MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Streptococcus suis A7 chromosome

Total Repeats: 5982

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017622	ACTT	2	8	653	660	25 %	50 %	0 %	25 %	386587282
2	NC_017622	ACGT	2	8	959	966	25 %	25 %	25 %	25 %	386587282
3	NC_017622	ACAA	2	8	1068	1075	75 %	0 %	0 %	25 %	386587282
4	NC_017622	GACA	2	8	1224	1231	50 %	0 %	25 %	25 %	386587282
5	NC_017622	ATGC	2	8	1285	1292	25 %	25 %	25 %	25 %	386587282
6	NC_017622	ACAA	2	8	1956	1963	75 %	0 %	0 %	25 %	386587283
7	NC_017622	TACC	2	8	2268	2275	25 %	25 %	0 %	50 %	386587283
8	NC_017622	ACCG	2	8	2281	2288	25 %	0 %	25 %	50 %	386587283
9	NC_017622	ACTT	2	8	2521	2528	25 %	50 %	0 %	25 %	386587283
10	NC_017622	GTCC	2	8	2587	2594	0 %	25 %	25 %	50 %	386587283
11	NC_017622	AAAG	2	8	2825	2832	75 %	0 %	25 %	0 %	386587284
12	NC_017622	GAAG	2	8	3409	3416	50 %	0 %	50 %	0 %	386587284
13	NC_017622	GTAT	2	8	3624	3631	25 %	50 %	25 %	0 %	386587284
14	NC_017622	AATG	2	8	4190	4197	50 %	25 %	25 %	0 %	386587286
15	NC_017622	AAAT	2	8	4659	4666	75 %	25 %	0 %	0 %	386587287
16	NC_017622	CTTG	2	8	5247	5254	0 %	50 %	25 %	25 %	386587287
17	NC_017622	TTGG	2	8	5626	5633	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017622	GATT	2	8	5679	5686	25 %	50 %	25 %	0 %	386587288
19	NC_017622	ATGA	2	8	5870	5877	50 %	25 %	25 %	0 %	386587288
20	NC_017622	ATCA	2	8	6277	6284	50 %	25 %	0 %	25 %	386587289
21	NC_017622	AATC	2	8	6301	6308	50 %	25 %	0 %	25 %	386587289
22	NC_017622	GTTT	2	8	6507	6514	0 %	75 %	25 %	0 %	386587289
23	NC_017622	TCAA	2	8	6534	6541	50 %	25 %	0 %	25 %	386587289
24	NC_017622	CTTA	2	8	7007	7014	25 %	50 %	0 %	25 %	386587289
25	NC_017622	GATG	2	8	7590	7597	25 %	25 %	50 %	0 %	386587289
26	NC_017622	GCAA	2	8	8222	8229	50 %	0 %	25 %	25 %	386587289
27	NC_017622	TCAG	2	8	9162	9169	25 %	25 %	25 %	25 %	386587289
28	NC_017622	ATTG	2	8	9399	9406	25 %	50 %	25 %	0 %	386587289
29	NC_017622	CTTG	2	8	9441	9448	0 %	50 %	25 %	25 %	386587289
30	NC_017622	AAGG	2	8	9720	9727	50 %	0 %	50 %	0 %	386587289
31	NC_017622	GAAG	2	8	9841	9848	50 %	0 %	50 %	0 %	386587290
32	NC_017622	TCTT	2	8	10171	10178	0 %	75 %	0 %	25 %	386587291
33	NC_017622	TGCC	2	8	10186	10193	0 %	25 %	25 %	50 %	386587291
34	NC_017622	CTAT	2	8	10650	10657	25 %	50 %	0 %	25 %	386587293
35	NC_017622	AGTG	2	8	11513	11520	25 %	25 %	50 %	0 %	386587293
36	NC_017622	AGAT	2	8	11821	11828	50 %	25 %	25 %	0 %	386587294
37	NC_017622	GAAG	2	8	12136	12143	50 %	0 %	50 %	0 %	386587294
38	NC_017622	GATT	2	8	12204	12211	25 %	50 %	25 %	0 %	386587294
39	NC_017622	GGCG	2	8	12215	12222	0 %	0 %	75 %	25 %	386587294
40	NC_017622	AGGC	2	8	12866	12873	25 %	0 %	50 %	25 %	386587294
41	NC_017622	TAAA	2	8	12900	12907	75 %	25 %	0 %	0 %	386587294
42	NC_017622	CTTG	2	8	14363	14370	0 %	50 %	25 %	25 %	386587296
43	NC_017622	TGTT	2	8	14437	14444	0 %	75 %	25 %	0 %	386587296
44	NC_017622	GTTC	2	8	14463	14470	0 %	50 %	25 %	25 %	386587296
45	NC_017622	GTCG	2	8	14532	14539	0 %	25 %	50 %	25 %	386587296
46	NC_017622	CAAC	2	8	14591	14598	50 %	0 %	0 %	50 %	386587296
47	NC_017622	ATGG	2	8	14610	14617	25 %	25 %	50 %	0 %	386587296
48	NC_017622	CAAC	2	8	14653	14660	50 %	0 %	0 %	50 %	386587296
49	NC_017622	TTGG	2	8	14718	14725	0 %	50 %	50 %	0 %	386587296
50	NC_017622	AAGA	2	8	14958	14965	75 %	0 %	25 %	0 %	386587296
51	NC_017622	ACAA	2	8	15341	15348	75 %	0 %	0 %	25 %	386587296
52	NC_017622	TTAT	2	8	15776	15783	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017622	ATTA	2	8	16359	16366	50 %	50 %	0 %	0 %	386587297
54	NC_017622	AAAT	2	8	16629	16636	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017622	GTGA	2	8	17378	17385	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017622	AGCG	2	8	17549	17556	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017622	AGCC	2	8	18431	18438	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017622	GTAA	2	8	19010	19017	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017622	TCAC	2	8	19067	19074	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017622	GCGA	2	8	19166	19173	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017622	ATTC	2	8	20032	20039	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017622	CTAA	2	8	20387	20394	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017622	TAGG	2	8	21043	21050	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017622	AATC	2	8	22189	22196	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017622	GCGT	2	8	23100	23107	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017622	TTTG	2	8	23942	23949	0 %	75 %	25 %	0 %	386587298
67	NC_017622	CAAA	2	8	24699	24706	75 %	0 %	0 %	25 %	386587298
68	NC_017622	GGTC	2	8	24797	24804	0 %	25 %	50 %	25 %	386587299
69	NC_017622	AACA	2	8	25206	25213	75 %	0 %	0 %	25 %	386587299
70	NC_017622	TCTA	2	8	25350	25357	25 %	50 %	0 %	25 %	386587300
71	NC_017622	ATCA	2	8	25689	25696	50 %	25 %	0 %	25 %	386587300
72	NC_017622	TTTG	2	8	26601	26608	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017622	ATTG	2	8	27117	27124	25 %	50 %	25 %	0 %	386587301
74	NC_017622	TTGA	2	8	27328	27335	25 %	50 %	25 %	0 %	386587301
75	NC_017622	TGAT	2	8	27341	27348	25 %	50 %	25 %	0 %	386587301
76	NC_017622	TTTG	2	8	27606	27613	0 %	75 %	25 %	0 %	386587301
77	NC_017622	ATTT	2	8	27668	27675	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017622	TGCC	2	8	28078	28085	0 %	25 %	25 %	50 %	386587302
79	NC_017622	GCGG	2	8	28595	28602	0 %	0 %	75 %	25 %	386587302
80	NC_017622	GAAA	2	8	28750	28757	75 %	0 %	25 %	0 %	386587302
81	NC_017622	TGGG	2	8	29689	29696	0 %	25 %	75 %	0 %	386587304
82	NC_017622	TCAA	2	8	29728	29735	50 %	25 %	0 %	25 %	386587304
83	NC_017622	CGTG	2	8	30155	30162	0 %	25 %	50 %	25 %	386587304
84	NC_017622	TCAA	2	8	30408	30415	50 %	25 %	0 %	25 %	386587304
85	NC_017622	AACC	2	8	30457	30464	50 %	0 %	0 %	50 %	386587304
86	NC_017622	CTTG	2	8	30515	30522	0 %	50 %	25 %	25 %	386587304
87	NC_017622	AATT	2	8	30698	30705	50 %	50 %	0 %	0 %	386587305
88	NC_017622	TTTA	2	8	30880	30887	25 %	75 %	0 %	0 %	386587305
89	NC_017622	AAGA	2	8	31141	31148	75 %	0 %	25 %	0 %	386587306
90	NC_017622	TGAA	2	8	31208	31215	50 %	25 %	25 %	0 %	386587306
91	NC_017622	TTCA	2	8	32335	32342	25 %	50 %	0 %	25 %	386587307
92	NC_017622	TACT	2	8	32400	32407	25 %	50 %	0 %	25 %	386587307
93	NC_017622	GTCC	2	8	33409	33416	0 %	25 %	25 %	50 %	386587307
94	NC_017622	TTCC	2	8	33546	33553	0 %	50 %	0 %	50 %	386587307
95	NC_017622	GCAG	2	8	33996	34003	25 %	0 %	50 %	25 %	386587307
96	NC_017622	TACC	2	8	34213	34220	25 %	25 %	0 %	50 %	386587307
97	NC_017622	CCAA	2	8	35078	35085	50 %	0 %	0 %	50 %	386587307
98	NC_017622	GACG	2	8	35205	35212	25 %	0 %	50 %	25 %	386587307
99	NC_017622	AAGA	2	8	35416	35423	75 %	0 %	25 %	0 %	386587307
100	NC_017622	AAAT	2	8	35464	35471	75 %	25 %	0 %	0 %	386587307
101	NC_017622	TGGT	2	8	36337	36344	0 %	50 %	50 %	0 %	386587308
102	NC_017622	CAAC	2	8	36450	36457	50 %	0 %	0 %	50 %	386587308
103	NC_017622	ACCT	2	8	36747	36754	25 %	25 %	0 %	50 %	386587308
104	NC_017622	AGCC	2	8	37322	37329	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017622	GATT	2	8	37385	37392	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017622	CTGG	2	8	37444	37451	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017622	GGCT	2	8	38449	38456	0 %	25 %	50 %	25 %	386587309
108	NC_017622	GTCC	2	8	38941	38948	0 %	25 %	25 %	50 %	386587310
109	NC_017622	CAAG	2	8	39134	39141	50 %	0 %	25 %	25 %	386587310
110	NC_017622	GCAG	2	8	39407	39414	25 %	0 %	50 %	25 %	386587310
111	NC_017622	AACC	2	8	39869	39876	50 %	0 %	0 %	50 %	386587310
112	NC_017622	CGTC	2	8	39883	39890	0 %	25 %	25 %	50 %	386587310
113	NC_017622	CAAA	2	8	40555	40562	75 %	0 %	0 %	25 %	386587311
114	NC_017622	GACC	2	8	41059	41066	25 %	0 %	25 %	50 %	386587311
115	NC_017622	AAAG	2	8	41621	41628	75 %	0 %	25 %	0 %	386587312
116	NC_017622	GCGG	2	8	41715	41722	0 %	0 %	75 %	25 %	386587312
117	NC_017622	TGCC	2	8	42644	42651	0 %	25 %	25 %	50 %	386587313
118	NC_017622	TGAA	2	8	42770	42777	50 %	25 %	25 %	0 %	386587313
119	NC_017622	ATAC	2	8	43532	43539	50 %	25 %	0 %	25 %	386587314
120	NC_017622	AAAG	2	8	43551	43558	75 %	0 %	25 %	0 %	386587314
121	NC_017622	TGAC	2	8	43857	43864	25 %	25 %	25 %	25 %	386587314
122	NC_017622	AATA	2	8	43926	43933	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017622	TAAA	2	8	43959	43966	75 %	25 %	0 %	0 %	386587315
124	NC_017622	TTAT	2	8	44649	44656	25 %	75 %	0 %	0 %	386587315
125	NC_017622	GAAG	2	8	44905	44912	50 %	0 %	50 %	0 %	386587315
126	NC_017622	GAAG	2	8	45073	45080	50 %	0 %	50 %	0 %	386587315
127	NC_017622	TTGG	2	8	45248	45255	0 %	50 %	50 %	0 %	386587316
128	NC_017622	CGAC	2	8	45463	45470	25 %	0 %	25 %	50 %	386587316
129	NC_017622	TTGA	2	8	46263	46270	25 %	50 %	25 %	0 %	386587316
130	NC_017622	TCAG	2	8	46390	46397	25 %	25 %	25 %	25 %	386587316
131	NC_017622	AATA	2	8	46526	46533	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017622	CTCC	2	8	46552	46559	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
133	NC_017622	TTCG	2	8	46653	46660	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017622	AAGC	2	8	46775	46782	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_017622	AAAC	2	8	46977	46984	75 %	0 %	0 %	25 %	386587317
136	NC_017622	ATCA	2	8	47047	47054	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_017622	CTAT	2	8	47850	47857	25 %	50 %	0 %	25 %	386587318
138	NC_017622	TCAA	2	8	47871	47878	50 %	25 %	0 %	25 %	386587318
139	NC_017622	GCTT	2	8	48185	48192	0 %	50 %	25 %	25 %	386587319
140	NC_017622	CCTA	2	8	48271	48278	25 %	25 %	0 %	50 %	386587319
141	NC_017622	GCTA	2	8	48539	48546	25 %	25 %	25 %	25 %	386587319
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143	NC_017622	ATCA	2	8	49173	49180	50 %	25 %	0 %	25 %	386587321
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