MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis GZ1 chromosome

Total Repeats: 41209

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017617	AGA	2	6	242398	242403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_017617	A	7	7	242418	242424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_017617	TAA	2	6	242426	242431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_017617	TAG	2	6	242456	242461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_017617	GAA	2	6	242467	242472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_017617	GTTT	2	8	242478	242485	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_017617	AAGA	2	8	242500	242507	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_017617	GGA	2	6	242519	242524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386577231
5009	NC_017617	TGA	2	6	242578	242583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386577231
5010	NC_017617	GCA	2	6	242586	242591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386577231
5011	NC_017617	GAA	2	6	242613	242618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386577231
5012	NC_017617	CG	3	6	242682	242687	0 %	0 %	50 %	50 %	386577231
5013	NC_017617	GGCTT	2	10	242757	242766	0 %	40 %	40 %	20 %	386577231
5014	NC_017617	CTA	2	6	242781	242786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386577231
5015	NC_017617	TGA	2	6	242846	242851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386577231
5016	NC_017617	TCTT	2	8	242912	242919	0 %	75 %	0 %	25 %	386577231
5017	NC_017617	AGG	2	6	242983	242988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386577231
5018	NC_017617	ACTT	2	8	242994	243001	25 %	50 %	0 %	25 %	386577231
5019	NC_017617	ACC	2	6	243026	243031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386577231
5020	NC_017617	AGC	3	9	243059	243067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386577231
5021	NC_017617	TCA	2	6	243151	243156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386577231
5022	NC_017617	TGG	2	6	243173	243178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386577231
5023	NC_017617	TTG	2	6	243259	243264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386577231
5024	NC_017617	TGG	2	6	243269	243274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386577231
5025	NC_017617	AAC	2	6	243338	243343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386577231
5026	NC_017617	AAGG	2	8	243351	243358	50 %	0 %	50 %	0 %	386577231
5027	NC_017617	CAT	2	6	243398	243403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386577231
5028	NC_017617	ATC	2	6	243469	243474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_017617	AAG	2	6	243490	243495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_017617	GGAAT	2	10	243599	243608	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_017617	AT	3	6	243623	243628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_017617	T	6	6	243659	243664	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_017617	GAA	2	6	243723	243728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_017617	T	6	6	243733	243738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_017617	CTG	2	6	243745	243750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5036	NC_017617	GA	3	6	243803	243808	50 %	0 %	50 %	0 %	386577232
5037	NC_017617	T	6	6	243866	243871	0 %	100 %	0 %	0 %	386577232
5038	NC_017617	TAT	2	6	243889	243894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386577232
5039	NC_017617	ATT	3	9	243902	243910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386577232
5040	NC_017617	CAT	2	6	243979	243984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386577232
5041	NC_017617	TTC	2	6	244017	244022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386577232
5042	NC_017617	GAG	2	6	244023	244028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386577232
5043	NC_017617	CAA	2	6	244189	244194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386577232
5044	NC_017617	ATG	2	6	244200	244205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386577232
5045	NC_017617	TGG	2	6	244218	244223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386577232
5046	NC_017617	CAC	2	6	244344	244349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386577232
5047	NC_017617	AGG	2	6	244434	244439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386577232
5048	NC_017617	ATG	2	6	244443	244448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386577232
5049	NC_017617	AAAGA	2	10	244469	244478	80 %	0 %	20 %	0 %	386577232
5050	NC_017617	GAGC	2	8	244493	244500	25 %	0 %	50 %	25 %	386577232
5051	NC_017617	GGA	2	6	244567	244572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386577232
5052	NC_017617	TGAT	2	8	244596	244603	25 %	50 %	25 %	0 %	386577232
5053	NC_017617	TGG	2	6	244624	244629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386577232
5054	NC_017617	ATC	2	6	244688	244693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386577232
5055	NC_017617	TGG	2	6	244936	244941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386577232
5056	NC_017617	GAG	2	6	245031	245036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386577232
5057	NC_017617	AG	3	6	245035	245040	50 %	0 %	50 %	0 %	386577233
5058	NC_017617	GAT	2	6	245043	245048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386577233
5059	NC_017617	ATGG	2	8	245071	245078	25 %	25 %	50 %	0 %	386577233
5060	NC_017617	AG	3	6	245110	245115	50 %	0 %	50 %	0 %	386577233
5061	NC_017617	TAC	2	6	245195	245200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386577233
5062	NC_017617	TCG	2	6	245283	245288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386577233
5063	NC_017617	T	6	6	245325	245330	0 %	100 %	0 %	0 %	386577233
5064	NC_017617	ATGT	2	8	245348	245355	25 %	50 %	25 %	0 %	386577233
5065	NC_017617	TGT	2	6	245360	245365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386577233
5066	NC_017617	TGG	2	6	245594	245599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386577233
5067	NC_017617	GACA	2	8	245781	245788	50 %	0 %	25 %	25 %	386577233
5068	NC_017617	GAA	2	6	245854	245859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386577233
5069	NC_017617	TA	3	6	245873	245878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_017617	A	6	6	245880	245885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_017617	ACC	2	6	245993	245998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386577234
5072	NC_017617	AG	3	6	246039	246044	50 %	0 %	50 %	0 %	386577234
5073	NC_017617	CAG	2	6	246085	246090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386577234
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5075	NC_017617	TCCAT	2	10	246279	246288	20 %	40 %	0 %	40 %	386577234
5076	NC_017617	GTT	2	6	246335	246340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386577234
5077	NC_017617	GAG	3	9	246400	246408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386577234
5078	NC_017617	TCAA	2	8	246596	246603	50 %	25 %	0 %	25 %	386577234
5079	NC_017617	GAA	2	6	246622	246627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386577234
5080	NC_017617	CAT	2	6	246652	246657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386577234
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5082	NC_017617	TTC	2	6	246695	246700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386577234
5083	NC_017617	ACG	2	6	246725	246730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386577234
5084	NC_017617	CTTGG	2	10	246731	246740	0 %	40 %	40 %	20 %	386577234
5085	NC_017617	AGC	2	6	246749	246754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386577234
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5088	NC_017617	TGA	2	6	247095	247100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386577235
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5090	NC_017617	TCT	2	6	247248	247253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386577235
5091	NC_017617	TAG	2	6	247280	247285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386577235
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5093	NC_017617	AT	3	6	247299	247304	50 %	50 %	0 %	0 %	386577235
5094	NC_017617	GTA	2	6	247305	247310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386577235
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5096	NC_017617	AG	3	6	247372	247377	50 %	0 %	50 %	0 %	386577235
5097	NC_017617	AGAA	2	8	247416	247423	75 %	0 %	25 %	0 %	386577235
5098	NC_017617	TCA	2	6	247444	247449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386577235
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5103	NC_017617	CTT	2	6	247761	247766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386577236
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5105	NC_017617	TGGT	2	8	247913	247920	0 %	50 %	50 %	0 %	386577236
5106	NC_017617	A	7	7	247927	247933	100 %	0 %	0 %	0 %	386577236
5107	NC_017617	TGG	2	6	247945	247950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386577236
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5109	NC_017617	TCAA	2	8	248041	248048	50 %	25 %	0 %	25 %	386577236
5110	NC_017617	CAT	2	6	248084	248089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386577236
5111	NC_017617	TCCAA	2	10	248132	248141	40 %	20 %	0 %	40 %	386577236
5112	NC_017617	TGG	3	9	248267	248275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386577236
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5114	NC_017617	TTTTCC	2	12	248313	248324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386577236
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5116	NC_017617	ATCAT	2	10	248455	248464	40 %	40 %	0 %	20 %	386577236
5117	NC_017617	TTA	2	6	248558	248563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386577237
5118	NC_017617	AT	3	6	248575	248580	50 %	50 %	0 %	0 %	386577237
5119	NC_017617	GAG	2	6	248582	248587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386577237
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5122	NC_017617	CAA	2	6	248717	248722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386577237
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5496	NC_017617	ACT	2	6	266350	266355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386577256
5497	NC_017617	GTGG	2	8	266388	266395	0 %	25 %	75 %	0 %	386577256
5498	NC_017617	TGACC	2	10	266399	266408	20 %	20 %	20 %	40 %	386577256
5499	NC_017617	ACG	2	6	266428	266433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386577256
5500	NC_017617	TGG	2	6	266450	266455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386577256

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