MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus HO 5096 0412

Total Repeats: 67694

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017763	ATT	2	6	125	130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017763	AC	3	6	234	239	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017763	TG	3	6	307	312	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017763	GTC	2	6	318	323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017763	ATTT	2	8	344	351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017763	TAA	2	6	384	389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017763	TTA	2	6	415	420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017763	ATT	2	6	432	437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017763	GT	3	6	444	449	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017763	AAGA	2	8	497	504	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017763	TAT	2	6	641	646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386829726
12	NC_017763	CAA	2	6	679	684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386829726
13	NC_017763	TGT	2	6	717	722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386829726
14	NC_017763	TAC	2	6	750	755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386829726
15	NC_017763	GAA	2	6	757	762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386829726
16	NC_017763	TAA	2	6	777	782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386829726
17	NC_017763	ACA	2	6	805	810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386829726
18	NC_017763	AAC	2	6	825	830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386829726
19	NC_017763	AG	3	6	853	858	50 %	0 %	50 %	0 %	386829726
20	NC_017763	ATT	2	6	969	974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386829726
21	NC_017763	ATGC	2	8	1012	1019	25 %	25 %	25 %	25 %	386829726
22	NC_017763	TCA	2	6	1026	1031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386829726
23	NC_017763	ATA	2	6	1040	1045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386829726
24	NC_017763	TTA	2	6	1097	1102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386829726
25	NC_017763	TTA	2	6	1162	1167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386829726
26	NC_017763	GAT	2	6	1171	1176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386829726
27	NC_017763	AAG	2	6	1208	1213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386829726
28	NC_017763	ACC	2	6	1278	1283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386829726
29	NC_017763	AGA	2	6	1302	1307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386829726
30	NC_017763	TTG	2	6	1340	1345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386829726
31	NC_017763	CCA	2	6	1354	1359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386829726
32	NC_017763	AGA	2	6	1388	1393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386829726
33	NC_017763	GAA	3	9	1399	1407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386829726
34	NC_017763	CCA	2	6	1420	1425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386829726
35	NC_017763	TA	3	6	1438	1443	50 %	50 %	0 %	0 %	386829726
36	NC_017763	CAAAT	2	10	1445	1454	60 %	20 %	0 %	20 %	386829726
37	NC_017763	ATT	2	6	1512	1517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386829726
38	NC_017763	CTG	2	6	1544	1549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386829726
39	NC_017763	A	6	6	1610	1615	100 %	0 %	0 %	0 %	386829726
40	NC_017763	A	7	7	1659	1665	100 %	0 %	0 %	0 %	386829726
41	NC_017763	AG	3	6	1714	1719	50 %	0 %	50 %	0 %	386829726
42	NC_017763	GAA	2	6	1750	1755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386829726
43	NC_017763	TGG	2	6	1758	1763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386829726
44	NC_017763	TCAT	2	8	1781	1788	25 %	50 %	0 %	25 %	386829726
45	NC_017763	A	6	6	1796	1801	100 %	0 %	0 %	0 %	386829726
46	NC_017763	AGA	2	6	1818	1823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386829726
47	NC_017763	AAG	2	6	1838	1843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386829726
48	NC_017763	TA	3	6	1907	1912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017763	TAA	3	9	1920	1928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017763	T	6	6	1935	1940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017763	TA	3	6	1948	1953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017763	CAT	2	6	2010	2015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017763	CCA	2	6	2071	2076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_017763	CTA	3	9	2088	2096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017763	TA	3	6	2116	2121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017763	TA	4	8	2124	2131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017763	TAAT	2	8	2150	2157	50 %	50 %	0 %	0 %	386829727
58	NC_017763	ATT	2	6	2181	2186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386829727
59	NC_017763	TTA	2	6	2187	2192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386829727
60	NC_017763	AAC	2	6	2230	2235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386829727
61	NC_017763	AGT	2	6	2380	2385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386829727
62	NC_017763	TTG	2	6	2403	2408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386829727
63	NC_017763	A	7	7	2416	2422	100 %	0 %	0 %	0 %	386829727
64	NC_017763	ATTA	2	8	2470	2477	50 %	50 %	0 %	0 %	386829727
65	NC_017763	AATTT	2	10	2493	2502	40 %	60 %	0 %	0 %	386829727
66	NC_017763	TTA	2	6	2531	2536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386829727
67	NC_017763	CAATT	2	10	2559	2568	40 %	40 %	0 %	20 %	386829727
68	NC_017763	GACT	2	8	2692	2699	25 %	25 %	25 %	25 %	386829727
69	NC_017763	AGA	2	6	2731	2736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386829727
70	NC_017763	TCA	2	6	2757	2762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386829727
71	NC_017763	TAAA	2	8	2787	2794	75 %	25 %	0 %	0 %	386829727
72	NC_017763	GAA	2	6	2810	2815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386829727
73	NC_017763	TCT	2	6	2826	2831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386829727
74	NC_017763	TTTA	2	8	2848	2855	25 %	75 %	0 %	0 %	386829727
75	NC_017763	ATT	2	6	2884	2889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386829727
76	NC_017763	ACA	2	6	2909	2914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386829727
77	NC_017763	AAATT	2	10	2937	2946	60 %	40 %	0 %	0 %	386829727
78	NC_017763	TTA	2	6	2993	2998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386829727
79	NC_017763	GGT	2	6	3008	3013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386829727
80	NC_017763	TTA	2	6	3021	3026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386829727
81	NC_017763	TGA	2	6	3040	3045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386829727
82	NC_017763	GTT	2	6	3047	3052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386829727
83	NC_017763	TCT	2	6	3059	3064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386829727
84	NC_017763	AGA	2	6	3091	3096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386829727
85	NC_017763	GGT	2	6	3119	3124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386829727
86	NC_017763	TTCA	2	8	3136	3143	25 %	50 %	0 %	25 %	386829727
87	NC_017763	AT	3	6	3151	3156	50 %	50 %	0 %	0 %	386829727
88	NC_017763	GATG	2	8	3157	3164	25 %	25 %	50 %	0 %	386829727
89	NC_017763	ATG	2	6	3183	3188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386829727
90	NC_017763	GTTGAA	2	12	3191	3202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386829727
91	NC_017763	TTC	2	6	3203	3208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386829727
92	NC_017763	GAC	2	6	3245	3250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386829727
93	NC_017763	AATT	2	8	3261	3268	50 %	50 %	0 %	0 %	386829727
94	NC_017763	ATAAAT	2	12	3292	3303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017763	ATTA	2	8	3317	3324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017763	T	6	6	3340	3345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017763	AAT	2	6	3352	3357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017763	AAAT	2	8	3374	3381	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017763	TAA	2	6	3447	3452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017763	TTTAAA	2	12	3469	3480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017763	A	6	6	3537	3542	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017763	AATT	2	8	3573	3580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017763	A	7	7	3629	3635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017763	AT	3	6	3642	3647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017763	ATT	2	6	3673	3678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386829728
106	NC_017763	AAG	2	6	3686	3691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386829728
107	NC_017763	GTA	2	6	3694	3699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386829728
108	NC_017763	ATT	2	6	3742	3747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386829728
109	NC_017763	TGG	2	6	3753	3758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386829728
110	NC_017763	ATTA	2	8	3792	3799	50 %	50 %	0 %	0 %	386829728
111	NC_017763	TTCT	2	8	3882	3889	0 %	75 %	0 %	25 %	386829728
112	NC_017763	TCAT	2	8	3893	3900	25 %	50 %	0 %	25 %	386829728
113	NC_017763	ATG	2	6	3952	3957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386829729
114	NC_017763	A	6	6	4176	4181	100 %	0 %	0 %	0 %	386829729
115	NC_017763	AT	3	6	4229	4234	50 %	50 %	0 %	0 %	386829729
116	NC_017763	AGA	2	6	4265	4270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386829729
117	NC_017763	CTC	2	6	4291	4296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386829729
118	NC_017763	GAC	2	6	4303	4308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386829729
119	NC_017763	CTG	2	6	4339	4344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386829729
120	NC_017763	AAT	2	6	4392	4397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386829729
121	NC_017763	A	7	7	4423	4429	100 %	0 %	0 %	0 %	386829729
122	NC_017763	CAG	2	6	4458	4463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386829729
123	NC_017763	AAG	2	6	4564	4569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386829729
124	NC_017763	ATT	2	6	4582	4587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386829729
125	NC_017763	GAA	2	6	4635	4640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386829729
126	NC_017763	ATA	2	6	4660	4665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386829729
127	NC_017763	GAT	2	6	4713	4718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386829729
128	NC_017763	TTA	3	9	4848	4856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386829729
129	NC_017763	GAT	2	6	4878	4883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386829729
130	NC_017763	TTA	2	6	4899	4904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386829729
131	NC_017763	ACA	2	6	5059	5064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386829730
132	NC_017763	GTAT	2	8	5131	5138	25 %	50 %	25 %	0 %	386829730
133	NC_017763	AG	4	8	5153	5160	50 %	0 %	50 %	0 %	386829730
134	NC_017763	ATA	2	6	5191	5196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386829730
135	NC_017763	CAAAT	2	10	5224	5233	60 %	20 %	0 %	20 %	386829730
136	NC_017763	GTT	2	6	5238	5243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386829730
137	NC_017763	A	6	6	5308	5313	100 %	0 %	0 %	0 %	386829730
138	NC_017763	TGG	2	6	5357	5362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386829730
139	NC_017763	CGG	2	6	5369	5374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386829730
140	NC_017763	TGG	2	6	5393	5398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386829730
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143	NC_017763	TCA	2	6	5480	5485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386829730
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