MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. B182 chromosome

Total Repeats: 100404

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017623	GGA	2	6	48720	48725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386589294
1002	NC_017623	TCG	2	6	48779	48784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589294
1003	NC_017623	GCTGG	2	10	48843	48852	0 %	20 %	60 %	20 %	386589294
1004	NC_017623	CGC	2	6	48854	48859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589294
1005	NC_017623	TGG	2	6	48919	48924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589294
1006	NC_017623	GGA	2	6	48998	49003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_017623	CAT	2	6	49019	49024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589295
1008	NC_017623	CG	3	6	49063	49068	0 %	0 %	50 %	50 %	386589295
1009	NC_017623	GGA	2	6	49106	49111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386589295
1010	NC_017623	GGCT	2	8	49128	49135	0 %	25 %	50 %	25 %	386589295
1011	NC_017623	GAT	3	9	49137	49145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589295
1012	NC_017623	CGC	2	6	49157	49162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589295
1013	NC_017623	A	6	6	49174	49179	100 %	0 %	0 %	0 %	386589295
1014	NC_017623	T	6	6	49258	49263	0 %	100 %	0 %	0 %	386589296
1015	NC_017623	CG	3	6	49543	49548	0 %	0 %	50 %	50 %	386589296
1016	NC_017623	CG	3	6	49701	49706	0 %	0 %	50 %	50 %	386589296
1017	NC_017623	CGCGG	2	10	49726	49735	0 %	0 %	60 %	40 %	386589296
1018	NC_017623	GGC	2	6	49752	49757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589296
1019	NC_017623	CCG	2	6	49820	49825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589296
1020	NC_017623	TACA	2	8	49837	49844	50 %	25 %	0 %	25 %	386589296
1021	NC_017623	ACA	2	6	49890	49895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386589296
1022	NC_017623	GCC	2	6	49912	49917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589297
1023	NC_017623	GGT	2	6	49918	49923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589297
1024	NC_017623	AGC	2	6	49958	49963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589297
1025	NC_017623	GCG	2	6	49974	49979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589297
1026	NC_017623	CGG	2	6	49981	49986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589297
1027	NC_017623	CGT	2	6	49994	49999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589297
1028	NC_017623	CAG	2	6	50003	50008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589297
1029	NC_017623	GGC	2	6	50077	50082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589297
1030	NC_017623	TGT	2	6	50085	50090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589297
1031	NC_017623	GCGCG	2	10	50164	50173	0 %	0 %	60 %	40 %	386589297
1032	NC_017623	GGC	2	6	50233	50238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589297
1033	NC_017623	TCA	2	6	50304	50309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589297
1034	NC_017623	GCC	2	6	50351	50356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589297
1035	NC_017623	GC	3	6	50383	50388	0 %	0 %	50 %	50 %	386589297
1036	NC_017623	GGC	2	6	50450	50455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589297
1037	NC_017623	GGC	2	6	50459	50464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589297
1038	NC_017623	CG	3	6	50498	50503	0 %	0 %	50 %	50 %	386589297
1039	NC_017623	ATC	2	6	50507	50512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589297
1040	NC_017623	TTC	2	6	50540	50545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589297
1041	NC_017623	GCC	2	6	50639	50644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589297
1042	NC_017623	ATCA	2	8	50651	50658	50 %	25 %	0 %	25 %	386589297
1043	NC_017623	TAC	2	6	50684	50689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589297
1044	NC_017623	CGC	2	6	50700	50705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589297
1045	NC_017623	GC	3	6	50805	50810	0 %	0 %	50 %	50 %	386589297
1046	NC_017623	CGG	2	6	50877	50882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589297
1047	NC_017623	AG	3	6	50929	50934	50 %	0 %	50 %	0 %	386589297
1048	NC_017623	TTG	2	6	50942	50947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589297
1049	NC_017623	AACG	2	8	50985	50992	50 %	0 %	25 %	25 %	386589297
1050	NC_017623	TAC	2	6	50998	51003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589297
1051	NC_017623	ATT	2	6	51012	51017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386589297
1052	NC_017623	CGG	2	6	51055	51060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589298
1053	NC_017623	CTG	2	6	51090	51095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589298
1054	NC_017623	GTG	2	6	51096	51101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589298
1055	NC_017623	ACT	2	6	51104	51109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589298
1056	NC_017623	CGG	2	6	51127	51132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589298
1057	NC_017623	GAT	2	6	51161	51166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589298
1058	NC_017623	TGGC	2	8	51184	51191	0 %	25 %	50 %	25 %	386589298
1059	NC_017623	CAT	2	6	51231	51236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589298
1060	NC_017623	GTG	2	6	51261	51266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589298
1061	NC_017623	CCT	2	6	51271	51276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386589298
1062	NC_017623	GCT	2	6	51302	51307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589298
1063	NC_017623	TCT	2	6	51316	51321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589298
1064	NC_017623	GGC	3	9	51326	51334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589298
1065	NC_017623	CTG	3	9	51426	51434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589298
1066	NC_017623	CGC	2	6	51506	51511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589298
1067	NC_017623	CGG	2	6	51533	51538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589298
1068	NC_017623	TGG	2	6	51580	51585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589298
1069	NC_017623	CGCTA	2	10	51628	51637	20 %	20 %	20 %	40 %	386589298
1070	NC_017623	CCT	2	6	51646	51651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386589298
1071	NC_017623	GGCAG	2	10	51665	51674	20 %	0 %	60 %	20 %	386589298
1072	NC_017623	TGA	2	6	51733	51738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589298
1073	NC_017623	CCT	2	6	51835	51840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386589298
1074	NC_017623	CGG	2	6	51931	51936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589298
1075	NC_017623	GCG	3	9	51939	51947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589298
1076	NC_017623	GCT	2	6	51986	51991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589298
1077	NC_017623	T	6	6	51991	51996	0 %	100 %	0 %	0 %	386589298
1078	NC_017623	CGT	2	6	52099	52104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589298
1079	NC_017623	GC	3	6	52183	52188	0 %	0 %	50 %	50 %	386589298
1080	NC_017623	GCG	2	6	52243	52248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589298
1081	NC_017623	TGC	2	6	52329	52334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589299
1082	NC_017623	GCC	2	6	52355	52360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589299
1083	NC_017623	CG	4	8	52372	52379	0 %	0 %	50 %	50 %	386589299
1084	NC_017623	TCG	2	6	52498	52503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589299
1085	NC_017623	TTC	2	6	52511	52516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589299
1086	NC_017623	TGGC	2	8	52544	52551	0 %	25 %	50 %	25 %	386589299
1087	NC_017623	GCG	2	6	52560	52565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589299
1088	NC_017623	TCG	2	6	52657	52662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589299
1089	NC_017623	CG	3	6	52698	52703	0 %	0 %	50 %	50 %	386589299
1090	NC_017623	GCG	2	6	52871	52876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589299
1091	NC_017623	CAG	2	6	52892	52897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589299
1092	NC_017623	GTG	3	9	52916	52924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589299
1093	NC_017623	TGA	2	6	52960	52965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589299
1094	NC_017623	CGA	2	6	52996	53001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589299
1095	NC_017623	A	6	6	53022	53027	100 %	0 %	0 %	0 %	386589299
1096	NC_017623	TTATT	2	10	53074	53083	20 %	80 %	0 %	0 %	386589299
1097	NC_017623	CTT	2	6	53284	53289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589299
1098	NC_017623	CGC	2	6	53332	53337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589299
1099	NC_017623	GCT	2	6	53373	53378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589300
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1101	NC_017623	GCT	2	6	53388	53393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589300
1102	NC_017623	CT	3	6	53392	53397	0 %	50 %	0 %	50 %	386589300
1103	NC_017623	CCG	2	6	53433	53438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589300
1104	NC_017623	TTTTC	2	10	53459	53468	0 %	80 %	0 %	20 %	386589300
1105	NC_017623	CTT	2	6	53487	53492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589300
1106	NC_017623	T	6	6	53491	53496	0 %	100 %	0 %	0 %	386589300
1107	NC_017623	TTTCG	2	10	53524	53533	0 %	60 %	20 %	20 %	386589300
1108	NC_017623	CGC	2	6	53546	53551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589300
1109	NC_017623	TAT	2	6	53573	53578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386589300
1110	NC_017623	CCG	2	6	53579	53584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589300
1111	NC_017623	GGCGT	2	10	53812	53821	0 %	20 %	60 %	20 %	386589300
1112	NC_017623	TTC	2	6	53830	53835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589300
1113	NC_017623	TTC	2	6	53839	53844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589300
1114	NC_017623	TGG	2	6	53858	53863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589300
1115	NC_017623	T	6	6	53899	53904	0 %	100 %	0 %	0 %	386589300
1116	NC_017623	GTTTG	2	10	53922	53931	0 %	60 %	40 %	0 %	386589300
1117	NC_017623	CGG	2	6	53949	53954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589300
1118	NC_017623	CG	3	6	53957	53962	0 %	0 %	50 %	50 %	386589300
1119	NC_017623	CAT	2	6	53967	53972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589300
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1121	NC_017623	GCG	2	6	54040	54045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589300
1122	NC_017623	CTGG	2	8	54072	54079	0 %	25 %	50 %	25 %	386589300
1123	NC_017623	GCG	2	6	54107	54112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589300
1124	NC_017623	CG	3	6	54143	54148	0 %	0 %	50 %	50 %	386589300
1125	NC_017623	GCT	2	6	54177	54182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589300
1126	NC_017623	CGTG	2	8	54228	54235	0 %	25 %	50 %	25 %	386589300
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1141	NC_017623	TGG	2	6	54826	54831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589301
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1161	NC_017623	GCT	2	6	55488	55493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1255	NC_017623	GTA	2	6	59187	59192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589303
1256	NC_017623	CAC	2	6	59212	59217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386589303
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1259	NC_017623	ATC	2	6	59312	59317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589303
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1262	NC_017623	CAT	2	6	59371	59376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589303
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1272	NC_017623	ATC	2	6	59751	59756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589304
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1288	NC_017623	TTGC	2	8	60359	60366	0 %	50 %	25 %	25 %	386589304
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1333	NC_017623	ATCA	2	8	62262	62269	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1334	NC_017623	AG	3	6	62292	62297	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1337	NC_017623	AAT	2	6	62359	62364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1377	NC_017623	GCC	2	6	63983	63988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589307
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1379	NC_017623	CAT	2	6	64046	64051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589307
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