MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis D12 chromosome

Total Repeats: 44212

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_017621	CAG	2	6	145747	145752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386585340
3003	NC_017621	GCT	2	6	145767	145772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386585340
3004	NC_017621	GGA	2	6	145803	145808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386585340
3005	NC_017621	GTA	2	6	145810	145815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585340
3006	NC_017621	CCAACT	3	18	145818	145835	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386585340
3007	NC_017621	TGT	2	6	145850	145855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585340
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3009	NC_017621	A	7	7	146129	146135	100 %	0 %	0 %	0 %	386585340
3010	NC_017621	ACA	3	9	146157	146165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386585340
3011	NC_017621	CAG	2	6	146239	146244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386585340
3012	NC_017621	TTG	2	6	146254	146259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585340
3013	NC_017621	GTT	2	6	146283	146288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585340
3014	NC_017621	ACA	2	6	146289	146294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386585340
3015	NC_017621	GTT	2	6	146301	146306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585340
3016	NC_017621	AAG	2	6	146368	146373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585340
3017	NC_017621	T	6	6	146410	146415	0 %	100 %	0 %	0 %	386585340
3018	NC_017621	AGAC	2	8	146428	146435	50 %	0 %	25 %	25 %	386585340
3019	NC_017621	CTC	2	6	146476	146481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386585340
3020	NC_017621	GTT	2	6	146532	146537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585340
3021	NC_017621	ACA	2	6	146538	146543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386585340
3022	NC_017621	GAA	2	6	146544	146549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585340
3023	NC_017621	GTT	2	6	146550	146555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585340
3024	NC_017621	GAT	2	6	146592	146597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585340
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3026	NC_017621	AGAC	2	8	146677	146684	50 %	0 %	25 %	25 %	386585340
3027	NC_017621	ACT	2	6	146724	146729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585340
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3029	NC_017621	ACA	2	6	146787	146792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386585340
3030	NC_017621	GAA	2	6	146793	146798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585340
3031	NC_017621	GTT	2	6	146799	146804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585340
3032	NC_017621	GAT	2	6	146873	146878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585340
3033	NC_017621	AAG	2	6	146898	146903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_017621	AGAC	2	8	146958	146965	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3035	NC_017621	ACT	2	6	147005	147010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3036	NC_017621	GTT	2	6	147062	147067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_017621	ACA	2	6	147068	147073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_017621	GAA	2	6	147074	147079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_017621	GTT	2	6	147080	147085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_017621	GAT	2	6	147122	147127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_017621	AAG	2	6	147147	147152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_017621	AGAC	2	8	147207	147214	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3043	NC_017621	ACT	2	6	147254	147259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3044	NC_017621	GTT	2	6	147311	147316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_017621	ACA	2	6	147317	147322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3046	NC_017621	GAA	2	6	147323	147328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_017621	GTT	2	6	147329	147334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_017621	AAG	2	6	147396	147401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585341
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3050	NC_017621	ACT	2	6	147503	147508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585341
3051	NC_017621	ACT	2	6	147515	147520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585341
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3053	NC_017621	CTA	2	6	147606	147611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585341
3054	NC_017621	AAG	2	6	147656	147661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585341
3055	NC_017621	TTC	2	6	147663	147668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386585341
3056	NC_017621	ACA	2	6	147692	147697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386585341
3057	NC_017621	TGGG	2	8	147715	147722	0 %	25 %	75 %	0 %	386585341
3058	NC_017621	CAA	2	6	147738	147743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386585341
3059	NC_017621	GAG	2	6	147748	147753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386585341
3060	NC_017621	A	6	6	147758	147763	100 %	0 %	0 %	0 %	386585341
3061	NC_017621	A	6	6	147787	147792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_017621	CTT	2	6	147794	147799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_017621	GAAG	2	8	147804	147811	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_017621	GAAA	2	8	147822	147829	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_017621	A	6	6	147827	147832	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_017621	TAAG	2	8	147845	147852	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_017621	TGT	2	6	147905	147910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585342
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3072	NC_017621	AGA	2	6	148143	148148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585342
3073	NC_017621	ATG	2	6	148151	148156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585342
3074	NC_017621	TAT	2	6	148249	148254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585342
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3082	NC_017621	TTA	2	6	148580	148585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585342
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3089	NC_017621	TTCCG	2	10	149127	149136	0 %	40 %	20 %	40 %	386585342
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3091	NC_017621	TGT	2	6	149177	149182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585342
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3095	NC_017621	TGA	2	6	149235	149240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585342
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3097	NC_017621	CTG	2	6	149312	149317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386585342
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3102	NC_017621	TGC	2	6	149463	149468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386585342
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3105	NC_017621	GTTG	2	8	149556	149563	0 %	50 %	50 %	0 %	386585342
3106	NC_017621	GTA	2	6	149656	149661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585342
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3108	NC_017621	TAT	2	6	149776	149781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585342
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3120	NC_017621	AGCC	2	8	150494	150501	25 %	0 %	25 %	50 %	386585342
3121	NC_017621	AATT	2	8	150513	150520	50 %	50 %	0 %	0 %	386585342
3122	NC_017621	TGA	2	6	150552	150557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585342
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3124	NC_017621	CGC	2	6	150687	150692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386585342
3125	NC_017621	TGT	2	6	150732	150737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585342
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3233	NC_017621	CCA	2	6	155515	155520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386585342
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3236	NC_017621	CCA	2	6	155584	155589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386585342
3237	NC_017621	CAC	2	6	155603	155608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386585342
3238	NC_017621	GAATG	2	10	155646	155655	40 %	20 %	40 %	0 %	386585342
3239	NC_017621	TTG	2	6	155663	155668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585342
3240	NC_017621	AGA	2	6	155701	155706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585342
3241	NC_017621	GAA	2	6	155729	155734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3242	NC_017621	TTAACA	2	12	155783	155794	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3243	NC_017621	T	6	6	155814	155819	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3244	NC_017621	AGA	2	6	155846	155851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3245	NC_017621	TGG	2	6	155910	155915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585343
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3485	NC_017621	TTTCA	2	10	167372	167381	20 %	60 %	0 %	20 %	386585354
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3493	NC_017621	A	6	6	167855	167860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3494	NC_017621	AGA	2	6	167877	167882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3500	NC_017621	GAA	2	6	167987	167992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585355

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