MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344 plasmid pCol1B9_SL1344

Total Repeats: 1188

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017718	TTA	2	6	67	72	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017718	GAG	2	6	84	89	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017718	TTA	2	6	156	161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017718	GCG	2	6	194	199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017718	AGA	2	6	264	269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017718	ACG	2	6	333	338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017718	GAA	2	6	466	471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730550
8	NC_017718	CGT	3	9	596	604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730551
9	NC_017718	CCA	2	6	615	620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730551
10	NC_017718	CCT	2	6	829	834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386730551
11	NC_017718	CAG	3	9	1139	1147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730551
12	NC_017718	CAG	2	6	1175	1180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730551
13	NC_017718	CGT	2	6	1280	1285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730551
14	NC_017718	AGC	3	9	1291	1299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730551
15	NC_017718	GAA	2	6	1321	1326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730551
16	NC_017718	CAG	2	6	1340	1345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730551
17	NC_017718	ATC	2	6	1511	1516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017718	TCA	2	6	1625	1630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017718	GTT	2	6	1643	1648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017718	AAG	2	6	1685	1690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017718	ATT	2	6	1734	1739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017718	CGC	2	6	1758	1763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_017718	CAA	2	6	1905	1910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017718	GCA	2	6	1943	1948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017718	GCC	2	6	1980	1985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_017718	AAC	2	6	2003	2008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017718	TGT	2	6	2027	2032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017718	ATC	2	6	2042	2047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017718	TCT	2	6	2056	2061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017718	TCG	2	6	2144	2149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017718	CGG	2	6	2265	2270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017718	GCC	2	6	2303	2308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_017718	GTA	2	6	2374	2379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017718	GCA	2	6	2523	2528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730552
35	NC_017718	CTG	2	6	2615	2620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730552
36	NC_017718	ATG	2	6	2661	2666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730552
37	NC_017718	AAT	2	6	2985	2990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730554
38	NC_017718	CCA	2	6	3001	3006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730554
39	NC_017718	TGG	2	6	3122	3127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730554
40	NC_017718	ACA	2	6	3194	3199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386730554
41	NC_017718	ATA	2	6	3325	3330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730554
42	NC_017718	GGT	2	6	3374	3379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730554
43	NC_017718	GCC	2	6	3423	3428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730554
44	NC_017718	GCG	2	6	3460	3465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730554
45	NC_017718	CAT	2	6	3469	3474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730554
46	NC_017718	CTG	2	6	3568	3573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730554
47	NC_017718	CCA	2	6	3655	3660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730554
48	NC_017718	TGC	2	6	3689	3694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730554
49	NC_017718	GGT	2	6	3764	3769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730554
50	NC_017718	TGC	2	6	3779	3784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730554
51	NC_017718	ATC	2	6	3787	3792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730554
52	NC_017718	CTG	2	6	3798	3803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730554
53	NC_017718	CCG	2	6	3878	3883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_017718	TTG	2	6	3885	3890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017718	GAT	2	6	3939	3944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017718	GGC	2	6	3986	3991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730555
57	NC_017718	TGC	2	6	4125	4130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730555
58	NC_017718	GTT	2	6	4238	4243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386730555
59	NC_017718	TGG	2	6	4299	4304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730555
60	NC_017718	GCC	2	6	4331	4336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730555
61	NC_017718	TTG	2	6	4436	4441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017718	TTC	2	6	4442	4447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017718	TCA	2	6	4452	4457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017718	ATG	2	6	4489	4494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017718	GTC	2	6	4557	4562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730556
66	NC_017718	TGC	2	6	4589	4594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730556
67	NC_017718	GCT	2	6	4602	4607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730556
68	NC_017718	GGT	2	6	4616	4621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730556
69	NC_017718	GAT	2	6	4651	4656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730556
70	NC_017718	AAT	2	6	4797	4802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017718	TTA	2	6	5027	5032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386730557
72	NC_017718	ATC	2	6	5092	5097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730557
73	NC_017718	ATC	3	9	5159	5167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730557
74	NC_017718	TTC	2	6	5203	5208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730558
75	NC_017718	CTG	2	6	5229	5234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730558
76	NC_017718	AAG	2	6	5343	5348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730558
77	NC_017718	AAG	2	6	5419	5424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730558
78	NC_017718	GTA	2	6	5457	5462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730558
79	NC_017718	ATA	2	6	5555	5560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730558
80	NC_017718	TCT	2	6	5633	5638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730558
81	NC_017718	CTG	2	6	5734	5739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730559
82	NC_017718	CGG	2	6	5885	5890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730559
83	NC_017718	CCA	2	6	6005	6010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730559
84	NC_017718	TTC	3	9	6116	6124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730559
85	NC_017718	CGG	2	6	6174	6179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730559
86	NC_017718	ATA	2	6	6218	6223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730559
87	NC_017718	ACG	2	6	6259	6264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730559
88	NC_017718	CAC	2	6	6271	6276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730559
89	NC_017718	TTC	2	6	6295	6300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730559
90	NC_017718	TAA	2	6	6345	6350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017718	TAA	2	6	6401	6406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017718	GTA	2	6	6435	6440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017718	TGT	2	6	6519	6524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017718	AGA	3	9	6563	6571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017718	AGA	2	6	6688	6693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730560
96	NC_017718	ATG	2	6	6829	6834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730560
97	NC_017718	TGC	2	6	6884	6889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730560
98	NC_017718	ACC	2	6	7049	7054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730560
99	NC_017718	TGA	2	6	7055	7060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730560
100	NC_017718	CTC	2	6	7115	7120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386730560
101	NC_017718	GCA	2	6	7265	7270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730560
102	NC_017718	AGA	2	6	7389	7394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730560
103	NC_017718	GCA	2	6	7424	7429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730560
104	NC_017718	TCA	2	6	7480	7485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730560
105	NC_017718	ATC	2	6	7584	7589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730560
106	NC_017718	GCA	2	6	7895	7900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730560
107	NC_017718	ATC	2	6	7960	7965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730560
108	NC_017718	TGT	2	6	8060	8065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017718	TGC	2	6	8116	8121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017718	CAG	2	6	8130	8135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017718	TAA	2	6	8212	8217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017718	GAT	2	6	8477	8482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730561
113	NC_017718	GCA	2	6	8551	8556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730561
114	NC_017718	TGC	2	6	8611	8616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730561
115	NC_017718	ATG	2	6	8751	8756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730561
116	NC_017718	AAG	2	6	8885	8890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730561
117	NC_017718	GCA	2	6	9016	9021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730561
118	NC_017718	AAC	2	6	9117	9122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386730561
119	NC_017718	TCA	2	6	9191	9196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730561
120	NC_017718	TTG	2	6	9210	9215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386730561
121	NC_017718	GTG	2	6	9219	9224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730561
122	NC_017718	TCT	2	6	9295	9300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730561
123	NC_017718	GGT	2	6	9352	9357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730561
124	NC_017718	CTG	2	6	9459	9464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730561
125	NC_017718	ATG	2	6	9528	9533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730561
126	NC_017718	GAT	2	6	9764	9769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730561
127	NC_017718	TAA	2	6	9796	9801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730561
128	NC_017718	ATG	2	6	9939	9944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730561
129	NC_017718	GCA	2	6	10016	10021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730561
130	NC_017718	GCT	2	6	10028	10033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730561
131	NC_017718	CAG	2	6	10035	10040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730561
132	NC_017718	ATT	2	6	10100	10105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386730561
133	NC_017718	GGC	2	6	10108	10113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730561
134	NC_017718	ATG	2	6	10181	10186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017718	AAT	2	6	10268	10273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730562
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262	NC_017718	ATC	2	6	19950	19955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730574
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264	NC_017718	CTG	2	6	19998	20003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730574
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388	NC_017718	GTT	2	6	27084	27089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386730582
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391	NC_017718	TCA	2	6	27147	27152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730582
392	NC_017718	AGG	2	6	27172	27177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386730582
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399	NC_017718	CTG	2	6	27380	27385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730583
400	NC_017718	ACC	2	6	27398	27403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730583
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408	NC_017718	GCG	2	6	27957	27962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730584
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426	NC_017718	TGT	2	6	28998	29003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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499	NC_017718	TTG	2	6	33405	33410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386730591
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