MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis JS14 chromosome

Total Repeats: 43189

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017618	ACA	2	6	47655	47660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386579018
1002	NC_017618	CAC	2	6	47665	47670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386579018
1003	NC_017618	TGT	2	6	47690	47695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386579018
1004	NC_017618	GTA	2	6	47751	47756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386579018
1005	NC_017618	GCTT	2	8	47873	47880	0 %	50 %	25 %	25 %	386579019
1006	NC_017618	CCTA	2	8	47959	47966	25 %	25 %	0 %	50 %	386579019
1007	NC_017618	TAT	2	6	47972	47977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386579019
1008	NC_017618	GAAGT	2	10	48054	48063	40 %	20 %	40 %	0 %	386579019
1009	NC_017618	TGA	2	6	48131	48136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386579019
1010	NC_017618	TAT	2	6	48152	48157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386579019
1011	NC_017618	GAA	2	6	48168	48173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386579019
1012	NC_017618	TTATC	2	10	48185	48194	20 %	60 %	0 %	20 %	386579019
1013	NC_017618	GCTA	2	8	48227	48234	25 %	25 %	25 %	25 %	386579019
1014	NC_017618	TC	3	6	48246	48251	0 %	50 %	0 %	50 %	386579019
1015	NC_017618	TTG	2	6	48264	48269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386579019
1016	NC_017618	ATT	2	6	48277	48282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386579019
1017	NC_017618	TAATC	2	10	48293	48302	40 %	40 %	0 %	20 %	386579019
1018	NC_017618	GGA	2	6	48369	48374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386579019
1019	NC_017618	ATG	2	6	48428	48433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386579020
1020	NC_017618	TAT	2	6	48444	48449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386579020
1021	NC_017618	TC	3	6	48502	48507	0 %	50 %	0 %	50 %	386579020
1022	NC_017618	TTG	3	9	48521	48529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386579020
1023	NC_017618	TCAAT	2	10	48552	48561	40 %	40 %	0 %	20 %	386579020
1024	NC_017618	CAG	2	6	48603	48608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386579020
1025	NC_017618	CAA	2	6	48618	48623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386579020
1026	NC_017618	GAT	2	6	48710	48715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386579020
1027	NC_017618	TTG	2	6	48768	48773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386579020
1028	NC_017618	TAT	2	6	48782	48787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386579020
1029	NC_017618	TTATT	2	10	48805	48814	20 %	80 %	0 %	0 %	386579020
1030	NC_017618	CAG	2	6	48815	48820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386579020
1031	NC_017618	AAGA	2	8	48830	48837	75 %	0 %	25 %	0 %	386579020
1032	NC_017618	ATCA	2	8	48861	48868	50 %	25 %	0 %	25 %	386579021
1033	NC_017618	TTG	2	6	48943	48948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386579021
1034	NC_017618	A	6	6	48959	48964	100 %	0 %	0 %	0 %	386579021
1035	NC_017618	TGAT	2	8	49090	49097	25 %	50 %	25 %	0 %	386579021
1036	NC_017618	A	6	6	49161	49166	100 %	0 %	0 %	0 %	386579021
1037	NC_017618	AAC	2	6	49258	49263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386579021
1038	NC_017618	ATTG	2	8	49355	49362	25 %	50 %	25 %	0 %	386579021
1039	NC_017618	GT	3	6	49645	49650	0 %	50 %	50 %	0 %	386579021
1040	NC_017618	ATTG	2	8	49664	49671	25 %	50 %	25 %	0 %	386579021
1041	NC_017618	GAAA	2	8	49700	49707	75 %	0 %	25 %	0 %	386579021
1042	NC_017618	TTTA	2	8	49814	49821	25 %	75 %	0 %	0 %	386579022
1043	NC_017618	TTG	2	6	49893	49898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386579022
1044	NC_017618	ATG	2	6	49910	49915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386579022
1045	NC_017618	CAG	2	6	49923	49928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386579022
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1047	NC_017618	AAG	2	6	49986	49991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386579022
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1050	NC_017618	AG	3	6	50182	50187	50 %	0 %	50 %	0 %	386579022
1051	NC_017618	TTTG	2	8	50259	50266	0 %	75 %	25 %	0 %	386579022
1052	NC_017618	GAT	3	9	50317	50325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386579022
1053	NC_017618	TTG	2	6	50334	50339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386579022
1054	NC_017618	GCGA	2	8	50384	50391	25 %	0 %	50 %	25 %	386579022
1055	NC_017618	GCTT	2	8	50410	50417	0 %	50 %	25 %	25 %	386579022
1056	NC_017618	ATT	2	6	50441	50446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386579022
1057	NC_017618	TGC	2	6	50470	50475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386579022
1058	NC_017618	A	6	6	50477	50482	100 %	0 %	0 %	0 %	386579022
1059	NC_017618	TCG	2	6	50519	50524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386579023
1060	NC_017618	GTT	2	6	50529	50534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386579023
1061	NC_017618	ATT	2	6	50732	50737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386579023
1062	NC_017618	GTA	2	6	50753	50758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386579023
1063	NC_017618	CAA	2	6	50776	50781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386579023
1064	NC_017618	TTG	2	6	50797	50802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386579023
1065	NC_017618	GTT	2	6	50875	50880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386579023
1066	NC_017618	TCA	2	6	50888	50893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386579023
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1068	NC_017618	TGA	2	6	50915	50920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386579023
1069	NC_017618	ATTT	2	8	50944	50951	25 %	75 %	0 %	0 %	386579023
1070	NC_017618	TCT	2	6	50990	50995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386579023
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1072	NC_017618	TAC	2	6	51049	51054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386579023
1073	NC_017618	TAG	2	6	51087	51092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386579023
1074	NC_017618	TGA	2	6	51122	51127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386579023
1075	NC_017618	GA	3	6	51158	51163	50 %	0 %	50 %	0 %	386579023
1076	NC_017618	TAG	2	6	51240	51245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386579023
1077	NC_017618	TAT	2	6	51261	51266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386579023
1078	NC_017618	TGA	2	6	51308	51313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386579023
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1080	NC_017618	TGAT	2	8	51356	51363	25 %	50 %	25 %	0 %	386579023
1081	NC_017618	TGC	2	6	51378	51383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386579023
1082	NC_017618	GAA	2	6	51454	51459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386579023
1083	NC_017618	GTTG	2	8	51474	51481	0 %	50 %	50 %	0 %	386579023
1084	NC_017618	CTA	2	6	51485	51490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386579023
1085	NC_017618	TTG	2	6	51584	51589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386579023
1086	NC_017618	TGA	2	6	51629	51634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386579023
1087	NC_017618	CAA	2	6	51673	51678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386579023
1088	NC_017618	GATT	2	8	51713	51720	25 %	50 %	25 %	0 %	386579023
1089	NC_017618	CT	3	6	51743	51748	0 %	50 %	0 %	50 %	386579023
1090	NC_017618	TAG	2	6	51848	51853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386579023
1091	NC_017618	AAC	2	6	51920	51925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386579023
1092	NC_017618	ATTT	2	8	51964	51971	25 %	75 %	0 %	0 %	386579023
1093	NC_017618	TCA	2	6	52146	52151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386579023
1094	NC_017618	CAG	2	6	52153	52158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386579023
1095	NC_017618	GA	3	6	52165	52170	50 %	0 %	50 %	0 %	386579023
1096	NC_017618	ATC	2	6	52172	52177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386579023
1097	NC_017618	GACC	2	8	52235	52242	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1098	NC_017618	AGTCTA	2	12	52243	52254	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1099	NC_017618	TAA	3	9	52263	52271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_017618	TGA	2	6	52282	52287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_017618	ATAG	2	8	52303	52310	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_017618	GAGAA	2	10	52311	52320	60 %	0 %	40 %	0 %	386579024
1103	NC_017618	AAAC	2	8	52323	52330	75 %	0 %	0 %	25 %	386579024
1104	NC_017618	GGA	2	6	52350	52355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386579024
1105	NC_017618	AG	3	6	52362	52367	50 %	0 %	50 %	0 %	386579024
1106	NC_017618	GAA	2	6	52389	52394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386579024
1107	NC_017618	AT	3	6	52406	52411	50 %	50 %	0 %	0 %	386579024
1108	NC_017618	GAA	2	6	52445	52450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386579024
1109	NC_017618	GAG	2	6	52485	52490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386579024
1110	NC_017618	GAAT	2	8	52543	52550	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_017618	TA	3	6	52721	52726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_017618	TGA	2	6	52934	52939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386579025
1113	NC_017618	ACC	2	6	52986	52991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386579025
1114	NC_017618	TGG	2	6	53071	53076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386579025
1115	NC_017618	GAG	2	6	53148	53153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386579025
1116	NC_017618	CAT	2	6	53189	53194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386579025
1117	NC_017618	GCC	2	6	53237	53242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386579025
1118	NC_017618	CGG	2	6	53368	53373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386579025
1119	NC_017618	GCT	2	6	53403	53408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386579025
1120	NC_017618	TCG	2	6	53420	53425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386579025
1121	NC_017618	AGA	2	6	53578	53583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386579025
1122	NC_017618	GAG	2	6	53655	53660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386579025
1123	NC_017618	GGA	2	6	53672	53677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386579025
1124	NC_017618	CAG	2	6	53700	53705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386579025
1125	NC_017618	GCGGAC	2	12	53717	53728	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386579025
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1261	NC_017618	TATT	2	8	61376	61383	25 %	75 %	0 %	0 %	386579033
1262	NC_017618	GT	3	6	61445	61450	0 %	50 %	50 %	0 %	386579033
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