MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis A7 chromosome

Total Repeats: 41287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017622	CTT	2	6	218383	218388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386587489
4502	NC_017622	AGCTC	2	10	218460	218469	20 %	20 %	20 %	40 %	386587489
4503	NC_017622	GGC	2	6	218483	218488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386587489
4504	NC_017622	CAT	2	6	218528	218533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386587489
4505	NC_017622	GTA	2	6	218713	218718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_017622	GAAT	2	8	218727	218734	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_017622	AGA	2	6	218750	218755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_017622	AAC	2	6	218756	218761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4509	NC_017622	C	6	6	218767	218772	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4510	NC_017622	AT	3	6	218807	218812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_017622	AAAATT	2	12	218891	218902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_017622	TTTA	2	8	218937	218944	25 %	75 %	0 %	0 %	386587490
4513	NC_017622	T	7	7	218982	218988	0 %	100 %	0 %	0 %	386587490
4514	NC_017622	TGT	2	6	218997	219002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386587490
4515	NC_017622	TGA	2	6	219015	219020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386587490
4516	NC_017622	GTC	2	6	219040	219045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386587490
4517	NC_017622	TTG	2	6	219080	219085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386587490
4518	NC_017622	T	6	6	219237	219242	0 %	100 %	0 %	0 %	386587490
4519	NC_017622	TCCACG	2	12	219437	219448	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386587490
4520	NC_017622	GTC	2	6	219451	219456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386587490
4521	NC_017622	TCCT	2	8	219556	219563	0 %	50 %	0 %	50 %	386587490
4522	NC_017622	CAA	2	6	219582	219587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386587490
4523	NC_017622	GTT	2	6	219616	219621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386587490
4524	NC_017622	TTC	2	6	219658	219663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386587490
4525	NC_017622	TTC	2	6	219691	219696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386587490
4526	NC_017622	AAAGTC	2	12	219697	219708	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386587490
4527	NC_017622	ATG	2	6	219710	219715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386587490
4528	NC_017622	GTG	2	6	219751	219756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386587490
4529	NC_017622	TGG	3	9	219819	219827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386587490
4530	NC_017622	TCA	2	6	219882	219887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386587490
4531	NC_017622	CGGT	2	8	219914	219921	0 %	25 %	50 %	25 %	386587490
4532	NC_017622	TCT	2	6	219953	219958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386587490
4533	NC_017622	TAA	2	6	219984	219989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386587490
4534	NC_017622	ACC	2	6	220034	220039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386587490
4535	NC_017622	TTC	2	6	220048	220053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386587490
4536	NC_017622	GTA	2	6	220111	220116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386587490
4537	NC_017622	CCA	2	6	220151	220156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386587490
4538	NC_017622	CAGT	2	8	220169	220176	25 %	25 %	25 %	25 %	386587490
4539	NC_017622	TTC	2	6	220321	220326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386587490
4540	NC_017622	AAT	2	6	220468	220473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386587490
4541	NC_017622	AAC	2	6	220537	220542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386587490
4542	NC_017622	CT	4	8	220568	220575	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4543	NC_017622	CTT	2	6	220589	220594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4544	NC_017622	AGG	2	6	220609	220614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_017622	CCT	2	6	220632	220637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4546	NC_017622	TGGT	2	8	220729	220736	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_017622	CAG	2	6	220766	220771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4548	NC_017622	TGA	2	6	220775	220780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_017622	TCCAA	2	10	220861	220870	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4550	NC_017622	AGC	2	6	221100	221105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4551	NC_017622	CAA	2	6	221114	221119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4552	NC_017622	CTT	2	6	221141	221146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4553	NC_017622	TCT	2	6	221155	221160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4554	NC_017622	T	7	7	221160	221166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_017622	ACA	2	6	221212	221217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4556	NC_017622	CAA	2	6	221222	221227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4557	NC_017622	ACC	2	6	221287	221292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4558	NC_017622	GCT	2	6	221306	221311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4559	NC_017622	AG	3	6	221329	221334	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_017622	AGC	2	6	221362	221367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4561	NC_017622	TTG	2	6	221439	221444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_017622	ACC	2	6	221557	221562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4563	NC_017622	CAAT	2	8	221571	221578	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4564	NC_017622	GAT	2	6	221755	221760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_017622	GAA	2	6	221766	221771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_017622	AAC	2	6	221812	221817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4567	NC_017622	AGA	2	6	221826	221831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_017622	AGG	2	6	221861	221866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_017622	TGC	2	6	221947	221952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4570	NC_017622	GAG	2	6	221988	221993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_017622	AAG	2	6	222077	222082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_017622	CCG	2	6	222269	222274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4573	NC_017622	CTT	2	6	222372	222377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4574	NC_017622	AGA	2	6	222420	222425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_017622	GAT	2	6	222442	222447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_017622	CTG	2	6	222486	222491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4577	NC_017622	T	6	6	222520	222525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_017622	GT	3	6	222562	222567	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_017622	CTT	2	6	222618	222623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4581	NC_017622	T	6	6	222683	222688	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_017622	TC	3	6	222694	222699	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4583	NC_017622	T	6	6	222711	222716	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_017622	A	6	6	222766	222771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_017622	T	8	8	222794	222801	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_017622	ATG	2	6	222870	222875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386587491
4587	NC_017622	A	6	6	222876	222881	100 %	0 %	0 %	0 %	386587491
4588	NC_017622	A	6	6	222910	222915	100 %	0 %	0 %	0 %	386587491
4589	NC_017622	CAG	2	6	222960	222965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386587491
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4591	NC_017622	TGT	2	6	223160	223165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386587491
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4595	NC_017622	AGCA	2	8	223524	223531	50 %	0 %	25 %	25 %	386587491
4596	NC_017622	GA	3	6	223587	223592	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_017622	T	6	6	223607	223612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_017622	ATAG	2	8	223621	223628	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_017622	AAG	2	6	223629	223634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_017622	AAAGA	2	10	223767	223776	80 %	0 %	20 %	0 %	386587492
4601	NC_017622	CGG	2	6	223783	223788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386587492
4602	NC_017622	CAAT	2	8	223816	223823	50 %	25 %	0 %	25 %	386587492
4603	NC_017622	CG	3	6	223843	223848	0 %	0 %	50 %	50 %	386587492
4604	NC_017622	TTGA	2	8	223920	223927	25 %	50 %	25 %	0 %	386587492
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4608	NC_017622	A	6	6	224081	224086	100 %	0 %	0 %	0 %	386587493
4609	NC_017622	TCCT	2	8	224093	224100	0 %	50 %	0 %	50 %	386587493
4610	NC_017622	ACT	2	6	224145	224150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386587493
4611	NC_017622	TGA	2	6	224155	224160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386587493
4612	NC_017622	CTTT	2	8	224206	224213	0 %	75 %	0 %	25 %	386587493
4613	NC_017622	GCG	2	6	224313	224318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386587493
4614	NC_017622	GAT	2	6	224389	224394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386587493
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4616	NC_017622	CAT	2	6	224428	224433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386587493
4617	NC_017622	AC	3	6	224442	224447	50 %	0 %	0 %	50 %	386587493
4618	NC_017622	TAG	2	6	224455	224460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386587493
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4620	NC_017622	GTT	2	6	224559	224564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_017622	TGA	2	6	224569	224574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_017622	AT	3	6	224647	224652	50 %	50 %	0 %	0 %	386587494
4623	NC_017622	AAT	2	6	224654	224659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386587494
4624	NC_017622	ATT	2	6	224663	224668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386587494
4625	NC_017622	A	6	6	224697	224702	100 %	0 %	0 %	0 %	386587494
4626	NC_017622	GAA	2	6	224735	224740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386587494
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4628	NC_017622	CGA	2	6	224791	224796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386587494
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4630	NC_017622	GCT	2	6	224846	224851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386587494
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