MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Streptococcus suis ST1 chromosome

Total Repeats: 5872

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017950	ACTT	2	8	653	660	25 %	50 %	0 %	25 %	389855710
2	NC_017950	ACGT	2	8	959	966	25 %	25 %	25 %	25 %	389855710
3	NC_017950	ACAA	2	8	1068	1075	75 %	0 %	0 %	25 %	389855710
4	NC_017950	GACA	2	8	1224	1231	50 %	0 %	25 %	25 %	389855710
5	NC_017950	ATGC	2	8	1285	1292	25 %	25 %	25 %	25 %	389855710
6	NC_017950	ACAA	2	8	1957	1964	75 %	0 %	0 %	25 %	389855711
7	NC_017950	TACC	2	8	2269	2276	25 %	25 %	0 %	50 %	389855711
8	NC_017950	ACCG	2	8	2282	2289	25 %	0 %	25 %	50 %	389855711
9	NC_017950	ACTT	2	8	2522	2529	25 %	50 %	0 %	25 %	389855711
10	NC_017950	GTCC	2	8	2588	2595	0 %	25 %	25 %	50 %	389855711
11	NC_017950	AAAG	2	8	2826	2833	75 %	0 %	25 %	0 %	389855712
12	NC_017950	GAAG	2	8	3410	3417	50 %	0 %	50 %	0 %	389855712
13	NC_017950	GTAT	2	8	3625	3632	25 %	50 %	25 %	0 %	389855712
14	NC_017950	AATG	2	8	4149	4156	50 %	25 %	25 %	0 %	389855715
15	NC_017950	AAAT	2	8	4617	4624	75 %	25 %	0 %	0 %	389855716
16	NC_017950	CTTG	2	8	5205	5212	0 %	50 %	25 %	25 %	389855716
17	NC_017950	TTGG	2	8	5584	5591	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017950	TCTA	2	8	5802	5809	25 %	50 %	0 %	25 %	389855717
19	NC_017950	ATGA	2	8	5828	5835	50 %	25 %	25 %	0 %	389855717
20	NC_017950	AATC	2	8	6234	6241	50 %	25 %	0 %	25 %	389855718
21	NC_017950	GTTT	2	8	6465	6472	0 %	75 %	25 %	0 %	389855718
22	NC_017950	TCAA	2	8	6492	6499	50 %	25 %	0 %	25 %	389855718
23	NC_017950	CTTA	2	8	6965	6972	25 %	50 %	0 %	25 %	389855718
24	NC_017950	GATG	2	8	7548	7555	25 %	25 %	50 %	0 %	389855718
25	NC_017950	GCAA	2	8	8180	8187	50 %	0 %	25 %	25 %	389855718
26	NC_017950	TCAG	2	8	9120	9127	25 %	25 %	25 %	25 %	389855718
27	NC_017950	TTGA	2	8	9358	9365	25 %	50 %	25 %	0 %	389855718
28	NC_017950	TACT	2	8	9397	9404	25 %	50 %	0 %	25 %	389855718
29	NC_017950	AAGG	2	8	9678	9685	50 %	0 %	50 %	0 %	389855718
30	NC_017950	GAAG	2	8	9799	9806	50 %	0 %	50 %	0 %	389855719
31	NC_017950	TCTT	2	8	10129	10136	0 %	75 %	0 %	25 %	389855720
32	NC_017950	TGCC	2	8	10144	10151	0 %	25 %	25 %	50 %	389855720
33	NC_017950	CTAT	2	8	10608	10615	25 %	50 %	0 %	25 %	389855722
34	NC_017950	AGTG	2	8	11471	11478	25 %	25 %	50 %	0 %	389855722
35	NC_017950	AGAT	2	8	11779	11786	50 %	25 %	25 %	0 %	389855723
36	NC_017950	GAAG	2	8	12094	12101	50 %	0 %	50 %	0 %	389855723
37	NC_017950	GATT	2	8	12162	12169	25 %	50 %	25 %	0 %	389855723
38	NC_017950	AGGC	2	8	12824	12831	25 %	0 %	50 %	25 %	389855723
39	NC_017950	TAAA	2	8	12858	12865	75 %	25 %	0 %	0 %	389855723
40	NC_017950	CTTG	2	8	14318	14325	0 %	50 %	25 %	25 %	389855725
41	NC_017950	TGTT	2	8	14392	14399	0 %	75 %	25 %	0 %	389855725
42	NC_017950	GTTC	2	8	14418	14425	0 %	50 %	25 %	25 %	389855725
43	NC_017950	GTCG	2	8	14487	14494	0 %	25 %	50 %	25 %	389855725
44	NC_017950	CAAC	2	8	14546	14553	50 %	0 %	0 %	50 %	389855725
45	NC_017950	ATGG	2	8	14565	14572	25 %	25 %	50 %	0 %	389855725
46	NC_017950	CAAC	2	8	14608	14615	50 %	0 %	0 %	50 %	389855725
47	NC_017950	TTGG	2	8	14673	14680	0 %	50 %	50 %	0 %	389855725
48	NC_017950	AAGA	2	8	14913	14920	75 %	0 %	25 %	0 %	389855725
49	NC_017950	TTAT	2	8	15745	15752	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017950	AAAT	2	8	15851	15858	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017950	ATTA	2	8	16331	16338	50 %	50 %	0 %	0 %	389855726
52	NC_017950	GTGA	2	8	17483	17490	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017950	AGCG	2	8	17654	17661	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017950	AGCC	2	8	18536	18543	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017950	GTAA	2	8	19116	19123	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017950	TCAC	2	8	19173	19180	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017950	GCGA	2	8	19272	19279	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017950	ATTC	2	8	20138	20145	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017950	CTAA	2	8	20494	20501	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017950	CTGA	2	8	20768	20775	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017950	TAGG	2	8	21150	21157	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017950	ATCG	2	8	21960	21967	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017950	GCGT	2	8	23237	23244	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017950	TTTG	2	8	23766	23773	0 %	75 %	25 %	0 %	389855727
65	NC_017950	TTTA	2	8	24213	24220	25 %	75 %	0 %	0 %	389855727
66	NC_017950	CAAA	2	8	24523	24530	75 %	0 %	0 %	25 %	389855727
67	NC_017950	GGTC	2	8	24621	24628	0 %	25 %	50 %	25 %	389855728
68	NC_017950	TCTA	2	8	25174	25181	25 %	50 %	0 %	25 %	389855729
69	NC_017950	ATCA	2	8	25513	25520	50 %	25 %	0 %	25 %	389855729
70	NC_017950	TAGG	2	8	27392	27399	25 %	25 %	50 %	0 %	389855730
71	NC_017950	CTTT	2	8	27561	27568	0 %	75 %	0 %	25 %	389855730
72	NC_017950	TTTG	2	8	27847	27854	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017950	ATTG	2	8	28363	28370	25 %	50 %	25 %	0 %	389855731
74	NC_017950	TTGA	2	8	28574	28581	25 %	50 %	25 %	0 %	389855731
75	NC_017950	TGAT	2	8	28587	28594	25 %	50 %	25 %	0 %	389855731
76	NC_017950	TTTG	2	8	28852	28859	0 %	75 %	25 %	0 %	389855731
77	NC_017950	ATTT	2	8	28914	28921	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017950	GTCT	2	8	30324	30331	0 %	50 %	25 %	25 %	389855733
79	NC_017950	TGGG	2	8	30935	30942	0 %	25 %	75 %	0 %	389855734
80	NC_017950	TCAA	2	8	30974	30981	50 %	25 %	0 %	25 %	389855734
81	NC_017950	AAGA	2	8	31132	31139	75 %	0 %	25 %	0 %	389855734
82	NC_017950	CGTG	2	8	31401	31408	0 %	25 %	50 %	25 %	389855734
83	NC_017950	TCAA	2	8	31654	31661	50 %	25 %	0 %	25 %	389855734
84	NC_017950	AACC	2	8	31703	31710	50 %	0 %	0 %	50 %	389855734
85	NC_017950	CTTG	2	8	31761	31768	0 %	50 %	25 %	25 %	389855734
86	NC_017950	AATT	2	8	31944	31951	50 %	50 %	0 %	0 %	389855735
87	NC_017950	GCTG	2	8	32872	32879	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_017950	AAGA	2	8	33142	33149	75 %	0 %	25 %	0 %	389855737
89	NC_017950	TGAA	2	8	33209	33216	50 %	25 %	25 %	0 %	389855737
90	NC_017950	TTCA	2	8	34336	34343	25 %	50 %	0 %	25 %	389855738
91	NC_017950	TACT	2	8	34401	34408	25 %	50 %	0 %	25 %	389855738
92	NC_017950	GACA	2	8	34539	34546	50 %	0 %	25 %	25 %	389855738
93	NC_017950	CGTG	2	8	34959	34966	0 %	25 %	50 %	25 %	389855738
94	NC_017950	ACAG	2	8	35139	35146	50 %	0 %	25 %	25 %	389855738
95	NC_017950	TTCC	2	8	35547	35554	0 %	50 %	0 %	50 %	389855738
96	NC_017950	GCAG	2	8	35997	36004	25 %	0 %	50 %	25 %	389855738
97	NC_017950	TACC	2	8	36214	36221	25 %	25 %	0 %	50 %	389855738
98	NC_017950	CCAA	2	8	37079	37086	50 %	0 %	0 %	50 %	389855738
99	NC_017950	GGAA	2	8	37188	37195	50 %	0 %	50 %	0 %	389855738
100	NC_017950	GACG	2	8	37206	37213	25 %	0 %	50 %	25 %	389855738
101	NC_017950	TCAG	2	8	37250	37257	25 %	25 %	25 %	25 %	389855738
102	NC_017950	AAGA	2	8	37417	37424	75 %	0 %	25 %	0 %	389855738
103	NC_017950	AAAT	2	8	37465	37472	75 %	25 %	0 %	0 %	389855738
104	NC_017950	AGTT	2	8	37829	37836	25 %	50 %	25 %	0 %	389855739
105	NC_017950	TGGT	2	8	38338	38345	0 %	50 %	50 %	0 %	389855739
106	NC_017950	CAAC	2	8	38451	38458	50 %	0 %	0 %	50 %	389855739
107	NC_017950	ACCT	2	8	38748	38755	25 %	25 %	0 %	50 %	389855739
108	NC_017950	CCAG	2	8	39044	39051	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017950	ATAA	2	8	39792	39799	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017950	AGCC	2	8	40129	40136	25 %	0 %	25 %	50 %	389855741
111	NC_017950	GATT	2	8	40192	40199	25 %	50 %	25 %	0 %	389855741
112	NC_017950	CTGG	2	8	40251	40258	0 %	25 %	50 %	25 %	389855741
113	NC_017950	TTGG	2	8	41442	41449	0 %	50 %	50 %	0 %	389855743
114	NC_017950	TTGA	2	8	41648	41655	25 %	50 %	25 %	0 %	389855743
115	NC_017950	TTCG	2	8	41760	41767	0 %	50 %	25 %	25 %	389855743
116	NC_017950	CAAG	2	8	41941	41948	50 %	0 %	25 %	25 %	389855743
117	NC_017950	GCAG	2	8	42214	42221	25 %	0 %	50 %	25 %	389855743
118	NC_017950	GCTA	2	8	42382	42389	25 %	25 %	25 %	25 %	389855743
119	NC_017950	AACC	2	8	42676	42683	50 %	0 %	0 %	50 %	389855743
120	NC_017950	CGTC	2	8	42690	42697	0 %	25 %	25 %	50 %	389855743
121	NC_017950	AATA	2	8	43200	43207	75 %	25 %	0 %	0 %	389855744
122	NC_017950	GTCA	2	8	43418	43425	25 %	25 %	25 %	25 %	389855744
123	NC_017950	TTAT	2	8	43483	43490	25 %	75 %	0 %	0 %	389855744
124	NC_017950	GTTT	2	8	43548	43555	0 %	75 %	25 %	0 %	389855744
125	NC_017950	TGAT	2	8	43730	43737	25 %	50 %	25 %	0 %	389855744
126	NC_017950	GGCG	2	8	44567	44574	0 %	0 %	75 %	25 %	389855745
127	NC_017950	TGCT	2	8	45292	45299	0 %	50 %	25 %	25 %	389855746
128	NC_017950	GTCC	2	8	45560	45567	0 %	25 %	25 %	50 %	389855746
129	NC_017950	GAAA	2	8	45645	45652	75 %	0 %	25 %	0 %	389855746
130	NC_017950	AAAG	2	8	45797	45804	75 %	0 %	25 %	0 %	389855747
131	NC_017950	GCGG	2	8	45891	45898	0 %	0 %	75 %	25 %	389855747
132	NC_017950	CCTG	2	8	45938	45945	0 %	25 %	25 %	50 %	389855747
133	NC_017950	TAAT	2	8	47299	47306	50 %	50 %	0 %	0 %	389855749
134	NC_017950	TCAA	2	8	47569	47576	50 %	25 %	0 %	25 %	389855749
135	NC_017950	GTTT	2	8	47919	47926	0 %	75 %	25 %	0 %	389855749
136	NC_017950	TAAT	2	8	48211	48218	50 %	50 %	0 %	0 %	389855749
137	NC_017950	GATT	2	8	48881	48888	25 %	50 %	25 %	0 %	389855749
138	NC_017950	CAAT	2	8	49067	49074	50 %	25 %	0 %	25 %	389855749
139	NC_017950	ACAT	2	8	50040	50047	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_017950	TTGG	2	8	50265	50272	0 %	50 %	50 %	0 %	389855750
141	NC_017950	CAGC	2	8	51258	51265	25 %	0 %	25 %	50 %	389855750
142	NC_017950	TTGA	2	8	51280	51287	25 %	50 %	25 %	0 %	389855750
143	NC_017950	GCTG	2	8	52227	52234	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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