MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Streptococcus suis GZ1 chromosome

Total Repeats: 1567

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017617	CTATC	2	10	928	937	20 %	40 %	0 %	40 %	386577003
2	NC_017617	AATAA	2	10	1297	1306	80 %	20 %	0 %	0 %	386577003
3	NC_017617	CATAT	2	10	2807	2816	40 %	40 %	0 %	20 %	386577005
4	NC_017617	AAACA	2	10	5721	5730	80 %	0 %	0 %	20 %	386577009
5	NC_017617	TGTCT	2	10	6112	6121	0 %	60 %	20 %	20 %	386577009
6	NC_017617	GAGAT	2	10	6830	6839	40 %	20 %	40 %	0 %	386577010
7	NC_017617	TGAAA	2	10	9967	9976	60 %	20 %	20 %	0 %	386577011
8	NC_017617	CTATT	2	10	11204	11213	20 %	60 %	0 %	20 %	386577014
9	NC_017617	CTTTG	2	10	13433	13442	0 %	60 %	20 %	20 %	386577016
10	NC_017617	AACAG	2	10	13877	13886	60 %	0 %	20 %	20 %	386577017
11	NC_017617	CTTGT	2	10	15033	15042	0 %	60 %	20 %	20 %	386577017
12	NC_017617	ACAAA	2	10	16914	16923	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017617	TCGTG	2	10	18046	18055	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017617	GTTAA	2	10	18925	18934	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017617	ATATT	2	10	22740	22749	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017617	TTTAT	2	10	23771	23780	20 %	80 %	0 %	0 %	386577020
17	NC_017617	AATGC	2	10	24737	24746	40 %	20 %	20 %	20 %	386577021
18	NC_017617	CTACG	2	10	30091	30100	20 %	20 %	20 %	40 %	386577027
19	NC_017617	GAACG	2	10	32377	32386	40 %	0 %	40 %	20 %	386577028
20	NC_017617	AAACC	2	10	32513	32522	60 %	0 %	0 %	40 %	386577028
21	NC_017617	ATTCT	2	10	33860	33869	20 %	60 %	0 %	20 %	386577028
22	NC_017617	GCCAT	2	10	34335	34344	20 %	20 %	20 %	40 %	386577028
23	NC_017617	AAATG	2	10	35421	35430	60 %	20 %	20 %	0 %	386577029
24	NC_017617	AGCAG	2	10	38052	38061	40 %	0 %	40 %	20 %	386577032
25	NC_017617	CTATT	2	10	38277	38286	20 %	60 %	0 %	20 %	386577032
26	NC_017617	CTATT	2	10	40839	40848	20 %	60 %	0 %	20 %	386577034
27	NC_017617	GAAGC	2	10	42017	42026	40 %	0 %	40 %	20 %	386577035
28	NC_017617	AGCGG	2	10	45123	45132	20 %	0 %	60 %	20 %	386577038
29	NC_017617	TTAGT	2	10	46739	46748	20 %	60 %	20 %	0 %	386577040
30	NC_017617	GAAGT	2	10	47386	47395	40 %	20 %	40 %	0 %	386577041
31	NC_017617	TTATC	2	10	47517	47526	20 %	60 %	0 %	20 %	386577041
32	NC_017617	TAATC	2	10	47625	47634	40 %	40 %	0 %	20 %	386577041
33	NC_017617	TCAAT	2	10	47884	47893	40 %	40 %	0 %	20 %	386577042
34	NC_017617	TTATT	2	10	48137	48146	20 %	80 %	0 %	0 %	386577042
35	NC_017617	GAGAA	2	10	51643	51652	60 %	0 %	40 %	0 %	386577046
36	NC_017617	GCAGA	2	10	53124	53133	40 %	0 %	40 %	20 %	386577048
37	NC_017617	GGGCT	2	10	53595	53604	0 %	20 %	60 %	20 %	386577048
38	NC_017617	TTTTG	2	10	54624	54633	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017617	TGAAT	2	10	55218	55227	40 %	40 %	20 %	0 %	386577050
40	NC_017617	TTAAG	2	10	57073	57082	40 %	40 %	20 %	0 %	386577051
41	NC_017617	AGCAG	2	10	58798	58807	40 %	0 %	40 %	20 %	386577053
42	NC_017617	GCCCT	2	10	61620	61629	0 %	20 %	20 %	60 %	386577057
43	NC_017617	GTTTT	2	10	64123	64132	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017617	TTGCT	2	10	64719	64728	0 %	60 %	20 %	20 %	386577059
45	NC_017617	GTATC	2	10	68006	68015	20 %	40 %	20 %	20 %	386577062
46	NC_017617	TGGAT	2	10	70000	70009	20 %	40 %	40 %	0 %	386577066
47	NC_017617	TTATG	2	10	70210	70219	20 %	60 %	20 %	0 %	386577067
48	NC_017617	AAATT	2	10	71102	71111	60 %	40 %	0 %	0 %	386577068
49	NC_017617	TGGCG	2	10	72109	72118	0 %	20 %	60 %	20 %	386577070
50	NC_017617	AAAAC	2	10	72669	72678	80 %	0 %	0 %	20 %	386577071
51	NC_017617	TACAC	2	10	73083	73092	40 %	20 %	0 %	40 %	386577072
52	NC_017617	GAAAA	2	10	73962	73971	80 %	0 %	20 %	0 %	386577073
53	NC_017617	GTCTT	2	10	74250	74259	0 %	60 %	20 %	20 %	386577074
54	NC_017617	TTTGG	2	10	74381	74390	0 %	60 %	40 %	0 %	386577074
55	NC_017617	AAGGA	2	10	76956	76965	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017617	TAAGA	2	10	77714	77723	60 %	20 %	20 %	0 %	386577082
57	NC_017617	AGAAT	2	10	82502	82511	60 %	20 %	20 %	0 %	386577090
58	NC_017617	TAGTC	2	10	83287	83296	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_017617	GAAAA	2	10	84828	84837	80 %	0 %	20 %	0 %	386577095
60	NC_017617	TGACT	2	10	85223	85232	20 %	40 %	20 %	20 %	386577095
61	NC_017617	TTTTA	2	10	86057	86066	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017617	ACAAA	2	10	86481	86490	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_017617	TCGTG	2	10	87613	87622	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_017617	GTTAA	2	10	88492	88501	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017617	TTAAT	2	10	92202	92211	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017617	TGTGA	2	10	93163	93172	20 %	40 %	40 %	0 %	386577097
67	NC_017617	CTTTC	2	10	94061	94070	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
68	NC_017617	TGCTT	2	10	94725	94734	0 %	60 %	20 %	20 %	386577099
69	NC_017617	CGCTC	2	10	95823	95832	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
70	NC_017617	TTGTT	2	10	95930	95939	0 %	80 %	20 %	0 %	386577101
71	NC_017617	AATAT	2	10	97372	97381	60 %	40 %	0 %	0 %	386577102
72	NC_017617	TTTCA	2	10	98188	98197	20 %	60 %	0 %	20 %	386577104
73	NC_017617	CTTCG	2	10	98431	98440	0 %	40 %	20 %	40 %	386577104
74	NC_017617	AAAAT	2	10	98565	98574	80 %	20 %	0 %	0 %	386577104
75	NC_017617	TTTTG	2	10	98744	98753	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017617	TTTTC	2	10	99352	99361	0 %	80 %	0 %	20 %	386577105
77	NC_017617	TTTGG	2	10	101648	101657	0 %	60 %	40 %	0 %	386577109
78	NC_017617	ATTGC	2	10	102113	102122	20 %	40 %	20 %	20 %	386577109
79	NC_017617	GCTTT	2	10	102344	102353	0 %	60 %	20 %	20 %	386577110
80	NC_017617	AGAAA	2	10	102802	102811	80 %	0 %	20 %	0 %	386577110
81	NC_017617	GACTT	2	10	104381	104390	20 %	40 %	20 %	20 %	386577111
82	NC_017617	CTGGG	2	10	108601	108610	0 %	20 %	60 %	20 %	386577116
83	NC_017617	AAGAA	2	10	113442	113451	80 %	0 %	20 %	0 %	386577118
84	NC_017617	CCGTT	2	10	114485	114494	0 %	40 %	20 %	40 %	386577118
85	NC_017617	GTCTG	2	10	117957	117966	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
86	NC_017617	GGCCT	2	10	118025	118034	0 %	20 %	40 %	40 %	386577121
87	NC_017617	GTCAA	2	10	118122	118131	40 %	20 %	20 %	20 %	386577121
88	NC_017617	GCTTG	2	10	119973	119982	0 %	40 %	40 %	20 %	386577123
89	NC_017617	TGGTT	2	10	120101	120110	0 %	60 %	40 %	0 %	386577123
90	NC_017617	GGTCA	2	10	120400	120409	20 %	20 %	40 %	20 %	386577123
91	NC_017617	AAGGA	2	10	121491	121500	60 %	0 %	40 %	0 %	386577126
92	NC_017617	GGCAA	2	10	122049	122058	40 %	0 %	40 %	20 %	386577128
93	NC_017617	TTGGT	2	10	124437	124446	0 %	60 %	40 %	0 %	386577130
94	NC_017617	GGATG	2	10	124739	124748	20 %	20 %	60 %	0 %	386577131
95	NC_017617	GAAAA	2	10	124899	124908	80 %	0 %	20 %	0 %	386577131
96	NC_017617	CCTTG	2	10	124952	124961	0 %	40 %	20 %	40 %	386577131
97	NC_017617	CTGGA	2	10	125840	125849	20 %	20 %	40 %	20 %	386577132
98	NC_017617	AGCAG	2	10	126196	126205	40 %	0 %	40 %	20 %	386577132
99	NC_017617	GCTCA	2	10	126304	126313	20 %	20 %	20 %	40 %	386577132
100	NC_017617	AATCA	2	10	126818	126827	60 %	20 %	0 %	20 %	386577133
101	NC_017617	AGGTG	2	10	127506	127515	20 %	20 %	60 %	0 %	386577133
102	NC_017617	CATGA	2	10	127879	127888	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_017617	GAAAG	2	10	129318	129327	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017617	ACTTT	2	10	131212	131221	20 %	60 %	0 %	20 %	386577138
105	NC_017617	CTATA	2	10	132234	132243	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_017617	TAGCG	2	10	134308	134317	20 %	20 %	40 %	20 %	386577142
107	NC_017617	ATCAA	2	10	135469	135478	60 %	20 %	0 %	20 %	386577144
108	NC_017617	GAAGC	2	10	135958	135967	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
109	NC_017617	CGTAT	2	10	136741	136750	20 %	40 %	20 %	20 %	386577145
110	NC_017617	ATCCA	2	10	136832	136841	40 %	20 %	0 %	40 %	386577145
111	NC_017617	CAAGA	2	10	137608	137617	60 %	0 %	20 %	20 %	386577145
112	NC_017617	AAGCT	2	10	138038	138047	40 %	20 %	20 %	20 %	386577145
113	NC_017617	AAGAA	2	10	140298	140307	80 %	0 %	20 %	0 %	386577146
114	NC_017617	GCAGT	2	10	140588	140597	20 %	20 %	40 %	20 %	386577146
115	NC_017617	ATCCA	2	10	140699	140708	40 %	20 %	0 %	40 %	386577146
116	NC_017617	TACGA	2	10	141200	141209	40 %	20 %	20 %	20 %	386577146
117	NC_017617	TTAAG	2	10	141532	141541	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017617	GTAAA	2	10	143014	143023	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017617	GAAAA	2	10	144992	145001	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017617	CTATT	2	10	145018	145027	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_017617	GTTTA	2	10	145197	145206	20 %	60 %	20 %	0 %	386577149
122	NC_017617	GCATG	2	10	146719	146728	20 %	20 %	40 %	20 %	386577151
123	NC_017617	AAAAT	2	10	147132	147141	80 %	20 %	0 %	0 %	386577151
124	NC_017617	ATAAA	2	10	147571	147580	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017617	GGGTC	2	10	151756	151765	0 %	20 %	60 %	20 %	386577156
126	NC_017617	TTTCA	2	10	152726	152735	20 %	60 %	0 %	20 %	386577157
127	NC_017617	AAAAG	2	10	153318	153327	80 %	0 %	20 %	0 %	386577158
128	NC_017617	TGGTC	2	10	155911	155920	0 %	40 %	40 %	20 %	386577160
129	NC_017617	GTCTT	2	10	156866	156875	0 %	60 %	20 %	20 %	386577161
130	NC_017617	TTGGA	2	10	159382	159391	20 %	40 %	40 %	0 %	386577162
131	NC_017617	TCATC	2	10	160255	160264	20 %	40 %	0 %	40 %	386577164
132	NC_017617	CTTGG	2	10	160424	160433	0 %	40 %	40 %	20 %	386577164
133	NC_017617	AATTG	2	10	161084	161093	40 %	40 %	20 %	0 %	386577165
134	NC_017617	TTTTC	2	10	161443	161452	0 %	80 %	0 %	20 %	386577166
135	NC_017617	CACCT	2	10	162006	162015	20 %	20 %	0 %	60 %	386577166
136	NC_017617	AGACT	2	10	166792	166801	40 %	20 %	20 %	20 %	386577169
137	NC_017617	CATTG	2	10	170845	170854	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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263	NC_017617	TTCCT	2	10	314417	314426	0 %	60 %	0 %	40 %	386577301
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267	NC_017617	ACAGA	2	10	320629	320638	60 %	0 %	20 %	20 %	386577308
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