MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Streptococcus thermophilus MN-ZLW-002 chromosome

Total Repeats: 24887

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017927	TAT	2	6	28	33	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017927	AGA	2	6	236	241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387908809
3	NC_017927	ATT	2	6	262	267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387908809
4	NC_017927	TCA	2	6	286	291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387908809
5	NC_017927	GAA	2	6	324	329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387908809
6	NC_017927	TGA	2	6	373	378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908809
7	NC_017927	AAC	2	6	490	495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387908809
8	NC_017927	AGC	2	6	587	592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387908809
9	NC_017927	TAA	2	6	692	697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387908809
10	NC_017927	TTA	2	6	751	756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387908809
11	NC_017927	TGA	2	6	836	841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908809
12	NC_017927	ATA	3	9	916	924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387908809
13	NC_017927	GGA	2	6	1437	1442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387908809
14	NC_017927	ACT	2	6	1563	1568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017927	CTA	5	15	1661	1675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017927	ATA	2	6	1678	1683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017927	TAA	2	6	1685	1690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017927	TAA	2	6	1722	1727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387908810
19	NC_017927	AGA	2	6	1887	1892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387908810
20	NC_017927	GTA	2	6	1922	1927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908810
21	NC_017927	GTT	2	6	1957	1962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387908810
22	NC_017927	GAA	2	6	1993	1998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387908810
23	NC_017927	AAG	2	6	2084	2089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387908810
24	NC_017927	GCA	2	6	2158	2163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387908810
25	NC_017927	GTC	2	6	2177	2182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387908810
26	NC_017927	GTA	2	6	2305	2310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908810
27	NC_017927	CAG	2	6	2339	2344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387908810
28	NC_017927	TCT	2	6	2378	2383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387908810
29	NC_017927	ATC	2	6	2584	2589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387908810
30	NC_017927	CAG	2	6	2786	2791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387908810
31	NC_017927	AGG	2	6	2880	2885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017927	GAA	2	6	2921	2926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387908811
33	NC_017927	ATG	2	6	3036	3041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908811
34	NC_017927	GTC	2	6	3043	3048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387908811
35	NC_017927	AAG	2	6	3060	3065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387908811
36	NC_017927	CTA	2	6	3107	3112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017927	CAG	2	6	3306	3311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387908812
38	NC_017927	GCT	2	6	3380	3385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387908812
39	NC_017927	CAA	2	6	3399	3404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387908812
40	NC_017927	GAT	2	6	3617	3622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908812
41	NC_017927	TTC	2	6	3801	3806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387908812
42	NC_017927	AGA	2	6	3826	3831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387908812
43	NC_017927	GAA	2	6	3866	3871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387908812
44	NC_017927	ACA	2	6	3902	3907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387908812
45	NC_017927	TGA	2	6	3934	3939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908812
46	NC_017927	TGA	2	6	3958	3963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908812
47	NC_017927	AGT	2	6	4015	4020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908812
48	NC_017927	GAA	2	6	4043	4048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387908812
49	NC_017927	GAT	2	6	4061	4066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908812
50	NC_017927	GCA	2	6	4133	4138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387908812
51	NC_017927	AGC	2	6	4228	4233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387908812
52	NC_017927	AAG	2	6	4329	4334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387908812
53	NC_017927	GAA	2	6	4349	4354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387908812
54	NC_017927	TGT	2	6	4366	4371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387908812
55	NC_017927	AAT	2	6	4480	4485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387908813
56	NC_017927	TAG	2	6	4494	4499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908813
57	NC_017927	CAA	2	6	4671	4676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387908813
58	NC_017927	TTA	2	6	4720	4725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387908813
59	NC_017927	GGA	2	6	4738	4743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387908813
60	NC_017927	GAT	2	6	4760	4765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908813
61	NC_017927	CAG	2	6	4809	4814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387908813
62	NC_017927	ACT	2	6	5001	5006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387908813
63	NC_017927	GAA	2	6	5075	5080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387908814
64	NC_017927	TCA	2	6	5081	5086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387908814
65	NC_017927	TAG	2	6	5242	5247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908814
66	NC_017927	GAT	2	6	5298	5303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908814
67	NC_017927	GCT	2	6	5310	5315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387908814
68	NC_017927	TGT	2	6	5708	5713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387908814
69	NC_017927	CGG	2	6	5722	5727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387908814
70	NC_017927	AGA	2	6	5747	5752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387908814
71	NC_017927	TGA	2	6	5948	5953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908814
72	NC_017927	TCA	2	6	6023	6028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387908814
73	NC_017927	ACT	2	6	6052	6057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387908814
74	NC_017927	CTT	2	6	6101	6106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387908814
75	NC_017927	TCG	2	6	6218	6223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387908814
76	NC_017927	TAG	2	6	6326	6331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908814
77	NC_017927	GTT	2	6	6411	6416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387908814
78	NC_017927	CGT	2	6	6456	6461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387908814
79	NC_017927	TGT	2	6	6530	6535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387908814
80	NC_017927	ACT	2	6	6604	6609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387908814
81	NC_017927	TGC	2	6	6629	6634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387908814
82	NC_017927	TAA	2	6	6710	6715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387908814
83	NC_017927	ATG	2	6	6721	6726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908814
84	NC_017927	GAT	3	9	6840	6848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908814
85	NC_017927	TGC	2	6	7004	7009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387908814
86	NC_017927	ATG	2	6	7024	7029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908814
87	NC_017927	ATT	3	9	7200	7208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387908814
88	NC_017927	TTG	2	6	7221	7226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387908814
89	NC_017927	TGA	2	6	7268	7273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908814
90	NC_017927	AAC	2	6	7276	7281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387908814
91	NC_017927	ATT	2	6	7407	7412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387908814
92	NC_017927	GTA	2	6	7798	7803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908814
93	NC_017927	ATC	2	6	7831	7836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387908814
94	NC_017927	TCG	2	6	8060	8065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387908814
95	NC_017927	TGC	2	6	8285	8290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387908814
96	NC_017927	ATC	2	6	8325	8330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387908814
97	NC_017927	TTC	2	6	8358	8363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387908814
98	NC_017927	ATT	2	6	8442	8447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387908814
99	NC_017927	AGA	2	6	8703	8708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017927	AAG	2	6	8796	8801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387908815
101	NC_017927	GCA	2	6	8951	8956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387908815
102	NC_017927	AAG	2	6	9003	9008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387908815
103	NC_017927	GTT	2	6	9123	9128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387908816
104	NC_017927	GAT	2	6	9276	9281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908816
105	NC_017927	TTA	2	6	9357	9362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387908816
106	NC_017927	GAA	2	6	9484	9489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387908817
107	NC_017927	CTG	2	6	9521	9526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387908818
108	NC_017927	TCT	2	6	9535	9540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387908818
109	NC_017927	TGA	2	6	9834	9839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908818
110	NC_017927	TTA	2	6	10002	10007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387908818
111	NC_017927	AGC	2	6	10133	10138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387908818
112	NC_017927	AGC	2	6	10155	10160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387908818
113	NC_017927	TAT	2	6	10216	10221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387908818
114	NC_017927	TGA	2	6	10344	10349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908818
115	NC_017927	TTA	2	6	10425	10430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387908818
116	NC_017927	AGC	2	6	10524	10529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387908818
117	NC_017927	ATT	2	6	10570	10575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387908818
118	NC_017927	ATG	2	6	10598	10603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908818
119	NC_017927	ATG	2	6	10673	10678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908818
120	NC_017927	AAG	2	6	10730	10735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387908818
121	NC_017927	GAT	2	6	10762	10767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908818
122	NC_017927	AAT	2	6	10784	10789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387908818
123	NC_017927	TTG	2	6	10800	10805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387908819
124	NC_017927	ATG	2	6	10809	10814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908819
125	NC_017927	TAG	2	6	10852	10857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387908819
126	NC_017927	TGC	2	6	10888	10893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387908819
127	NC_017927	GAA	2	6	10980	10985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387908819
128	NC_017927	ATT	2	6	10987	10992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387908819
129	NC_017927	GCC	2	6	11064	11069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387908819
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