MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Streptococcus pyogenes Alab49 chromosome

Total Repeats: 1417

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017596	GGTAA	2	10	2668	2677	40 %	20 %	40 %	0 %	386361883
2	NC_017596	TGAAA	2	10	2978	2987	60 %	20 %	20 %	0 %	386361884
3	NC_017596	TGGTA	2	10	3604	3613	20 %	40 %	40 %	0 %	386361885
4	NC_017596	GATTT	2	10	6170	6179	20 %	60 %	20 %	0 %	386361887
5	NC_017596	TCAAT	2	10	11678	11687	40 %	40 %	0 %	20 %	386361892
6	NC_017596	ATTAA	2	10	11999	12008	60 %	40 %	0 %	0 %	386361892
7	NC_017596	TACAC	2	10	15947	15956	40 %	20 %	0 %	40 %	386361895
8	NC_017596	TAAAT	2	10	15957	15966	60 %	40 %	0 %	0 %	386361895
9	NC_017596	ACATT	2	10	16524	16533	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017596	TCGTG	2	10	18143	18152	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017596	GTTAA	2	10	19039	19048	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017596	GGGAG	2	10	19558	19567	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017596	AGGGA	2	10	21769	21778	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017596	GCTTA	2	10	22135	22144	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017596	TCGTG	2	10	24144	24153	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017596	GTTAA	2	10	25040	25049	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017596	GGGAG	2	10	25559	25568	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017596	AGGGA	2	10	27770	27779	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017596	GCTTA	2	10	28136	28145	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017596	TTCTT	2	10	29969	29978	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_017596	CTTTT	2	10	30075	30084	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017596	TATAA	2	10	32511	32520	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017596	AGTGA	2	10	33258	33267	40 %	20 %	40 %	0 %	386361897
24	NC_017596	ATTTT	2	10	33957	33966	20 %	80 %	0 %	0 %	386361898
25	NC_017596	TTGAT	2	10	34146	34155	20 %	60 %	20 %	0 %	386361898
26	NC_017596	AGCAG	2	10	43479	43488	40 %	0 %	40 %	20 %	386361905
27	NC_017596	GGTCA	2	10	43843	43852	20 %	20 %	40 %	20 %	386361905
28	NC_017596	TTGGG	2	10	44239	44248	0 %	40 %	60 %	0 %	386361906
29	NC_017596	CAACT	2	10	44738	44747	40 %	20 %	0 %	40 %	386361906
30	NC_017596	GCAGG	2	10	48320	48329	20 %	0 %	60 %	20 %	386361908
31	NC_017596	CTCAG	2	10	49677	49686	20 %	20 %	20 %	40 %	386361910
32	NC_017596	TACTA	2	10	51315	51324	40 %	40 %	0 %	20 %	386361911
33	NC_017596	AAATT	2	10	51608	51617	60 %	40 %	0 %	0 %	386361912
34	NC_017596	CAAAT	2	10	51822	51831	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_017596	TGTAT	2	10	54146	54155	20 %	60 %	20 %	0 %	386361914
36	NC_017596	TATTT	2	10	54225	54234	20 %	80 %	0 %	0 %	386361914
37	NC_017596	TCGGA	2	10	54574	54583	20 %	20 %	40 %	20 %	386361915
38	NC_017596	TTTGC	2	10	57316	57325	0 %	60 %	20 %	20 %	386361918
39	NC_017596	TTTTC	2	10	57517	57526	0 %	80 %	0 %	20 %	386361918
40	NC_017596	AAACC	2	10	57582	57591	60 %	0 %	0 %	40 %	386361918
41	NC_017596	ATTCA	2	10	60039	60048	40 %	40 %	0 %	20 %	386361919
42	NC_017596	ATTTT	2	10	61304	61313	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017596	AAATA	2	10	62572	62581	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017596	TATAT	2	10	62657	62666	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017596	TTTTA	2	10	63811	63820	20 %	80 %	0 %	0 %	386361921
46	NC_017596	AAAGC	2	10	64004	64013	60 %	0 %	20 %	20 %	386361921
47	NC_017596	TTTGG	2	10	67998	68007	0 %	60 %	40 %	0 %	386361928
48	NC_017596	TTCAC	2	10	68354	68363	20 %	40 %	0 %	40 %	386361929
49	NC_017596	GAAAT	2	10	69435	69444	60 %	20 %	20 %	0 %	386361931
50	NC_017596	AAGGA	2	10	70515	70524	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017596	TCCAA	2	10	75135	75144	40 %	20 %	0 %	40 %	386361943
52	NC_017596	GTTTC	2	10	77785	77794	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017596	TCGTG	2	10	81044	81053	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_017596	GTTAA	2	10	81940	81949	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017596	GGGAG	2	10	82459	82468	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017596	AGGGA	2	10	84670	84679	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017596	GCTTA	2	10	85036	85045	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_017596	ATTAT	2	10	85326	85335	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017596	TATAT	2	10	85409	85418	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017596	CTTGG	2	10	89345	89354	0 %	40 %	40 %	20 %	386361955
61	NC_017596	TCTTA	2	10	89763	89772	20 %	60 %	0 %	20 %	386361955
62	NC_017596	CACTC	2	10	91308	91317	20 %	20 %	0 %	60 %	386361957
63	NC_017596	GATTG	2	10	93569	93578	20 %	40 %	40 %	0 %	386361958
64	NC_017596	TTGAT	2	10	103710	103719	20 %	60 %	20 %	0 %	386361963
65	NC_017596	AAATC	2	10	103878	103887	60 %	20 %	0 %	20 %	386361963
66	NC_017596	TGAAG	2	10	109195	109204	40 %	20 %	40 %	0 %	386361972
67	NC_017596	AGAAA	2	10	110636	110645	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017596	TTTAG	2	10	110905	110914	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017596	TTTAG	2	10	111054	111063	20 %	60 %	20 %	0 %	386361974
70	NC_017596	GTGTT	2	10	115457	115466	0 %	60 %	40 %	0 %	386361980
71	NC_017596	TTGAA	2	10	115746	115755	40 %	40 %	20 %	0 %	386361981
72	NC_017596	TTTAG	2	10	117621	117630	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017596	AGGAG	2	10	124291	124300	40 %	0 %	60 %	0 %	386361988
74	NC_017596	TAATT	2	10	125118	125127	40 %	60 %	0 %	0 %	386361988
75	NC_017596	TCAGG	2	10	125581	125590	20 %	20 %	40 %	20 %	386361988
76	NC_017596	TTTTA	2	10	127370	127379	20 %	80 %	0 %	0 %	386361990
77	NC_017596	GCTTT	3	15	127946	127960	0 %	60 %	20 %	20 %	386361990
78	NC_017596	GTCAT	2	10	128265	128274	20 %	40 %	20 %	20 %	386361990
79	NC_017596	TAGTG	2	10	129210	129219	20 %	40 %	40 %	0 %	386361991
80	NC_017596	GTTAA	2	10	129613	129622	40 %	40 %	20 %	0 %	386361991
81	NC_017596	AATAA	2	10	129642	129651	80 %	20 %	0 %	0 %	386361991
82	NC_017596	TTGAT	2	10	130729	130738	20 %	60 %	20 %	0 %	386361992
83	NC_017596	TTGAC	2	10	131951	131960	20 %	40 %	20 %	20 %	386361994
84	NC_017596	TACCT	2	10	132132	132141	20 %	40 %	0 %	40 %	386361994
85	NC_017596	AATCA	2	10	132912	132921	60 %	20 %	0 %	20 %	386361995
86	NC_017596	TCATG	2	10	133519	133528	20 %	40 %	20 %	20 %	386361996
87	NC_017596	AACAA	2	10	134665	134674	80 %	0 %	0 %	20 %	386361997
88	NC_017596	TTGGC	2	10	134750	134759	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
89	NC_017596	CAAAA	2	10	135882	135891	80 %	0 %	0 %	20 %	386361999
90	NC_017596	TTTTA	2	10	136955	136964	20 %	80 %	0 %	0 %	386361999
91	NC_017596	AAAGC	2	10	138143	138152	60 %	0 %	20 %	20 %	386362001
92	NC_017596	AGTTC	2	10	138393	138402	20 %	40 %	20 %	20 %	386362001
93	NC_017596	GCTGA	2	10	138413	138422	20 %	20 %	40 %	20 %	386362001
94	NC_017596	ATCGC	2	10	141787	141796	20 %	20 %	20 %	40 %	386362005
95	NC_017596	TTGGG	2	10	143190	143199	0 %	40 %	60 %	0 %	386362006
96	NC_017596	GAAAA	2	10	148500	148509	80 %	0 %	20 %	0 %	386362011
97	NC_017596	GGATT	2	10	148617	148626	20 %	40 %	40 %	0 %	386362011
98	NC_017596	TTTTG	2	10	149137	149146	0 %	80 %	20 %	0 %	386362011
99	NC_017596	TCATG	2	10	150677	150686	20 %	40 %	20 %	20 %	386362013
100	NC_017596	GATGT	2	10	151311	151320	20 %	40 %	40 %	0 %	386362013
101	NC_017596	GTATC	2	10	151937	151946	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_017596	GTCGC	2	10	152376	152385	0 %	20 %	40 %	40 %	386362015
103	NC_017596	ATTAT	2	10	154435	154444	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017596	ATATT	2	10	154449	154458	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017596	ATTAT	2	10	155020	155029	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017596	CTTGT	2	10	156976	156985	0 %	60 %	20 %	20 %	386362018
107	NC_017596	GCCTA	2	10	157692	157701	20 %	20 %	20 %	40 %	386362019
108	NC_017596	GCAAC	2	10	157909	157918	40 %	0 %	20 %	40 %	386362019
109	NC_017596	AAGGT	2	10	159591	159600	40 %	20 %	40 %	0 %	386362019
110	NC_017596	CGTCA	2	10	159788	159797	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
111	NC_017596	AACAA	2	10	161527	161536	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_017596	ATTTG	2	10	165875	165884	20 %	60 %	20 %	0 %	386362026
113	NC_017596	CAAGA	2	10	167797	167806	60 %	0 %	20 %	20 %	386362027
114	NC_017596	TTTGG	2	10	168965	168974	0 %	60 %	40 %	0 %	386362028
115	NC_017596	TGGAT	2	10	169914	169923	20 %	40 %	40 %	0 %	386362029
116	NC_017596	TGCCT	2	10	170290	170299	0 %	40 %	20 %	40 %	386362029
117	NC_017596	ACCTA	2	10	170986	170995	40 %	20 %	0 %	40 %	386362029
118	NC_017596	ATTTT	2	10	175850	175859	20 %	80 %	0 %	0 %	386362033
119	NC_017596	AAAAG	2	10	176014	176023	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017596	GTTTG	2	10	177378	177387	0 %	60 %	40 %	0 %	386362034
121	NC_017596	TGAAA	2	10	177553	177562	60 %	20 %	20 %	0 %	386362035
122	NC_017596	TTGAT	2	10	177801	177810	20 %	60 %	20 %	0 %	386362035
123	NC_017596	CCAAA	2	10	180147	180156	60 %	0 %	0 %	40 %	386362040
124	NC_017596	TCCCA	2	10	180349	180358	20 %	20 %	0 %	60 %	386362040
125	NC_017596	GCCAA	2	10	181196	181205	40 %	0 %	20 %	40 %	386362041
126	NC_017596	GGAAA	2	10	184115	184124	60 %	0 %	40 %	0 %	386362045
127	NC_017596	TAATC	2	10	186940	186949	40 %	40 %	0 %	20 %	386362049
128	NC_017596	TCTAA	2	10	190223	190232	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_017596	TTTAC	2	10	191072	191081	20 %	60 %	0 %	20 %	386362053
130	NC_017596	CAAAC	2	10	193593	193602	60 %	0 %	0 %	40 %	386362057
131	NC_017596	AGATA	2	10	193707	193716	60 %	20 %	20 %	0 %	386362057
132	NC_017596	ATATA	2	10	194496	194505	60 %	40 %	0 %	0 %	386362057
133	NC_017596	TTAAA	2	10	195007	195016	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017596	GTTTT	2	10	196453	196462	0 %	80 %	20 %	0 %	386362061
135	NC_017596	TTTTG	2	10	198383	198392	0 %	80 %	20 %	0 %	386362062
136	NC_017596	ATCGC	2	10	199699	199708	20 %	20 %	20 %	40 %	386362064
137	NC_017596	TTTTA	2	10	200867	200876	20 %	80 %	0 %	0 %	386362065
138	NC_017596	CTAAT	2	10	201105	201114	40 %	40 %	0 %	20 %	386362065
139	NC_017596	GAATG	2	10	201628	201637	40 %	20 %	40 %	0 %	386362065
140	NC_017596	TGTCT	2	10	204122	204131	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_017596	TAAGA	2	10	205640	205649	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_017596	CTTTT	2	10	217901	217910	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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251	NC_017596	CCTCT	2	10	340479	340488	0 %	40 %	0 %	60 %	386362203
252	NC_017596	GTTTT	2	10	340785	340794	0 %	80 %	20 %	0 %	386362203
253	NC_017596	TTAGA	2	10	341366	341375	40 %	40 %	20 %	0 %	386362203
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260	NC_017596	TTGAT	2	10	346818	346827	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
261	NC_017596	CTATG	2	10	346835	346844	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
262	NC_017596	TGGAA	2	10	349092	349101	40 %	20 %	40 %	0 %	386362207
263	NC_017596	ACCGT	2	10	349417	349426	20 %	20 %	20 %	40 %	386362207
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265	NC_017596	AGTAG	2	10	350625	350634	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
266	NC_017596	CCATG	2	10	353750	353759	20 %	20 %	20 %	40 %	386362210
267	NC_017596	CCAGA	2	10	355347	355356	40 %	0 %	20 %	40 %	386362211
268	NC_017596	TGAAA	2	10	357119	357128	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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