018000	CCG	2	6	216523	216528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5394	NC_018000	GAG	2	6	216537	216542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5395	NC_018000	GCG	2	6	216600	216605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350085
5396	NC_018000	CGGC	2	8	216699	216706	0 %	0 %	50 %	50 %	398350085
5397	NC_018000	GAC	2	6	216844	216849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350085
5398	NC_018000	CTT	2	6	216904	216909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398350085
5399	NC_018000	ACC	2	6	216918	216923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398350085
5400	NC_018000	CGT	2	6	217054	217059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350085
5401	NC_018000	GGCG	2	8	217126	217133	0 %	0 %	75 %	25 %	398350085
5402	NC_018000	ATCG	2	8	217163	217170	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5403	NC_018000	CG	3	6	217226	217231	0 %	0 %	50 %	50 %	398350086
5404	NC_018000	CGATC	2	10	217259	217268	20 %	20 %	20 %	40 %	398350086
5405	NC_018000	GCT	2	6	217301	217306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350086
5406	NC_018000	TGC	2	6	217309	217314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350086
5407	NC_018000	GAT	2	6	217316	217321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398350086
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5409	NC_018000	CGA	2	6	217400	217405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350086
5410	NC_018000	AAG	2	6	217455	217460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398350086
5411	NC_018000	GAT	2	6	217463	217468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398350086
5412	NC_018000	TCT	2	6	217507	217512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398350086
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5417	NC_018000	GC	4	8	217716	217723	0 %	0 %	50 %	50 %	398350086
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5421	NC_018000	CCT	2	6	217861	217866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398350086
5422	NC_018000	CTC	2	6	217887	217892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398350086
5423	NC_018000	TGG	2	6	217945	217950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398350086
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5446	NC_018000	CGG	2	6	218549	218554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5447	NC_018000	CCA	2	6	218587	218592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5449	NC_018000	A	6	6	218673	218678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5450	NC_018000	AAT	2	6	218694	218699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5452	NC_018000	ATG	2	6	218752	218757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5461	NC_018000	CGG	2	6	219272	219277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5462	NC_018000	GGA	2	6	219314	219319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5472	NC_018000	CCGAG	3	15	219692	219706	20 %	0 %	40 %	40 %	398350089
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5474	NC_018000	GCCGG	2	10	219827	219836	0 %	0 %	60 %	40 %	398350089
5475	NC_018000	A	6	6	219838	219843	100 %	0 %	0 %	0 %	398350089
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5481	NC_018000	CTG	2	6	220009	220014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350089
5482	NC_018000	GCAGCG	2	12	220021	220032	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	398350089
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5484	NC_018000	CTG	2	6	220051	220056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350089
5485	NC_018000	GAG	2	6	220096	220101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398350089
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5488	NC_018000	GC	3	6	220195	220200	0 %	0 %	50 %	50 %	398350089
5489	NC_018000	CCG	2	6	220210	220215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350089
5490	NC_018000	TCG	2	6	220220	220225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350089
5491	NC_018000	GGA	2	6	220242	220247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398350089
5492	NC_018000	GGGC	2	8	220316	220323	0 %	0 %	75 %	25 %	398350089
5493	NC_018000	GCA	2	6	220340	220345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350089
5494	NC_018000	AGG	2	6	220412	220417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398350089
5495	NC_018000	CTGG	2	8	220431	220438	0 %	25 %	50 %	25 %	398350089
5496	NC_018000	ATCT	2	8	220486	220493	25 %	50 %	0 %	25 %	398350089
5497	NC_018000	CGG	3	9	220517	220525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350089
5498	NC_018000	AGG	2	6	220544	220549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398350089
5499	NC_018000	GGC	2	6	220584	220589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350089
5500	NC_018000	CAG	2	6	220645	220650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350089

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