MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. B182 chromosome

Total Repeats: 100404

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017623	GTG	2	6	233420	233425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589459
5002	NC_017623	CCG	2	6	233478	233483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589459
5003	NC_017623	AGGT	2	8	233505	233512	25 %	25 %	50 %	0 %	386589459
5004	NC_017623	GAC	2	6	233546	233551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589459
5005	NC_017623	CGG	2	6	233560	233565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589459
5006	NC_017623	CTT	2	6	233584	233589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589459
5007	NC_017623	CGCCAG	2	12	233615	233626	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386589459
5008	NC_017623	GCC	2	6	233645	233650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589459
5009	NC_017623	TGG	2	6	233659	233664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589459
5010	NC_017623	CGC	2	6	233665	233670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589459
5011	NC_017623	GC	4	8	233682	233689	0 %	0 %	50 %	50 %	386589459
5012	NC_017623	CAG	2	6	233729	233734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589459
5013	NC_017623	GC	3	6	233743	233748	0 %	0 %	50 %	50 %	386589459
5014	NC_017623	GCA	2	6	233794	233799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589459
5015	NC_017623	GC	3	6	233845	233850	0 %	0 %	50 %	50 %	386589459
5016	NC_017623	CCG	3	9	233943	233951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589459
5017	NC_017623	GC	3	6	233991	233996	0 %	0 %	50 %	50 %	386589459
5018	NC_017623	CGC	2	6	234025	234030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589459
5019	NC_017623	CCAG	2	8	234124	234131	25 %	0 %	25 %	50 %	386589459
5020	NC_017623	AAT	2	6	234151	234156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386589459
5021	NC_017623	CG	3	6	234165	234170	0 %	0 %	50 %	50 %	386589459
5022	NC_017623	AAT	2	6	234209	234214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386589459
5023	NC_017623	TC	3	6	234229	234234	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5024	NC_017623	TTG	2	6	234319	234324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589460
5025	NC_017623	AAGG	2	8	234336	234343	50 %	0 %	50 %	0 %	386589460
5026	NC_017623	GCC	2	6	234404	234409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589460
5027	NC_017623	CGC	2	6	234477	234482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589460
5028	NC_017623	GCC	2	6	234536	234541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589460
5029	NC_017623	CGG	2	6	234567	234572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589460
5030	NC_017623	CTT	2	6	234591	234596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589460
5031	NC_017623	T	6	6	234595	234600	0 %	100 %	0 %	0 %	386589460
5032	NC_017623	CGG	2	6	234627	234632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589460
5033	NC_017623	CAC	2	6	234646	234651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386589460
5034	NC_017623	CTT	2	6	234684	234689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589460
5035	NC_017623	CCA	2	6	234690	234695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386589460
5036	NC_017623	TCGCG	2	10	234702	234711	0 %	20 %	40 %	40 %	386589460
5037	NC_017623	CTT	2	6	234738	234743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589460
5038	NC_017623	GCA	2	6	234768	234773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589460
5039	NC_017623	AGAT	2	8	234780	234787	50 %	25 %	25 %	0 %	386589460
5040	NC_017623	GCTG	2	8	234793	234800	0 %	25 %	50 %	25 %	386589460
5041	NC_017623	TGG	2	6	234816	234821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589460
5042	NC_017623	TGA	2	6	235030	235035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_017623	TGT	2	6	235052	235057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_017623	AAT	2	6	235097	235102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_017623	ATT	2	6	235151	235156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_017623	GCTG	2	8	235166	235173	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5047	NC_017623	GGC	2	6	235181	235186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5048	NC_017623	GGC	2	6	235226	235231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5049	NC_017623	CTTTCA	2	12	235274	235285	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_017623	CG	3	6	235424	235429	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5051	NC_017623	CGGCG	2	10	235434	235443	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5052	NC_017623	TCA	2	6	235450	235455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_017623	GC	3	6	235481	235486	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5054	NC_017623	CAAT	2	8	235553	235560	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5055	NC_017623	TGC	2	6	235570	235575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5056	NC_017623	CTGCAT	2	12	235584	235595	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5057	NC_017623	GC	3	6	235641	235646	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5058	NC_017623	TGC	2	6	235672	235677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_017623	CTG	2	6	235710	235715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_017623	GTG	2	6	235738	235743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_017623	GCC	2	6	235773	235778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5062	NC_017623	CGCTGG	2	12	235904	235915	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5063	NC_017623	AAAT	2	8	235918	235925	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_017623	GCAGCG	2	12	235931	235942	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_017623	TGA	2	6	235949	235954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_017623	GA	3	6	235960	235965	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_017623	CGT	2	6	235976	235981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5068	NC_017623	ATT	2	6	236052	236057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_017623	GGC	2	6	236065	236070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5070	NC_017623	GA	3	6	236096	236101	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_017623	AGCGTT	2	12	236120	236131	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5072	NC_017623	GCA	2	6	236137	236142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5073	NC_017623	AATC	2	8	236190	236197	50 %	25 %	0 %	25 %	386589461
5074	NC_017623	CAT	2	6	236283	236288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589461
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5077	NC_017623	CTGC	2	8	236379	236386	0 %	25 %	25 %	50 %	386589461
5078	NC_017623	CAG	2	6	236404	236409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589461
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5084	NC_017623	CGG	2	6	236635	236640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589461
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5094	NC_017623	ACCAGT	2	12	237158	237169	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386589461
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5098	NC_017623	GCGAG	2	10	237249	237258	20 %	0 %	60 %	20 %	386589461
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5101	NC_017623	CGGCG	2	10	237298	237307	0 %	0 %	60 %	40 %	386589461
5102	NC_017623	GATGG	2	10	237379	237388	20 %	20 %	60 %	0 %	386589461
5103	NC_017623	CAG	2	6	237403	237408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589461
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5108	NC_017623	GCA	2	6	237668	237673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589461
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5112	NC_017623	AAGA	2	8	237975	237982	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_017623	AT	3	6	238011	238016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_017623	A	6	6	238019	238024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5117	NC_017623	CT	3	6	238080	238085	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5125	NC_017623	GAA	2	6	238465	238470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386589462
5126	NC_017623	CCA	2	6	238518	238523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386589462
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5128	NC_017623	GCA	2	6	238560	238565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589462
5129	NC_017623	CG	3	6	238603	238608	0 %	0 %	50 %	50 %	386589462
5130	NC_017623	CGC	2	6	238620	238625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589462
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5134	NC_017623	CAG	2	6	238813	238818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589462
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5233	NC_017623	CAT	2	6	243586	243591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589465
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5247	NC_017623	GGC	2	6	244159	244164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5248	NC_017623	GAA	2	6	244237	244242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5249	NC_017623	TAT	2	6	244254	244259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5250	NC_017623	GGC	2	6	244287	244292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589466
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5276	NC_017623	GA	3	6	245765	245770	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5277	NC_017623	GTG	2	6	245785	245790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5278	NC_017623	TAT	2	6	245831	245836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5280	NC_017623	TGCTA	2	10	245870	245879	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5281	NC_017623	GGA	2	6	245907	245912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5282	NC_017623	AAT	2	6	245915	245920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5283	NC_017623	TGG	2	6	245944	245949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589467
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5368	NC_017623	ATC	2	6	250301	250306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589471
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5450	NC_017623	GGT	2	6	254677	254682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5474	NC_017623	AGTCG	2	10	256311	256320	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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5500	NC_017623	AAGGA	2	10	257996	258005	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding

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