MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis D12 chromosome

Total Repeats: 44212

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017621	AAT	2	6	218620	218625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386585395
4502	NC_017621	ATT	2	6	218629	218634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585395
4503	NC_017621	A	6	6	218663	218668	100 %	0 %	0 %	0 %	386585395
4504	NC_017621	GAA	2	6	218701	218706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585395
4505	NC_017621	TGG	2	6	218726	218731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585395
4506	NC_017621	CGA	2	6	218757	218762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386585395
4507	NC_017621	GACA	2	8	218766	218773	50 %	0 %	25 %	25 %	386585395
4508	NC_017621	GCT	2	6	218812	218817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386585395
4509	NC_017621	CGT	2	6	218842	218847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386585395
4510	NC_017621	ATT	2	6	218880	218885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585395
4511	NC_017621	A	6	6	218892	218897	100 %	0 %	0 %	0 %	386585395
4512	NC_017621	TC	3	6	218917	218922	0 %	50 %	0 %	50 %	386585395
4513	NC_017621	CTCC	2	8	219012	219019	0 %	25 %	0 %	75 %	386585395
4514	NC_017621	ATG	2	6	219029	219034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585395
4515	NC_017621	CCG	2	6	219078	219083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386585395
4516	NC_017621	GAA	2	6	219135	219140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585395
4517	NC_017621	TTC	2	6	219194	219199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386585395
4518	NC_017621	A	6	6	219204	219209	100 %	0 %	0 %	0 %	386585395
4519	NC_017621	GTG	2	6	219289	219294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585395
4520	NC_017621	GAA	2	6	219304	219309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585395
4521	NC_017621	AGA	2	6	219327	219332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585395
4522	NC_017621	TCCG	2	8	219377	219384	0 %	25 %	25 %	50 %	386585395
4523	NC_017621	GGT	2	6	219610	219615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585395
4524	NC_017621	CAT	2	6	219621	219626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585395
4525	NC_017621	GTCTG	2	10	219663	219672	0 %	40 %	40 %	20 %	386585395
4526	NC_017621	TGA	2	6	219735	219740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585395
4527	NC_017621	TC	3	6	219823	219828	0 %	50 %	0 %	50 %	386585395
4528	NC_017621	AGG	2	6	219866	219871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386585395
4529	NC_017621	TGGCTA	2	12	219881	219892	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386585395
4530	NC_017621	ACC	2	6	219934	219939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386585395
4531	NC_017621	CCG	2	6	220080	220085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386585395
4532	NC_017621	ATT	2	6	220102	220107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585395
4533	NC_017621	GTC	2	6	220190	220195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386585395
4534	NC_017621	TGC	2	6	220377	220382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386585395
4535	NC_017621	CCA	2	6	220398	220403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386585395
4536	NC_017621	GTG	2	6	220447	220452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585395
4537	NC_017621	GAA	2	6	220476	220481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585395
4538	NC_017621	TGAGTT	2	12	220623	220634	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386585395
4539	NC_017621	CA	3	6	220678	220683	50 %	0 %	0 %	50 %	386585395
4540	NC_017621	ATG	2	6	220753	220758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585395
4541	NC_017621	ATAGG	2	10	221009	221018	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_017621	TACT	2	8	221036	221043	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4543	NC_017621	CTATA	2	10	221052	221061	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4544	NC_017621	AGG	2	6	221104	221109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_017621	A	6	6	221119	221124	100 %	0 %	0 %	0 %	386585396
4546	NC_017621	TTA	2	6	221135	221140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585396
4547	NC_017621	AGG	2	6	221172	221177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386585396
4548	NC_017621	A	6	6	221192	221197	100 %	0 %	0 %	0 %	386585396
4549	NC_017621	TGG	2	6	221213	221218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585396
4550	NC_017621	ATT	2	6	221248	221253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585396
4551	NC_017621	CTCA	2	8	221287	221294	25 %	25 %	0 %	50 %	386585396
4552	NC_017621	ACT	2	6	221324	221329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585396
4553	NC_017621	A	6	6	221340	221345	100 %	0 %	0 %	0 %	386585396
4554	NC_017621	ATA	2	6	221374	221379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386585396
4555	NC_017621	ATG	3	9	221381	221389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585396
4556	NC_017621	GAA	2	6	221428	221433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585396
4557	NC_017621	TTA	2	6	221476	221481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585396
4558	NC_017621	TA	3	6	221505	221510	50 %	50 %	0 %	0 %	386585397
4559	NC_017621	ATT	2	6	221553	221558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585397
4560	NC_017621	GTT	2	6	221570	221575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585397
4561	NC_017621	AAAT	2	8	221577	221584	75 %	25 %	0 %	0 %	386585397
4562	NC_017621	TTG	2	6	221652	221657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585397
4563	NC_017621	GAAG	2	8	221710	221717	50 %	0 %	50 %	0 %	386585397
4564	NC_017621	AAC	2	6	221726	221731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4565	NC_017621	TGACGG	2	12	221757	221768	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4566	NC_017621	AGG	2	6	221840	221845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_017621	A	6	6	221855	221860	100 %	0 %	0 %	0 %	386585398
4568	NC_017621	ATT	2	6	221870	221875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585398
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4571	NC_017621	CTA	2	6	221961	221966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585398
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4574	NC_017621	TTA	2	6	222215	222220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585398
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4579	NC_017621	TAG	2	6	222333	222338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585399
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4581	NC_017621	T	7	7	222525	222531	0 %	100 %	0 %	0 %	386585399
4582	NC_017621	ATC	2	6	222555	222560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585399
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4585	NC_017621	GATG	2	8	222685	222692	25 %	25 %	50 %	0 %	386585399
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4587	NC_017621	AT	3	6	222768	222773	50 %	50 %	0 %	0 %	386585399
4588	NC_017621	GAC	2	6	222785	222790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386585399
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4591	NC_017621	AGG	2	6	223092	223097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_017621	TGAAA	2	10	223100	223109	60 %	20 %	20 %	0 %	386585400
4593	NC_017621	AGG	2	6	223160	223165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386585400
4594	NC_017621	A	6	6	223180	223185	100 %	0 %	0 %	0 %	386585400
4595	NC_017621	TGG	2	6	223201	223206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585400
4596	NC_017621	AGA	2	6	223241	223246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585400
4597	NC_017621	GAT	2	6	223311	223316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585400
4598	NC_017621	TCT	2	6	223317	223322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386585400
4599	NC_017621	TCAT	2	8	223324	223331	25 %	50 %	0 %	25 %	386585400
4600	NC_017621	GGGA	2	8	223340	223347	25 %	0 %	75 %	0 %	386585400
4601	NC_017621	GTG	2	6	223389	223394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585400
4602	NC_017621	TTC	2	6	223451	223456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386585400
4603	NC_017621	A	6	6	223464	223469	100 %	0 %	0 %	0 %	386585400
4604	NC_017621	TGATCG	2	12	223506	223517	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386585401
4605	NC_017621	CAA	2	6	223530	223535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386585401
4606	NC_017621	TGT	2	6	223650	223655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585401
4607	NC_017621	GAAG	2	8	223710	223717	50 %	0 %	50 %	0 %	386585401
4608	NC_017621	TGGA	2	8	223732	223739	25 %	25 %	50 %	0 %	386585401
4609	NC_017621	ACA	2	6	223760	223765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386585401
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4611	NC_017621	AATG	2	8	223884	223891	50 %	25 %	25 %	0 %	386585401
4612	NC_017621	GGT	2	6	224182	224187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585401
4613	NC_017621	TTC	2	6	224229	224234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386585401
4614	NC_017621	AAC	2	6	224243	224248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386585401
4615	NC_017621	ATT	2	6	224249	224254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585401
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4619	NC_017621	ATCT	2	8	224347	224354	25 %	50 %	0 %	25 %	386585401
4620	NC_017621	TGA	2	6	224511	224516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585401
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4622	NC_017621	GAA	2	6	224744	224749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585402
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4874	NC_017621	CTC	2	6	236496	236501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386585413
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4983	NC_017621	GTCAAA	2	12	241862	241873	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386585417
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4995	NC_017621	CAGA	2	8	242501	242508	50 %	0 %	25 %	25 %	386585417
4996	NC_017621	GCG	2	6	242579	242584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386585417
4997	NC_017621	CGTAGA	2	12	242771	242782	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386585417
4998	NC_017621	TAA	2	6	242786	242791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386585417
4999	NC_017621	AG	4	8	242795	242802	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5000	NC_017621	CT	3	6	242814	242819	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

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