MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis D12 chromosome

Total Repeats: 44212

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017621	CGG	2	6	24018	24023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386585218
502	NC_017621	ATG	2	6	24117	24122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585218
503	NC_017621	TGA	2	6	24163	24168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585218
504	NC_017621	TGT	2	6	24187	24192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585218
505	NC_017621	CAAA	2	8	24341	24348	75 %	0 %	0 %	25 %	386585218
506	NC_017621	TTTAT	2	10	24393	24402	20 %	80 %	0 %	0 %	386585219
507	NC_017621	GGTC	2	8	24439	24446	0 %	25 %	50 %	25 %	386585219
508	NC_017621	ATT	2	6	24449	24454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585219
509	NC_017621	T	6	6	24490	24495	0 %	100 %	0 %	0 %	386585219
510	NC_017621	ATT	2	6	24524	24529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585219
511	NC_017621	CTA	2	6	24589	24594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585219
512	NC_017621	TCT	2	6	24628	24633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386585219
513	NC_017621	TAG	2	6	24679	24684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585219
514	NC_017621	TTA	2	6	24703	24708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585219
515	NC_017621	TAA	2	6	24767	24772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386585219
516	NC_017621	TAT	2	6	24787	24792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585219
517	NC_017621	TAC	2	6	24814	24819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585219
518	NC_017621	AACA	2	8	24848	24855	75 %	0 %	0 %	25 %	386585219
519	NC_017621	TAA	2	6	24869	24874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_017621	T	7	7	24896	24902	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_017621	GA	3	6	24911	24916	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
522	NC_017621	GAG	2	6	24930	24935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017621	GAA	2	6	24950	24955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585220
524	NC_017621	A	7	7	24954	24960	100 %	0 %	0 %	0 %	386585220
525	NC_017621	TCTA	2	8	24992	24999	25 %	50 %	0 %	25 %	386585220
526	NC_017621	ATG	2	6	25030	25035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585220
527	NC_017621	GCA	2	6	25050	25055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386585220
528	NC_017621	A	6	6	25055	25060	100 %	0 %	0 %	0 %	386585220
529	NC_017621	CAA	2	6	25086	25091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386585220
530	NC_017621	CAA	3	9	25101	25109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386585220
531	NC_017621	AGA	2	6	25166	25171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585220
532	NC_017621	GGC	2	6	25205	25210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386585220
533	NC_017621	AATC	2	8	25330	25337	50 %	25 %	0 %	25 %	386585220
534	NC_017621	AATGC	2	10	25359	25368	40 %	20 %	20 %	20 %	386585220
535	NC_017621	TAA	2	6	25385	25390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386585220
536	NC_017621	AAC	2	6	25402	25407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386585220
537	NC_017621	TTG	2	6	25429	25434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585220
538	NC_017621	ACT	2	6	25464	25469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585220
539	NC_017621	GCT	2	6	25539	25544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386585220
540	NC_017621	CTG	2	6	25573	25578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386585220
541	NC_017621	AGA	2	6	25619	25624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585220
542	NC_017621	AGC	2	6	25625	25630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386585220
543	NC_017621	CAA	2	6	25689	25694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386585220
544	NC_017621	CAT	2	6	25819	25824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585220
545	NC_017621	GCA	2	6	25845	25850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386585220
546	NC_017621	AAT	2	6	25851	25856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386585220
547	NC_017621	GGT	2	6	26031	26036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585220
548	NC_017621	TAT	2	6	26037	26042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585220
549	NC_017621	GTT	2	6	26055	26060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585220
550	NC_017621	CAA	2	6	26077	26082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386585220
551	NC_017621	GTT	2	6	26091	26096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585220
552	NC_017621	GTC	2	6	26113	26118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386585220
553	NC_017621	GTG	2	6	26137	26142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585220
554	NC_017621	CAA	2	6	26155	26160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386585220
555	NC_017621	TAC	2	6	26181	26186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585220
556	NC_017621	TTTG	2	8	26243	26250	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017621	AT	3	6	26290	26295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017621	AGG	2	6	26296	26301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
559	NC_017621	A	7	7	26373	26379	100 %	0 %	0 %	0 %	386585221
560	NC_017621	TTC	2	6	26476	26481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386585221
561	NC_017621	CTG	2	6	26554	26559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386585221
562	NC_017621	GTA	2	6	26571	26576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585221
563	NC_017621	TTA	2	6	26582	26587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585221
564	NC_017621	TGG	2	6	26644	26649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585221
565	NC_017621	TTG	2	6	26682	26687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585221
566	NC_017621	TGC	2	6	26702	26707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386585221
567	NC_017621	TTC	2	6	26721	26726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386585221
568	NC_017621	ATTG	2	8	26759	26766	25 %	50 %	25 %	0 %	386585221
569	NC_017621	ATT	2	6	26770	26775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585221
570	NC_017621	CGT	2	6	26781	26786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386585221
571	NC_017621	TGT	3	9	26807	26815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585221
572	NC_017621	TGG	2	6	26828	26833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585221
573	NC_017621	TAT	2	6	26882	26887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585221
574	NC_017621	TGA	2	6	26929	26934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585221
575	NC_017621	ATT	2	6	26937	26942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585221
576	NC_017621	TTGA	2	8	26970	26977	25 %	50 %	25 %	0 %	386585221
577	NC_017621	TGAT	2	8	26983	26990	25 %	50 %	25 %	0 %	386585221
578	NC_017621	GTT	2	6	27126	27131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585221
579	NC_017621	AGA	2	6	27152	27157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585221
580	NC_017621	ATT	2	6	27197	27202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585221
581	NC_017621	ATT	2	6	27213	27218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585221
582	NC_017621	TTTG	2	8	27248	27255	0 %	75 %	25 %	0 %	386585221
583	NC_017621	CTT	2	6	27298	27303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_017621	T	6	6	27302	27307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_017621	ATTT	2	8	27310	27317	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_017621	TAT	2	6	27326	27331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_017621	TTA	2	6	27368	27373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585222
588	NC_017621	TAA	2	6	27382	27387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386585222
589	NC_017621	GAT	2	6	27412	27417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585222
590	NC_017621	AGC	2	6	27511	27516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386585222
591	NC_017621	GCT	2	6	27521	27526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386585222
592	NC_017621	TTA	2	6	27544	27549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585222
593	NC_017621	CT	3	6	27644	27649	0 %	50 %	0 %	50 %	386585222
594	NC_017621	TTC	2	6	27714	27719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386585222
595	NC_017621	TGCC	2	8	27720	27727	0 %	25 %	25 %	50 %	386585222
596	NC_017621	TGG	2	6	27762	27767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585222
597	NC_017621	ACG	2	6	27791	27796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386585222
598	NC_017621	ATT	2	6	27839	27844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585222
599	NC_017621	CAT	2	6	28123	28128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585222
600	NC_017621	ATC	2	6	28136	28141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585222
601	NC_017621	CCA	2	6	28147	28152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386585222
602	NC_017621	GCG	2	6	28166	28171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386585222
603	NC_017621	GCGG	2	8	28237	28244	0 %	0 %	75 %	25 %	386585222
604	NC_017621	CAT	2	6	28267	28272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585222
605	NC_017621	CTT	2	6	28372	28377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386585222
606	NC_017621	GAAA	2	8	28392	28399	75 %	0 %	25 %	0 %	386585222
607	NC_017621	GCA	2	6	28466	28471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386585222
608	NC_017621	AGA	2	6	28519	28524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585222
609	NC_017621	TA	3	6	28558	28563	50 %	50 %	0 %	0 %	386585223
610	NC_017621	ATG	3	9	28711	28719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585223
611	NC_017621	GTCT	2	8	28720	28727	0 %	50 %	25 %	25 %	386585223
612	NC_017621	TCA	2	6	28742	28747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585223
613	NC_017621	CTAC	2	8	28798	28805	25 %	25 %	0 %	50 %	386585223
614	NC_017621	CT	3	6	28855	28860	0 %	50 %	0 %	50 %	386585223
615	NC_017621	T	6	6	28865	28870	0 %	100 %	0 %	0 %	386585223
616	NC_017621	CAA	2	6	29058	29063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386585223
617	NC_017621	TGA	2	6	29132	29137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585223
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619	NC_017621	TCT	2	6	29256	29261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386585223
620	NC_017621	TGGG	2	8	29331	29338	0 %	25 %	75 %	0 %	386585224
621	NC_017621	TCAA	2	8	29370	29377	50 %	25 %	0 %	25 %	386585224
622	NC_017621	TGA	2	6	29419	29424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585224
623	NC_017621	TGACAG	2	12	29445	29456	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386585224
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625	NC_017621	GAT	2	6	29498	29503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585224
626	NC_017621	TCG	2	6	29521	29526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386585224
627	NC_017621	AAGA	2	8	29528	29535	75 %	0 %	25 %	0 %	386585224
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629	NC_017621	GTC	2	6	29636	29641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386585224
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