MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis SS12 chromosome

Total Repeats: 42496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017619	ATT	2	6	146222	146227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_017619	AGG	2	6	146253	146258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_017619	GAAAA	2	10	146280	146289	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_017619	CTATT	2	10	146306	146315	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3005	NC_017619	A	6	6	146348	146353	100 %	0 %	0 %	0 %	386581196
3006	NC_017619	TTTG	2	8	146431	146438	0 %	75 %	25 %	0 %	386581196
3007	NC_017619	GTTTA	2	10	146485	146494	20 %	60 %	20 %	0 %	386581196
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3009	NC_017619	AAT	2	6	146675	146680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386581196
3010	NC_017619	ATT	2	6	146690	146695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386581196
3011	NC_017619	ATTA	2	8	146713	146720	50 %	50 %	0 %	0 %	386581196
3012	NC_017619	CTG	2	6	146736	146741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386581196
3013	NC_017619	GT	3	6	146769	146774	0 %	50 %	50 %	0 %	386581196
3014	NC_017619	ATG	2	6	146817	146822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581196
3015	NC_017619	A	7	7	146833	146839	100 %	0 %	0 %	0 %	386581196
3016	NC_017619	ATG	2	6	146854	146859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581196
3017	NC_017619	A	9	9	146890	146898	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_017619	GA	3	6	146935	146940	50 %	0 %	50 %	0 %	386581197
3019	NC_017619	TCG	2	6	146950	146955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386581197
3020	NC_017619	TGA	2	6	146985	146990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581197
3021	NC_017619	TCG	2	6	147070	147075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386581197
3022	NC_017619	ACTT	2	8	147099	147106	25 %	50 %	0 %	25 %	386581197
3023	NC_017619	T	6	6	147121	147126	0 %	100 %	0 %	0 %	386581197
3024	NC_017619	TGC	2	6	147145	147150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386581197
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3027	NC_017619	TGA	2	6	147217	147222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581197
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3030	NC_017619	GTC	2	6	147255	147260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386581197
3031	NC_017619	TCG	2	6	147296	147301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386581197
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3033	NC_017619	CAT	2	6	147410	147415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386581198
3034	NC_017619	TGA	2	6	147421	147426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581198
3035	NC_017619	TGA	2	6	147449	147454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581198
3036	NC_017619	TGA	2	6	147584	147589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581198
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3039	NC_017619	TTCA	2	8	147710	147717	25 %	50 %	0 %	25 %	386581198
3040	NC_017619	CCAGAA	2	12	147726	147737	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386581198
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3044	NC_017619	TCA	2	6	147893	147898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386581198
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3046	NC_017619	GCATG	2	10	148007	148016	20 %	20 %	40 %	20 %	386581198
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3050	NC_017619	AAAAT	2	10	148420	148429	80 %	20 %	0 %	0 %	386581198
3051	NC_017619	AGCACC	2	12	148433	148444	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386581198
3052	NC_017619	TGA	2	6	148472	148477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581198
3053	NC_017619	CGT	2	6	148482	148487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386581198
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3055	NC_017619	TAA	2	6	148785	148790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3057	NC_017619	ATAAA	2	10	148859	148868	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3059	NC_017619	T	6	6	148952	148957	0 %	100 %	0 %	0 %	386581199
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3104	NC_017619	A	6	6	150854	150859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_017619	GTCT	2	8	150875	150882	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3106	NC_017619	GT	3	6	151062	151067	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3109	NC_017619	ATT	2	6	151198	151203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_017619	A	6	6	151206	151211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_017619	AG	3	6	151232	151237	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_017619	TAA	2	6	151382	151387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_017619	AAAG	2	8	151406	151413	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_017619	TGG	2	6	151471	151476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386581202
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3124	NC_017619	CAGT	2	8	152221	152228	25 %	25 %	25 %	25 %	386581203
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3495	NC_017619	GAAA	2	8	171298	171305	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3496	NC_017619	GTAG	2	8	171306	171313	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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