MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis SS12 chromosome

Total Repeats: 42496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017619	GGA	2	6	267926	267931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_017619	A	6	6	267946	267951	100 %	0 %	0 %	0 %	386581304
5503	NC_017619	GTA	2	6	267952	267957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581304
5504	NC_017619	AGA	2	6	267963	267968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581304
5505	NC_017619	GC	3	6	267982	267987	0 %	0 %	50 %	50 %	386581304
5506	NC_017619	TGA	2	6	268029	268034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581304
5507	NC_017619	AAG	3	9	268052	268060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581304
5508	NC_017619	GAA	2	6	268132	268137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581304
5509	NC_017619	GTG	2	6	268145	268150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386581304
5510	NC_017619	CTA	2	6	268166	268171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386581304
5511	NC_017619	GAT	2	6	268243	268248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581304
5512	NC_017619	CGGT	2	8	268277	268284	0 %	25 %	50 %	25 %	386581304
5513	NC_017619	GTT	2	6	268285	268290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386581304
5514	NC_017619	CAA	3	9	268304	268312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386581304
5515	NC_017619	ATTG	2	8	268341	268348	25 %	50 %	25 %	0 %	386581304
5516	NC_017619	TCT	2	6	268402	268407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386581304
5517	NC_017619	AGC	2	6	268434	268439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386581304
5518	NC_017619	TGA	2	6	268511	268516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581304
5519	NC_017619	ATG	2	6	268520	268525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581304
5520	NC_017619	CAA	2	6	268532	268537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386581304
5521	NC_017619	TGG	2	6	268548	268553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386581304
5522	NC_017619	GTGC	2	8	268564	268571	0 %	25 %	50 %	25 %	386581304
5523	NC_017619	GCA	2	6	268657	268662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386581304
5524	NC_017619	AAG	2	6	268736	268741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581304
5525	NC_017619	ACTT	2	8	268780	268787	25 %	50 %	0 %	25 %	386581304
5526	NC_017619	TAA	2	6	268791	268796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386581304
5527	NC_017619	GAAA	2	8	268797	268804	75 %	0 %	25 %	0 %	386581304
5528	NC_017619	CTT	2	6	268810	268815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386581304
5529	NC_017619	GAA	2	6	268816	268821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581304
5530	NC_017619	AGC	2	6	269058	269063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386581304
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5532	NC_017619	CAT	2	6	269228	269233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386581304
5533	NC_017619	ATA	2	6	269330	269335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386581304
5534	NC_017619	ATC	2	6	269470	269475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386581304
5535	NC_017619	TCG	2	6	269490	269495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386581304
5536	NC_017619	TAA	2	6	269496	269501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386581304
5537	NC_017619	GTT	2	6	269503	269508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386581304
5538	NC_017619	TCT	2	6	269516	269521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386581304
5539	NC_017619	ATC	2	6	269599	269604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386581304
5540	NC_017619	GGT	3	9	269611	269619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386581304
5541	NC_017619	TGC	2	6	269631	269636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386581304
5542	NC_017619	AAC	2	6	269660	269665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386581304
5543	NC_017619	AAC	2	6	269827	269832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386581304
5544	NC_017619	ACT	2	6	269852	269857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386581304
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5547	NC_017619	TGG	2	6	270162	270167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386581304
5548	NC_017619	ACT	2	6	270272	270277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386581304
5549	NC_017619	TCT	2	6	270312	270317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386581304
5550	NC_017619	AGA	2	6	270339	270344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581304
5551	NC_017619	GCA	2	6	270352	270357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386581304
5552	NC_017619	CGA	2	6	270426	270431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386581304
5553	NC_017619	CTT	2	6	270466	270471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386581304
5554	NC_017619	ATC	2	6	270535	270540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386581304
5555	NC_017619	CTA	2	6	270549	270554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386581304
5556	NC_017619	TAGG	2	8	270740	270747	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_017619	AGT	2	6	270748	270753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_017619	TTGT	2	8	270845	270852	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_017619	TGG	2	6	270863	270868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_017619	TCTA	2	8	270930	270937	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5561	NC_017619	TAGAA	2	10	270966	270975	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_017619	A	6	6	270974	270979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_017619	T	6	6	270984	270989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_017619	ATCA	2	8	271015	271022	50 %	25 %	0 %	25 %	386581305
5565	NC_017619	CGAC	2	8	271078	271085	25 %	0 %	25 %	50 %	386581305
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5573	NC_017619	CA	3	6	271478	271483	50 %	0 %	0 %	50 %	386581305
5574	NC_017619	TCT	2	6	271492	271497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386581305
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5581	NC_017619	ACA	2	6	271882	271887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386581305
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5585	NC_017619	TCT	2	6	271977	271982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386581305
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5587	NC_017619	TGC	2	6	272111	272116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386581305
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5592	NC_017619	GTTT	2	8	272525	272532	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_017619	TTAAA	2	10	272545	272554	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_017619	TA	3	6	272584	272589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_017619	GAT	2	6	272611	272616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581306
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5597	NC_017619	A	6	6	272651	272656	100 %	0 %	0 %	0 %	386581306
5598	NC_017619	ATT	2	6	272750	272755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386581306
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5601	NC_017619	GGGCT	2	10	272891	272900	0 %	20 %	60 %	20 %	386581306
5602	NC_017619	TCTT	2	8	272930	272937	0 %	75 %	0 %	25 %	386581306
5603	NC_017619	CGG	3	9	272982	272990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386581306
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5605	NC_017619	CTA	2	6	273043	273048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386581306
5606	NC_017619	AGC	2	6	273445	273450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386581306
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5608	NC_017619	T	6	6	273503	273508	0 %	100 %	0 %	0 %	386581306
5609	NC_017619	TGA	3	9	273546	273554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581306
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5611	NC_017619	AGA	2	6	273694	273699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581306
5612	NC_017619	CAGGG	2	10	273750	273759	20 %	0 %	60 %	20 %	386581306
5613	NC_017619	GCT	2	6	273778	273783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386581306
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5615	NC_017619	TCTA	2	8	273911	273918	25 %	50 %	0 %	25 %	386581306
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5617	NC_017619	CTTGG	2	10	273961	273970	0 %	40 %	40 %	20 %	386581306
5618	NC_017619	TGA	2	6	274036	274041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581306
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5992	NC_017619	GCA	2	6	293255	293260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386581323
5993	NC_017619	CACTT	2	10	293265	293274	20 %	40 %	0 %	40 %	386581323
5994	NC_017619	GGT	2	6	293408	293413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386581323
5995	NC_017619	CAAA	2	8	293469	293476	75 %	0 %	0 %	25 %	386581323
5996	NC_017619	GGT	2	6	293522	293527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386581323
5997	NC_017619	TGT	2	6	293551	293556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386581323
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6000	NC_017619	ACA	2	6	293633	293638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386581323

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