MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. B182 chromosome

Total Repeats: 100404

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017623	CTGGC	2	10	25425	25434	0 %	20 %	40 %	40 %	386589275
502	NC_017623	GTT	2	6	25441	25446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589275
503	NC_017623	CGT	2	6	25459	25464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589275
504	NC_017623	AGG	2	6	25515	25520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386589275
505	NC_017623	TGG	2	6	25647	25652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589275
506	NC_017623	TAC	2	6	25702	25707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589275
507	NC_017623	GC	3	6	25751	25756	0 %	0 %	50 %	50 %	386589275
508	NC_017623	A	6	6	25775	25780	100 %	0 %	0 %	0 %	386589275
509	NC_017623	CGG	2	6	25795	25800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589275
510	NC_017623	GCAG	2	8	25816	25823	25 %	0 %	50 %	25 %	386589275
511	NC_017623	TGA	2	6	26005	26010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589275
512	NC_017623	CGG	2	6	26076	26081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589275
513	NC_017623	GC	3	6	26197	26202	0 %	0 %	50 %	50 %	386589275
514	NC_017623	CTAT	2	8	26238	26245	25 %	50 %	0 %	25 %	386589275
515	NC_017623	GTT	3	9	26251	26259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589275
516	NC_017623	GTG	2	6	26294	26299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589275
517	NC_017623	ACG	2	6	26300	26305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589275
518	NC_017623	GCA	2	6	26314	26319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589275
519	NC_017623	CCCG	2	8	26352	26359	0 %	0 %	25 %	75 %	386589275
520	NC_017623	TCA	2	6	26367	26372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589275
521	NC_017623	CGG	2	6	26409	26414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589275
522	NC_017623	GC	3	6	26421	26426	0 %	0 %	50 %	50 %	386589275
523	NC_017623	ATG	2	6	26480	26485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589275
524	NC_017623	GCA	2	6	26578	26583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589275
525	NC_017623	ACC	2	6	26612	26617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386589275
526	NC_017623	CGA	2	6	26758	26763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589275
527	NC_017623	GCC	2	6	26788	26793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589275
528	NC_017623	ATG	2	6	26830	26835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589275
529	NC_017623	GTG	2	6	26896	26901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589276
530	NC_017623	ATTGA	2	10	26968	26977	40 %	40 %	20 %	0 %	386589276
531	NC_017623	CGGT	2	8	26992	26999	0 %	25 %	50 %	25 %	386589276
532	NC_017623	CAA	2	6	27076	27081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386589276
533	NC_017623	GAA	2	6	27103	27108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_017623	GAC	2	6	27113	27118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589277
535	NC_017623	A	6	6	27120	27125	100 %	0 %	0 %	0 %	386589277
536	NC_017623	TGA	2	6	27338	27343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589277
537	NC_017623	AAC	2	6	27378	27383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386589277
538	NC_017623	TCCG	2	8	27400	27407	0 %	25 %	25 %	50 %	386589277
539	NC_017623	TCA	2	6	27469	27474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589277
540	NC_017623	CGC	2	6	27476	27481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589277
541	NC_017623	G	6	6	27490	27495	0 %	0 %	100 %	0 %	386589277
542	NC_017623	CGATG	2	10	27530	27539	20 %	20 %	40 %	20 %	386589277
543	NC_017623	TTC	2	6	27542	27547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589277
544	NC_017623	GCGG	2	8	27591	27598	0 %	0 %	75 %	25 %	386589277
545	NC_017623	CTC	2	6	27608	27613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386589277
546	NC_017623	CTG	2	6	27615	27620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589277
547	NC_017623	GC	3	6	27633	27638	0 %	0 %	50 %	50 %	386589277
548	NC_017623	CCG	2	6	27741	27746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589277
549	NC_017623	CGCGA	2	10	27777	27786	20 %	0 %	40 %	40 %	386589277
550	NC_017623	TCA	2	6	27787	27792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589277
551	NC_017623	CGA	2	6	27860	27865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589277
552	NC_017623	AGGT	2	8	27925	27932	25 %	25 %	50 %	0 %	386589277
553	NC_017623	CAA	2	6	27966	27971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386589277
554	NC_017623	CTT	2	6	27974	27979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589277
555	NC_017623	ATA	2	6	28037	28042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386589277
556	NC_017623	AAT	2	6	28065	28070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017623	GGC	2	6	28085	28090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_017623	GTA	2	6	28118	28123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_017623	GTGA	2	8	28134	28141	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017623	TAAA	2	8	28191	28198	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_017623	CCA	3	9	28220	28228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386589278
562	NC_017623	CG	3	6	28255	28260	0 %	0 %	50 %	50 %	386589278
563	NC_017623	GC	3	6	28266	28271	0 %	0 %	50 %	50 %	386589278
564	NC_017623	GTG	2	6	28315	28320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589278
565	NC_017623	CGG	2	6	28401	28406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589278
566	NC_017623	CG	3	6	28487	28492	0 %	0 %	50 %	50 %	386589278
567	NC_017623	GT	3	6	28549	28554	0 %	50 %	50 %	0 %	386589278
568	NC_017623	CGG	2	6	28632	28637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589278
569	NC_017623	GCT	2	6	28860	28865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589278
570	NC_017623	GTT	2	6	28890	28895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589278
571	NC_017623	TTG	2	6	28916	28921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589278
572	NC_017623	CTG	2	6	29053	29058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589278
573	NC_017623	GCG	3	9	29059	29067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589278
574	NC_017623	CGG	2	6	29187	29192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589278
575	NC_017623	GCT	2	6	29229	29234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589278
576	NC_017623	A	7	7	29323	29329	100 %	0 %	0 %	0 %	386589278
577	NC_017623	TAC	2	6	29358	29363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589278
578	NC_017623	TC	3	6	29372	29377	0 %	50 %	0 %	50 %	386589278
579	NC_017623	ACC	2	6	29405	29410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386589278
580	NC_017623	CGCT	2	8	29428	29435	0 %	25 %	25 %	50 %	386589278
581	NC_017623	CGG	2	6	29457	29462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589278
582	NC_017623	CCGGC	2	10	29546	29555	0 %	0 %	40 %	60 %	386589278
583	NC_017623	GAC	2	6	29575	29580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589278
584	NC_017623	CGG	2	6	29598	29603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589278
585	NC_017623	AGT	2	6	29607	29612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589278
586	NC_017623	GC	3	6	29723	29728	0 %	0 %	50 %	50 %	386589278
587	NC_017623	TCA	2	6	29729	29734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589278
588	NC_017623	CGG	2	6	29751	29756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589278
589	NC_017623	GCG	2	6	29801	29806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589278
590	NC_017623	GCA	2	6	29861	29866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589278
591	NC_017623	CAGTTG	2	12	29869	29880	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386589278
592	NC_017623	CGC	2	6	29895	29900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589278
593	NC_017623	CGC	2	6	29902	29907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589278
594	NC_017623	CGTCAG	2	12	29953	29964	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386589278
595	NC_017623	TGA	2	6	30049	30054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589278
596	NC_017623	GC	3	6	30104	30109	0 %	0 %	50 %	50 %	386589279
597	NC_017623	CG	3	6	30117	30122	0 %	0 %	50 %	50 %	386589279
598	NC_017623	GCG	2	6	30135	30140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589279
599	NC_017623	CGC	2	6	30148	30153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589279
600	NC_017623	A	6	6	30157	30162	100 %	0 %	0 %	0 %	386589279
601	NC_017623	GCG	2	6	30244	30249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589279
602	NC_017623	GAT	2	6	30257	30262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589279
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604	NC_017623	CGG	2	6	30310	30315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589279
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606	NC_017623	CGG	2	6	30391	30396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589279
607	NC_017623	GGC	2	6	30426	30431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589279
608	NC_017623	TGA	2	6	30458	30463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589279
609	NC_017623	AGCGAA	2	12	30464	30475	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386589279
610	NC_017623	GCA	3	9	30491	30499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589279
611	NC_017623	GCC	2	6	30515	30520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589279
612	NC_017623	GGGCA	2	10	30546	30555	20 %	0 %	60 %	20 %	386589279
613	NC_017623	CGCTGG	2	12	30556	30567	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386589279
614	NC_017623	CAG	2	6	30576	30581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589279
615	NC_017623	GGC	4	12	30615	30626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589279
616	NC_017623	GGC	2	6	30629	30634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589279
617	NC_017623	GGA	2	6	30695	30700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386589279
618	NC_017623	GCCT	2	8	30705	30712	0 %	25 %	25 %	50 %	386589279
619	NC_017623	GCG	2	6	30717	30722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589279
620	NC_017623	CG	3	6	30751	30756	0 %	0 %	50 %	50 %	386589279
621	NC_017623	CGA	2	6	30797	30802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589279
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623	NC_017623	ATT	2	6	30837	30842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386589279
624	NC_017623	GCG	2	6	30867	30872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589279
625	NC_017623	TGCG	2	8	30895	30902	0 %	25 %	50 %	25 %	386589279
626	NC_017623	GC	3	6	30919	30924	0 %	0 %	50 %	50 %	386589279
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763	NC_017623	GCT	2	6	36660	36665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589285
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765	NC_017623	TCTA	2	8	36712	36719	25 %	50 %	0 %	25 %	386589285
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