MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344 plasmid pCol1B9_SL1344

Total Repeats: 1755

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017718	TGT	2	6	47322	47327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386730602
1002	NC_017718	TAA	2	6	47389	47394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730602
1003	NC_017718	ATGG	2	8	47418	47425	25 %	25 %	50 %	0 %	386730602
1004	NC_017718	T	6	6	47429	47434	0 %	100 %	0 %	0 %	386730602
1005	NC_017718	GTCTG	2	10	47445	47454	0 %	40 %	40 %	20 %	386730602
1006	NC_017718	T	6	6	47476	47481	0 %	100 %	0 %	0 %	386730602
1007	NC_017718	TGAT	2	8	47521	47528	25 %	50 %	25 %	0 %	386730603
1008	NC_017718	GTT	2	6	47549	47554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386730603
1009	NC_017718	ATA	2	6	47559	47564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730603
1010	NC_017718	CCA	2	6	47711	47716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730603
1011	NC_017718	AT	3	6	47776	47781	50 %	50 %	0 %	0 %	386730603
1012	NC_017718	ATG	2	6	47929	47934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730603
1013	NC_017718	GT	3	6	48089	48094	0 %	50 %	50 %	0 %	386730603
1014	NC_017718	CGG	2	6	48170	48175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730603
1015	NC_017718	TCC	2	6	48177	48182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386730603
1016	NC_017718	CAT	2	6	48233	48238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730603
1017	NC_017718	TGC	2	6	48261	48266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730603
1018	NC_017718	CCT	2	6	48419	48424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386730603
1019	NC_017718	ATC	2	6	48451	48456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730603
1020	NC_017718	TGAT	2	8	48514	48521	25 %	50 %	25 %	0 %	386730603
1021	NC_017718	GAC	2	6	48591	48596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730603
1022	NC_017718	CTG	2	6	48597	48602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730603
1023	NC_017718	CGA	2	6	48620	48625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730603
1024	NC_017718	GAT	2	6	48836	48841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730604
1025	NC_017718	ACG	2	6	48851	48856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730604
1026	NC_017718	ATC	2	6	48953	48958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730604
1027	NC_017718	GCG	2	6	48976	48981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730604
1028	NC_017718	GTT	2	6	49056	49061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386730604
1029	NC_017718	CAA	2	6	49085	49090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386730604
1030	NC_017718	T	6	6	49223	49228	0 %	100 %	0 %	0 %	386730604
1031	NC_017718	GCCC	2	8	49360	49367	0 %	0 %	25 %	75 %	386730605
1032	NC_017718	AG	3	6	49701	49706	50 %	0 %	50 %	0 %	386730605
1033	NC_017718	TCA	2	6	49850	49855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730605
1034	NC_017718	CCT	2	6	49872	49877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386730605
1035	NC_017718	GCT	2	6	49929	49934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730605
1036	NC_017718	CAC	2	6	49971	49976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730605
1037	NC_017718	ATG	2	6	50003	50008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730605
1038	NC_017718	GCCT	2	8	50019	50026	0 %	25 %	25 %	50 %	386730605
1039	NC_017718	ATT	2	6	50050	50055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386730605
1040	NC_017718	GCG	2	6	50149	50154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730605
1041	NC_017718	CAG	2	6	50164	50169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730605
1042	NC_017718	GCC	2	6	50285	50290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730605
1043	NC_017718	CCA	2	6	50347	50352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730605
1044	NC_017718	CAT	2	6	50358	50363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730605
1045	NC_017718	CCA	2	6	50400	50405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730605
1046	NC_017718	TTC	2	6	50407	50412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730605
1047	NC_017718	ATT	2	6	50437	50442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386730605
1048	NC_017718	ACCGGT	2	12	50518	50529	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386730605
1049	NC_017718	AG	3	6	50538	50543	50 %	0 %	50 %	0 %	386730605
1050	NC_017718	CA	3	6	50544	50549	50 %	0 %	0 %	50 %	386730605
1051	NC_017718	AAT	2	6	50647	50652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730605
1052	NC_017718	TCTTT	2	10	50666	50675	0 %	80 %	0 %	20 %	386730605
1053	NC_017718	GGA	2	6	50678	50683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386730605
1054	NC_017718	GAT	2	6	50768	50773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730605
1055	NC_017718	TTG	2	6	50854	50859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386730605
1056	NC_017718	TCT	2	6	50894	50899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730605
1057	NC_017718	CAGA	2	8	50930	50937	50 %	0 %	25 %	25 %	386730605
1058	NC_017718	TGT	2	6	51061	51066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386730605
1059	NC_017718	GTG	2	6	51068	51073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730605
1060	NC_017718	ATG	2	6	51161	51166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730605
1061	NC_017718	GCC	2	6	51200	51205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730605
1062	NC_017718	GCT	2	6	51250	51255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730605
1063	NC_017718	TTC	2	6	51272	51277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730605
1064	NC_017718	CCG	2	6	51296	51301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730605
1065	NC_017718	CCGC	2	8	51419	51426	0 %	0 %	25 %	75 %	386730605
1066	NC_017718	TG	3	6	51443	51448	0 %	50 %	50 %	0 %	386730605
1067	NC_017718	GTA	2	6	51492	51497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730605
1068	NC_017718	GCTG	2	8	51527	51534	0 %	25 %	50 %	25 %	386730605
1069	NC_017718	CAGG	2	8	51543	51550	25 %	0 %	50 %	25 %	386730605
1070	NC_017718	TCTG	2	8	51584	51591	0 %	50 %	25 %	25 %	386730605
1071	NC_017718	ACG	2	6	51592	51597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730605
1072	NC_017718	TCT	2	6	51772	51777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730605
1073	NC_017718	TCA	2	6	51785	51790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730605
1074	NC_017718	GCCA	2	8	51839	51846	25 %	0 %	25 %	50 %	386730605
1075	NC_017718	TCT	2	6	51965	51970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730605
1076	NC_017718	AG	3	6	52141	52146	50 %	0 %	50 %	0 %	386730605
1077	NC_017718	CTGT	2	8	52210	52217	0 %	50 %	25 %	25 %	386730605
1078	NC_017718	CAA	2	6	52251	52256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386730605
1079	NC_017718	AGG	2	6	52356	52361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_017718	T	7	7	52380	52386	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_017718	GAA	2	6	52413	52418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_017718	ATCA	2	8	52421	52428	50 %	25 %	0 %	25 %	386730606
1083	NC_017718	T	6	6	52437	52442	0 %	100 %	0 %	0 %	386730606
1084	NC_017718	ATGA	2	8	52444	52451	50 %	25 %	25 %	0 %	386730606
1085	NC_017718	T	6	6	52484	52489	0 %	100 %	0 %	0 %	386730606
1086	NC_017718	CGA	2	6	52522	52527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730606
1087	NC_017718	AG	3	6	52602	52607	50 %	0 %	50 %	0 %	386730606
1088	NC_017718	CCG	2	6	52620	52625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730606
1089	NC_017718	ACG	2	6	52665	52670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730606
1090	NC_017718	TGGA	2	8	52688	52695	25 %	25 %	50 %	0 %	386730606
1091	NC_017718	TGC	2	6	52728	52733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730606
1092	NC_017718	CAGA	2	8	52886	52893	50 %	0 %	25 %	25 %	386730606
1093	NC_017718	CTTTTC	2	12	52941	52952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730606
1094	NC_017718	CAC	2	6	52970	52975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730606
1095	NC_017718	T	6	6	52978	52983	0 %	100 %	0 %	0 %	386730606
1096	NC_017718	TTA	2	6	53008	53013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386730606
1097	NC_017718	GT	3	6	53024	53029	0 %	50 %	50 %	0 %	386730606
1098	NC_017718	GCA	2	6	53103	53108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730606
1099	NC_017718	GTT	2	6	53125	53130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386730606
1100	NC_017718	TTCCGG	2	12	53133	53144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730606
1101	NC_017718	ATG	2	6	53264	53269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730607
1102	NC_017718	TCG	2	6	53356	53361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730607
1103	NC_017718	CCT	2	6	53400	53405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1104	NC_017718	TCA	2	6	53505	53510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730608
1105	NC_017718	CGG	2	6	53520	53525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730608
1106	NC_017718	GATA	2	8	53545	53552	50 %	25 %	25 %	0 %	386730608
1107	NC_017718	CCAG	2	8	53561	53568	25 %	0 %	25 %	50 %	386730608
1108	NC_017718	C	6	6	53575	53580	0 %	0 %	0 %	100 %	386730608
1109	NC_017718	T	6	6	53593	53598	0 %	100 %	0 %	0 %	386730608
1110	NC_017718	TGA	3	9	53656	53664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730608
1111	NC_017718	GCA	2	6	53739	53744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730608
1112	NC_017718	CAT	2	6	53746	53751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730608
1113	NC_017718	AGC	2	6	53759	53764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730608
1114	NC_017718	GCG	2	6	53822	53827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730608
1115	NC_017718	AT	3	6	53880	53885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_017718	A	7	7	53906	53912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_017718	AGA	2	6	53915	53920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730609
1118	NC_017718	CAG	2	6	53937	53942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730609
1119	NC_017718	CGAT	2	8	53956	53963	25 %	25 %	25 %	25 %	386730609
1120	NC_017718	CAG	2	6	53970	53975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730609
1121	NC_017718	TGC	2	6	54126	54131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730609
1122	NC_017718	CAG	3	9	54134	54142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730609
1123	NC_017718	ACCGG	2	10	54295	54304	20 %	0 %	40 %	40 %	386730609
1124	NC_017718	CTG	2	6	54397	54402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730609
1125	NC_017718	TCA	2	6	54437	54442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730609
1126	NC_017718	TGA	2	6	54463	54468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730610
1127	NC_017718	CAC	2	6	54500	54505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730610
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