MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. B182 chromosome

Total Repeats: 3319

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017623	CACGC	2	10	3066	3075	20 %	0 %	20 %	60 %	386589260
2	NC_017623	CGCGT	2	10	4647	4656	0 %	20 %	40 %	40 %	386589261
3	NC_017623	GCAAC	2	10	7591	7600	40 %	0 %	20 %	40 %	386589262
4	NC_017623	TGACG	2	10	8925	8934	20 %	20 %	40 %	20 %	386589264
5	NC_017623	GCGTG	2	10	10220	10229	0 %	20 %	60 %	20 %	386589265
6	NC_017623	TTCCG	2	10	12702	12711	0 %	40 %	20 %	40 %	386589267
7	NC_017623	CGATG	2	10	13500	13509	20 %	20 %	40 %	20 %	386589268
8	NC_017623	ACGCG	2	10	14916	14925	20 %	0 %	40 %	40 %	386589269
9	NC_017623	AAGCG	2	10	16187	16196	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017623	AGCGA	2	10	19455	19464	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017623	AAGTG	2	10	22100	22109	40 %	20 %	40 %	0 %	386589271
12	NC_017623	TGTTT	2	10	22634	22643	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017623	CTGGC	2	10	25425	25434	0 %	20 %	40 %	40 %	386589275
14	NC_017623	ATTGA	2	10	26968	26977	40 %	40 %	20 %	0 %	386589276
15	NC_017623	CGATG	2	10	27530	27539	20 %	20 %	40 %	20 %	386589277
16	NC_017623	CGCGA	2	10	27777	27786	20 %	0 %	40 %	40 %	386589277
17	NC_017623	CCGGC	2	10	29546	29555	0 %	0 %	40 %	60 %	386589278
18	NC_017623	GGGCA	2	10	30546	30555	20 %	0 %	60 %	20 %	386589279
19	NC_017623	AAAGT	2	10	31625	31634	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017623	ATGTT	2	10	31831	31840	20 %	60 %	20 %	0 %	386589280
21	NC_017623	GGGCA	2	10	32900	32909	20 %	0 %	60 %	20 %	386589282
22	NC_017623	CATCG	2	10	33028	33037	20 %	20 %	20 %	40 %	386589282
23	NC_017623	CGGCG	2	10	33962	33971	0 %	0 %	60 %	40 %	386589283
24	NC_017623	CGCTG	2	10	36264	36273	0 %	20 %	40 %	40 %	386589285
25	NC_017623	AAGCG	2	10	38009	38018	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017623	CCTGC	2	10	40768	40777	0 %	20 %	20 %	60 %	386589287
27	NC_017623	TTCTG	2	10	40896	40905	0 %	60 %	20 %	20 %	386589287
28	NC_017623	CGGCG	2	10	42718	42727	0 %	0 %	60 %	40 %	386589289
29	NC_017623	TTTTG	2	10	43116	43125	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017623	GTCAT	2	10	43140	43149	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_017623	GGAGT	2	10	44578	44587	20 %	20 %	60 %	0 %	386589291
32	NC_017623	TGCCG	2	10	46891	46900	0 %	20 %	40 %	40 %	386589293
33	NC_017623	GCTGG	2	10	48843	48852	0 %	20 %	60 %	20 %	386589294
34	NC_017623	CGCGG	2	10	49726	49735	0 %	0 %	60 %	40 %	386589296
35	NC_017623	GCGCG	2	10	50164	50173	0 %	0 %	60 %	40 %	386589297
36	NC_017623	CGCTA	2	10	51628	51637	20 %	20 %	20 %	40 %	386589298
37	NC_017623	GGCAG	2	10	51665	51674	20 %	0 %	60 %	20 %	386589298
38	NC_017623	TTATT	2	10	53074	53083	20 %	80 %	0 %	0 %	386589299
39	NC_017623	TTTTC	2	10	53459	53468	0 %	80 %	0 %	20 %	386589300
40	NC_017623	TTTCG	2	10	53524	53533	0 %	60 %	20 %	20 %	386589300
41	NC_017623	GGCGT	2	10	53812	53821	0 %	20 %	60 %	20 %	386589300
42	NC_017623	GTTTG	2	10	53922	53931	0 %	60 %	40 %	0 %	386589300
43	NC_017623	CTGGC	2	10	54335	54344	0 %	20 %	40 %	40 %	386589300
44	NC_017623	GGGCG	2	10	54381	54390	0 %	0 %	80 %	20 %	386589300
45	NC_017623	TTCTG	2	10	54623	54632	0 %	60 %	20 %	20 %	386589300
46	NC_017623	ATTGA	2	10	55700	55709	40 %	40 %	20 %	0 %	386589302
47	NC_017623	GTTGA	2	10	56297	56306	20 %	40 %	40 %	0 %	386589302
48	NC_017623	AAGCG	2	10	58149	58158	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_017623	GCGCG	2	10	58311	58320	0 %	0 %	60 %	40 %	386589303
50	NC_017623	CCAGC	2	10	60627	60636	20 %	0 %	20 %	60 %	386589305
51	NC_017623	GCCGC	2	10	64512	64521	0 %	0 %	40 %	60 %	386589307
52	NC_017623	GCTTT	2	10	65818	65827	0 %	60 %	20 %	20 %	386589309
53	NC_017623	CGTGC	2	10	65903	65912	0 %	20 %	40 %	40 %	386589309
54	NC_017623	GGGCT	2	10	66291	66300	0 %	20 %	60 %	20 %	386589311
55	NC_017623	AAGCG	2	10	70184	70193	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_017623	CTGGT	2	10	70788	70797	0 %	40 %	40 %	20 %	386589317
57	NC_017623	ATTAA	2	10	74114	74123	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017623	TGGAT	2	10	74497	74506	20 %	40 %	40 %	0 %	386589319
59	NC_017623	ATATT	2	10	74678	74687	40 %	60 %	0 %	0 %	386589319
60	NC_017623	TATTG	2	10	74691	74700	20 %	60 %	20 %	0 %	386589319
61	NC_017623	AAATA	2	10	75591	75600	80 %	20 %	0 %	0 %	386589320
62	NC_017623	GATTG	2	10	77192	77201	20 %	40 %	40 %	0 %	386589322
63	NC_017623	TGCGC	2	10	79937	79946	0 %	20 %	40 %	40 %	386589325
64	NC_017623	AGATA	2	10	80198	80207	60 %	20 %	20 %	0 %	386589325
65	NC_017623	TGTGT	2	10	80500	80509	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017623	GTGCG	2	10	81020	81029	0 %	20 %	60 %	20 %	386589326
67	NC_017623	GCTGC	2	10	83624	83633	0 %	20 %	40 %	40 %	386589329
68	NC_017623	AATAA	2	10	84440	84449	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017623	CGGGC	2	10	86520	86529	0 %	0 %	60 %	40 %	386589330
70	NC_017623	CCTGA	2	10	86794	86803	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
71	NC_017623	CTTTT	2	10	90362	90371	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017623	AGTTA	2	10	91886	91895	40 %	40 %	20 %	0 %	386589334
73	NC_017623	GTTTG	2	10	92411	92420	0 %	60 %	40 %	0 %	386589335
74	NC_017623	GCGAA	2	10	95410	95419	40 %	0 %	40 %	20 %	386589338
75	NC_017623	TGCTG	2	10	96543	96552	0 %	40 %	40 %	20 %	386589340
76	NC_017623	GGCGC	2	10	96978	96987	0 %	0 %	60 %	40 %	386589341
77	NC_017623	ACTGC	2	10	97284	97293	20 %	20 %	20 %	40 %	386589341
78	NC_017623	CAGTA	2	10	98088	98097	40 %	20 %	20 %	20 %	386589342
79	NC_017623	GCCGC	2	10	98761	98770	0 %	0 %	40 %	60 %	386589343
80	NC_017623	TCTGT	2	10	100498	100507	0 %	60 %	20 %	20 %	386589344
81	NC_017623	ACGTG	2	10	101018	101027	20 %	20 %	40 %	20 %	386589345
82	NC_017623	GTGAT	2	10	101809	101818	20 %	40 %	40 %	0 %	386589345
83	NC_017623	AAGTG	2	10	102061	102070	40 %	20 %	40 %	0 %	386589345
84	NC_017623	CGCTG	2	10	102795	102804	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
85	NC_017623	TCGCG	2	10	104487	104496	0 %	20 %	40 %	40 %	386589347
86	NC_017623	AGTTT	2	10	105776	105785	20 %	60 %	20 %	0 %	386589347
87	NC_017623	TTCCG	2	10	106951	106960	0 %	40 %	20 %	40 %	386589348
88	NC_017623	AGCGC	2	10	115986	115995	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
89	NC_017623	GTTTA	2	10	118371	118380	20 %	60 %	20 %	0 %	386589355
90	NC_017623	GCCAA	2	10	119710	119719	40 %	0 %	20 %	40 %	386589357
91	NC_017623	CGCGG	2	10	122984	122993	0 %	0 %	60 %	40 %	386589358
92	NC_017623	AGTAA	2	10	124500	124509	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017623	GCGCT	2	10	126918	126927	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
94	NC_017623	GCGCC	2	10	129226	129235	0 %	0 %	40 %	60 %	386589363
95	NC_017623	ACTTC	2	10	131318	131327	20 %	40 %	0 %	40 %	386589364
96	NC_017623	ATTAA	2	10	133735	133744	60 %	40 %	0 %	0 %	386589366
97	NC_017623	GATAC	2	10	134064	134073	40 %	20 %	20 %	20 %	386589367
98	NC_017623	AATGT	2	10	135493	135502	40 %	40 %	20 %	0 %	386589368
99	NC_017623	TAACA	2	10	135518	135527	60 %	20 %	0 %	20 %	386589368
100	NC_017623	ATTAG	2	10	136049	136058	40 %	40 %	20 %	0 %	386589368
101	NC_017623	CGTAG	2	10	138971	138980	20 %	20 %	40 %	20 %	386589370
102	NC_017623	TTCCC	2	10	142028	142037	0 %	40 %	0 %	60 %	386589373
103	NC_017623	ATTTT	2	10	147659	147668	20 %	80 %	0 %	0 %	386589379
104	NC_017623	GCGAG	2	10	152468	152477	20 %	0 %	60 %	20 %	386589387
105	NC_017623	CGGCG	2	10	153200	153209	0 %	0 %	60 %	40 %	386589387
106	NC_017623	AGCCC	2	10	153844	153853	20 %	0 %	20 %	60 %	386589388
107	NC_017623	ACATG	2	10	154170	154179	40 %	20 %	20 %	20 %	386589389
108	NC_017623	CCAGC	2	10	155605	155614	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
109	NC_017623	CCAGC	2	10	156673	156682	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
110	NC_017623	GGCGC	2	10	158736	158745	0 %	0 %	60 %	40 %	386589390
111	NC_017623	GCGCG	2	10	163026	163035	0 %	0 %	60 %	40 %	386589395
112	NC_017623	TGCGA	2	10	164136	164145	20 %	20 %	40 %	20 %	386589397
113	NC_017623	AGCGC	2	10	166054	166063	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
114	NC_017623	CCGGC	2	10	167591	167600	0 %	0 %	40 %	60 %	386589400
115	NC_017623	ATGGC	2	10	169682	169691	20 %	20 %	40 %	20 %	386589401
116	NC_017623	GCACA	2	10	171117	171126	40 %	0 %	20 %	40 %	386589403
117	NC_017623	TTTTA	2	10	172480	172489	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017623	TTAAA	2	10	172546	172555	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017623	GATTA	2	10	175310	175319	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017623	GTACT	2	10	176115	176124	20 %	40 %	20 %	20 %	386589407
121	NC_017623	TTGCA	2	10	177252	177261	20 %	40 %	20 %	20 %	386589408
122	NC_017623	GAAAA	2	10	177455	177464	80 %	0 %	20 %	0 %	386589409
123	NC_017623	GCGTC	2	10	177806	177815	0 %	20 %	40 %	40 %	386589409
124	NC_017623	GCCCG	2	10	178992	179001	0 %	0 %	40 %	60 %	386589411
125	NC_017623	AGCGC	2	10	179072	179081	20 %	0 %	40 %	40 %	386589411
126	NC_017623	AGGCA	2	10	181200	181209	40 %	0 %	40 %	20 %	386589413
127	NC_017623	GCCAG	2	10	182576	182585	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
128	NC_017623	CCTGA	2	10	182615	182624	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
129	NC_017623	CAACA	2	10	183883	183892	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
130	NC_017623	GTTAT	2	10	186736	186745	20 %	60 %	20 %	0 %	386589418
131	NC_017623	GAAAA	2	10	187065	187074	80 %	0 %	20 %	0 %	386589418
132	NC_017623	AACAG	2	10	187424	187433	60 %	0 %	20 %	20 %	386589419
133	NC_017623	CGCGC	3	15	189758	189772	0 %	0 %	40 %	60 %	386589421
134	NC_017623	ATTGA	2	10	192669	192678	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017623	TTATT	2	10	192687	192696	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017623	CCACT	2	10	196423	196432	20 %	20 %	0 %	60 %	386589426
137	NC_017623	ATTTC	2	10	196964	196973	20 %	60 %	0 %	20 %	386589427
138	NC_017623	ATTCT	2	10	198899	198908	20 %	60 %	0 %	20 %	386589429
139	NC_017623	TTATT	2	10	199491	199500	20 %	80 %	0 %	0 %	386589430
140	NC_017623	GGCAG	2	10	199903	199912	20 %	0 %	60 %	20 %	386589431
141	NC_017623	AGCGC	2	10	200649	200658	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
142	NC_017623	CATTT	2	10	201444	201453	20 %	60 %	0 %	20 %	386589432
143	NC_017623	GCTTT	2	10	201543	201552	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_017623	TTCAT	2	10	205299	205308	20 %	60 %	0 %	20 %	386589437
145	NC_017623	TGAAT	2	10	207325	207334	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_017623	TGACC	2	10	218038	218047	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
152	NC_017623	CAGTC	2	10	218728	218737	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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166	NC_017623	GATGG	2	10	237379	237388	20 %	20 %	60 %	0 %	386589461
167	NC_017623	GCCCA	2	10	237824	237833	20 %	0 %	20 %	60 %	386589461
168	NC_017623	AGTTC	2	10	239439	239448	20 %	40 %	20 %	20 %	386589462
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172	NC_017623	CGCAG	2	10	242823	242832	20 %	0 %	40 %	40 %	386589464
173	NC_017623	TGCTA	2	10	245870	245879	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
174	NC_017623	CGTAC	2	10	246123	246132	20 %	20 %	20 %	40 %	386589467
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177	NC_017623	TGAGA	2	10	250772	250781	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
178	NC_017623	GATGA	2	10	251879	251888	40 %	20 %	40 %	0 %	386589472
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182	NC_017623	AGTCG	2	10	256311	256320	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
183	NC_017623	AAGGA	2	10	257996	258005	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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197	NC_017623	AGCGC	2	10	300494	300503	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
198	NC_017623	TAAAT	2	10	300587	300596	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_017623	TTCTA	2	10	301039	301048	20 %	60 %	0 %	20 %	386589507
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255	NC_017623	GCGCT	2	10	360811	360820	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
256	NC_017623	TATCT	2	10	361993	362002	20 %	60 %	0 %	20 %	386589565
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265	NC_017623	TACAA	2	10	380410	380419	60 %	20 %	0 %	20 %	386589583
266	NC_017623	GAAAA	2	10	380904	380913	80 %	0 %	20 %	0 %	386589584
267	NC_017623	AATGA	2	10	382070	382079	60 %	20 %	20 %	0 %	386589584
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