MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. B182 chromosome

Total Repeats: 100404

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017623	CTT	2	6	187115	187120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589418
4002	NC_017623	CGGG	2	8	187144	187151	0 %	0 %	75 %	25 %	386589418
4003	NC_017623	CTG	2	6	187164	187169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589418
4004	NC_017623	GC	3	6	187204	187209	0 %	0 %	50 %	50 %	386589418
4005	NC_017623	TGA	3	9	187231	187239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589418
4006	NC_017623	GCT	2	6	187274	187279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589418
4007	NC_017623	TAA	2	6	187298	187303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386589418
4008	NC_017623	AGG	2	6	187352	187357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386589418
4009	NC_017623	AACAG	2	10	187424	187433	60 %	0 %	20 %	20 %	386589419
4010	NC_017623	CGG	2	6	187449	187454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589419
4011	NC_017623	GCCG	2	8	187534	187541	0 %	0 %	50 %	50 %	386589419
4012	NC_017623	CGC	2	6	187697	187702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589419
4013	NC_017623	GCC	2	6	187710	187715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589419
4014	NC_017623	GCA	2	6	187847	187852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589419
4015	NC_017623	TGA	2	6	187869	187874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589419
4016	NC_017623	CCG	2	6	187898	187903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589419
4017	NC_017623	TTA	2	6	187980	187985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386589419
4018	NC_017623	GC	3	6	188036	188041	0 %	0 %	50 %	50 %	386589419
4019	NC_017623	CCG	2	6	188051	188056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589419
4020	NC_017623	CAC	2	6	188078	188083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386589419
4021	NC_017623	GTC	2	6	188092	188097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589419
4022	NC_017623	ACC	2	6	188101	188106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386589419
4023	NC_017623	CGG	2	6	188127	188132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589419
4024	NC_017623	TGT	2	6	188135	188140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589419
4025	NC_017623	CTG	2	6	188176	188181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589419
4026	NC_017623	CAATGC	2	12	188196	188207	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386589419
4027	NC_017623	GCG	2	6	188210	188215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589419
4028	NC_017623	TTTC	2	8	188278	188285	0 %	75 %	0 %	25 %	386589419
4029	NC_017623	TCA	2	6	188327	188332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_017623	TGG	2	6	188366	188371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589420
4031	NC_017623	GCC	3	9	188374	188382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589420
4032	NC_017623	CAG	2	6	188419	188424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589420
4033	NC_017623	GGC	2	6	188443	188448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589420
4034	NC_017623	GAC	2	6	188454	188459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589420
4035	NC_017623	GAT	2	6	188518	188523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589420
4036	NC_017623	CAT	2	6	188541	188546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589420
4037	NC_017623	GCT	2	6	188553	188558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589420
4038	NC_017623	CGA	2	6	188580	188585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589420
4039	NC_017623	CAG	2	6	188605	188610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589420
4040	NC_017623	TAC	2	6	188626	188631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589420
4041	NC_017623	CGA	2	6	188648	188653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589420
4042	NC_017623	TAA	2	6	188742	188747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386589420
4043	NC_017623	AACG	2	8	188763	188770	50 %	0 %	25 %	25 %	386589420
4044	NC_017623	GCC	2	6	188773	188778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589420
4045	NC_017623	GCG	2	6	188794	188799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589420
4046	NC_017623	TGC	2	6	188801	188806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589420
4047	NC_017623	GC	3	6	188837	188842	0 %	0 %	50 %	50 %	386589420
4048	NC_017623	ATA	2	6	188864	188869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386589420
4049	NC_017623	GCG	2	6	188893	188898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589420
4050	NC_017623	GGC	3	9	188901	188909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589420
4051	NC_017623	ATT	2	6	188950	188955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386589420
4052	NC_017623	GCC	2	6	188956	188961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589420
4053	NC_017623	CTG	2	6	188989	188994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589420
4054	NC_017623	GAT	2	6	189012	189017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589420
4055	NC_017623	CGG	2	6	189092	189097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589420
4056	NC_017623	TGG	2	6	189098	189103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589420
4057	NC_017623	ATT	2	6	189115	189120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386589420
4058	NC_017623	GTGA	2	8	189136	189143	25 %	25 %	50 %	0 %	386589420
4059	NC_017623	CGG	2	6	189152	189157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589420
4060	NC_017623	TGT	2	6	189175	189180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589420
4061	NC_017623	TAT	2	6	189201	189206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386589420
4062	NC_017623	TGATAC	2	12	189228	189239	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386589420
4063	NC_017623	CCA	2	6	189245	189250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386589420
4064	NC_017623	ATT	2	6	189302	189307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386589420
4065	NC_017623	CTG	2	6	189407	189412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4066	NC_017623	T	6	6	189480	189485	0 %	100 %	0 %	0 %	386589421
4067	NC_017623	ATC	2	6	189486	189491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589421
4068	NC_017623	CAG	2	6	189495	189500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589421
4069	NC_017623	CAGC	2	8	189527	189534	25 %	0 %	25 %	50 %	386589421
4070	NC_017623	ATT	2	6	189621	189626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386589421
4071	NC_017623	TCG	2	6	189627	189632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589421
4072	NC_017623	CGCGC	3	15	189758	189772	0 %	0 %	40 %	60 %	386589421
4073	NC_017623	GC	4	8	189769	189776	0 %	0 %	50 %	50 %	386589421
4074	NC_017623	CCGT	2	8	189854	189861	0 %	25 %	25 %	50 %	386589421
4075	NC_017623	ATCT	2	8	189876	189883	25 %	50 %	0 %	25 %	386589421
4076	NC_017623	CTT	2	6	189893	189898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589421
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4079	NC_017623	TAT	2	6	190051	190056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386589421
4080	NC_017623	CAGA	2	8	190064	190071	50 %	0 %	25 %	25 %	386589421
4081	NC_017623	CCTG	2	8	190203	190210	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4082	NC_017623	CGT	2	6	190217	190222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4083	NC_017623	A	6	6	190233	190238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_017623	TTCC	2	8	190282	190289	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4085	NC_017623	TCA	2	6	190292	190297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4086	NC_017623	T	6	6	190363	190368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_017623	GCGG	2	8	190401	190408	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4088	NC_017623	CTG	2	6	190465	190470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4089	NC_017623	ATC	2	6	190526	190531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4090	NC_017623	TCA	2	6	190556	190561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4092	NC_017623	TAA	2	6	190709	190714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386589422
4093	NC_017623	TTA	2	6	190741	190746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386589422
4094	NC_017623	TTCC	2	8	190811	190818	0 %	50 %	0 %	50 %	386589422
4095	NC_017623	A	6	6	190850	190855	100 %	0 %	0 %	0 %	386589422
4096	NC_017623	TAT	2	6	190868	190873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386589422
4097	NC_017623	GTA	2	6	190904	190909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589422
4098	NC_017623	GAC	2	6	190911	190916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589422
4099	NC_017623	TTC	2	6	190984	190989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589422
4100	NC_017623	T	6	6	190997	191002	0 %	100 %	0 %	0 %	386589422
4101	NC_017623	CCA	2	6	191057	191062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386589423
4102	NC_017623	GC	3	6	191070	191075	0 %	0 %	50 %	50 %	386589423
4103	NC_017623	CTG	2	6	191113	191118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589423
4104	NC_017623	CTT	2	6	191250	191255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589423
4105	NC_017623	GAC	2	6	191257	191262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589423
4106	NC_017623	TCC	2	6	191326	191331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386589423
4107	NC_017623	GGC	2	6	191407	191412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589423
4108	NC_017623	GC	3	6	191424	191429	0 %	0 %	50 %	50 %	386589423
4109	NC_017623	TTA	2	6	191444	191449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386589423
4110	NC_017623	ACG	2	6	191481	191486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589423
4111	NC_017623	AGA	2	6	191526	191531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386589423
4112	NC_017623	CAG	2	6	191581	191586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589423
4113	NC_017623	A	6	6	191674	191679	100 %	0 %	0 %	0 %	386589423
4114	NC_017623	GAC	2	6	191770	191775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589423
4115	NC_017623	ACG	2	6	191822	191827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589423
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4117	NC_017623	AGC	2	6	191930	191935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589423
4118	NC_017623	GA	3	6	191957	191962	50 %	0 %	50 %	0 %	386589423
4119	NC_017623	CGT	2	6	192034	192039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589423
4120	NC_017623	CGC	2	6	192069	192074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589423
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4122	NC_017623	TGG	2	6	192143	192148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589423
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4246	NC_017623	CGG	2	6	198121	198126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589428
4247	NC_017623	ATC	2	6	198132	198137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589428
4248	NC_017623	CAT	2	6	198161	198166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589428
4249	NC_017623	CTG	2	6	198190	198195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589428
4250	NC_017623	GGC	2	6	198203	198208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589428
4251	NC_017623	AAT	2	6	198225	198230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386589428
4252	NC_017623	TTG	2	6	198238	198243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589428
4253	NC_017623	GTC	2	6	198315	198320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589428
4254	NC_017623	AATG	2	8	198374	198381	50 %	25 %	25 %	0 %	386589428
4255	NC_017623	CAA	2	6	198503	198508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386589428
4256	NC_017623	GAT	2	6	198577	198582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589429
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4258	NC_017623	CAAT	2	8	198860	198867	50 %	25 %	0 %	25 %	386589429
4259	NC_017623	CG	3	6	198883	198888	0 %	0 %	50 %	50 %	386589429
4260	NC_017623	ATTCT	2	10	198899	198908	20 %	60 %	0 %	20 %	386589429
4261	NC_017623	GATG	2	8	198942	198949	25 %	25 %	50 %	0 %	386589429
4262	NC_017623	TGC	3	9	198972	198980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589429
4263	NC_017623	ATT	2	6	199030	199035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386589429
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4265	NC_017623	AAT	2	6	199071	199076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386589429
4266	NC_017623	GGGT	2	8	199088	199095	0 %	25 %	75 %	0 %	386589429
4267	NC_017623	TAT	2	6	199177	199182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386589429
4268	NC_017623	CGG	2	6	199239	199244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589429
4269	NC_017623	A	6	6	199246	199251	100 %	0 %	0 %	0 %	386589429
4270	NC_017623	AT	3	6	199328	199333	50 %	50 %	0 %	0 %	386589429
4271	NC_017623	AGA	2	6	199341	199346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386589429
4272	NC_017623	TCA	2	6	199383	199388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589429
4273	NC_017623	CAG	2	6	199397	199402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589429
4274	NC_017623	TGAG	2	8	199424	199431	25 %	25 %	50 %	0 %	386589429
4275	NC_017623	GAG	2	6	199472	199477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4276	NC_017623	TTATT	2	10	199491	199500	20 %	80 %	0 %	0 %	386589430
4277	NC_017623	AAT	2	6	199504	199509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386589430
4278	NC_017623	ATG	2	6	199520	199525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589430
4279	NC_017623	ATG	2	6	199554	199559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589430
4280	NC_017623	ATC	2	6	199596	199601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589430
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4283	NC_017623	TGA	2	6	199764	199769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589430
4284	NC_017623	A	7	7	199783	199789	100 %	0 %	0 %	0 %	386589430
4285	NC_017623	CG	3	6	199848	199853	0 %	0 %	50 %	50 %	386589431
4286	NC_017623	TG	3	6	199859	199864	0 %	50 %	50 %	0 %	386589431
4287	NC_017623	GGCAG	2	10	199903	199912	20 %	0 %	60 %	20 %	386589431
4288	NC_017623	GATG	2	8	199981	199988	25 %	25 %	50 %	0 %	386589431
4289	NC_017623	CGG	2	6	200088	200093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589431
4290	NC_017623	GGCG	2	8	200110	200117	0 %	0 %	75 %	25 %	386589431
4291	NC_017623	CAT	2	6	200159	200164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589431
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4295	NC_017623	TGT	2	6	200473	200478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589431
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4300	NC_017623	ATTG	2	8	200667	200674	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4301	NC_017623	AGC	2	6	200691	200696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589432
4302	NC_017623	CTG	2	6	200699	200704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589432
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4313	NC_017623	CAGA	2	8	201233	201240	50 %	0 %	25 %	25 %	386589432
4314	NC_017623	GC	3	6	201257	201262	0 %	0 %	50 %	50 %	386589432
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4319	NC_017623	GGC	2	6	201398	201403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589432
4320	NC_017623	CATTT	2	10	201444	201453	20 %	60 %	0 %	20 %	386589432
4321	NC_017623	AGC	2	6	201498	201503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4322	NC_017623	GCTTT	2	10	201543	201552	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4323	NC_017623	TCA	2	6	201556	201561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4324	NC_017623	ACA	2	6	201644	201649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386589433
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4329	NC_017623	AT	3	6	201776	201781	50 %	50 %	0 %	0 %	386589433
4330	NC_017623	GCTTTC	2	12	201788	201799	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386589433
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4334	NC_017623	ACA	2	6	202122	202127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386589433
4335	NC_017623	TCA	2	6	202152	202157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589433
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4337	NC_017623	CTG	2	6	202415	202420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589434
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4343	NC_017623	TGA	2	6	202587	202592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589434
4344	NC_017623	TGA	2	6	202743	202748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4345	NC_017623	CGG	2	6	202824	202829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589435
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4347	NC_017623	TGC	2	6	202869	202874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589435
4348	NC_017623	ACC	2	6	203022	203027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386589435
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4352	NC_017623	GC	3	6	203138	203143	0 %	0 %	50 %	50 %	386589435
4353	NC_017623	GCC	2	6	203295	203300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589435
4354	NC_017623	CG	3	6	203384	203389	0 %	0 %	50 %	50 %	386589435
4355	NC_017623	TTCG	2	8	203570	203577	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4356	NC_017623	CTAA	2	8	203617	203624	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4357	NC_017623	GCG	2	6	203693	203698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589436
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4360	NC_017623	TTCC	2	8	203764	203771	0 %	50 %	0 %	50 %	386589436
4361	NC_017623	GC	3	6	203879	203884	0 %	0 %	50 %	50 %	386589436
4362	NC_017623	GCG	2	6	203903	203908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589436
4363	NC_017623	TTC	2	6	203912	203917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589436
4364	NC_017623	GC	3	6	203939	203944	0 %	0 %	50 %	50 %	386589436
4365	NC_017623	CAG	2	6	203945	203950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589436
4366	NC_017623	GC	3	6	203974	203979	0 %	0 %	50 %	50 %	386589436
4367	NC_017623	GC	3	6	204010	204015	0 %	0 %	50 %	50 %	386589436
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4493	NC_017623	GATCA	2	10	209938	209947	40 %	20 %	20 %	20 %	386589443
4494	NC_017623	AGC	2	6	210202	210207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589443
4495	NC_017623	CTT	2	6	210210	210215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589443
4496	NC_017623	CAAC	2	8	210216	210223	50 %	0 %	0 %	50 %	386589443
4497	NC_017623	GTTTCT	2	12	210258	210269	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	386589443
4498	NC_017623	CTGG	2	8	210301	210308	0 %	25 %	50 %	25 %	386589443
4499	NC_017623	CGGCG	2	10	210352	210361	0 %	0 %	60 %	40 %	386589443
4500	NC_017623	TCG	2	6	210386	210391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589443

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