MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. B182 chromosome

Total Repeats: 100404

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017623	CAT	2	6	141412	141417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589372
3002	NC_017623	GATA	2	8	141421	141428	50 %	25 %	25 %	0 %	386589372
3003	NC_017623	TCT	2	6	141489	141494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589372
3004	NC_017623	CAC	2	6	141607	141612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386589372
3005	NC_017623	CATA	2	8	141617	141624	50 %	25 %	0 %	25 %	386589372
3006	NC_017623	AAC	2	6	141652	141657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_017623	CGT	2	6	141688	141693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_017623	TTAT	2	8	141702	141709	25 %	75 %	0 %	0 %	386589373
3009	NC_017623	CTG	2	6	141732	141737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589373
3010	NC_017623	GAGC	2	8	141759	141766	25 %	0 %	50 %	25 %	386589373
3011	NC_017623	AGA	2	6	141794	141799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386589373
3012	NC_017623	TA	3	6	141803	141808	50 %	50 %	0 %	0 %	386589373
3013	NC_017623	TTG	2	6	141842	141847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589373
3014	NC_017623	CCA	2	6	141865	141870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386589373
3015	NC_017623	CCA	2	6	141913	141918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386589373
3016	NC_017623	TTCCC	2	10	142028	142037	0 %	40 %	0 %	60 %	386589373
3017	NC_017623	TCC	2	6	142118	142123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386589373
3018	NC_017623	AGC	2	6	142124	142129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589373
3019	NC_017623	GTT	2	6	142140	142145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589373
3020	NC_017623	TGC	2	6	142162	142167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589373
3021	NC_017623	GCA	2	6	142176	142181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589373
3022	NC_017623	ATT	2	6	142312	142317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386589373
3023	NC_017623	CAT	2	6	142326	142331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589373
3024	NC_017623	AAT	2	6	142333	142338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386589373
3025	NC_017623	T	6	6	142372	142377	0 %	100 %	0 %	0 %	386589373
3026	NC_017623	CTT	2	6	142497	142502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589373
3027	NC_017623	GAA	2	6	142603	142608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386589373
3028	NC_017623	CCA	2	6	142635	142640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386589373
3029	NC_017623	GCC	2	6	142669	142674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589373
3030	NC_017623	T	6	6	142678	142683	0 %	100 %	0 %	0 %	386589373
3031	NC_017623	GC	3	6	142692	142697	0 %	0 %	50 %	50 %	386589373
3032	NC_017623	CGC	2	6	142756	142761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589373
3033	NC_017623	TCT	2	6	142814	142819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589373
3034	NC_017623	CAGC	2	8	142840	142847	25 %	0 %	25 %	50 %	386589373
3035	NC_017623	CAC	2	6	142861	142866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386589373
3036	NC_017623	CGGT	2	8	142892	142899	0 %	25 %	50 %	25 %	386589373
3037	NC_017623	CCAG	2	8	142908	142915	25 %	0 %	25 %	50 %	386589373
3038	NC_017623	GCG	2	6	142966	142971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589374
3039	NC_017623	CAT	2	6	142978	142983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589374
3040	NC_017623	TGA	2	6	143068	143073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589374
3041	NC_017623	CG	3	6	143080	143085	0 %	0 %	50 %	50 %	386589374
3042	NC_017623	CG	3	6	143131	143136	0 %	0 %	50 %	50 %	386589374
3043	NC_017623	AG	3	6	143164	143169	50 %	0 %	50 %	0 %	386589374
3044	NC_017623	AAG	2	6	143218	143223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386589374
3045	NC_017623	CG	3	6	143231	143236	0 %	0 %	50 %	50 %	386589374
3046	NC_017623	CGC	2	6	143337	143342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589374
3047	NC_017623	GCG	2	6	143346	143351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589374
3048	NC_017623	GCT	2	6	143430	143435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589374
3049	NC_017623	TCG	2	6	143444	143449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589374
3050	NC_017623	T	7	7	143514	143520	0 %	100 %	0 %	0 %	386589374
3051	NC_017623	ATC	2	6	143566	143571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589374
3052	NC_017623	CGC	2	6	143572	143577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589374
3053	NC_017623	CTG	2	6	143638	143643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589374
3054	NC_017623	CAG	2	6	143647	143652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589374
3055	NC_017623	CGC	2	6	143683	143688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589374
3056	NC_017623	CAG	3	9	143739	143747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589374
3057	NC_017623	CAGC	2	8	143781	143788	25 %	0 %	25 %	50 %	386589374
3058	NC_017623	CCG	2	6	143798	143803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589374
3059	NC_017623	GTT	2	6	143833	143838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589374
3060	NC_017623	T	6	6	143868	143873	0 %	100 %	0 %	0 %	386589375
3061	NC_017623	GGC	2	6	143978	143983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589375
3062	NC_017623	GATC	2	8	144052	144059	25 %	25 %	25 %	25 %	386589375
3063	NC_017623	TCA	2	6	144085	144090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589375
3064	NC_017623	GGT	3	9	144104	144112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589375
3065	NC_017623	TCA	2	6	144142	144147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589375
3066	NC_017623	CA	3	6	144184	144189	50 %	0 %	0 %	50 %	386589375
3067	NC_017623	CGG	2	6	144193	144198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589375
3068	NC_017623	CGG	2	6	144202	144207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589375
3069	NC_017623	GTT	2	6	144236	144241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589375
3070	NC_017623	GCC	2	6	144272	144277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589375
3071	NC_017623	CCG	2	6	144337	144342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589375
3072	NC_017623	CAG	2	6	144353	144358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589375
3073	NC_017623	CAA	2	6	144359	144364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386589375
3074	NC_017623	CATC	2	8	144406	144413	25 %	25 %	0 %	50 %	386589375
3075	NC_017623	CAAA	2	8	144532	144539	75 %	0 %	0 %	25 %	386589375
3076	NC_017623	GAAC	2	8	144543	144550	50 %	0 %	25 %	25 %	386589375
3077	NC_017623	GCT	2	6	144611	144616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589375
3078	NC_017623	GC	3	6	144625	144630	0 %	0 %	50 %	50 %	386589375
3079	NC_017623	GGT	2	6	144778	144783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_017623	T	6	6	144788	144793	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_017623	TCTG	2	8	144812	144819	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3082	NC_017623	A	6	6	144848	144853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_017623	GCG	2	6	145034	145039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589376
3084	NC_017623	GCG	2	6	145045	145050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589376
3085	NC_017623	GCG	2	6	145066	145071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589376
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3087	NC_017623	GAC	2	6	145114	145119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589376
3088	NC_017623	CTG	2	6	145132	145137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589376
3089	NC_017623	CGC	2	6	145177	145182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589376
3090	NC_017623	GTC	2	6	145197	145202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589376
3091	NC_017623	TGG	2	6	145217	145222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589376
3092	NC_017623	TTA	2	6	145267	145272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386589376
3093	NC_017623	CGC	2	6	145415	145420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589376
3094	NC_017623	TGG	2	6	145436	145441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589376
3095	NC_017623	CGC	2	6	145455	145460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589376
3096	NC_017623	A	7	7	145518	145524	100 %	0 %	0 %	0 %	386589376
3097	NC_017623	GCG	2	6	145594	145599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589376
3098	NC_017623	CCA	2	6	145605	145610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386589376
3099	NC_017623	GGT	2	6	145629	145634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589376
3100	NC_017623	TAC	2	6	145638	145643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589376
3101	NC_017623	GCG	2	6	145727	145732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589376
3102	NC_017623	CGGG	2	8	145765	145772	0 %	0 %	75 %	25 %	386589376
3103	NC_017623	TCTT	2	8	145798	145805	0 %	75 %	0 %	25 %	386589376
3104	NC_017623	TGA	2	6	145911	145916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589377
3105	NC_017623	TTG	2	6	145951	145956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589377
3106	NC_017623	CGC	2	6	145978	145983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589377
3107	NC_017623	TCA	2	6	146022	146027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589377
3108	NC_017623	CGG	2	6	146028	146033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589377
3109	NC_017623	AGC	2	6	146072	146077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589377
3110	NC_017623	A	6	6	146101	146106	100 %	0 %	0 %	0 %	386589377
3111	NC_017623	ACG	2	6	146170	146175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589377
3112	NC_017623	GC	5	10	146188	146197	0 %	0 %	50 %	50 %	386589377
3113	NC_017623	ATC	2	6	146210	146215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589377
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3115	NC_017623	GGC	2	6	146290	146295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589377
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3117	NC_017623	CGG	2	6	146336	146341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589377
3118	NC_017623	AG	3	6	146394	146399	50 %	0 %	50 %	0 %	386589377
3119	NC_017623	ATG	2	6	146452	146457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589377
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3121	NC_017623	GCC	2	6	146482	146487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589377
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3123	NC_017623	GAC	2	6	146638	146643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589377
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3229	NC_017623	CG	3	6	152772	152777	0 %	0 %	50 %	50 %	386589387
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3232	NC_017623	GCA	2	6	152993	152998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589387
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3234	NC_017623	GCG	2	6	153041	153046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589387
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3238	NC_017623	TGCGCG	2	12	153124	153135	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386589387
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3240	NC_017623	CGGCG	2	10	153200	153209	0 %	0 %	60 %	40 %	386589387
3241	NC_017623	CGG	2	6	153243	153248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589387
3242	NC_017623	CCG	2	6	153257	153262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589387
3243	NC_017623	CTT	2	6	153368	153373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589388
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3245	NC_017623	GCG	2	6	153435	153440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589388
3246	NC_017623	CAG	3	9	153569	153577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589388
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3363	NC_017623	CGAA	2	8	159107	159114	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3364	NC_017623	A	6	6	159113	159118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3365	NC_017623	GAT	2	6	159224	159229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589391
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3373	NC_017623	TGC	2	6	159637	159642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589391
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3496	NC_017623	ATCG	2	8	164742	164749	25 %	25 %	25 %	25 %	386589397
3497	NC_017623	GCC	3	9	164754	164762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589397
3498	NC_017623	CGC	2	6	164799	164804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589397
3499	NC_017623	TCA	2	6	164848	164853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589397
3500	NC_017623	GGT	2	6	164858	164863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589397

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