MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Streptococcus suis JS14 chromosome

Total Repeats: 6280

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017618	ACTT	2	8	653	660	25 %	50 %	0 %	25 %	386578981
2	NC_017618	ACGT	2	8	959	966	25 %	25 %	25 %	25 %	386578981
3	NC_017618	ACAA	2	8	1068	1075	75 %	0 %	0 %	25 %	386578981
4	NC_017618	GACA	2	8	1224	1231	50 %	0 %	25 %	25 %	386578981
5	NC_017618	ATGC	2	8	1285	1292	25 %	25 %	25 %	25 %	386578981
6	NC_017618	ACAA	2	8	1956	1963	75 %	0 %	0 %	25 %	386578982
7	NC_017618	TACC	2	8	2268	2275	25 %	25 %	0 %	50 %	386578982
8	NC_017618	ACCG	2	8	2281	2288	25 %	0 %	25 %	50 %	386578982
9	NC_017618	ACTT	2	8	2521	2528	25 %	50 %	0 %	25 %	386578982
10	NC_017618	GTCC	2	8	2587	2594	0 %	25 %	25 %	50 %	386578982
11	NC_017618	AAAG	2	8	2825	2832	75 %	0 %	25 %	0 %	386578983
12	NC_017618	GAAG	2	8	3409	3416	50 %	0 %	50 %	0 %	386578983
13	NC_017618	GTAT	2	8	3624	3631	25 %	50 %	25 %	0 %	386578983
14	NC_017618	AATG	2	8	4190	4197	50 %	25 %	25 %	0 %	386578985
15	NC_017618	AAAT	2	8	4659	4666	75 %	25 %	0 %	0 %	386578986
16	NC_017618	CTTG	2	8	5247	5254	0 %	50 %	25 %	25 %	386578986
17	NC_017618	TTGG	2	8	5626	5633	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017618	GATT	2	8	5679	5686	25 %	50 %	25 %	0 %	386578987
19	NC_017618	ATGA	2	8	5870	5877	50 %	25 %	25 %	0 %	386578987
20	NC_017618	ATCA	2	8	6277	6284	50 %	25 %	0 %	25 %	386578988
21	NC_017618	AATC	2	8	6301	6308	50 %	25 %	0 %	25 %	386578988
22	NC_017618	GTTT	2	8	6507	6514	0 %	75 %	25 %	0 %	386578988
23	NC_017618	TCAA	2	8	6534	6541	50 %	25 %	0 %	25 %	386578988
24	NC_017618	CTTA	2	8	7007	7014	25 %	50 %	0 %	25 %	386578988
25	NC_017618	GATG	2	8	7590	7597	25 %	25 %	50 %	0 %	386578988
26	NC_017618	GCAA	2	8	8222	8229	50 %	0 %	25 %	25 %	386578988
27	NC_017618	TCAG	2	8	9162	9169	25 %	25 %	25 %	25 %	386578988
28	NC_017618	ATTG	2	8	9399	9406	25 %	50 %	25 %	0 %	386578988
29	NC_017618	CTTG	2	8	9441	9448	0 %	50 %	25 %	25 %	386578988
30	NC_017618	AAGG	2	8	9720	9727	50 %	0 %	50 %	0 %	386578988
31	NC_017618	GAAG	2	8	9841	9848	50 %	0 %	50 %	0 %	386578989
32	NC_017618	TCTT	2	8	10171	10178	0 %	75 %	0 %	25 %	386578990
33	NC_017618	TGCC	2	8	10186	10193	0 %	25 %	25 %	50 %	386578990
34	NC_017618	CTAT	2	8	10650	10657	25 %	50 %	0 %	25 %	386578992
35	NC_017618	AGTG	2	8	11513	11520	25 %	25 %	50 %	0 %	386578992
36	NC_017618	AGAT	2	8	11821	11828	50 %	25 %	25 %	0 %	386578993
37	NC_017618	GAAG	2	8	12136	12143	50 %	0 %	50 %	0 %	386578993
38	NC_017618	GATT	2	8	12204	12211	25 %	50 %	25 %	0 %	386578993
39	NC_017618	GGCG	2	8	12215	12222	0 %	0 %	75 %	25 %	386578993
40	NC_017618	AGGC	2	8	12866	12873	25 %	0 %	50 %	25 %	386578993
41	NC_017618	TAAA	2	8	12900	12907	75 %	25 %	0 %	0 %	386578993
42	NC_017618	CTTG	2	8	14363	14370	0 %	50 %	25 %	25 %	386578995
43	NC_017618	TGTT	2	8	14437	14444	0 %	75 %	25 %	0 %	386578995
44	NC_017618	GTTC	2	8	14463	14470	0 %	50 %	25 %	25 %	386578995
45	NC_017618	GTCG	2	8	14532	14539	0 %	25 %	50 %	25 %	386578995
46	NC_017618	CAAC	2	8	14591	14598	50 %	0 %	0 %	50 %	386578995
47	NC_017618	ATGG	2	8	14610	14617	25 %	25 %	50 %	0 %	386578995
48	NC_017618	CAAC	2	8	14653	14660	50 %	0 %	0 %	50 %	386578995
49	NC_017618	TTGG	2	8	14718	14725	0 %	50 %	50 %	0 %	386578995
50	NC_017618	AAGA	2	8	14958	14965	75 %	0 %	25 %	0 %	386578995
51	NC_017618	ACAA	2	8	15341	15348	75 %	0 %	0 %	25 %	386578995
52	NC_017618	TTAT	2	8	15776	15783	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017618	ATTA	2	8	16359	16366	50 %	50 %	0 %	0 %	386578996
54	NC_017618	ACAA	2	8	16913	16920	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017618	GTGA	2	8	17377	17384	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017618	AGCG	2	8	17548	17555	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017618	AGCC	2	8	18430	18437	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017618	GTAA	2	8	19009	19016	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017618	TCAC	2	8	19066	19073	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017618	GCGA	2	8	19165	19172	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017618	ATTC	2	8	20031	20038	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017618	CTAA	2	8	20387	20394	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017618	TAGG	2	8	21043	21050	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017618	AATC	2	8	22190	22197	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017618	GCGT	2	8	23102	23109	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017618	TTTG	2	8	23630	23637	0 %	75 %	25 %	0 %	386578997
67	NC_017618	CAAA	2	8	24387	24394	75 %	0 %	0 %	25 %	386578997
68	NC_017618	GGTC	2	8	24485	24492	0 %	25 %	50 %	25 %	386578998
69	NC_017618	AACA	2	8	24894	24901	75 %	0 %	0 %	25 %	386578998
70	NC_017618	TCTA	2	8	25038	25045	25 %	50 %	0 %	25 %	386578999
71	NC_017618	ATCA	2	8	25377	25384	50 %	25 %	0 %	25 %	386578999
72	NC_017618	TTTG	2	8	26289	26296	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017618	ATTG	2	8	26805	26812	25 %	50 %	25 %	0 %	386579000
74	NC_017618	TTGA	2	8	27016	27023	25 %	50 %	25 %	0 %	386579000
75	NC_017618	TGAT	2	8	27029	27036	25 %	50 %	25 %	0 %	386579000
76	NC_017618	TTTG	2	8	27294	27301	0 %	75 %	25 %	0 %	386579000
77	NC_017618	ATTT	2	8	27356	27363	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017618	TGCC	2	8	27766	27773	0 %	25 %	25 %	50 %	386579001
79	NC_017618	GCGG	2	8	28283	28290	0 %	0 %	75 %	25 %	386579001
80	NC_017618	GAAA	2	8	28438	28445	75 %	0 %	25 %	0 %	386579001
81	NC_017618	TGGG	2	8	29377	29384	0 %	25 %	75 %	0 %	386579003
82	NC_017618	TCAA	2	8	29416	29423	50 %	25 %	0 %	25 %	386579003
83	NC_017618	CGTG	2	8	29843	29850	0 %	25 %	50 %	25 %	386579003
84	NC_017618	TCAA	2	8	30096	30103	50 %	25 %	0 %	25 %	386579003
85	NC_017618	AACC	2	8	30145	30152	50 %	0 %	0 %	50 %	386579003
86	NC_017618	CTTG	2	8	30203	30210	0 %	50 %	25 %	25 %	386579003
87	NC_017618	AATT	2	8	30386	30393	50 %	50 %	0 %	0 %	386579004
88	NC_017618	TTTA	2	8	30568	30575	25 %	75 %	0 %	0 %	386579004
89	NC_017618	AAGA	2	8	30829	30836	75 %	0 %	25 %	0 %	386579005
90	NC_017618	TGAA	2	8	30896	30903	50 %	25 %	25 %	0 %	386579005
91	NC_017618	TTCA	2	8	32023	32030	25 %	50 %	0 %	25 %	386579006
92	NC_017618	TACT	2	8	32088	32095	25 %	50 %	0 %	25 %	386579006
93	NC_017618	GTCC	2	8	33097	33104	0 %	25 %	25 %	50 %	386579006
94	NC_017618	TTCC	2	8	33234	33241	0 %	50 %	0 %	50 %	386579006
95	NC_017618	GCAG	2	8	33684	33691	25 %	0 %	50 %	25 %	386579006
96	NC_017618	TACC	2	8	33901	33908	25 %	25 %	0 %	50 %	386579006
97	NC_017618	CCAA	2	8	34766	34773	50 %	0 %	0 %	50 %	386579006
98	NC_017618	GACG	2	8	34893	34900	25 %	0 %	50 %	25 %	386579006
99	NC_017618	AAGA	2	8	35104	35111	75 %	0 %	25 %	0 %	386579006
100	NC_017618	AAAT	2	8	35152	35159	75 %	25 %	0 %	0 %	386579006
101	NC_017618	TGGT	2	8	36025	36032	0 %	50 %	50 %	0 %	386579007
102	NC_017618	CAAC	2	8	36138	36145	50 %	0 %	0 %	50 %	386579007
103	NC_017618	ACCT	2	8	36435	36442	25 %	25 %	0 %	50 %	386579007
104	NC_017618	AGCC	2	8	37010	37017	25 %	0 %	25 %	50 %	386579008
105	NC_017618	GATT	2	8	37073	37080	25 %	50 %	25 %	0 %	386579008
106	NC_017618	CTGG	2	8	37132	37139	0 %	25 %	50 %	25 %	386579008
107	NC_017618	GGCT	2	8	38137	38144	0 %	25 %	50 %	25 %	386579009
108	NC_017618	GTCC	2	8	38629	38636	0 %	25 %	25 %	50 %	386579010
109	NC_017618	CAAG	2	8	38822	38829	50 %	0 %	25 %	25 %	386579010
110	NC_017618	GCAG	2	8	39095	39102	25 %	0 %	50 %	25 %	386579010
111	NC_017618	AACC	2	8	39557	39564	50 %	0 %	0 %	50 %	386579010
112	NC_017618	CGTC	2	8	39571	39578	0 %	25 %	25 %	50 %	386579010
113	NC_017618	CAAA	2	8	40243	40250	75 %	0 %	0 %	25 %	386579011
114	NC_017618	GACC	2	8	40747	40754	25 %	0 %	25 %	50 %	386579011
115	NC_017618	AAAG	2	8	41309	41316	75 %	0 %	25 %	0 %	386579012
116	NC_017618	GCGG	2	8	41403	41410	0 %	0 %	75 %	25 %	386579012
117	NC_017618	TGCC	2	8	42332	42339	0 %	25 %	25 %	50 %	386579013
118	NC_017618	TGAA	2	8	42458	42465	50 %	25 %	25 %	0 %	386579013
119	NC_017618	ATAC	2	8	43220	43227	50 %	25 %	0 %	25 %	386579014
120	NC_017618	AAAG	2	8	43239	43246	75 %	0 %	25 %	0 %	386579014
121	NC_017618	TGAC	2	8	43545	43552	25 %	25 %	25 %	25 %	386579014
122	NC_017618	AATA	2	8	43614	43621	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017618	TAAA	2	8	43647	43654	75 %	25 %	0 %	0 %	386579015
124	NC_017618	TTAT	2	8	44337	44344	25 %	75 %	0 %	0 %	386579015
125	NC_017618	GAAG	2	8	44593	44600	50 %	0 %	50 %	0 %	386579015
126	NC_017618	GAAG	2	8	44761	44768	50 %	0 %	50 %	0 %	386579015
127	NC_017618	TTGG	2	8	44936	44943	0 %	50 %	50 %	0 %	386579016
128	NC_017618	TTGA	2	8	45951	45958	25 %	50 %	25 %	0 %	386579016
129	NC_017618	TCAG	2	8	46078	46085	25 %	25 %	25 %	25 %	386579016
130	NC_017618	AATA	2	8	46214	46221	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017618	CTCC	2	8	46240	46247	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
132	NC_017618	TTCG	2	8	46341	46348	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_017618	AAGC	2	8	46463	46470	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017618	AAAC	2	8	46665	46672	75 %	0 %	0 %	25 %	386579017
135	NC_017618	ATCA	2	8	46735	46742	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_017618	CTAT	2	8	47538	47545	25 %	50 %	0 %	25 %	386579018
137	NC_017618	TCAA	2	8	47559	47566	50 %	25 %	0 %	25 %	386579018
138	NC_017618	GCTT	2	8	47873	47880	0 %	50 %	25 %	25 %	386579019
139	NC_017618	CCTA	2	8	47959	47966	25 %	25 %	0 %	50 %	386579019
140	NC_017618	GCTA	2	8	48227	48234	25 %	25 %	25 %	25 %	386579019
141	NC_017618	AAGA	2	8	48830	48837	75 %	0 %	25 %	0 %	386579020
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143	NC_017618	TGAT	2	8	49090	49097	25 %	50 %	25 %	0 %	386579021
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