MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis SS12 chromosome

Total Repeats: 42496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017619	GTG	2	6	23990	23995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386581064
502	NC_017619	TGG	2	6	24024	24029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386581064
503	NC_017619	CGG	2	6	24065	24070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386581064
504	NC_017619	ATG	2	6	24164	24169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581064
505	NC_017619	TGA	2	6	24210	24215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581064
506	NC_017619	TGT	2	6	24234	24239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386581064
507	NC_017619	CAAA	2	8	24388	24395	75 %	0 %	0 %	25 %	386581064
508	NC_017619	TTTAT	2	10	24440	24449	20 %	80 %	0 %	0 %	386581065
509	NC_017619	GGTC	2	8	24486	24493	0 %	25 %	50 %	25 %	386581065
510	NC_017619	ATT	2	6	24496	24501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386581065
511	NC_017619	T	6	6	24537	24542	0 %	100 %	0 %	0 %	386581065
512	NC_017619	ATT	2	6	24571	24576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386581065
513	NC_017619	CTA	2	6	24636	24641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386581065
514	NC_017619	TCT	2	6	24675	24680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386581065
515	NC_017619	TAG	2	6	24726	24731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581065
516	NC_017619	TTA	2	6	24750	24755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386581065
517	NC_017619	TAA	2	6	24814	24819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386581065
518	NC_017619	ATT	2	6	24871	24876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386581065
519	NC_017619	AACA	2	8	24895	24902	75 %	0 %	0 %	25 %	386581065
520	NC_017619	TAA	2	6	24916	24921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_017619	T	7	7	24943	24949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_017619	GA	3	6	24958	24963	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017619	GAG	2	6	24977	24982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
524	NC_017619	GAA	2	6	24997	25002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581066
525	NC_017619	A	7	7	25001	25007	100 %	0 %	0 %	0 %	386581066
526	NC_017619	TCTA	2	8	25039	25046	25 %	50 %	0 %	25 %	386581066
527	NC_017619	ATG	2	6	25077	25082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581066
528	NC_017619	CAA	2	6	25098	25103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386581066
529	NC_017619	A	6	6	25102	25107	100 %	0 %	0 %	0 %	386581066
530	NC_017619	CAA	2	6	25133	25138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386581066
531	NC_017619	CAA	3	9	25148	25156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386581066
532	NC_017619	AGA	2	6	25213	25218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581066
533	NC_017619	GGC	2	6	25252	25257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386581066
534	NC_017619	ATCA	2	8	25378	25385	50 %	25 %	0 %	25 %	386581066
535	NC_017619	AATGC	2	10	25406	25415	40 %	20 %	20 %	20 %	386581066
536	NC_017619	ATT	2	6	25421	25426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386581066
537	NC_017619	TAA	2	6	25432	25437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386581066
538	NC_017619	AAC	2	6	25449	25454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386581066
539	NC_017619	TTG	2	6	25476	25481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386581066
540	NC_017619	ACT	2	6	25511	25516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386581066
541	NC_017619	GCT	2	6	25586	25591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386581066
542	NC_017619	CTG	2	6	25620	25625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386581066
543	NC_017619	TTG	2	6	25643	25648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386581066
544	NC_017619	AGA	2	6	25666	25671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581066
545	NC_017619	AGC	2	6	25672	25677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386581066
546	NC_017619	CAA	2	6	25736	25741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386581066
547	NC_017619	TAG	2	6	25776	25781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581066
548	NC_017619	CAT	2	6	25866	25871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386581066
549	NC_017619	GCA	2	6	25892	25897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386581066
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552	NC_017619	TAT	2	6	26084	26089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386581066
553	NC_017619	GTT	2	6	26102	26107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386581066
554	NC_017619	CAA	2	6	26124	26129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386581066
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556	NC_017619	GTC	2	6	26160	26165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386581066
557	NC_017619	GTG	2	6	26184	26189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386581066
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559	NC_017619	TAC	2	6	26228	26233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386581066
560	NC_017619	TTTG	2	8	26290	26297	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
561	NC_017619	AT	3	6	26337	26342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017619	AGG	2	6	26343	26348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
563	NC_017619	A	7	7	26420	26426	100 %	0 %	0 %	0 %	386581067
564	NC_017619	TTC	2	6	26523	26528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386581067
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589	NC_017619	ATTT	2	8	27357	27364	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_017619	TAT	2	6	27373	27378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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599	NC_017619	TGG	2	6	27809	27814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386581068
600	NC_017619	ACG	2	6	27838	27843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386581068
601	NC_017619	ATT	2	6	27886	27891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386581068
602	NC_017619	CAT	2	6	28170	28175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386581068
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604	NC_017619	CAT	2	6	28314	28319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386581068
605	NC_017619	CTT	2	6	28419	28424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386581068
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609	NC_017619	TA	3	6	28605	28610	50 %	50 %	0 %	0 %	386581069
610	NC_017619	ATG	3	9	28758	28766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581069
611	NC_017619	TCA	2	6	28789	28794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386581069
612	NC_017619	CTTGGC	2	12	28855	28866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386581069
613	NC_017619	CT	3	6	28902	28907	0 %	50 %	0 %	50 %	386581069
614	NC_017619	T	6	6	28912	28917	0 %	100 %	0 %	0 %	386581069
615	NC_017619	CAA	2	6	29105	29110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386581069
616	NC_017619	TGA	2	6	29179	29184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581069
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621	NC_017619	TCAA	2	8	29417	29424	50 %	25 %	0 %	25 %	386581070
622	NC_017619	TGA	2	6	29466	29471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581070
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627	NC_017619	GGC	2	6	29667	29672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386581070
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