MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis ST1 chromosome

Total Repeats: 41086

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017950	GTC	2	6	219933	219938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389855926
4502	NC_017950	TCCT	2	8	220038	220045	0 %	50 %	0 %	50 %	389855926
4503	NC_017950	CAA	2	6	220064	220069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389855926
4504	NC_017950	GTT	2	6	220098	220103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389855926
4505	NC_017950	TTC	2	6	220173	220178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389855926
4506	NC_017950	AAAGTC	2	12	220179	220190	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	389855926
4507	NC_017950	ATG	2	6	220192	220197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855926
4508	NC_017950	GTG	2	6	220233	220238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389855926
4509	NC_017950	TTC	2	6	220260	220265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389855926
4510	NC_017950	TGG	3	9	220301	220309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389855926
4511	NC_017950	ATT	2	6	220359	220364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389855926
4512	NC_017950	CAT	2	6	220365	220370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389855926
4513	NC_017950	CGGT	2	8	220396	220403	0 %	25 %	50 %	25 %	389855926
4514	NC_017950	TCT	2	6	220435	220440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389855926
4515	NC_017950	ACC	2	6	220516	220521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389855926
4516	NC_017950	TTC	2	6	220530	220535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389855926
4517	NC_017950	GTA	2	6	220593	220598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855926
4518	NC_017950	CCA	2	6	220633	220638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389855926
4519	NC_017950	CAGT	2	8	220651	220658	25 %	25 %	25 %	25 %	389855926
4520	NC_017950	CCA	2	6	220796	220801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389855926
4521	NC_017950	TTC	2	6	220803	220808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389855926
4522	NC_017950	AAT	2	6	220950	220955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389855926
4523	NC_017950	AAC	2	6	221019	221024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389855926
4524	NC_017950	CT	4	8	221050	221057	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4525	NC_017950	CTT	2	6	221071	221076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4526	NC_017950	AGG	2	6	221091	221096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_017950	CCT	2	6	221114	221119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4528	NC_017950	TGGT	2	8	221211	221218	0 %	50 %	50 %	0 %	389855927
4529	NC_017950	CAG	2	6	221248	221253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389855927
4530	NC_017950	TCCAA	2	10	221343	221352	40 %	20 %	0 %	40 %	389855927
4531	NC_017950	AGC	2	6	221582	221587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389855927
4532	NC_017950	CTT	2	6	221623	221628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389855927
4533	NC_017950	TCT	2	6	221637	221642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389855927
4534	NC_017950	T	7	7	221642	221648	0 %	100 %	0 %	0 %	389855927
4535	NC_017950	ACA	2	6	221694	221699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389855927
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4537	NC_017950	ACC	2	6	221768	221773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389855927
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4540	NC_017950	AGC	2	6	221843	221848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389855927
4541	NC_017950	TAGG	2	8	221906	221913	25 %	25 %	50 %	0 %	389855927
4542	NC_017950	CTT	2	6	221944	221949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389855927
4543	NC_017950	CTG	2	6	221986	221991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389855927
4544	NC_017950	CCA	2	6	222039	222044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389855927
4545	NC_017950	CAAT	2	8	222052	222059	50 %	25 %	0 %	25 %	389855927
4546	NC_017950	GAA	2	6	222247	222252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389855927
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4549	NC_017950	TGC	2	6	222428	222433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389855927
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4553	NC_017950	CTT	2	6	222853	222858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389855927
4554	NC_017950	AGA	2	6	222901	222906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389855927
4555	NC_017950	GAT	2	6	222923	222928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855927
4556	NC_017950	CTG	2	6	222967	222972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389855927
4557	NC_017950	T	6	6	223001	223006	0 %	100 %	0 %	0 %	389855927
4558	NC_017950	GT	3	6	223043	223048	0 %	50 %	50 %	0 %	389855927
4559	NC_017950	CTT	2	6	223099	223104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389855927
4560	NC_017950	AT	3	6	223119	223124	50 %	50 %	0 %	0 %	389855927
4561	NC_017950	T	6	6	223164	223169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_017950	TC	3	6	223175	223180	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4563	NC_017950	T	6	6	223192	223197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_017950	A	6	6	223247	223252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_017950	T	8	8	223275	223282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4568	NC_017950	A	6	6	223391	223396	100 %	0 %	0 %	0 %	389855928
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4572	NC_017950	TAG	2	6	223671	223676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855928
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4575	NC_017950	GA	3	6	224068	224073	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_017950	T	6	6	224088	224093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4577	NC_017950	ATAG	2	8	224102	224109	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_017950	AAG	2	6	224110	224115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4580	NC_017950	AAAGA	2	10	224248	224257	80 %	0 %	20 %	0 %	389855929
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4598	NC_017950	TAG	2	6	224936	224941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855930
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4600	NC_017950	ATC	2	6	225001	225006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4601	NC_017950	GTT	2	6	225037	225042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_017950	TTGAT	2	10	225046	225055	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_017950	GAGTGG	2	12	225056	225067	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_017950	CAGCCT	2	12	225222	225233	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4605	NC_017950	TGATTT	2	12	225343	225354	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_017950	AT	3	6	225469	225474	50 %	50 %	0 %	0 %	389855931
4607	NC_017950	AAT	2	6	225476	225481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389855931
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4609	NC_017950	A	6	6	225519	225524	100 %	0 %	0 %	0 %	389855931
4610	NC_017950	GAA	2	6	225557	225562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389855931
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4612	NC_017950	GACA	2	8	225622	225629	50 %	0 %	25 %	25 %	389855931
4613	NC_017950	GCT	2	6	225668	225673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389855931
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4617	NC_017950	CTCC	2	8	225868	225875	0 %	25 %	0 %	75 %	389855931
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4625	NC_017950	ATC	2	6	226320	226325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389855931
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