MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes Alab49 chromosome

Total Repeats: 38976

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017596	A	6	6	186556	186561	100 %	0 %	0 %	0 %	386362049
4002	NC_017596	AAC	2	6	186627	186632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386362049
4003	NC_017596	CTG	2	6	186656	186661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386362049
4004	NC_017596	CTT	2	6	186679	186684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386362049
4005	NC_017596	T	6	6	186921	186926	0 %	100 %	0 %	0 %	386362049
4006	NC_017596	TAATC	2	10	186940	186949	40 %	40 %	0 %	20 %	386362049
4007	NC_017596	TGG	2	6	187010	187015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_017596	TAA	2	6	187048	187053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_017596	AAGA	2	8	187064	187071	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_017596	ACC	2	6	187091	187096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386362050
4011	NC_017596	CCTATC	2	12	187113	187124	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	386362050
4012	NC_017596	GATG	2	8	187180	187187	25 %	25 %	50 %	0 %	386362050
4013	NC_017596	ATT	2	6	187250	187255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386362050
4014	NC_017596	ATT	2	6	187302	187307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386362050
4015	NC_017596	ATG	2	6	187362	187367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386362050
4016	NC_017596	ATG	2	6	187425	187430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386362050
4017	NC_017596	TG	3	6	187492	187497	0 %	50 %	50 %	0 %	386362050
4018	NC_017596	AAG	2	6	187590	187595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386362050
4019	NC_017596	CAGG	2	8	187688	187695	25 %	0 %	50 %	25 %	386362050
4020	NC_017596	AAG	2	6	187700	187705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386362050
4021	NC_017596	TCC	2	6	187732	187737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386362050
4022	NC_017596	CA	3	6	187827	187832	50 %	0 %	0 %	50 %	386362050
4023	NC_017596	TCTT	2	8	187852	187859	0 %	75 %	0 %	25 %	386362050
4024	NC_017596	AGA	2	6	187875	187880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386362051
4025	NC_017596	AAG	2	6	187910	187915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386362051
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4027	NC_017596	AG	3	6	188007	188012	50 %	0 %	50 %	0 %	386362051
4028	NC_017596	ATG	2	6	188038	188043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386362051
4029	NC_017596	TTA	2	6	188083	188088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386362051
4030	NC_017596	TG	3	6	188119	188124	0 %	50 %	50 %	0 %	386362051
4031	NC_017596	GTG	2	6	188132	188137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386362051
4032	NC_017596	TTAT	2	8	188165	188172	25 %	75 %	0 %	0 %	386362051
4033	NC_017596	TGG	2	6	188193	188198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386362051
4034	NC_017596	AGC	2	6	188271	188276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386362051
4035	NC_017596	CAT	2	6	188289	188294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386362051
4036	NC_017596	A	7	7	188326	188332	100 %	0 %	0 %	0 %	386362051
4037	NC_017596	GTT	2	6	188465	188470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_017596	TGA	2	6	188576	188581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_017596	TGACAC	2	12	188719	188730	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4040	NC_017596	AT	3	6	188793	188798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_017596	A	6	6	188813	188818	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_017596	TCA	2	6	188823	188828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_017596	AAT	3	9	188897	188905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_017596	ATC	2	6	188957	188962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_017596	CTA	2	6	188997	189002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386362052
4046	NC_017596	ATT	2	6	189056	189061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386362052
4047	NC_017596	TCG	2	6	189100	189105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386362052
4048	NC_017596	TTG	2	6	189122	189127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386362052
4049	NC_017596	ATC	2	6	189131	189136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386362052
4050	NC_017596	TGA	2	6	189138	189143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386362052
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4052	NC_017596	TGA	2	6	189237	189242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386362052
4053	NC_017596	ATC	2	6	189263	189268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386362052
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4056	NC_017596	GA	3	6	189411	189416	50 %	0 %	50 %	0 %	386362052
4057	NC_017596	ATA	2	6	189458	189463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386362052
4058	NC_017596	TTA	2	6	189468	189473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386362052
4059	NC_017596	CATG	2	8	189489	189496	25 %	25 %	25 %	25 %	386362052
4060	NC_017596	TGAT	2	8	189671	189678	25 %	50 %	25 %	0 %	386362052
4061	NC_017596	T	6	6	189692	189697	0 %	100 %	0 %	0 %	386362052
4062	NC_017596	ATG	2	6	189717	189722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386362052
4063	NC_017596	CGA	2	6	189775	189780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386362052
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4065	NC_017596	TCT	2	6	189825	189830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386362052
4066	NC_017596	T	7	7	189949	189955	0 %	100 %	0 %	0 %	386362052
4067	NC_017596	TGA	2	6	189973	189978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386362052
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4070	NC_017596	TTG	2	6	190082	190087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386362052
4071	NC_017596	T	6	6	190092	190097	0 %	100 %	0 %	0 %	386362052
4072	NC_017596	A	6	6	190108	190113	100 %	0 %	0 %	0 %	386362052
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4075	NC_017596	TTA	2	6	190238	190243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_017596	ATA	3	9	190420	190428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4079	NC_017596	GT	3	6	190495	190500	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_017596	T	7	7	190505	190511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4082	NC_017596	TCA	2	6	190549	190554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4083	NC_017596	GTT	2	6	190555	190560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_017596	TTTA	2	8	190577	190584	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_017596	AAAC	2	8	190626	190633	75 %	0 %	0 %	25 %	386362053
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4088	NC_017596	CATA	2	8	190795	190802	50 %	25 %	0 %	25 %	386362053
4089	NC_017596	A	6	6	190815	190820	100 %	0 %	0 %	0 %	386362053
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4092	NC_017596	AAAT	2	8	190981	190988	75 %	25 %	0 %	0 %	386362053
4093	NC_017596	GAAA	2	8	191023	191030	75 %	0 %	25 %	0 %	386362053
4094	NC_017596	GTT	2	6	191048	191053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386362053
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4096	NC_017596	TTTAC	2	10	191072	191081	20 %	60 %	0 %	20 %	386362053
4097	NC_017596	CTA	2	6	191175	191180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386362053
4098	NC_017596	ATTT	2	8	191205	191212	25 %	75 %	0 %	0 %	386362053
4099	NC_017596	GAT	2	6	191219	191224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386362053
4100	NC_017596	ATA	2	6	191265	191270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386362053
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4103	NC_017596	AGTA	2	8	191389	191396	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_017596	AAG	2	6	191402	191407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_017596	ATG	2	6	191486	191491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386362054
4106	NC_017596	TTA	2	6	191495	191500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386362054
4107	NC_017596	TTA	2	6	191534	191539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_017596	T	6	6	191561	191566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_017596	A	6	6	191606	191611	100 %	0 %	0 %	0 %	386362055
4110	NC_017596	ATG	2	6	191617	191622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386362055
4111	NC_017596	T	6	6	191645	191650	0 %	100 %	0 %	0 %	386362055
4112	NC_017596	A	6	6	191658	191663	100 %	0 %	0 %	0 %	386362055
4113	NC_017596	A	6	6	191677	191682	100 %	0 %	0 %	0 %	386362055
4114	NC_017596	TAGA	2	8	191728	191735	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_017596	ATT	2	6	191803	191808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386362056
4116	NC_017596	ACA	2	6	191834	191839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386362056
4117	NC_017596	T	6	6	191849	191854	0 %	100 %	0 %	0 %	386362056
4118	NC_017596	GGCT	2	8	191922	191929	0 %	25 %	50 %	25 %	386362056
4119	NC_017596	CTG	3	9	191977	191985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386362056
4120	NC_017596	ATCGGT	2	12	192021	192032	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386362056
4121	NC_017596	AGC	2	6	192053	192058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386362056
4122	NC_017596	GATT	2	8	192059	192066	25 %	50 %	25 %	0 %	386362056
4123	NC_017596	T	6	6	192065	192070	0 %	100 %	0 %	0 %	386362056
4124	NC_017596	ATC	2	6	192073	192078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386362056
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4126	NC_017596	ACTT	2	8	192153	192160	25 %	50 %	0 %	25 %	386362056
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4252	NC_017596	TCA	2	6	197344	197349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386362061
4253	NC_017596	CCT	2	6	197353	197358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4254	NC_017596	CATT	2	8	197387	197394	25 %	50 %	0 %	25 %	386362062
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4262	NC_017596	GCT	2	6	197750	197755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386362062
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4277	NC_017596	TGT	2	6	198517	198522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4278	NC_017596	TAA	2	6	198524	198529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4367	NC_017596	CTTT	2	8	202684	202691	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4368	NC_017596	AGCA	2	8	202708	202715	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4369	NC_017596	A	6	6	202720	202725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4370	NC_017596	TGAT	2	8	202746	202753	25 %	50 %	25 %	0 %	386362066
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