MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis D12 chromosome

Total Repeats: 44212

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017621	CTTG	2	8	168011	168018	0 %	50 %	25 %	25 %	386585355
3502	NC_017621	GGAA	2	8	168074	168081	50 %	0 %	50 %	0 %	386585355
3503	NC_017621	TGAA	2	8	168385	168392	50 %	25 %	25 %	0 %	386585355
3504	NC_017621	ACA	2	6	168397	168402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386585355
3505	NC_017621	A	6	6	168462	168467	100 %	0 %	0 %	0 %	386585355
3506	NC_017621	GAT	2	6	168498	168503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585355
3507	NC_017621	GAAG	2	8	168524	168531	50 %	0 %	50 %	0 %	386585355
3508	NC_017621	CTA	2	6	168602	168607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585355
3509	NC_017621	TATC	2	8	168614	168621	25 %	50 %	0 %	25 %	386585355
3510	NC_017621	TGG	2	6	168626	168631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585355
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3512	NC_017621	TGA	2	6	168644	168649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585355
3513	NC_017621	GAT	2	6	168666	168671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585355
3514	NC_017621	TAC	2	6	168696	168701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585355
3515	NC_017621	A	6	6	168718	168723	100 %	0 %	0 %	0 %	386585355
3516	NC_017621	TGC	2	6	168923	168928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386585355
3517	NC_017621	TGC	2	6	168947	168952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386585355
3518	NC_017621	TGG	2	6	169096	169101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585355
3519	NC_017621	AAC	2	6	169130	169135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386585355
3520	NC_017621	GAA	2	6	169200	169205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585355
3521	NC_017621	ATG	2	6	169227	169232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585355
3522	NC_017621	TAGG	2	8	169257	169264	25 %	25 %	50 %	0 %	386585355
3523	NC_017621	TTC	2	6	169282	169287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_017621	CTT	2	6	169295	169300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3525	NC_017621	GAA	2	6	169308	169313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_017621	A	7	7	169335	169341	100 %	0 %	0 %	0 %	386585356
3527	NC_017621	ATT	2	6	169390	169395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585356
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3532	NC_017621	CGT	2	6	169750	169755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386585356
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3534	NC_017621	ATTTTA	2	12	169852	169863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585356
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3540	NC_017621	ATT	2	6	170158	170163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585356
3541	NC_017621	A	6	6	170197	170202	100 %	0 %	0 %	0 %	386585356
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3544	NC_017621	ATGC	2	8	170264	170271	25 %	25 %	25 %	25 %	386585357
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3547	NC_017621	AAGT	2	8	170383	170390	50 %	25 %	25 %	0 %	386585357
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3552	NC_017621	TGA	2	6	170616	170621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585357
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3555	NC_017621	TGG	2	6	171046	171051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585357
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3558	NC_017621	TAT	2	6	171173	171178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585358
3559	NC_017621	CGTG	2	8	171214	171221	0 %	25 %	50 %	25 %	386585358
3560	NC_017621	AGA	2	6	171253	171258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585358
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3563	NC_017621	ATTT	2	8	171476	171483	25 %	75 %	0 %	0 %	386585358
3564	NC_017621	GTCTT	2	10	171512	171521	0 %	60 %	20 %	20 %	386585358
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3592	NC_017621	CAA	2	6	173338	173343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3593	NC_017621	GA	3	6	173409	173414	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3602	NC_017621	A	7	7	174020	174026	100 %	0 %	0 %	0 %	386585359
3603	NC_017621	CTG	2	6	174038	174043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386585359
3604	NC_017621	GTCT	2	8	174066	174073	0 %	50 %	25 %	25 %	386585359
3605	NC_017621	ATG	2	6	174074	174079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585359
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3612	NC_017621	TAT	2	6	174311	174316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585360
3613	NC_017621	TGG	2	6	174385	174390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585360
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3621	NC_017621	GGC	2	6	174543	174548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386585361
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3999	NC_017621	T	6	6	192984	192989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4000	NC_017621	ATA	2	6	192993	192998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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