MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptomyces hygroscopicus subsp. jinggangensis 5008 plasmid pSHJG1

Total Repeats: 4299

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017766	GGCA	2	8	18784	18791	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
502	NC_017766	CAG	2	6	18793	18798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_017766	GCA	2	6	18843	18848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_017766	CGA	2	6	18874	18879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_017766	AGC	3	9	18895	18903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_017766	GCG	2	6	18931	18936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835859
507	NC_017766	AGC	3	9	18986	18994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835859
508	NC_017766	GGC	2	6	19015	19020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835859
509	NC_017766	GTC	2	6	19024	19029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386835859
510	NC_017766	GGC	2	6	19035	19040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835859
511	NC_017766	TGC	2	6	19042	19047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386835859
512	NC_017766	GCGA	2	8	19049	19056	25 %	0 %	50 %	25 %	386835859
513	NC_017766	CCG	2	6	19062	19067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835859
514	NC_017766	GGGGC	2	10	19089	19098	0 %	0 %	80 %	20 %	386835859
515	NC_017766	TGG	2	6	19121	19126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386835859
516	NC_017766	CG	3	6	19132	19137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
517	NC_017766	GCT	2	6	19165	19170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_017766	ACG	2	6	19207	19212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_017766	CG	3	6	19218	19223	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
520	NC_017766	TCG	2	6	19260	19265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386835860
521	NC_017766	TGCG	2	8	19296	19303	0 %	25 %	50 %	25 %	386835860
522	NC_017766	CGG	2	6	19318	19323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835860
523	NC_017766	GCG	2	6	19455	19460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835860
524	NC_017766	GC	3	6	19462	19467	0 %	0 %	50 %	50 %	386835860
525	NC_017766	GCG	2	6	19479	19484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835860
526	NC_017766	GTT	2	6	19556	19561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_017766	AGC	2	6	19562	19567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_017766	CGG	2	6	19571	19576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_017766	CTC	2	6	19597	19602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386835861
530	NC_017766	GCG	2	6	19604	19609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835861
531	NC_017766	GGCC	2	8	19630	19637	0 %	0 %	50 %	50 %	386835861
532	NC_017766	CTG	2	6	19665	19670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386835861
533	NC_017766	GCA	2	6	19720	19725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835861
534	NC_017766	GCG	2	6	19742	19747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835861
535	NC_017766	GTC	2	6	19758	19763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386835861
536	NC_017766	CTG	3	9	19805	19813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386835861
537	NC_017766	GCCA	2	8	19886	19893	25 %	0 %	25 %	50 %	386835861
538	NC_017766	CCG	3	9	19933	19941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835861
539	NC_017766	TGG	2	6	20042	20047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386835861
540	NC_017766	GTC	3	9	20061	20069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386835861
541	NC_017766	CGGG	2	8	20094	20101	0 %	0 %	75 %	25 %	386835861
542	NC_017766	GGC	2	6	20141	20146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835861
543	NC_017766	CAC	2	6	20165	20170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386835861
544	NC_017766	TG	3	6	20290	20295	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
545	NC_017766	CGC	2	6	20419	20424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835862
546	NC_017766	GGT	2	6	20482	20487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386835862
547	NC_017766	CGG	2	6	20553	20558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835862
548	NC_017766	GGAC	2	8	20562	20569	25 %	0 %	50 %	25 %	386835862
549	NC_017766	CG	3	6	20598	20603	0 %	0 %	50 %	50 %	386835862
550	NC_017766	GAA	2	6	20626	20631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386835862
551	NC_017766	CG	3	6	20638	20643	0 %	0 %	50 %	50 %	386835862
552	NC_017766	GGC	2	6	20650	20655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835862
553	NC_017766	CGG	2	6	20693	20698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835863
554	NC_017766	CGC	2	6	20699	20704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835863
555	NC_017766	CTG	2	6	20745	20750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386835863
556	NC_017766	GCT	2	6	20801	20806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386835863
557	NC_017766	CTC	2	6	20841	20846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386835863
558	NC_017766	CAG	2	6	20847	20852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835863
559	NC_017766	TGG	2	6	20861	20866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386835863
560	NC_017766	CTC	2	6	20874	20879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386835863
561	NC_017766	CGG	2	6	20957	20962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_017766	GCT	2	6	21049	21054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_017766	CGTCGG	2	12	21105	21116	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_017766	GCG	2	6	21159	21164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_017766	GTT	2	6	21187	21192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_017766	GC	3	6	21212	21217	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
567	NC_017766	GAC	2	6	21273	21278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_017766	TG	3	6	21300	21305	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
569	NC_017766	GAA	2	6	21309	21314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_017766	GGC	2	6	21387	21392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_017766	CGC	2	6	21398	21403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
572	NC_017766	AAG	2	6	21422	21427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386835864
573	NC_017766	CCG	2	6	21533	21538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835864
574	NC_017766	GGCT	2	8	21564	21571	0 %	25 %	50 %	25 %	386835864
575	NC_017766	GCCGC	2	10	21607	21616	0 %	0 %	40 %	60 %	386835864
576	NC_017766	GCA	2	6	21637	21642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835864
577	NC_017766	CTT	2	6	21733	21738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386835864
578	NC_017766	CGC	2	6	21820	21825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835865
579	NC_017766	CG	3	6	21857	21862	0 %	0 %	50 %	50 %	386835865
580	NC_017766	ACT	2	6	21915	21920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386835865
581	NC_017766	CCG	2	6	21922	21927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835865
582	NC_017766	GC	3	6	21937	21942	0 %	0 %	50 %	50 %	386835865
583	NC_017766	GTGC	2	8	22063	22070	0 %	25 %	50 %	25 %	386835865
584	NC_017766	CCT	2	6	22233	22238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386835866
585	NC_017766	GAG	2	6	22285	22290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386835866
586	NC_017766	GGC	2	6	22297	22302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835866
587	NC_017766	GGACC	2	10	22318	22327	20 %	0 %	40 %	40 %	386835866
588	NC_017766	GGA	2	6	22350	22355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386835866
589	NC_017766	CTG	2	6	22366	22371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386835866
590	NC_017766	GGC	2	6	22466	22471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835866
591	NC_017766	CCG	2	6	22505	22510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835866
592	NC_017766	C	6	6	22520	22525	0 %	0 %	0 %	100 %	386835866
593	NC_017766	GCC	2	6	22560	22565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835866
594	NC_017766	CCG	2	6	22568	22573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835866
595	NC_017766	CCGG	2	8	22593	22600	0 %	0 %	50 %	50 %	386835866
596	NC_017766	ACGG	2	8	22601	22608	25 %	0 %	50 %	25 %	386835866
597	NC_017766	CGTC	2	8	22614	22621	0 %	25 %	25 %	50 %	386835866
598	NC_017766	CGA	2	6	22630	22635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835866
599	NC_017766	GCCA	2	8	22672	22679	25 %	0 %	25 %	50 %	386835866
600	NC_017766	GTGA	2	8	22699	22706	25 %	25 %	50 %	0 %	386835866
601	NC_017766	GCA	2	6	22712	22717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835866
602	NC_017766	ACG	2	6	22769	22774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835866
603	NC_017766	TGG	2	6	22840	22845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386835866
604	NC_017766	CGC	2	6	22851	22856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835866
605	NC_017766	CGC	2	6	22875	22880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835866
606	NC_017766	CCT	2	6	22884	22889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386835866
607	NC_017766	CGC	2	6	22890	22895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835866
608	NC_017766	CCA	2	6	22896	22901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386835866
609	NC_017766	CG	3	6	22930	22935	0 %	0 %	50 %	50 %	386835866
610	NC_017766	CCGG	2	8	22965	22972	0 %	0 %	50 %	50 %	386835866
611	NC_017766	CCAG	2	8	22986	22993	25 %	0 %	25 %	50 %	386835866
612	NC_017766	GCACC	2	10	22998	23007	20 %	0 %	20 %	60 %	386835866
613	NC_017766	AAG	2	6	23048	23053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386835866
614	NC_017766	CGAC	2	8	23117	23124	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
615	NC_017766	CGT	2	6	23132	23137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_017766	CAG	2	6	23143	23148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_017766	GTC	2	6	23149	23154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_017766	AGG	2	6	23163	23168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
619	NC_017766	AAC	2	6	23179	23184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_017766	ATC	2	6	23185	23190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_017766	CGT	2	6	23196	23201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_017766	CG	4	8	23238	23245	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
623	NC_017766	CAG	2	6	23322	23327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_017766	CCCT	2	8	23521	23528	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
625	NC_017766	CGG	2	6	23552	23557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_017766	CGA	2	6	23573	23578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_017766	CGC	2	6	23612	23617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
628	NC_017766	GCCG	2	8	23628	23635	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
629	NC_017766	CCA	2	6	23658	23663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386835867
630	NC_017766	AGG	2	6	23664	23669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386835867
631	NC_017766	TGG	2	6	23685	23690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386835867
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757	NC_017766	CCGTG	2	10	29449	29458	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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