MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Streptococcus suis A7 chromosome

Total Repeats: 1558

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017622	CTATC	2	10	928	937	20 %	40 %	0 %	40 %	386587282
2	NC_017622	AATAA	2	10	1297	1306	80 %	20 %	0 %	0 %	386587282
3	NC_017622	CATAT	2	10	2807	2816	40 %	40 %	0 %	20 %	386587284
4	NC_017622	AAACA	2	10	5721	5730	80 %	0 %	0 %	20 %	386587288
5	NC_017622	TGTCT	2	10	6112	6121	0 %	60 %	20 %	20 %	386587288
6	NC_017622	GAGAT	2	10	6830	6839	40 %	20 %	40 %	0 %	386587289
7	NC_017622	TGAAA	2	10	9967	9976	60 %	20 %	20 %	0 %	386587290
8	NC_017622	CTATT	2	10	11204	11213	20 %	60 %	0 %	20 %	386587293
9	NC_017622	CTTTG	2	10	13433	13442	0 %	60 %	20 %	20 %	386587295
10	NC_017622	AACAG	2	10	13877	13886	60 %	0 %	20 %	20 %	386587296
11	NC_017622	CTTGT	2	10	15033	15042	0 %	60 %	20 %	20 %	386587296
12	NC_017622	CAAAC	2	10	16867	16876	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_017622	ACAAA	2	10	16913	16922	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017622	TCGTG	2	10	18045	18054	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017622	GTTAA	2	10	18924	18933	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017622	ATTAT	2	10	22858	22867	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017622	TTAAT	2	10	23302	23311	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017622	ATATT	2	10	23720	23729	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017622	TTTAT	2	10	24751	24760	20 %	80 %	0 %	0 %	386587299
20	NC_017622	AATGC	2	10	25717	25726	40 %	20 %	20 %	20 %	386587300
21	NC_017622	CTACG	2	10	31071	31080	20 %	20 %	20 %	40 %	386587306
22	NC_017622	GAACG	2	10	33357	33366	40 %	0 %	40 %	20 %	386587307
23	NC_017622	AAACC	2	10	33493	33502	60 %	0 %	0 %	40 %	386587307
24	NC_017622	ATTCT	2	10	34840	34849	20 %	60 %	0 %	20 %	386587307
25	NC_017622	GCCAT	2	10	35315	35324	20 %	20 %	20 %	40 %	386587307
26	NC_017622	AAATG	2	10	36401	36410	60 %	20 %	20 %	0 %	386587308
27	NC_017622	AGCAG	2	10	39032	39041	40 %	0 %	40 %	20 %	386587310
28	NC_017622	CTATT	2	10	39257	39266	20 %	60 %	0 %	20 %	386587310
29	NC_017622	CTATT	2	10	41819	41828	20 %	60 %	0 %	20 %	386587312
30	NC_017622	GAAGC	2	10	42997	43006	40 %	0 %	40 %	20 %	386587313
31	NC_017622	AGCGG	2	10	46103	46112	20 %	0 %	60 %	20 %	386587316
32	NC_017622	TTAGT	2	10	47719	47728	20 %	60 %	20 %	0 %	386587318
33	NC_017622	GAAGT	2	10	48366	48375	40 %	20 %	40 %	0 %	386587319
34	NC_017622	TTATC	2	10	48497	48506	20 %	60 %	0 %	20 %	386587319
35	NC_017622	TAATC	2	10	48605	48614	40 %	40 %	0 %	20 %	386587319
36	NC_017622	TCAAT	2	10	48864	48873	40 %	40 %	0 %	20 %	386587320
37	NC_017622	TTATT	2	10	49117	49126	20 %	80 %	0 %	0 %	386587320
38	NC_017622	GAGAA	2	10	52623	52632	60 %	0 %	40 %	0 %	386587324
39	NC_017622	GCAGA	2	10	54104	54113	40 %	0 %	40 %	20 %	386587326
40	NC_017622	GGGCT	2	10	54575	54584	0 %	20 %	60 %	20 %	386587326
41	NC_017622	TTTTG	2	10	55604	55613	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017622	TGAAT	2	10	56198	56207	40 %	40 %	20 %	0 %	386587328
43	NC_017622	AGCAG	2	10	60336	60345	40 %	0 %	40 %	20 %	386587331
44	NC_017622	GCCCT	2	10	63158	63167	0 %	20 %	20 %	60 %	386587335
45	NC_017622	GTTTT	2	10	65661	65670	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017622	TTGCT	2	10	66257	66266	0 %	60 %	20 %	20 %	386587337
47	NC_017622	GTATC	2	10	69544	69553	20 %	40 %	20 %	20 %	386587340
48	NC_017622	TGGAT	2	10	71538	71547	20 %	40 %	40 %	0 %	386587344
49	NC_017622	TTATG	2	10	71748	71757	20 %	60 %	20 %	0 %	386587345
50	NC_017622	AAATT	2	10	72640	72649	60 %	40 %	0 %	0 %	386587347
51	NC_017622	TGGCG	2	10	73647	73656	0 %	20 %	60 %	20 %	386587349
52	NC_017622	AAAAC	2	10	74207	74216	80 %	0 %	0 %	20 %	386587350
53	NC_017622	TACAC	2	10	74621	74630	40 %	20 %	0 %	40 %	386587351
54	NC_017622	GAAAA	2	10	75500	75509	80 %	0 %	20 %	0 %	386587352
55	NC_017622	GTCTT	2	10	75788	75797	0 %	60 %	20 %	20 %	386587353
56	NC_017622	TTTGG	2	10	75919	75928	0 %	60 %	40 %	0 %	386587353
57	NC_017622	AAGGA	2	10	78494	78503	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017622	TAAGA	2	10	79252	79261	60 %	20 %	20 %	0 %	386587361
59	NC_017622	AGAAT	2	10	84040	84049	60 %	20 %	20 %	0 %	386587368
60	NC_017622	TAGTC	2	10	84825	84834	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_017622	GAAAA	2	10	86366	86375	80 %	0 %	20 %	0 %	386587373
62	NC_017622	TGACT	2	10	86761	86770	20 %	40 %	20 %	20 %	386587373
63	NC_017622	TTTTA	2	10	87595	87604	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017622	ACAAA	2	10	88020	88029	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_017622	TCGTG	2	10	89152	89161	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_017622	GTTAA	2	10	90031	90040	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017622	TTAAT	2	10	93541	93550	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017622	TGTGA	2	10	94502	94511	20 %	40 %	40 %	0 %	386587375
69	NC_017622	CTTTC	2	10	95389	95398	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
70	NC_017622	TGCTT	2	10	96053	96062	0 %	60 %	20 %	20 %	386587377
71	NC_017622	CGCTC	2	10	97151	97160	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
72	NC_017622	TTGTT	2	10	97258	97267	0 %	80 %	20 %	0 %	386587380
73	NC_017622	AATAT	2	10	98700	98709	60 %	40 %	0 %	0 %	386587381
74	NC_017622	TTTCA	2	10	99516	99525	20 %	60 %	0 %	20 %	386587383
75	NC_017622	CTTCG	2	10	99759	99768	0 %	40 %	20 %	40 %	386587383
76	NC_017622	AAAAT	2	10	99893	99902	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017622	TTTTG	2	10	100072	100081	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017622	TTTTC	2	10	100680	100689	0 %	80 %	0 %	20 %	386587384
79	NC_017622	TTTGG	2	10	102976	102985	0 %	60 %	40 %	0 %	386587388
80	NC_017622	ATTGC	2	10	103441	103450	20 %	40 %	20 %	20 %	386587388
81	NC_017622	GCTTT	2	10	103672	103681	0 %	60 %	20 %	20 %	386587389
82	NC_017622	AGAAA	2	10	104130	104139	80 %	0 %	20 %	0 %	386587389
83	NC_017622	GACTT	2	10	105709	105718	20 %	40 %	20 %	20 %	386587390
84	NC_017622	CTGGG	2	10	109929	109938	0 %	20 %	60 %	20 %	386587395
85	NC_017622	AAGAA	2	10	114770	114779	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017622	CCGTT	2	10	115813	115822	0 %	40 %	20 %	40 %	386587397
87	NC_017622	GTCTG	2	10	119285	119294	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_017622	GGCCT	2	10	119353	119362	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
89	NC_017622	GTCAA	2	10	119450	119459	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_017622	GCTTG	2	10	121301	121310	0 %	40 %	40 %	20 %	386587400
91	NC_017622	TGGTT	2	10	121429	121438	0 %	60 %	40 %	0 %	386587400
92	NC_017622	GGTCA	2	10	121728	121737	20 %	20 %	40 %	20 %	386587400
93	NC_017622	AAGGA	2	10	122818	122827	60 %	0 %	40 %	0 %	386587403
94	NC_017622	GGCAA	2	10	123376	123385	40 %	0 %	40 %	20 %	386587405
95	NC_017622	TTGGT	2	10	125764	125773	0 %	60 %	40 %	0 %	386587407
96	NC_017622	GGATG	2	10	126066	126075	20 %	20 %	60 %	0 %	386587408
97	NC_017622	GAAAA	2	10	126226	126235	80 %	0 %	20 %	0 %	386587409
98	NC_017622	CCTTG	2	10	126279	126288	0 %	40 %	20 %	40 %	386587409
99	NC_017622	CTGGA	2	10	127167	127176	20 %	20 %	40 %	20 %	386587410
100	NC_017622	AGCAG	2	10	127523	127532	40 %	0 %	40 %	20 %	386587410
101	NC_017622	GCTCA	2	10	127631	127640	20 %	20 %	20 %	40 %	386587410
102	NC_017622	AATCA	2	10	128145	128154	60 %	20 %	0 %	20 %	386587411
103	NC_017622	AGGTG	2	10	128833	128842	20 %	20 %	60 %	0 %	386587411
104	NC_017622	CATGA	2	10	129206	129215	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_017622	GAAAG	2	10	130814	130823	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017622	ACTTT	2	10	132708	132717	20 %	60 %	0 %	20 %	386587416
107	NC_017622	CTATA	2	10	133732	133741	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_017622	TAGCG	2	10	135806	135815	20 %	20 %	40 %	20 %	386587420
109	NC_017622	ATCAA	2	10	136967	136976	60 %	20 %	0 %	20 %	386587422
110	NC_017622	GAAGC	2	10	137456	137465	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
111	NC_017622	CGTAT	2	10	138239	138248	20 %	40 %	20 %	20 %	386587423
112	NC_017622	ATCCA	2	10	138330	138339	40 %	20 %	0 %	40 %	386587423
113	NC_017622	CAAGA	2	10	139106	139115	60 %	0 %	20 %	20 %	386587423
114	NC_017622	AAGCT	2	10	139536	139545	40 %	20 %	20 %	20 %	386587423
115	NC_017622	AAGAA	2	10	141742	141751	80 %	0 %	20 %	0 %	386587425
116	NC_017622	GCAGT	2	10	142032	142041	20 %	20 %	40 %	20 %	386587425
117	NC_017622	ATCCA	2	10	142143	142152	40 %	20 %	0 %	40 %	386587425
118	NC_017622	TACGA	2	10	142644	142653	40 %	20 %	20 %	20 %	386587425
119	NC_017622	TTAAG	2	10	142976	142985	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017622	GTAAA	2	10	144458	144467	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017622	GAAAA	2	10	146436	146445	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017622	CTATT	2	10	146462	146471	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_017622	GTTTA	2	10	146641	146650	20 %	60 %	20 %	0 %	386587428
124	NC_017622	GCATG	2	10	148163	148172	20 %	20 %	40 %	20 %	386587430
125	NC_017622	AAAAT	2	10	148576	148585	80 %	20 %	0 %	0 %	386587430
126	NC_017622	ATAAA	2	10	149015	149024	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017622	GGGTC	2	10	153207	153216	0 %	20 %	60 %	20 %	386587435
128	NC_017622	TTTCA	2	10	154177	154186	20 %	60 %	0 %	20 %	386587436
129	NC_017622	AAAAG	2	10	154770	154779	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017622	TGGTC	2	10	157363	157372	0 %	40 %	40 %	20 %	386587439
131	NC_017622	GTCTT	2	10	158318	158327	0 %	60 %	20 %	20 %	386587440
132	NC_017622	TTGGA	2	10	160834	160843	20 %	40 %	40 %	0 %	386587442
133	NC_017622	TCATC	2	10	161707	161716	20 %	40 %	0 %	40 %	386587444
134	NC_017622	CTTGG	2	10	161876	161885	0 %	40 %	40 %	20 %	386587444
135	NC_017622	AATTG	2	10	162536	162545	40 %	40 %	20 %	0 %	386587445
136	NC_017622	TTTTC	2	10	162895	162904	0 %	80 %	0 %	20 %	386587446
137	NC_017622	CACCT	2	10	163458	163467	20 %	20 %	0 %	60 %	386587446
138	NC_017622	AGACT	2	10	168244	168253	40 %	20 %	20 %	20 %	386587449
139	NC_017622	CATTG	2	10	172851	172860	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_017622	ATACA	2	10	173917	173926	60 %	20 %	0 %	20 %	386587454
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147	NC_017622	TTGAT	2	10	184909	184918	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017622	TGATT	2	10	185557	185566	20 %	60 %	20 %	0 %	386587463
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151	NC_017622	GGAAA	2	10	193043	193052	60 %	0 %	40 %	0 %	386587467
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175	NC_017622	TTGAT	2	10	217339	217348	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
176	NC_017622	ATTTA	2	10	217523	217532	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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247	NC_017622	GCCTA	2	10	295026	295035	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
248	NC_017622	GAAAG	2	10	295211	295220	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
249	NC_017622	TGACA	2	10	299540	299549	40 %	20 %	20 %	20 %	386587558
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252	NC_017622	CATAG	2	10	302103	302112	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
253	NC_017622	CCCAG	2	10	302931	302940	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
254	NC_017622	CTTTT	2	10	304258	304267	0 %	80 %	0 %	20 %	386587562
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259	NC_017622	CAAGG	2	10	310701	310710	40 %	0 %	40 %	20 %	386587572
260	NC_017622	ATGAC	2	10	311128	311137	40 %	20 %	20 %	20 %	386587572
261	NC_017622	AGAGC	2	10	311787	311796	40 %	0 %	40 %	20 %	386587573
262	NC_017622	GATTT	2	10	312116	312125	20 %	60 %	20 %	0 %	386587573
263	NC_017622	TTGGT	2	10	314053	314062	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
264	NC_017622	TTCCT	2	10	314604	314613	0 %	60 %	0 %	40 %	386587577
265	NC_017622	CAATC	2	10	318556	318565	40 %	20 %	0 %	40 %	386587582
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268	NC_017622	ACAGA	2	10	320816	320825	60 %	0 %	20 %	20 %	386587584
269	NC_017622	CAACA	2	10	324914	324923	60 %	0 %	0 %	40 %	386587586
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