MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis A7 chromosome

Total Repeats: 41287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017622	TCT	2	6	267482	267487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386587533
5502	NC_017622	CTT	2	6	267522	267527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386587533
5503	NC_017622	ATT	2	6	267547	267552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386587533
5504	NC_017622	T	6	6	267586	267591	0 %	100 %	0 %	0 %	386587533
5505	NC_017622	CCA	2	6	267620	267625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386587533
5506	NC_017622	ATAG	2	8	267631	267638	50 %	25 %	25 %	0 %	386587533
5507	NC_017622	CTT	2	6	267666	267671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386587533
5508	NC_017622	CTTG	2	8	267713	267720	0 %	50 %	25 %	25 %	386587533
5509	NC_017622	ACC	2	6	267787	267792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386587533
5510	NC_017622	T	6	6	267812	267817	0 %	100 %	0 %	0 %	386587533
5511	NC_017622	AG	3	6	267828	267833	50 %	0 %	50 %	0 %	386587533
5512	NC_017622	CA	3	6	267858	267863	50 %	0 %	0 %	50 %	386587533
5513	NC_017622	GAA	2	6	267877	267882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386587533
5514	NC_017622	CGACAA	2	12	268089	268100	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386587533
5515	NC_017622	CCT	2	6	268145	268150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5516	NC_017622	GTT	2	6	268191	268196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_017622	AGG	2	6	268246	268251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_017622	TAC	2	6	268288	268293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5519	NC_017622	A	7	7	268303	268309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_017622	AGAA	2	8	268360	268367	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_017622	CAAA	2	8	268408	268415	75 %	0 %	0 %	25 %	386587534
5522	NC_017622	CAAAA	2	10	268467	268476	80 %	0 %	0 %	20 %	386587534
5523	NC_017622	A	6	6	268480	268485	100 %	0 %	0 %	0 %	386587534
5524	NC_017622	A	6	6	268490	268495	100 %	0 %	0 %	0 %	386587534
5525	NC_017622	AAATA	2	10	268514	268523	80 %	20 %	0 %	0 %	386587534
5526	NC_017622	A	6	6	268523	268528	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_017622	TAG	2	6	268529	268534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_017622	GGA	2	6	268579	268584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_017622	A	6	6	268599	268604	100 %	0 %	0 %	0 %	386587535
5530	NC_017622	GTA	2	6	268605	268610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386587535
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5533	NC_017622	TGA	2	6	268682	268687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386587535
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5540	NC_017622	GTT	2	6	268938	268943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386587535
5541	NC_017622	CAA	3	9	268957	268965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386587535
5542	NC_017622	ATTG	2	8	268994	269001	25 %	50 %	25 %	0 %	386587535
5543	NC_017622	TCT	2	6	269055	269060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386587535
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5550	NC_017622	GCA	2	6	269310	269315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386587535
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5555	NC_017622	CTT	2	6	269463	269468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386587535
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5559	NC_017622	CAT	2	6	269881	269886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386587535
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5587	NC_017622	TCTA	2	8	271583	271590	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5588	NC_017622	TAGAA	2	10	271619	271628	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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5601	NC_017622	TCT	2	6	272145	272150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386587536
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5605	NC_017622	GCG	2	6	272417	272422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386587536
5606	NC_017622	TTA	2	6	272479	272484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386587536
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5608	NC_017622	ACA	2	6	272535	272540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386587536
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5612	NC_017622	TCT	2	6	272630	272635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386587536
5613	NC_017622	AGCTG	2	10	272686	272695	20 %	20 %	40 %	20 %	386587536
5614	NC_017622	TGC	2	6	272764	272769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386587536
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5619	NC_017622	GTTT	2	8	273178	273185	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_017622	TTAAA	2	10	273198	273207	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_017622	TA	3	6	273237	273242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_017622	GAT	2	6	273264	273269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386587537
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