MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptomyces hygroscopicus subsp. jinggangensis 5008 chromosome

Total Repeats: 294576

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017765	CT	3	6	38576	38581	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1002	NC_017765	GCC	2	6	38588	38593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1003	NC_017765	CGG	2	6	38605	38610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_017765	G	7	7	38643	38649	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_017765	GT	3	6	38663	38668	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_017765	GCA	2	6	38681	38686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_017765	GCG	2	6	38729	38734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_017765	GGC	2	6	38736	38741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_017765	CG	3	6	38763	38768	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1010	NC_017765	CTCG	2	8	38771	38778	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1011	NC_017765	TCG	2	6	38783	38788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_017765	CGGG	2	8	38810	38817	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1013	NC_017765	CGAT	2	8	38833	38840	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1014	NC_017765	CCG	2	6	38849	38854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1015	NC_017765	GCC	2	6	38950	38955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836130
1016	NC_017765	GGTGCT	2	12	38988	38999	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386836130
1017	NC_017765	TGGTG	2	10	39024	39033	0 %	40 %	60 %	0 %	386836130
1018	NC_017765	GTG	2	6	39097	39102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836130
1019	NC_017765	TGC	2	6	39107	39112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836130
1020	NC_017765	GTG	2	6	39124	39129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836130
1021	NC_017765	CGG	2	6	39140	39145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836130
1022	NC_017765	GAC	2	6	39163	39168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836130
1023	NC_017765	TGC	2	6	39185	39190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836130
1024	NC_017765	GAA	2	6	39237	39242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386836130
1025	NC_017765	GCT	2	6	39255	39260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836130
1026	NC_017765	GCT	2	6	39264	39269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836130
1027	NC_017765	CCGG	2	8	39319	39326	0 %	0 %	50 %	50 %	386836130
1028	NC_017765	CCGG	2	8	39344	39351	0 %	0 %	50 %	50 %	386836130
1029	NC_017765	GCG	2	6	39355	39360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836130
1030	NC_017765	GCT	4	12	39375	39386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836130
1031	NC_017765	GAA	2	6	39402	39407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386836130
1032	NC_017765	CGGG	2	8	39408	39415	0 %	0 %	75 %	25 %	386836130
1033	NC_017765	GCG	2	6	39425	39430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836130
1034	NC_017765	GCG	3	9	39457	39465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836130
1035	NC_017765	GCT	2	6	39477	39482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836130
1036	NC_017765	CGG	2	6	39497	39502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836130
1037	NC_017765	GGA	2	6	39525	39530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386836130
1038	NC_017765	CGG	2	6	39602	39607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836130
1039	NC_017765	GGA	2	6	39648	39653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386836130
1040	NC_017765	GCA	2	6	39698	39703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836130
1041	NC_017765	TGA	2	6	39763	39768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_017765	GTC	2	6	39833	39838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_017765	C	6	6	39842	39847	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1044	NC_017765	TGG	2	6	39856	39861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_017765	GTG	2	6	39879	39884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_017765	CG	3	6	39905	39910	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1047	NC_017765	GC	4	8	39912	39919	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1048	NC_017765	TGG	2	6	40104	40109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_017765	AGC	2	6	40110	40115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_017765	CGC	2	6	40157	40162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1051	NC_017765	CGCGGG	2	12	40193	40204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_017765	GCT	2	6	40212	40217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_017765	CGG	2	6	40220	40225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_017765	CGGT	2	8	40228	40235	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1055	NC_017765	CGG	2	6	40238	40243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_017765	GTA	2	6	40263	40268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_017765	CGA	2	6	40274	40279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_017765	GGCC	2	8	40280	40287	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1059	NC_017765	ATG	2	6	40318	40323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_017765	GCT	2	6	40326	40331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_017765	GTG	2	6	40369	40374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_017765	GCG	2	6	40398	40403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_017765	GCCG	2	8	40421	40428	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1064	NC_017765	CGC	2	6	40458	40463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1065	NC_017765	CGCC	2	8	40550	40557	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1066	NC_017765	CGGC	2	8	40568	40575	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1067	NC_017765	TCG	3	9	40599	40607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_017765	CTG	2	6	40677	40682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_017765	GAG	2	6	40749	40754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1071	NC_017765	GGGT	2	8	40819	40826	0 %	25 %	75 %	0 %	386836131
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1096	NC_017765	CGA	3	9	41794	41802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836133
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1099	NC_017765	ACC	2	6	41863	41868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386836133
1100	NC_017765	GTG	2	6	41886	41891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836133
1101	NC_017765	GAC	2	6	41912	41917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836133
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1103	NC_017765	CTG	2	6	41957	41962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836133
1104	NC_017765	GAC	2	6	42086	42091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_017765	CCA	2	6	42137	42142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1106	NC_017765	TCG	2	6	42158	42163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_017765	AGG	2	6	42246	42251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_017765	GTT	2	6	42266	42271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386836134
1109	NC_017765	GCC	2	6	42311	42316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836134
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1111	NC_017765	GAA	2	6	42422	42427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386836134
1112	NC_017765	CCGA	2	8	42429	42436	25 %	0 %	25 %	50 %	386836134
1113	NC_017765	CG	3	6	42464	42469	0 %	0 %	50 %	50 %	386836134
1114	NC_017765	GCT	2	6	42470	42475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836134
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1116	NC_017765	GCC	2	6	42525	42530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836134
1117	NC_017765	CCG	2	6	42658	42663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836134
1118	NC_017765	CAC	2	6	42680	42685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386836134
1119	NC_017765	CGACGT	2	12	42691	42702	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386836134
1120	NC_017765	GAA	2	6	42719	42724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386836134
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1123	NC_017765	GGC	2	6	42750	42755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836134
1124	NC_017765	GTC	2	6	42789	42794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836134
1125	NC_017765	CGG	2	6	42830	42835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836134
1126	NC_017765	CCGGG	2	10	42922	42931	0 %	0 %	60 %	40 %	386836134
1127	NC_017765	GCT	2	6	42947	42952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836134
1128	NC_017765	CGA	2	6	43004	43009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836134
1129	NC_017765	TCG	2	6	43018	43023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836134
1130	NC_017765	GTC	2	6	43047	43052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836134
1131	NC_017765	AGC	2	6	43054	43059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836134
1132	NC_017765	CCGCC	2	10	43118	43127	0 %	0 %	20 %	80 %	386836134
1133	NC_017765	CCT	2	6	43165	43170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386836134
1134	NC_017765	GCCG	2	8	43217	43224	0 %	0 %	50 %	50 %	386836134
1135	NC_017765	TGA	2	6	43261	43266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386836134
1136	NC_017765	CGC	2	6	43267	43272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836134
1137	NC_017765	CCG	2	6	43282	43287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836134
1138	NC_017765	TGA	2	6	43303	43308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386836134
1139	NC_017765	CG	3	6	43327	43332	0 %	0 %	50 %	50 %	386836134
1140	NC_017765	GCTC	2	8	43381	43388	0 %	25 %	25 %	50 %	386836134
1141	NC_017765	GCC	2	6	43418	43423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836134
1142	NC_017765	CGG	2	6	43486	43491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836134
1143	NC_017765	GAG	2	6	43503	43508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386836134
1144	NC_017765	CGC	2	6	43589	43594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836134
1145	NC_017765	CTG	2	6	43752	43757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836134
1146	NC_017765	GGCC	2	8	43795	43802	0 %	0 %	50 %	50 %	386836134
1147	NC_017765	GCCG	2	8	43973	43980	0 %	0 %	50 %	50 %	386836134
1148	NC_017765	TCG	2	6	44032	44037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836134
1149	NC_017765	CG	3	6	44092	44097	0 %	0 %	50 %	50 %	386836134
1150	NC_017765	GGC	2	6	44107	44112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836134
1151	NC_017765	CG	3	6	44163	44168	0 %	0 %	50 %	50 %	386836134
1152	NC_017765	CGT	2	6	44264	44269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836134
1153	NC_017765	CGG	2	6	44333	44338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836134
1154	NC_017765	AC	3	6	44535	44540	50 %	0 %	0 %	50 %	386836135
1155	NC_017765	GGC	2	6	44548	44553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836135
1156	NC_017765	CAC	2	6	44566	44571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386836135
1157	NC_017765	CAC	2	6	44584	44589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386836135
1158	NC_017765	GCC	2	6	44603	44608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836135
1159	NC_017765	CTC	2	6	44729	44734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386836135
1160	NC_017765	CCG	2	6	44775	44780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836135
1161	NC_017765	CACC	2	8	44812	44819	25 %	0 %	0 %	75 %	386836135
1162	NC_017765	AGC	2	6	44825	44830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836135
1163	NC_017765	GCC	2	6	44840	44845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1164	NC_017765	CGC	2	6	44872	44877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836136
1165	NC_017765	CCCG	2	8	44895	44902	0 %	0 %	25 %	75 %	386836136
1166	NC_017765	GC	3	6	44919	44924	0 %	0 %	50 %	50 %	386836136
1167	NC_017765	AGC	2	6	44943	44948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836136
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1170	NC_017765	CGC	2	6	45046	45051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836136
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1172	NC_017765	AAG	2	6	45071	45076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386836136
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1184	NC_017765	CGG	2	6	45331	45336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836136
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1186	NC_017765	TCC	2	6	45471	45476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1187	NC_017765	GTC	2	6	45570	45575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836137
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1189	NC_017765	TCC	2	6	45667	45672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386836137
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1191	NC_017765	CGA	2	6	45713	45718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836137
1192	NC_017765	CG	3	6	45728	45733	0 %	0 %	50 %	50 %	386836137
1193	NC_017765	GCTGC	2	10	45734	45743	0 %	20 %	40 %	40 %	386836137
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1197	NC_017765	CTC	2	6	45858	45863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386836137
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1202	NC_017765	TGT	2	6	46040	46045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1203	NC_017765	ACG	2	6	46079	46084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1204	NC_017765	GTT	2	6	46122	46127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1206	NC_017765	CGG	2	6	46330	46335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1207	NC_017765	GAAG	2	8	46353	46360	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1212	NC_017765	ACG	2	6	46531	46536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836138
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1221	NC_017765	GCC	2	6	46842	46847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1222	NC_017765	CGCGG	2	10	46881	46890	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1223	NC_017765	CGTT	2	8	46892	46899	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1224	NC_017765	GCC	2	6	46924	46929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1225	NC_017765	GCG	2	6	46991	46996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1229	NC_017765	GTGA	2	8	47268	47275	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1230	NC_017765	CT	3	6	47284	47289	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1231	NC_017765	CCG	2	6	47310	47315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1241	NC_017765	ACGG	2	8	47551	47558	25 %	0 %	50 %	25 %	386836139
1242	NC_017765	TGA	2	6	47666	47671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386836139
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1244	NC_017765	CGG	2	6	47742	47747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836139
1245	NC_017765	CACCG	2	10	47771	47780	20 %	0 %	20 %	60 %	386836139
1246	NC_017765	AGC	2	6	47785	47790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836139
1247	NC_017765	CCCG	2	8	47832	47839	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1248	NC_017765	TGG	2	6	47905	47910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1249	NC_017765	GAC	2	6	47966	47971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836140
1250	NC_017765	AGC	2	6	47974	47979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836140
1251	NC_017765	CCTTC	2	10	48088	48097	0 %	40 %	0 %	60 %	386836140
1252	NC_017765	GGC	2	6	48127	48132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836140
1253	NC_017765	AGC	2	6	48190	48195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836140
1254	NC_017765	TCA	2	6	48262	48267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386836140
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1256	NC_017765	GCCC	2	8	48455	48462	0 %	0 %	25 %	75 %	386836140
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