MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 chromosome

Total Repeats: 149709

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_018000	CGG	2	6	179704	179709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350058
4502	NC_018000	CG	3	6	179713	179718	0 %	0 %	50 %	50 %	398350058
4503	NC_018000	GGT	2	6	179735	179740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398350058
4504	NC_018000	GAT	2	6	179780	179785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398350058
4505	NC_018000	CAG	2	6	179807	179812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350058
4506	NC_018000	CGC	2	6	179875	179880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350058
4507	NC_018000	GC	3	6	179882	179887	0 %	0 %	50 %	50 %	398350058
4508	NC_018000	CCA	2	6	179896	179901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398350058
4509	NC_018000	GGCC	2	8	179926	179933	0 %	0 %	50 %	50 %	398350058
4510	NC_018000	GAT	2	6	179975	179980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398350058
4511	NC_018000	GCA	2	6	180040	180045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350058
4512	NC_018000	CTCG	2	8	180068	180075	0 %	25 %	25 %	50 %	398350058
4513	NC_018000	AGC	2	6	180084	180089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350058
4514	NC_018000	CGA	2	6	180101	180106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350058
4515	NC_018000	GTC	2	6	180110	180115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350058
4516	NC_018000	GCA	2	6	180124	180129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350058
4517	NC_018000	GAG	2	6	180156	180161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398350058
4518	NC_018000	CTG	2	6	180245	180250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350058
4519	NC_018000	CGGT	2	8	180357	180364	0 %	25 %	50 %	25 %	398350058
4520	NC_018000	GCG	2	6	180371	180376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350058
4521	NC_018000	CGAGC	2	10	180431	180440	20 %	0 %	40 %	40 %	398350058
4522	NC_018000	AGG	2	6	180531	180536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398350058
4523	NC_018000	CCG	2	6	180576	180581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350058
4524	NC_018000	GCC	2	6	180661	180666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350058
4525	NC_018000	CCG	2	6	180675	180680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350058
4526	NC_018000	AGC	2	6	180681	180686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350058
4527	NC_018000	CGA	2	6	180709	180714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350058
4528	NC_018000	AGC	2	6	180720	180725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350058
4529	NC_018000	CGAG	2	8	180727	180734	25 %	0 %	50 %	25 %	398350058
4530	NC_018000	TAG	2	6	180765	180770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398350058
4531	NC_018000	AGC	2	6	180780	180785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350058
4532	NC_018000	GAC	2	6	180788	180793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350058
4533	NC_018000	GCG	2	6	180806	180811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350058
4534	NC_018000	AGC	2	6	180819	180824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350058
4535	NC_018000	CG	3	6	180853	180858	0 %	0 %	50 %	50 %	398350058
4536	NC_018000	CGA	2	6	180931	180936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350058
4537	NC_018000	GGC	2	6	180950	180955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350058
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4539	NC_018000	GAG	2	6	180977	180982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398350058
4540	NC_018000	TGA	2	6	180985	180990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398350058
4541	NC_018000	GCCGGA	2	12	181040	181051	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	398350058
4542	NC_018000	GGCGAT	2	12	181067	181078	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	398350058
4543	NC_018000	GTTC	2	8	181141	181148	0 %	50 %	25 %	25 %	398350058
4544	NC_018000	CGA	2	6	181162	181167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350058
4545	NC_018000	ATG	2	6	181194	181199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398350058
4546	NC_018000	CAG	2	6	181223	181228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350058
4547	NC_018000	GC	3	6	181235	181240	0 %	0 %	50 %	50 %	398350058
4548	NC_018000	CCG	2	6	181345	181350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350058
4549	NC_018000	CGA	2	6	181360	181365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350058
4550	NC_018000	ACC	2	6	181371	181376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398350058
4551	NC_018000	AGC	2	6	181479	181484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350058
4552	NC_018000	ATC	2	6	181536	181541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398350058
4553	NC_018000	AG	3	6	181602	181607	50 %	0 %	50 %	0 %	398350058
4554	NC_018000	CGA	2	6	181615	181620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350058
4555	NC_018000	CGC	2	6	181622	181627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350058
4556	NC_018000	CCG	2	6	181630	181635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350058
4557	NC_018000	GC	3	6	181649	181654	0 %	0 %	50 %	50 %	398350058
4558	NC_018000	CGG	2	6	181786	181791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350058
4559	NC_018000	CGC	2	6	181801	181806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350058
4560	NC_018000	AGG	2	6	181819	181824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398350058
4561	NC_018000	CTG	2	6	181887	181892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350058
4562	NC_018000	AGC	3	9	181926	181934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350058
4563	NC_018000	CTC	2	6	181985	181990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4564	NC_018000	GCA	2	6	181996	182001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4565	NC_018000	CCG	2	6	182093	182098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4566	NC_018000	TGC	2	6	182161	182166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4567	NC_018000	ACG	2	6	182193	182198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4568	NC_018000	GA	3	6	182211	182216	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_018000	ATC	2	6	182283	182288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398350059
4570	NC_018000	GCC	2	6	182292	182297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350059
4571	NC_018000	GTC	2	6	182319	182324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350059
4572	NC_018000	GAC	2	6	182325	182330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350059
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4575	NC_018000	CAG	2	6	182439	182444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350059
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4580	NC_018000	CGGC	2	8	182657	182664	0 %	0 %	50 %	50 %	398350060
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4584	NC_018000	TCG	2	6	182819	182824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350061
4585	NC_018000	GTG	2	6	182827	182832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398350061
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4591	NC_018000	AGA	2	6	183017	183022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398350061
4592	NC_018000	TCGCC	2	10	183092	183101	0 %	20 %	20 %	60 %	398350061
4593	NC_018000	CGA	2	6	183105	183110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350061
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4595	NC_018000	TGCCG	2	10	183180	183189	0 %	20 %	40 %	40 %	398350061
4596	NC_018000	CTCGAT	2	12	183217	183228	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	398350061
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4600	NC_018000	ATC	2	6	183361	183366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398350061
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4603	NC_018000	CGG	2	6	183399	183404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350061
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4611	NC_018000	TCG	2	6	183785	183790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350061
4612	NC_018000	GTCC	2	8	183943	183950	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4613	NC_018000	CGAT	2	8	183955	183962	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4614	NC_018000	ACGA	2	8	184000	184007	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4615	NC_018000	GCG	2	6	184024	184029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4616	NC_018000	CGT	3	9	184186	184194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350062
4617	NC_018000	GTC	2	6	184316	184321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350062
4618	NC_018000	CTA	2	6	184372	184377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398350062
4619	NC_018000	CG	4	8	184398	184405	0 %	0 %	50 %	50 %	398350062
4620	NC_018000	CGA	2	6	184416	184421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350062
4621	NC_018000	TCT	2	6	184446	184451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398350062
4622	NC_018000	GCC	2	6	184460	184465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350062
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4624	NC_018000	CGG	2	6	184506	184511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350062
4625	NC_018000	GCC	3	9	184577	184585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350062
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4634	NC_018000	TCG	2	6	185127	185132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350062
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4642	NC_018000	GCTGC	2	10	185575	185584	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4643	NC_018000	CCCG	2	8	185585	185592	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4644	NC_018000	TGCC	2	8	185659	185666	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4645	NC_018000	TC	3	6	185710	185715	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4646	NC_018000	CGA	2	6	185749	185754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350064
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4650	NC_018000	GC	3	6	185919	185924	0 %	0 %	50 %	50 %	398350065
4651	NC_018000	CGA	2	6	185925	185930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350065
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4742	NC_018000	GGC	2	6	189965	189970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350068
4743	NC_018000	GCC	2	6	189987	189992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350068
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4753	NC_018000	GTGC	2	8	190408	190415	0 %	25 %	50 %	25 %	398350068
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4763	NC_018000	CGCGC	2	10	190768	190777	0 %	0 %	40 %	60 %	398350069
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4783	NC_018000	GAT	2	6	191700	191705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4822	NC_018000	TAA	2	6	193005	193010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4856	NC_018000	CCT	2	6	194527	194532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398350072
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4859	NC_018000	GCG	2	6	194644	194649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350072
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4987	NC_018000	TAG	2	6	200076	200081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4988	NC_018000	ATT	2	6	200098	200103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4989	NC_018000	CCG	2	6	200155	200160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4990	NC_018000	TCGCG	2	10	200168	200177	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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