MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Streptococcus pyogenes Alab49 chromosome

Total Repeats: 4669

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017596	ATTT	2	8	123	130	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017596	ACTA	2	8	149	156	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017596	ATCA	2	8	510	517	50 %	25 %	0 %	25 %	386361882
4	NC_017596	GAAA	2	8	839	846	75 %	0 %	25 %	0 %	386361882
5	NC_017596	ACAA	2	8	961	968	75 %	0 %	0 %	25 %	386361882
6	NC_017596	CAAA	2	8	1226	1233	75 %	0 %	0 %	25 %	386361882
7	NC_017596	TTTA	2	8	1665	1672	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017596	GTAA	2	8	1921	1928	50 %	25 %	25 %	0 %	386361883
9	NC_017596	GACT	2	8	2280	2287	25 %	25 %	25 %	25 %	386361883
10	NC_017596	AGTC	2	8	2698	2705	25 %	25 %	25 %	25 %	386361883
11	NC_017596	AATT	2	8	2852	2859	50 %	50 %	0 %	0 %	386361883
12	NC_017596	TAAG	2	8	2878	2885	50 %	25 %	25 %	0 %	386361883
13	NC_017596	TAAA	2	8	3162	3169	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017596	TTGA	2	8	3452	3459	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017596	AAAT	2	8	3742	3749	75 %	25 %	0 %	0 %	386361885
16	NC_017596	TCAA	2	8	3908	3915	50 %	25 %	0 %	25 %	386361885
17	NC_017596	CAAA	2	8	4162	4169	75 %	0 %	0 %	25 %	386361885
18	NC_017596	TTTA	2	8	5184	5191	25 %	75 %	0 %	0 %	386361886
19	NC_017596	TTGA	2	8	6391	6398	25 %	50 %	25 %	0 %	386361887
20	NC_017596	ACGA	2	8	6464	6471	50 %	0 %	25 %	25 %	386361887
21	NC_017596	CCTT	2	8	6504	6511	0 %	50 %	0 %	50 %	386361887
22	NC_017596	AGTG	2	8	6513	6520	25 %	25 %	50 %	0 %	386361887
23	NC_017596	GATT	2	8	7442	7449	25 %	50 %	25 %	0 %	386361887
24	NC_017596	TGAT	2	8	7451	7458	25 %	50 %	25 %	0 %	386361887
25	NC_017596	ACCA	2	8	7608	7615	50 %	0 %	0 %	50 %	386361887
26	NC_017596	AAAG	2	8	7740	7747	75 %	0 %	25 %	0 %	386361887
27	NC_017596	TTGA	2	8	7831	7838	25 %	50 %	25 %	0 %	386361887
28	NC_017596	TCGG	2	8	8176	8183	0 %	25 %	50 %	25 %	386361887
29	NC_017596	AGCA	2	8	8224	8231	50 %	0 %	25 %	25 %	386361887
30	NC_017596	AATC	2	8	8268	8275	50 %	25 %	0 %	25 %	386361887
31	NC_017596	TCAA	2	8	8358	8365	50 %	25 %	0 %	25 %	386361887
32	NC_017596	GAAC	2	8	8786	8793	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017596	AAAT	2	8	9059	9066	75 %	25 %	0 %	0 %	386361888
34	NC_017596	AAGA	2	8	9205	9212	75 %	0 %	25 %	0 %	386361889
35	NC_017596	GGAT	2	8	9268	9275	25 %	25 %	50 %	0 %	386361889
36	NC_017596	TATT	2	8	9296	9303	25 %	75 %	0 %	0 %	386361889
37	NC_017596	TCAA	2	8	9791	9798	50 %	25 %	0 %	25 %	386361891
38	NC_017596	CAAA	2	8	10155	10162	75 %	0 %	0 %	25 %	386361891
39	NC_017596	ATTT	2	8	10871	10878	25 %	75 %	0 %	0 %	386361891
40	NC_017596	AAAT	2	8	10892	10899	75 %	25 %	0 %	0 %	386361891
41	NC_017596	CAAA	2	8	11125	11132	75 %	0 %	0 %	25 %	386361892
42	NC_017596	TTCA	2	8	11561	11568	25 %	50 %	0 %	25 %	386361892
43	NC_017596	AGTT	2	8	11868	11875	25 %	50 %	25 %	0 %	386361892
44	NC_017596	TTTA	2	8	11980	11987	25 %	75 %	0 %	0 %	386361892
45	NC_017596	TTTA	2	8	12067	12074	25 %	75 %	0 %	0 %	386361892
46	NC_017596	GAAG	2	8	12513	12520	50 %	0 %	50 %	0 %	386361893
47	NC_017596	TGTT	2	8	12671	12678	0 %	75 %	25 %	0 %	386361893
48	NC_017596	ATTA	2	8	12941	12948	50 %	50 %	0 %	0 %	386361894
49	NC_017596	GAAA	2	8	13136	13143	75 %	0 %	25 %	0 %	386361894
50	NC_017596	TCAA	2	8	13334	13341	50 %	25 %	0 %	25 %	386361894
51	NC_017596	GTTC	2	8	13608	13615	0 %	50 %	25 %	25 %	386361894
52	NC_017596	ATGG	2	8	13755	13762	25 %	25 %	50 %	0 %	386361894
53	NC_017596	GTTG	2	8	14018	14025	0 %	50 %	50 %	0 %	386361894
54	NC_017596	AAAG	2	8	14102	14109	75 %	0 %	25 %	0 %	386361894
55	NC_017596	TGAT	2	8	14530	14537	25 %	50 %	25 %	0 %	386361894
56	NC_017596	ATTG	2	8	14615	14622	25 %	50 %	25 %	0 %	386361894
57	NC_017596	ACTA	2	8	15061	15068	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017596	TTGC	2	8	15490	15497	0 %	50 %	25 %	25 %	386361895
59	NC_017596	TTTA	2	8	15678	15685	25 %	75 %	0 %	0 %	386361895
60	NC_017596	GTAT	2	8	16060	16067	25 %	50 %	25 %	0 %	386361895
61	NC_017596	ATAA	2	8	16496	16503	75 %	25 %	0 %	0 %	386361895
62	NC_017596	TACT	2	8	16579	16586	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017596	AAAT	2	8	17021	17028	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017596	ACCT	2	8	17195	17202	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017596	GTGA	2	8	17476	17483	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017596	TAAC	2	8	17559	17566	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017596	AGCG	2	8	17647	17654	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017596	TGGT	2	8	18312	18319	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017596	AGCC	2	8	18529	18536	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017596	AGCG	2	8	18875	18882	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017596	GTAA	2	8	19125	19132	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017596	ACTA	2	8	19167	19174	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017596	GAAG	2	8	19207	19214	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017596	GCGA	2	8	19281	19288	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017596	ATTC	2	8	20147	20154	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017596	CTAA	2	8	20503	20510	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017596	TAGG	2	8	21158	21165	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017596	TTGG	2	8	21341	21348	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017596	AATC	2	8	21350	21357	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017596	AAAT	2	8	23022	23029	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017596	ACCT	2	8	23196	23203	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017596	GTGA	2	8	23477	23484	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017596	TAAC	2	8	23560	23567	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017596	AGCG	2	8	23648	23655	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017596	TGGT	2	8	24313	24320	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017596	AGCC	2	8	24530	24537	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017596	AGCG	2	8	24876	24883	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_017596	GTAA	2	8	25126	25133	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017596	ACTA	2	8	25168	25175	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_017596	GAAG	2	8	25208	25215	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017596	GCGA	2	8	25282	25289	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017596	ATTC	2	8	26148	26155	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017596	CTAA	2	8	26504	26511	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_017596	TAGG	2	8	27159	27166	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017596	TTGG	2	8	27342	27349	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017596	AATC	2	8	27351	27358	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017596	GCGT	2	8	29198	29205	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017596	TAAA	2	8	29749	29756	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017596	GTTA	2	8	30089	30096	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017596	ATTC	2	8	30889	30896	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017596	AAGT	2	8	31366	31373	50 %	25 %	25 %	0 %	386361896
102	NC_017596	AAGC	2	8	31674	31681	50 %	0 %	25 %	25 %	386361896
103	NC_017596	TGGT	2	8	32345	32352	0 %	50 %	50 %	0 %	386361896
104	NC_017596	ATTT	2	8	32372	32379	25 %	75 %	0 %	0 %	386361896
105	NC_017596	TTGA	2	8	33306	33313	25 %	50 %	25 %	0 %	386361897
106	NC_017596	TGAT	2	8	33319	33326	25 %	50 %	25 %	0 %	386361897
107	NC_017596	TTCT	2	8	33409	33416	0 %	75 %	0 %	25 %	386361897
108	NC_017596	ATTA	2	8	33674	33681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017596	CATT	2	8	34503	34510	25 %	50 %	0 %	25 %	386361898
110	NC_017596	GTTT	2	8	34971	34978	0 %	75 %	25 %	0 %	386361899
111	NC_017596	TAAT	2	8	35394	35401	50 %	50 %	0 %	0 %	386361899
112	NC_017596	GTAC	2	8	35579	35586	25 %	25 %	25 %	25 %	386361899
113	NC_017596	AACA	2	8	35728	35735	75 %	0 %	0 %	25 %	386361900
114	NC_017596	TTAG	2	8	35888	35895	25 %	50 %	25 %	0 %	386361900
115	NC_017596	AGAA	2	8	36021	36028	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017596	TTAT	2	8	36056	36063	25 %	75 %	0 %	0 %	386361901
117	NC_017596	TTGA	2	8	36556	36563	25 %	50 %	25 %	0 %	386361901
118	NC_017596	GGAA	2	8	36756	36763	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017596	AATC	2	8	37481	37488	50 %	25 %	0 %	25 %	386361902
120	NC_017596	TACT	2	8	37527	37534	25 %	50 %	0 %	25 %	386361902
121	NC_017596	TGGT	2	8	38141	38148	0 %	50 %	50 %	0 %	386361902
122	NC_017596	CTTG	2	8	38205	38212	0 %	50 %	25 %	25 %	386361902
123	NC_017596	GCAC	2	8	38749	38756	25 %	0 %	25 %	50 %	386361902
124	NC_017596	ACAG	2	8	39723	39730	50 %	0 %	25 %	25 %	386361902
125	NC_017596	TTGG	2	8	40260	40267	0 %	50 %	50 %	0 %	386361902
126	NC_017596	AGAA	2	8	40651	40658	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017596	ACTT	2	8	40835	40842	25 %	50 %	0 %	25 %	386361903
128	NC_017596	AATC	2	8	40955	40962	50 %	25 %	0 %	25 %	386361903
129	NC_017596	TGAT	2	8	41820	41827	25 %	50 %	25 %	0 %	386361903
130	NC_017596	TTGA	2	8	42053	42060	25 %	50 %	25 %	0 %	386361903
131	NC_017596	TGCT	2	8	42450	42457	0 %	50 %	25 %	25 %	386361904
132	NC_017596	AAGG	2	8	42761	42768	50 %	0 %	50 %	0 %	386361904
133	NC_017596	TAGT	2	8	43291	43298	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017596	AGTT	2	8	43494	43501	25 %	50 %	25 %	0 %	386361905
135	NC_017596	GATT	2	8	43644	43651	25 %	50 %	25 %	0 %	386361905
136	NC_017596	GTCT	2	8	43654	43661	0 %	50 %	25 %	25 %	386361905
137	NC_017596	CCTG	2	8	43740	43747	0 %	25 %	25 %	50 %	386361905
138	NC_017596	AAAG	2	8	44045	44052	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017596	GCTA	2	8	45180	45187	25 %	25 %	25 %	25 %	386361906
140	NC_017596	CCAA	2	8	45354	45361	50 %	0 %	0 %	50 %	386361906
141	NC_017596	AACC	2	8	45474	45481	50 %	0 %	0 %	50 %	386361906
142	NC_017596	AAAC	2	8	45660	45667	75 %	0 %	0 %	25 %	386361906
143	NC_017596	ATTA	2	8	46896	46903	50 %	50 %	0 %	0 %	386361907
144	NC_017596	TAAT	2	8	47076	47083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017596	AGAA	2	8	48471	48478	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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