MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis SS12 chromosome

Total Repeats: 42496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017619	TGT	2	6	47779	47784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386581085
1002	NC_017619	GTA	2	6	47840	47845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581085
1003	NC_017619	GCTT	2	8	47962	47969	0 %	50 %	25 %	25 %	386581086
1004	NC_017619	CCTA	2	8	48048	48055	25 %	25 %	0 %	50 %	386581086
1005	NC_017619	TAT	2	6	48061	48066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386581086
1006	NC_017619	GAAGT	2	10	48143	48152	40 %	20 %	40 %	0 %	386581086
1007	NC_017619	TGA	2	6	48220	48225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581086
1008	NC_017619	TAT	2	6	48241	48246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386581086
1009	NC_017619	GAA	2	6	48257	48262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581086
1010	NC_017619	TTATC	2	10	48274	48283	20 %	60 %	0 %	20 %	386581086
1011	NC_017619	GCTA	2	8	48316	48323	25 %	25 %	25 %	25 %	386581086
1012	NC_017619	TC	3	6	48335	48340	0 %	50 %	0 %	50 %	386581086
1013	NC_017619	TTG	2	6	48353	48358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386581086
1014	NC_017619	ATT	2	6	48366	48371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386581086
1015	NC_017619	TAATC	2	10	48382	48391	40 %	40 %	0 %	20 %	386581086
1016	NC_017619	GGA	2	6	48458	48463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386581086
1017	NC_017619	ATG	2	6	48517	48522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581087
1018	NC_017619	TAT	2	6	48533	48538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386581087
1019	NC_017619	TC	3	6	48591	48596	0 %	50 %	0 %	50 %	386581087
1020	NC_017619	TTG	3	9	48610	48618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386581087
1021	NC_017619	TCAAT	2	10	48641	48650	40 %	40 %	0 %	20 %	386581087
1022	NC_017619	CAG	2	6	48692	48697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386581087
1023	NC_017619	CAA	2	6	48707	48712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386581087
1024	NC_017619	GAT	2	6	48799	48804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581087
1025	NC_017619	TTG	2	6	48857	48862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386581087
1026	NC_017619	TAT	2	6	48871	48876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386581087
1027	NC_017619	TTATT	2	10	48894	48903	20 %	80 %	0 %	0 %	386581087
1028	NC_017619	CAG	2	6	48904	48909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386581087
1029	NC_017619	AAGA	2	8	48919	48926	75 %	0 %	25 %	0 %	386581087
1030	NC_017619	ATCA	2	8	48950	48957	50 %	25 %	0 %	25 %	386581088
1031	NC_017619	TTG	2	6	49032	49037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386581088
1032	NC_017619	A	6	6	49048	49053	100 %	0 %	0 %	0 %	386581088
1033	NC_017619	TGAT	2	8	49179	49186	25 %	50 %	25 %	0 %	386581088
1034	NC_017619	A	6	6	49250	49255	100 %	0 %	0 %	0 %	386581088
1035	NC_017619	AAC	2	6	49347	49352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386581088
1036	NC_017619	ATTG	2	8	49444	49451	25 %	50 %	25 %	0 %	386581088
1037	NC_017619	GT	3	6	49734	49739	0 %	50 %	50 %	0 %	386581088
1038	NC_017619	ATTG	2	8	49753	49760	25 %	50 %	25 %	0 %	386581088
1039	NC_017619	GAAA	2	8	49789	49796	75 %	0 %	25 %	0 %	386581088
1040	NC_017619	TTTA	2	8	49903	49910	25 %	75 %	0 %	0 %	386581089
1041	NC_017619	TTG	2	6	49982	49987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386581089
1042	NC_017619	ATG	2	6	49999	50004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581089
1043	NC_017619	CAG	2	6	50012	50017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386581089
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1046	NC_017619	CAA	2	6	50159	50164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386581089
1047	NC_017619	TCT	2	6	50183	50188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386581089
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1049	NC_017619	TTTG	2	8	50348	50355	0 %	75 %	25 %	0 %	386581089
1050	NC_017619	GAT	3	9	50406	50414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581089
1051	NC_017619	TTG	2	6	50423	50428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386581089
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1053	NC_017619	GCTT	2	8	50499	50506	0 %	50 %	25 %	25 %	386581089
1054	NC_017619	ATT	2	6	50530	50535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386581089
1055	NC_017619	TGC	2	6	50559	50564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386581089
1056	NC_017619	A	6	6	50566	50571	100 %	0 %	0 %	0 %	386581089
1057	NC_017619	TCG	2	6	50608	50613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386581090
1058	NC_017619	GTT	2	6	50618	50623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386581090
1059	NC_017619	ATT	2	6	50821	50826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386581090
1060	NC_017619	GTA	2	6	50842	50847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581090
1061	NC_017619	CAA	2	6	50865	50870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386581090
1062	NC_017619	TTG	2	6	50886	50891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386581090
1063	NC_017619	GTT	2	6	50964	50969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386581090
1064	NC_017619	TCA	2	6	50977	50982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386581090
1065	NC_017619	TTC	2	6	50989	50994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386581090
1066	NC_017619	TGA	2	6	51004	51009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581090
1067	NC_017619	ATTT	2	8	51033	51040	25 %	75 %	0 %	0 %	386581090
1068	NC_017619	TCT	2	6	51079	51084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386581090
1069	NC_017619	TGT	2	6	51094	51099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386581090
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1072	NC_017619	TGA	2	6	51211	51216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581090
1073	NC_017619	GA	3	6	51247	51252	50 %	0 %	50 %	0 %	386581090
1074	NC_017619	TAG	2	6	51329	51334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581090
1075	NC_017619	TAT	2	6	51350	51355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386581090
1076	NC_017619	TGA	2	6	51397	51402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581090
1077	NC_017619	ATG	2	6	51435	51440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581090
1078	NC_017619	TGAT	2	8	51445	51452	25 %	50 %	25 %	0 %	386581090
1079	NC_017619	TGC	2	6	51467	51472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386581090
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1081	NC_017619	GTTG	2	8	51563	51570	0 %	50 %	50 %	0 %	386581090
1082	NC_017619	CTA	2	6	51574	51579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386581090
1083	NC_017619	TTG	2	6	51673	51678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386581090
1084	NC_017619	TGA	2	6	51718	51723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581090
1085	NC_017619	CAA	2	6	51762	51767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386581090
1086	NC_017619	GATT	2	8	51802	51809	25 %	50 %	25 %	0 %	386581090
1087	NC_017619	CT	3	6	51832	51837	0 %	50 %	0 %	50 %	386581090
1088	NC_017619	TAG	2	6	51937	51942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581090
1089	NC_017619	AAC	2	6	52009	52014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386581090
1090	NC_017619	ATTT	2	8	52053	52060	25 %	75 %	0 %	0 %	386581090
1091	NC_017619	TCA	2	6	52235	52240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386581090
1092	NC_017619	CAG	2	6	52242	52247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386581090
1093	NC_017619	GA	3	6	52254	52259	50 %	0 %	50 %	0 %	386581090
1094	NC_017619	ATC	2	6	52261	52266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386581090
1095	NC_017619	GACC	2	8	52324	52331	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1096	NC_017619	AGTCTA	2	12	52332	52343	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1097	NC_017619	TAA	3	9	52352	52360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_017619	TGA	2	6	52371	52376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_017619	ATAG	2	8	52392	52399	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_017619	GAGAA	2	10	52400	52409	60 %	0 %	40 %	0 %	386581091
1101	NC_017619	AAAC	2	8	52412	52419	75 %	0 %	0 %	25 %	386581091
1102	NC_017619	GGA	2	6	52439	52444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386581091
1103	NC_017619	AG	3	6	52451	52456	50 %	0 %	50 %	0 %	386581091
1104	NC_017619	GAA	2	6	52478	52483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581091
1105	NC_017619	AT	3	6	52495	52500	50 %	50 %	0 %	0 %	386581091
1106	NC_017619	GAA	2	6	52534	52539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581091
1107	NC_017619	GAG	2	6	52574	52579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386581091
1108	NC_017619	GAAT	2	8	52632	52639	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_017619	TA	3	6	52810	52815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_017619	TGA	2	6	53023	53028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581092
1111	NC_017619	ACC	2	6	53075	53080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386581092
1112	NC_017619	TGG	2	6	53160	53165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386581092
1113	NC_017619	GAG	2	6	53237	53242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386581092
1114	NC_017619	CAT	2	6	53278	53283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386581092
1115	NC_017619	GCC	2	6	53326	53331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386581092
1116	NC_017619	CGG	2	6	53457	53462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386581092
1117	NC_017619	GCT	2	6	53492	53497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386581092
1118	NC_017619	TCG	2	6	53509	53514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386581092
1119	NC_017619	AGA	2	6	53667	53672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581092
1120	NC_017619	GAG	2	6	53744	53749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386581092
1121	NC_017619	GGA	2	6	53761	53766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386581092
1122	NC_017619	CAG	2	6	53789	53794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386581092
1123	NC_017619	GCGGAC	2	12	53806	53817	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386581092
1124	NC_017619	GCAGA	2	10	53881	53890	40 %	0 %	40 %	20 %	386581093
1125	NC_017619	AGC	2	6	53898	53903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386581093
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1259	NC_017619	TATT	2	8	61468	61475	25 %	75 %	0 %	0 %	386581100
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1271	NC_017619	TTC	2	6	62044	62049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386581100
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1291	NC_017619	CCAG	2	8	62715	62722	25 %	0 %	25 %	50 %	386581102
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1310	NC_017619	TAT	2	6	63732	63737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386581102
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1321	NC_017619	TCAA	2	8	64338	64345	50 %	25 %	0 %	25 %	386581102
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1326	NC_017619	A	6	6	64522	64527	100 %	0 %	0 %	0 %	386581102
1327	NC_017619	AAG	2	6	64746	64751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581103
1328	NC_017619	TCA	2	6	64765	64770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386581103
1329	NC_017619	CAA	2	6	64866	64871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386581103
1330	NC_017619	TAT	2	6	64882	64887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386581103
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1333	NC_017619	TACC	2	8	64939	64946	25 %	25 %	0 %	50 %	386581103
1334	NC_017619	CAG	2	6	64982	64987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386581103
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1342	NC_017619	CA	3	6	65515	65520	50 %	0 %	0 %	50 %	386581104
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1349	NC_017619	CAT	2	6	66191	66196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386581105
1350	NC_017619	TTC	2	6	66244	66249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386581105
1351	NC_017619	AGG	2	6	66256	66261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386581105
1352	NC_017619	GAA	2	6	66386	66391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581105
1353	NC_017619	CTGT	2	8	66415	66422	0 %	50 %	25 %	25 %	386581105
1354	NC_017619	TGAA	2	8	66454	66461	50 %	25 %	25 %	0 %	386581105
1355	NC_017619	GAA	2	6	66465	66470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581105
1356	NC_017619	GAAA	2	8	66484	66491	75 %	0 %	25 %	0 %	386581105
1357	NC_017619	GAGC	2	8	66509	66516	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1358	NC_017619	AGG	2	6	66534	66539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1359	NC_017619	TAT	2	6	66688	66693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386581106
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1363	NC_017619	TGA	2	6	66815	66820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581106
1364	NC_017619	AAT	2	6	66882	66887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386581106
1365	NC_017619	TGG	2	6	66950	66955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386581106
1366	NC_017619	CCA	2	6	66999	67004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386581106
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1368	NC_017619	T	6	6	67089	67094	0 %	100 %	0 %	0 %	386581106
1369	NC_017619	TGAT	2	8	67135	67142	25 %	50 %	25 %	0 %	386581106
1370	NC_017619	CAGA	2	8	67146	67153	50 %	0 %	25 %	25 %	386581106
1371	NC_017619	CCA	2	6	67204	67209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386581106
1372	NC_017619	AAG	3	9	67222	67230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581106
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1374	NC_017619	ACA	2	6	67268	67273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386581106
1375	NC_017619	TCG	2	6	67372	67377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386581106
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1378	NC_017619	GTC	2	6	67455	67460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386581106
1379	NC_017619	GGCT	2	8	67482	67489	0 %	25 %	50 %	25 %	386581106
1380	NC_017619	AGAT	2	8	67639	67646	50 %	25 %	25 %	0 %	386581106
1381	NC_017619	GGT	2	6	67650	67655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386581106
1382	NC_017619	GCTT	2	8	67679	67686	0 %	50 %	25 %	25 %	386581106
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