MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis ST1 chromosome

Total Repeats: 41086

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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41002	NC_017950	CAT	2	6	2031124	2031129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389857693
41003	NC_017950	ACT	2	6	2031133	2031138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389857693
41004	NC_017950	TGTT	2	8	2031157	2031164	0 %	75 %	25 %	0 %	389857693
41005	NC_017950	CTT	2	6	2031176	2031181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389857693
41006	NC_017950	A	6	6	2031193	2031198	100 %	0 %	0 %	0 %	389857693
41007	NC_017950	A	6	6	2031211	2031216	100 %	0 %	0 %	0 %	389857693
41008	NC_017950	A	6	6	2031266	2031271	100 %	0 %	0 %	0 %	389857693
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41010	NC_017950	ACT	2	6	2031444	2031449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389857694
41011	NC_017950	CTG	2	6	2031466	2031471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389857694
41012	NC_017950	TCA	2	6	2031549	2031554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389857694
41013	NC_017950	T	7	7	2031567	2031573	0 %	100 %	0 %	0 %	389857694
41014	NC_017950	ACC	2	6	2031598	2031603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389857694
41015	NC_017950	GAT	2	6	2031604	2031609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389857694
41016	NC_017950	TTC	2	6	2031664	2031669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389857694
41017	NC_017950	CTT	2	6	2031747	2031752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389857694
41018	NC_017950	T	7	7	2031751	2031757	0 %	100 %	0 %	0 %	389857694
41019	NC_017950	T	6	6	2031798	2031803	0 %	100 %	0 %	0 %	389857694
41020	NC_017950	CTT	2	6	2031870	2031875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389857694
41021	NC_017950	TTTC	2	8	2031885	2031892	0 %	75 %	0 %	25 %	389857694
41022	NC_017950	ATTTT	2	10	2031912	2031921	20 %	80 %	0 %	0 %	389857694
41023	NC_017950	AAT	2	6	2031927	2031932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41024	NC_017950	GATT	2	8	2032031	2032038	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41025	NC_017950	AAGA	2	8	2032062	2032069	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41026	NC_017950	A	6	6	2032119	2032124	100 %	0 %	0 %	0 %	389857695
41027	NC_017950	T	6	6	2032158	2032163	0 %	100 %	0 %	0 %	389857695
41028	NC_017950	TTC	2	6	2032194	2032199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389857695
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41035	NC_017950	ATC	2	6	2032373	2032378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389857695
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41037	NC_017950	TTA	2	6	2032465	2032470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389857695
41038	NC_017950	A	6	6	2032510	2032515	100 %	0 %	0 %	0 %	389857695
41039	NC_017950	TTG	2	6	2032528	2032533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389857695
41040	NC_017950	CAG	2	6	2032573	2032578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389857695
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41043	NC_017950	ACAA	2	8	2032742	2032749	75 %	0 %	0 %	25 %	389857695
41044	NC_017950	ATG	2	6	2032921	2032926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389857695
41045	NC_017950	TAT	2	6	2032934	2032939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389857695
41046	NC_017950	A	6	6	2032951	2032956	100 %	0 %	0 %	0 %	389857695
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41051	NC_017950	TTA	2	6	2033222	2033227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389857695
41052	NC_017950	AAT	2	6	2033232	2033237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389857695
41053	NC_017950	AAAC	2	8	2033241	2033248	75 %	0 %	0 %	25 %	389857695
41054	NC_017950	AGA	2	6	2033276	2033281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389857695
41055	NC_017950	AAT	2	6	2033290	2033295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389857695
41056	NC_017950	T	8	8	2033331	2033338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41057	NC_017950	AT	3	6	2033351	2033356	50 %	50 %	0 %	0 %	389857696
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41085	NC_017950	ATTT	2	8	2034131	2034138	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41086	NC_017950	T	6	6	2034273	2034278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.