MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis A7 chromosome

Total Repeats: 41287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017622	GAA	2	6	243032	243037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_017622	T	6	6	243042	243047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_017622	CTG	2	6	243054	243059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_017622	GA	3	6	243112	243117	50 %	0 %	50 %	0 %	386587508
5005	NC_017622	T	6	6	243175	243180	0 %	100 %	0 %	0 %	386587508
5006	NC_017622	TAT	2	6	243198	243203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386587508
5007	NC_017622	ATT	3	9	243211	243219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386587508
5008	NC_017622	CAT	2	6	243288	243293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386587508
5009	NC_017622	TTC	2	6	243326	243331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386587508
5010	NC_017622	GAG	2	6	243332	243337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386587508
5011	NC_017622	CAA	2	6	243498	243503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386587508
5012	NC_017622	ATG	2	6	243509	243514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386587508
5013	NC_017622	TGG	2	6	243527	243532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386587508
5014	NC_017622	CAC	2	6	243653	243658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386587508
5015	NC_017622	AGG	2	6	243743	243748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386587508
5016	NC_017622	ATG	2	6	243752	243757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386587508
5017	NC_017622	AAAGA	2	10	243778	243787	80 %	0 %	20 %	0 %	386587508
5018	NC_017622	GAGC	2	8	243802	243809	25 %	0 %	50 %	25 %	386587508
5019	NC_017622	GGA	2	6	243876	243881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386587508
5020	NC_017622	TGAT	2	8	243905	243912	25 %	50 %	25 %	0 %	386587508
5021	NC_017622	TGG	2	6	243933	243938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386587508
5022	NC_017622	ATC	2	6	243997	244002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386587508
5023	NC_017622	TGG	2	6	244245	244250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386587508
5024	NC_017622	GAG	2	6	244340	244345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386587508
5025	NC_017622	AG	3	6	244344	244349	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_017622	GAT	2	6	244352	244357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386587509
5027	NC_017622	ATGG	2	8	244380	244387	25 %	25 %	50 %	0 %	386587509
5028	NC_017622	AG	3	6	244419	244424	50 %	0 %	50 %	0 %	386587509
5029	NC_017622	TAC	2	6	244504	244509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386587509
5030	NC_017622	TCG	2	6	244592	244597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386587509
5031	NC_017622	T	6	6	244634	244639	0 %	100 %	0 %	0 %	386587509
5032	NC_017622	ATGT	2	8	244657	244664	25 %	50 %	25 %	0 %	386587509
5033	NC_017622	TGT	2	6	244669	244674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386587509
5034	NC_017622	TGG	2	6	244903	244908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386587509
5035	NC_017622	GACA	2	8	245090	245097	50 %	0 %	25 %	25 %	386587509
5036	NC_017622	GAA	2	6	245163	245168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386587509
5037	NC_017622	TA	3	6	245182	245187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_017622	A	6	6	245189	245194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_017622	ACC	2	6	245302	245307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386587510
5040	NC_017622	AG	3	6	245348	245353	50 %	0 %	50 %	0 %	386587510
5041	NC_017622	CAG	2	6	245394	245399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386587510
5042	NC_017622	GATA	2	8	245417	245424	50 %	25 %	25 %	0 %	386587510
5043	NC_017622	TCCAT	2	10	245588	245597	20 %	40 %	0 %	40 %	386587510
5044	NC_017622	GTT	2	6	245644	245649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386587510
5045	NC_017622	GAG	3	9	245709	245717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386587510
5046	NC_017622	TCAA	2	8	245905	245912	50 %	25 %	0 %	25 %	386587510
5047	NC_017622	GAA	2	6	245931	245936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386587510
5048	NC_017622	CAT	2	6	245961	245966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386587510
5049	NC_017622	AT	3	6	245998	246003	50 %	50 %	0 %	0 %	386587510
5050	NC_017622	TTC	2	6	246004	246009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386587510
5051	NC_017622	ACG	2	6	246034	246039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386587511
5052	NC_017622	CTTGG	2	10	246040	246049	0 %	40 %	40 %	20 %	386587511
5053	NC_017622	AGC	2	6	246058	246063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386587511
5054	NC_017622	A	6	6	246292	246297	100 %	0 %	0 %	0 %	386587511
5055	NC_017622	AAG	2	6	246302	246307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386587511
5056	NC_017622	TGA	2	6	246404	246409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386587511
5057	NC_017622	AG	3	6	246483	246488	50 %	0 %	50 %	0 %	386587511
5058	NC_017622	TCT	2	6	246557	246562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386587511
5059	NC_017622	TAG	2	6	246589	246594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386587511
5060	NC_017622	GAT	2	6	246604	246609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386587511
5061	NC_017622	AT	3	6	246608	246613	50 %	50 %	0 %	0 %	386587511
5062	NC_017622	GTA	2	6	246614	246619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386587511
5063	NC_017622	GAA	2	6	246658	246663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386587511
5064	NC_017622	AG	3	6	246681	246686	50 %	0 %	50 %	0 %	386587511
5065	NC_017622	AGAA	2	8	246725	246732	75 %	0 %	25 %	0 %	386587511
5066	NC_017622	TCA	2	6	246753	246758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386587511
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5069	NC_017622	ATC	2	6	246941	246946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386587512
5070	NC_017622	GAGAA	2	10	247005	247014	60 %	0 %	40 %	0 %	386587512
5071	NC_017622	CTT	2	6	247070	247075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386587512
5072	NC_017622	GGT	2	6	247148	247153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386587512
5073	NC_017622	TGGT	2	8	247222	247229	0 %	50 %	50 %	0 %	386587512
5074	NC_017622	A	7	7	247236	247242	100 %	0 %	0 %	0 %	386587512
5075	NC_017622	TGG	2	6	247254	247259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386587512
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5078	NC_017622	CAT	2	6	247393	247398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386587512
5079	NC_017622	TCCAA	2	10	247441	247450	40 %	20 %	0 %	40 %	386587512
5080	NC_017622	TGG	3	9	247576	247584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386587512
5081	NC_017622	GAT	2	6	247616	247621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386587512
5082	NC_017622	TTTTCC	2	12	247622	247633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386587512
5083	NC_017622	CAG	2	6	247657	247662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386587512
5084	NC_017622	ATCAT	2	10	247764	247773	40 %	40 %	0 %	20 %	386587512
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5087	NC_017622	GAG	2	6	247891	247896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386587513
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5089	NC_017622	TGC	2	6	247960	247965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386587513
5090	NC_017622	CAA	2	6	248026	248031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386587513
5091	NC_017622	ATG	2	6	248140	248145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386587513
5092	NC_017622	CAT	2	6	248158	248163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386587513
5093	NC_017622	CAG	2	6	248269	248274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386587513
5094	NC_017622	GT	3	6	248285	248290	0 %	50 %	50 %	0 %	386587513
5095	NC_017622	TGT	3	9	248288	248296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386587513
5096	NC_017622	CAGG	2	8	248321	248328	25 %	0 %	50 %	25 %	386587513
5097	NC_017622	GTTC	2	8	248358	248365	0 %	50 %	25 %	25 %	386587513
5098	NC_017622	TTC	2	6	248431	248436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5099	NC_017622	A	6	6	248539	248544	100 %	0 %	0 %	0 %	386587514
5100	NC_017622	TCAA	2	8	248663	248670	50 %	25 %	0 %	25 %	386587514
5101	NC_017622	TGA	2	6	248712	248717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386587514
5102	NC_017622	TGG	2	6	248720	248725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386587514
5103	NC_017622	AG	3	6	248736	248741	50 %	0 %	50 %	0 %	386587514
5104	NC_017622	GAA	2	6	248794	248799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386587514
5105	NC_017622	ACT	2	6	248804	248809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386587514
5106	NC_017622	TCA	2	6	248816	248821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386587514
5107	NC_017622	AGA	2	6	248829	248834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386587514
5108	NC_017622	TTG	2	6	248918	248923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386587514
5109	NC_017622	GA	3	6	249018	249023	50 %	0 %	50 %	0 %	386587514
5110	NC_017622	GGC	2	6	249045	249050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386587514
5111	NC_017622	GACT	2	8	249119	249126	25 %	25 %	25 %	25 %	386587514
5112	NC_017622	TCA	2	6	249320	249325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386587514
5113	NC_017622	AAC	2	6	249365	249370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386587514
5114	NC_017622	CAAT	2	8	249384	249391	50 %	25 %	0 %	25 %	386587514
5115	NC_017622	GCAG	2	8	249393	249400	25 %	0 %	50 %	25 %	386587514
5116	NC_017622	AAC	2	6	249407	249412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386587514
5117	NC_017622	CTG	2	6	249434	249439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386587514
5118	NC_017622	ATCA	2	8	249496	249503	50 %	25 %	0 %	25 %	386587514
5119	NC_017622	GGA	2	6	249529	249534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386587514
5120	NC_017622	ACTCT	2	10	249548	249557	20 %	40 %	0 %	40 %	386587514
5121	NC_017622	TTG	2	6	249598	249603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386587514
5122	NC_017622	CAG	2	6	249605	249610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386587514
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5124	NC_017622	TTGG	2	8	249694	249701	0 %	50 %	50 %	0 %	386587514
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5377	NC_017622	AAGA	2	8	261222	261229	75 %	0 %	25 %	0 %	386587525
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5385	NC_017622	ATC	2	6	261578	261583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5390	NC_017622	GCTG	2	8	261838	261845	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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5493	NC_017622	A	6	6	267063	267068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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